求助一个测序分析的问题# Biology - 生物学
e*6
1 楼
在Li Heng写的MAQ里边，
原文中是从一开始的28bp作为seed，生成6个template进行比较，貌似原始本版最短就
是28bp了。现在新版本都是16bp，显然没法用28bp作为seed，这样应该如何处理啊。是
不是新版本里边把起始的template数改成16个了，4个bp一段？
因为template的原因，用于对比的bp应该只能是4的倍数，那么不是4的倍数的长度的
reads，是应该什么样子的原理呢？是不是先减到4的倍数进行查找，然后再用全部的长
度进行计算呢？
这两个问题不确定，有没有对测序分析比较懂行的来降解一下。
原文中是从一开始的28bp作为seed，生成6个template进行比较，貌似原始本版最短就
是28bp了。现在新版本都是16bp，显然没法用28bp作为seed，这样应该如何处理啊。是
不是新版本里边把起始的template数改成16个了，4个bp一段？
因为template的原因，用于对比的bp应该只能是4的倍数，那么不是4的倍数的长度的
reads，是应该什么样子的原理呢？是不是先减到4的倍数进行查找，然后再用全部的长
度进行计算呢？
这两个问题不确定，有没有对测序分析比较懂行的来降解一下。