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News: Mammalian microRNAs predominantly act to decrease target mRNA levels
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News: Mammalian microRNAs predominantly act to decrease target mRNA levels# Biology - 生物学
B*S
1
就是我如果有好的idea,他很不高兴。就是说,他不喜欢学生水平很高。
怎么办?
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z*2
2
今天才知道有这个玩意。任意时间超过1万美元就要申报。家里LD, H4, 国内银行卡上
有8万人民币。这个每年都需要file form 114来申报么?
这个只能网上填表。感觉很多人,尤其是老年人根本都不会弄啊。
请问这个是强制的么?
不申报有严重后果么?
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k*r
3
http://www.youtube.com/watch?v=z7-bgWCE8EA
作词:kinkster
演唱:蔺&墨墨
后期:蔺
制作:kinkster
女:
远山峦坡上 天边正夕阳
晚霞涂抹莺飞草长
千里延袤广 马头琴声悠扬
缁缁玄驹 汲我的香
男:
骐骥冀伊人 芊芊影在旁
欲将墨色沾染衣裳
生刍衔一束 绿草的芬芳
于焉逍遥 于焉嘉王
女:
庭外草离离
枯槁换青碧
男:
只身天涯旅
山河斜相骑
男:
絷我维我心 无言守候盼无期
我身背一场无关风月的戏
女:
絷之维之背 一路红尘载乐行
我驰骋无关风月的戏
男:
嬉戏已落幕 后背等谁将我骑
驹儿我狂嘶憨走等受羁
女:
交蹄伴跳踯 似骑非骑相嬉戏
循画忆起嘶吼掷音的驹
女:
看草绿草枯
数春秋朝夕
男:
不知伊人去
空余背上迹
男:
絷我维我心 无言守候盼归期
为你背一场无关风月的戏
女:
絷之维之背 一路红尘载乐行
我驰骋无关风月的戏
男:
嬉戏又一幕 后背等你将我骑
驹儿我狂嘶憨走欲受羁
女:
怒行追疾风 似骑非骑再嬉戏
循画忆起嘶吼掷音的驹
女:
已封的薄尘 为你细拂拭去
轻轻将那根旧鞭扬起
男:
那一天的你 容颜一概如往昔
归来时一袭黑衣曳地
男:
竹批双耳峻 脚下高蹄削寒玉
如龙欲向空依草伫立
女:
清风伴胧月 默然最后的相戏
此生永离此别永无期
男:
骐骥冀伊人 芊芊影在旁
欲将墨色沾染衣裳
生刍衔一束 绿草的芬芳
于焉逍遥 于焉嘉王
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a*u
4
☆─────────────────────────────────────☆
leonany (Cagalli Yula Athha) 于 (Thu May 14 14:49:02 2009) 提到:
无论是佛道儒,诸子百家共产主义和无神论, 大家信的原因或目的?
☆─────────────────────────────────────☆
serawang (皇叔郎) 于 (Thu May 14 14:51:38 2009) 提到:
随遇而安算不算目的?
☆─────────────────────────────────────☆
Hermes99 (Hermes) 于 (Thu May 14 14:57:54 2009) 提到:
态度是随波逐流
目的是明悟因果
原因是不可理喻
heihei
☆─────────────────────────────────────☆
leonany (Cagalli Yula Athha) 于 (Thu May 14 14:59:23 2009) 提到:
算,

☆──────────────────
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d*t
5
我用Freemake Video Converter把DVD转成MP4文件。可以用nook color自带的播放器放
,但声
音有delay,那位大牛知道是什么问题。
这个MP4文件的参数是:
Video: H.264 MP4, 720x480, 1749Kbps, 25fps;
Sound: AAC, 48KHz(sample rate), 127Kbps, Stereo;
参照anoia的帖子看,这个文件的bit rate并不高,不知道为什么会有这个问题。
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B*S
7
我真想知道,那种出faculty的组里,老板的学生水平很高,老板是怎么handle的。
大家各抒己见把。

【在 B****S 的大作中提到】
: 就是我如果有好的idea,他很不高兴。就是说,他不喜欢学生水平很高。
: 怎么办?

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M*s
8
这个每年都需要file form 114来申报么?
当然。
这个只能网上填表。感觉很多人,尤其是老年人根本都不会弄啊。
无语。
请问这个是强制的么?
不是。
不申报有严重后果么?
罚款一万美金。
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s*e
9
nook的cpu够么?我觉得卖得这么便宜,cpu不会强到哪里。

【在 d****t 的大作中提到】
: 我用Freemake Video Converter把DVD转成MP4文件。可以用nook color自带的播放器放
: ,但声
: 音有delay,那位大牛知道是什么问题。
: 这个MP4文件的参数是:
: Video: H.264 MP4, 720x480, 1749Kbps, 25fps;
: Sound: AAC, 48KHz(sample rate), 127Kbps, Stereo;
: 参照anoia的帖子看,这个文件的bit rate并不高,不知道为什么会有这个问题。

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w*y
10
ft, 这个结论不是早就有了吗
还能发nature?

【在 t*d 的大作中提到】
: Nature 466: 835–840
: Mammalian microRNAs predominantly act to decrease target mRNA levels
: Huili Guo, Nicholas T. Ingolia, Jonathan S. Weissman, David P. Bartel
: http://www.nature.com/nature/journal/v466/n7308/abs/nature09267.html?lang=en
: 感觉 miRNA 的研究太没有章法了。一会儿东,一会儿西,把我彻底搞迷糊了。

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L*o
11
这个我觉得跟personality有关系
有些人很open 有些人很狭隘
其实学生牛就是自己牛啊
当老板真是应该明白这一点。。

【在 B****S 的大作中提到】
: 就是我如果有好的idea,他很不高兴。就是说,他不喜欢学生水平很高。
: 怎么办?

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z*2
12
支付宝里瞬间有过8万人民币的余额,但账单里面完全找不到支付宝的账号号码,实在
没办法报啊。
感觉这个税法条款实际操作性很差,制定的很严格很苛刻,只是为了有大事件,要搞某
人时有法可依,一般情况是不会派人力来对付普通人的。

【在 M*******s 的大作中提到】
: 这个每年都需要file form 114来申报么?
: 当然。
: 这个只能网上填表。感觉很多人,尤其是老年人根本都不会弄啊。
: 无语。
: 请问这个是强制的么?
: 不是。
: 不申报有严重后果么?
: 罚款一万美金。

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e*y
13
800mhz的A8, 有点过时

【在 s*****e 的大作中提到】
: nook的cpu够么?我觉得卖得这么便宜,cpu不会强到哪里。
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z*t
14
miRNA的两个效应翻译抑制和mRNA降解,植物以直接降解为主,虽然大家在哺乳动物倾向翻译抑制,我的印象中没人很严格的set up实验证明哺乳动物里哪个是主导,这篇文章算是一个基因组水平的解惑吧。

【在 w******y 的大作中提到】
: ft, 这个结论不是早就有了吗
: 还能发nature?

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B*S
15
你说得很对阿。
学生再牛,其实也还是局限于小的方面。

【在 L****o 的大作中提到】
: 这个我觉得跟personality有关系
: 有些人很open 有些人很狭隘
: 其实学生牛就是自己牛啊
: 当老板真是应该明白这一点。。

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M*s
16
一般情况是不会派人力来对付普通人的
谁说的?你没有看到而已。

【在 z****2 的大作中提到】
: 支付宝里瞬间有过8万人民币的余额,但账单里面完全找不到支付宝的账号号码,实在
: 没办法报啊。
: 感觉这个税法条款实际操作性很差,制定的很严格很苛刻,只是为了有大事件,要搞某
: 人时有法可依,一般情况是不会派人力来对付普通人的。

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d*t
17
it more depends on the GPU.

【在 e***y 的大作中提到】
: 800mhz的A8, 有点过时
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s*s
18
翻译吧,不是转录
ww

【在 z*t 的大作中提到】
: miRNA的两个效应翻译抑制和mRNA降解,植物以直接降解为主,虽然大家在哺乳动物倾向翻译抑制,我的印象中没人很严格的set up实验证明哺乳动物里哪个是主导,这篇文章算是一个基因组水平的解惑吧。
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O*e
19
他直接跟你说他不喜欢水平高的学生?还是他觉得你的idea不够好?

【在 B****S 的大作中提到】
: 就是我如果有好的idea,他很不高兴。就是说,他不喜欢学生水平很高。
: 怎么办?

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z*2
20
IRS audit团队60%精力是放在收入在50万美元以上的业主和个人。只有一小嘬来处理年
薪10万左右或以下的家庭,因为即使查到了也挖不出多少钱来。
这个条款我相信大多数国人看来都太扯淡了,入籍了美国公民的可能会更注意些,其他
F/H/绿卡身份用国内银行,支付宝微信收各种生意款项的人,我不觉得谁会很死板地如
实申报,然后给IRS交税。
不好意思,版主别生气,纯讨论,我知道这样不合美国税法,但这些税法本身就不合理
,IRS没有能力管到的地方也要纳税人自觉去交。结果可想而之,空条款,或是我说的
特殊事件时有法可依。IRS自己也知道。就像IRS管毫无记录的现金交易一样
当然了,中美正式开始交换金融税务信息了的话,那估计大部分人都会开始遵守规则了
,哈哈

【在 M*******s 的大作中提到】
: 一般情况是不会派人力来对付普通人的
: 谁说的?你没有看到而已。

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d*t
21
我现在怀疑是freemake 软件的问题。回头还得再试试。

【在 d****t 的大作中提到】
: 我用Freemake Video Converter把DVD转成MP4文件。可以用nook color自带的播放器放
: ,但声
: 音有delay,那位大牛知道是什么问题。
: 这个MP4文件的参数是:
: Video: H.264 MP4, 720x480, 1749Kbps, 25fps;
: Sound: AAC, 48KHz(sample rate), 127Kbps, Stereo;
: 参照anoia的帖子看,这个文件的bit rate并不高,不知道为什么会有这个问题。

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z*t
22
刚刚改过来,做DNA甲基化转录说顺嘴了。。。

【在 s******s 的大作中提到】
: 翻译吧,不是转录
: ww

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h*n
23
it is unlikely for a prof to dislike good students/ideas. it sometimes hinge
s on how you present it. humanbeings have some subtle feelings. for instance
, outsmarting him in public is not a good idea, but making good points in
private is mostly fine and welcome.

【在 B****S 的大作中提到】
: 就是我如果有好的idea,他很不高兴。就是说,他不喜欢学生水平很高。
: 怎么办?

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M*s
24
生气不至于。说你没有看到而已,是因为2011年时已经有过普通纳税人客户被国税局追
问2003,2004为什么没有申报这个表格。。。
所以各位好自为之啦
给人建议,需要给人安全的建议。

【在 z****2 的大作中提到】
: IRS audit团队60%精力是放在收入在50万美元以上的业主和个人。只有一小嘬来处理年
: 薪10万左右或以下的家庭,因为即使查到了也挖不出多少钱来。
: 这个条款我相信大多数国人看来都太扯淡了,入籍了美国公民的可能会更注意些,其他
: F/H/绿卡身份用国内银行,支付宝微信收各种生意款项的人,我不觉得谁会很死板地如
: 实申报,然后给IRS交税。
: 不好意思,版主别生气,纯讨论,我知道这样不合美国税法,但这些税法本身就不合理
: ,IRS没有能力管到的地方也要纳税人自觉去交。结果可想而之,空条款,或是我说的
: 特殊事件时有法可依。IRS自己也知道。就像IRS管毫无记录的现金交易一样
: 当然了,中美正式开始交换金融税务信息了的话,那估计大部分人都会开始遵守规则了
: ,哈哈

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a*a
25
大哥
要硬解,你必须是854 H254 base profile
你这个肯定不是base profile(这就是为啥我说要按照handbrake里那样设preset)
所以必然是软解,毫无疑问,软解的话1749kbps大于我说的1300kbps,自然最后
会lag了
你试试看用系统自带的播放器能否开这个档案(astro等file manager里打开这个文件
打开方式选择系统自带播放器)
我估计95%打不开(说明是软解)

【在 d****t 的大作中提到】
: 我用Freemake Video Converter把DVD转成MP4文件。可以用nook color自带的播放器放
: ,但声
: 音有delay,那位大牛知道是什么问题。
: 这个MP4文件的参数是:
: Video: H.264 MP4, 720x480, 1749Kbps, 25fps;
: Sound: AAC, 48KHz(sample rate), 127Kbps, Stereo;
: 参照anoia的帖子看,这个文件的bit rate并不高,不知道为什么会有这个问题。

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w*y
26
早在2004年, [email protected]就发表了mRNA降解在mammalian里是非常普遍的
Bartel这片能上nature我觉得很奇怪

倾向翻译抑制,我的印象中没人很严格的set up实验证明哺乳动物里哪个是主导,这篇
文章算是一个基因组水平的解惑吧。

【在 z*t 的大作中提到】
: miRNA的两个效应翻译抑制和mRNA降解,植物以直接降解为主,虽然大家在哺乳动物倾向翻译抑制,我的印象中没人很严格的set up实验证明哺乳动物里哪个是主导,这篇文章算是一个基因组水平的解惑吧。
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B*S
27
Good suggestions,thanks!

hinge
instance

【在 h*****n 的大作中提到】
: it is unlikely for a prof to dislike good students/ideas. it sometimes hinge
: s on how you present it. humanbeings have some subtle feelings. for instance
: , outsmarting him in public is not a good idea, but making good points in
: private is mostly fine and welcome.

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z*2
28
嗯,这个确实,如果过几年中美通财务信息了,很容易就会把以前的账拿出来算了。
版主的建议一向很安全。
我比较激进,愿意承担概率不太大的风险,给人理财建议都是全仓TQQQ,或者起码全仓
QQQ之类的。

【在 M*******s 的大作中提到】
: 生气不至于。说你没有看到而已,是因为2011年时已经有过普通纳税人客户被国税局追
: 问2003,2004为什么没有申报这个表格。。。
: 所以各位好自为之啦
: 给人建议,需要给人安全的建议。

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d*t
29
我就是用的nook自带的player,所以肯定是硬解。不过分辨率是设在720*480,不知道
跟这个有没有关系。我现在更怀疑是freemaker的原因。
我现在正在试dvdfab,看它是不是比freemaker好用。

【在 a***a 的大作中提到】
: 大哥
: 要硬解,你必须是854 H254 base profile
: 你这个肯定不是base profile(这就是为啥我说要按照handbrake里那样设preset)
: 所以必然是软解,毫无疑问,软解的话1749kbps大于我说的1300kbps,自然最后
: 会lag了
: 你试试看用系统自带的播放器能否开这个档案(astro等file manager里打开这个文件
: 打开方式选择系统自带播放器)
: 我估计95%打不开(说明是软解)

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a*e
30
the main conclusion of this paper is that " that destabilization of target
mRNAs is the predominant reason for reduced protein output"
--------------------
Bartel gave the talk in Keystone symposium in January and shocked everyone.
However, some people are concerning that the conclusion based on cell lines
may not represent the real mechanism in vivo. For example, Victor said lin-
4 does most in translation control. So does Gary with let-7.
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W*t
31
It is possible that sometimes students like to overvalue their ideas.

【在 O******e 的大作中提到】
: 他直接跟你说他不喜欢水平高的学生?还是他觉得你的idea不够好?
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a*a
32
okay,那这是个全新的问题,我没遇到过,请update

【在 d****t 的大作中提到】
: 我就是用的nook自带的player,所以肯定是硬解。不过分辨率是设在720*480,不知道
: 跟这个有没有关系。我现在更怀疑是freemaker的原因。
: 我现在正在试dvdfab,看它是不是比freemaker好用。

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a*k
33
that's true. some of the other groups are trying to repeat the same
experiment in other systems

.
lines
lin-

【在 a***e 的大作中提到】
: the main conclusion of this paper is that " that destabilization of target
: mRNAs is the predominant reason for reduced protein output"
: --------------------
: Bartel gave the talk in Keystone symposium in January and shocked everyone.
: However, some people are concerning that the conclusion based on cell lines
: may not represent the real mechanism in vivo. For example, Victor said lin-
: 4 does most in translation control. So does Gary with let-7.

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c*a
34
很多刚入道的学生以为自己什么都懂,老师啥也不懂。
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d*t
35
我用DVDFab压的MP4(H.264, AAC)在Nook Color上也放不了。但用HandBrake再处理一遍
就可以放了。
FreeMaker压的MP4也是这样,非得用HandBrake过一遍才行。
所以现在要把DVD转成Nook能放的mp4文件,我得先用DVDFab过一遍(因为HandBrake不
支持直接压DVD, 版权问题), 再用HandBrake过一遍, 杯具的很。
难道不同软件用的H264还是不一样的?
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t*d
36
因为 Bartel 是这个领域的权威。他在 2004 发了两篇reviews,一篇在 CELL, 一篇
在 Nature Reviews Genetics。在两篇 reviews 他都倾向于 mammalian miRNAs 主要
抑制翻译的观点。但是miRNA的大头也基本倾向这个观点。Rosetta 2004 的文章没有提
供直接的证据证明那些下调的 mRNAs 是 miR-1和miR-124 直接targets。所以 Rosetta
的文章动摇了军心,但是还没有颠覆大家伙先入为主的观念。

【在 w******y 的大作中提到】
: 早在2004年, [email protected]就发表了mRNA降解在mammalian里是非常普遍的
: Bartel这片能上nature我觉得很奇怪
:
: 倾向翻译抑制,我的印象中没人很严格的set up实验证明哺乳动物里哪个是主导,这篇
: 文章算是一个基因组水平的解惑吧。

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w*n
37
可能是你们有什么误会吧。

【在 B****S 的大作中提到】
: 就是我如果有好的idea,他很不高兴。就是说,他不喜欢学生水平很高。
: 怎么办?

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g*g
38
州长说过必须是h264 baseline profile。DVDFab我没用过,你可以看看是否有h264的
更详细的配置,如果能设的和HandBrake用的setting (尤其是advance tab那些)一样
的话,应该有希望

【在 d****t 的大作中提到】
: 我用DVDFab压的MP4(H.264, AAC)在Nook Color上也放不了。但用HandBrake再处理一遍
: 就可以放了。
: FreeMaker压的MP4也是这样,非得用HandBrake过一遍才行。
: 所以现在要把DVD转成Nook能放的mp4文件,我得先用DVDFab过一遍(因为HandBrake不
: 支持直接压DVD, 版权问题), 再用HandBrake过一遍, 杯具的很。
: 难道不同软件用的H264还是不一样的?

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h*n
39
太好了, 这个间接支持了我前不久发的一篇文章, 因为我一直用PCR来检验miRNA对
target gene的作用, 没有任何western的实验.
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d*r
40
说点刻薄点的。
他是在反讽你。也许他觉得你的idea stupid,而你又固执,说服你非常费时间。
我刚当上AP时,心高气盛。有一次我的原老板跟我聊天说DVD有制式,我按自己在中国
玩DVD的经验同他死争。后来他烦了,说我说的对,而且说中国电子水平快世界领先了。
后来我发现自己错了,从此见他头低8分。

【在 B****S 的大作中提到】
: 就是我如果有好的idea,他很不高兴。就是说,他不喜欢学生水平很高。
: 怎么办?

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a*a
41
我惊奇的发现youtube mate从youtube上下载的都是baseline profile。。。
换句话说,难道最2的方法就是逗经过youtube转一次。。。

【在 g*g 的大作中提到】
: 州长说过必须是h264 baseline profile。DVDFab我没用过,你可以看看是否有h264的
: 更详细的配置,如果能设的和HandBrake用的setting (尤其是advance tab那些)一样
: 的话,应该有希望

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W*C
42
以前是知道miRNA有这两方面的作用, 这片大概比较了一下这两种作用的贡献, rna降
解大概占了84%
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w*n
43
可以理解,我们都是从年轻时过来的,都有过看不起老板,觉得自己比老板牛的年轻时代

了。

【在 d*****r 的大作中提到】
: 说点刻薄点的。
: 他是在反讽你。也许他觉得你的idea stupid,而你又固执,说服你非常费时间。
: 我刚当上AP时,心高气盛。有一次我的原老板跟我聊天说DVD有制式,我按自己在中国
: 玩DVD的经验同他死争。后来他烦了,说我说的对,而且说中国电子水平快世界领先了。
: 后来我发现自己错了,从此见他头低8分。

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s*i
44
handbrake用ipod classic的pre-setting,然后把分辨率和码率改改就可以用了。
avatar
l*n
45
对,之前大家都被1993年microRNA lin-4主要抑制lin-14 RNA的翻译、而对lin-14 RNA
降解影响很小的情况误导了。
后来用cDNA microarray发现microRNA减少target RNA量的幅度非常小,就还是以为
microRNA主要是直接抑制target RNA的翻译,促进target RNA的降解是次要的。
实际上现在Bartel证明microRNA整个减少target蛋白的作用幅度就非常小(已经发表的
绝大部分direct target蛋白减少非常显著的文章,其实都是特例,因为target蛋白减
少幅度很小的情况很难发表文章),而且其中至少84%甚至90%都是促进target RNA的
降解产生的,直接抑制target RNA的翻译只占16%,甚至只占10%。
过去做microRNA抑制翻译的生化机理的实验几乎全是用串联3个,甚至7个microRNA
target的artificial 3'UTR来做,很可能根本不反映生理情况下的作用机制。
这对用RNA-Seq寻找microRNA direct target是一个福音啊。

【在 W****C 的大作中提到】
: 以前是知道miRNA有这两方面的作用, 这片大概比较了一下这两种作用的贡献, rna降
: 解大概占了84%

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U*1
46
I believe that you misunderstood your advisor.
Also, unless you are a genius, you can not be better than your advisor except some small problems.
Sometime advisor was not happy since you did not show respect or you are not polite.
avatar
a*a
47
i think maybe he needs to rip a dvd, im not sure if handbreak can do that.
of course he can always use handbreak to do a second transform.

【在 s********i 的大作中提到】
: handbrake用ipod classic的pre-setting,然后把分辨率和码率改改就可以用了。
avatar
o*a
48
是不是说大多数mammalian microRNAs不和3'UTR结合?那一般什么部位是他们的
targets?

RNA

【在 l******n 的大作中提到】
: 对,之前大家都被1993年microRNA lin-4主要抑制lin-14 RNA的翻译、而对lin-14 RNA
: 降解影响很小的情况误导了。
: 后来用cDNA microarray发现microRNA减少target RNA量的幅度非常小,就还是以为
: microRNA主要是直接抑制target RNA的翻译,促进target RNA的降解是次要的。
: 实际上现在Bartel证明microRNA整个减少target蛋白的作用幅度就非常小(已经发表的
: 绝大部分direct target蛋白减少非常显著的文章,其实都是特例,因为target蛋白减
: 少幅度很小的情况很难发表文章),而且其中至少84%甚至90%都是促进target RNA的
: 降解产生的,直接抑制target RNA的翻译只占16%,甚至只占10%。
: 过去做microRNA抑制翻译的生化机理的实验几乎全是用串联3个,甚至7个microRNA
: target的artificial 3'UTR来做,很可能根本不反映生理情况下的作用机制。

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x*h
49
年轻人把自己看太高的很多。其实时间长了,事后看,导师还会是对的。呵呵。耐心太
重要了!
如果在美国的话,你如果是学生(不是老师),你最好踏实地做好导师要求你做的事情
。在这个过程中学习,提高自己。等你确实到了一定程度后(达到提faculty的水平了
, 这个时间其实要个几年,要有耐心),你再和导师商量你的idea。 work on it。
很多情况下,你以为多高明的idea其实真不怎么高明。导师确实是有他的见解的。
还有就是,学点办公室政治(不太好听,但是社会就是这样):
你只有帮导师做好他要做好的事情,你才有好果子吃。
表面上,美国是很强调个性的,实际上还是喜欢听话,踏实干活的人。你一辈子都需要
以前老板的推荐信。
任何人出钱都是需要那个被雇的人干活。如果你光拿钱,光干你想干的,不把特别主要
的精力放在他要求你做的事情上,凭什么呀。你要那么牛,你做什么学生,你早该做导
师了。
如果你不是导师,拿人钱财就要替人消灾。呵呵,老祖宗说得有道理的。
另外,在美国十几年,我的结论是,做出成绩的人都是付出很多的。有的人看得出来是
很努力,有的人努力在你看不到的时候。尤其做科研的,实际上是没有上班下班一说的
。每个人不是在做实验,就是在看文献,在写文章。根本没有晚上休息和周末的。科研
是个苦差事。。。
不要把精力放在和导师生气上。你需要他。基本上,导师也不会特别和你过不去,他们
也忙得很,有压力。
如果你确实有水平,踏踏实实干个几年。慢慢成绩就会出来。
今天喝了点,话有点多呵。。。
avatar
s*i
50
handbrake不就是用来rip dvd的么?试试就知道了。关键是h.264 baseline profile.

【在 a***a 的大作中提到】
: i think maybe he needs to rip a dvd, im not sure if handbreak can do that.
: of course he can always use handbreak to do a second transform.

avatar
l*i
51
我太爱这篇paper了,当时我们这边一个教授的实验室就是有这么一个争论,一个中国
人认为是mRNA level,而另外一个印度薄厚认为是translation level,结果这位老板信
了后者,因为这位中国人脾气火爆,然后惹怒了这位教授,结果这位东欧的教授把那位
中国学生以作假的名义fire掉了。
现在bartel的实验室由一位中国学生做出相反的结果,真是让人大快人心啊,呵呵。我
希望篇paper能够被重复出来。
avatar
a*e
52
精辟。新学生通常都不知天高地后, 觉得自己是天才,多年以后才发现自己很可笑荒唐

except some small problems.
not polite.

【在 U*******1 的大作中提到】
: I believe that you misunderstood your advisor.
: Also, unless you are a genius, you can not be better than your advisor except some small problems.
: Sometime advisor was not happy since you did not show respect or you are not polite.

avatar
d*t
53
handbrake不能rip有版权保护的dvd。至少我目前没发现可以。
h264有很多profile,我觉得dvdfab用的不是'baseline profile,所以rip出的file不能
在nook上用。
avatar
l*n
54
大多数mammalian microRNA还是和3'UTR结合来抑制它们的。

【在 o*****a 的大作中提到】
: 是不是说大多数mammalian microRNAs不和3'UTR结合?那一般什么部位是他们的
: targets?
:
: RNA

avatar
a*a
55
学习了,写的挺好。看来大家回帖之前都可以考虑喝点:)

【在 x***h 的大作中提到】
: 年轻人把自己看太高的很多。其实时间长了,事后看,导师还会是对的。呵呵。耐心太
: 重要了!
: 如果在美国的话,你如果是学生(不是老师),你最好踏实地做好导师要求你做的事情
: 。在这个过程中学习,提高自己。等你确实到了一定程度后(达到提faculty的水平了
: , 这个时间其实要个几年,要有耐心),你再和导师商量你的idea。 work on it。
: 很多情况下,你以为多高明的idea其实真不怎么高明。导师确实是有他的见解的。
: 还有就是,学点办公室政治(不太好听,但是社会就是这样):
: 你只有帮导师做好他要做好的事情,你才有好果子吃。
: 表面上,美国是很强调个性的,实际上还是喜欢听话,踏实干活的人。你一辈子都需要
: 以前老板的推荐信。

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a*a
56
实在不行你就别折腾了,都先rip出来,再用handbrake转一次。。。其实也花不了
多少时间,晚上开着机子转就行了
handbrake很霸道,不能选priority和线程,每次一运行我所有core全满。。。

【在 d****t 的大作中提到】
: handbrake不能rip有版权保护的dvd。至少我目前没发现可以。
: h264有很多profile,我觉得dvdfab用的不是'baseline profile,所以rip出的file不能
: 在nook上用。

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H*1
57
能不能再展开说说为啥对用RNA-seq来找microRNA target是福音?谢谢

【在 l******n 的大作中提到】
: 大多数mammalian microRNA还是和3'UTR结合来抑制它们的。
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h*k
58
exactly.
当我是学生,就经常觉得老板啥都不懂,乱指挥
当我现在当叫兽了,就知道当年的idea都是不可能fundable idea
多幼稚的idea, 顶多打一枪,发一篇paper而已。

【在 c******a 的大作中提到】
: 很多刚入道的学生以为自己什么都懂,老师啥也不懂。
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g*g
59
我记得有单独的小程序来破除dvd版权保护的,好像是dvd43之类的,在后台运行起来,
然后其它程序看到的dvd就是没有保护的了,也许可以试试

【在 d****t 的大作中提到】
: handbrake不能rip有版权保护的dvd。至少我目前没发现可以。
: h264有很多profile,我觉得dvdfab用的不是'baseline profile,所以rip出的file不能
: 在nook上用。

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l*n
60
原来觉得即使做了mRNA表达谱也还是会漏掉这个microRNA的direct target中的很大一
部分(比如某个micrRNA有300个target,mRNA表达谱检测只能找到100个,漏掉200个)。
而现在看来mRNA表达谱会找到这个microRNA的几乎全部direct target(比如找到300个
target中的270个)。这样RNA-Seq就足够了。
而且RNA-Seq比SILAC这种Proteomics的方法成本便宜太多了,很多实验室都用得起。

【在 H*********1 的大作中提到】
: 能不能再展开说说为啥对用RNA-seq来找microRNA target是福音?谢谢
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s*i
61
你这四个选项不是压缩的参数,是encoder/decoder的选项。
参考http://www.dvdfab.com/tutorial/Convert-DVD-to-iPod
ipod classic用的是baseline。

【在 d****t 的大作中提到】
: handbrake不能rip有版权保护的dvd。至少我目前没发现可以。
: h264有很多profile,我觉得dvdfab用的不是'baseline profile,所以rip出的file不能
: 在nook上用。

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t*d
62
下一个要证明的是:
mammalian miRNAs bind to both coding region and 3'UTR with equal chances to guide mRNA
degradation or block of translation.
从此以后,世界就清静了。
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d*t
63
新版的DVDFab好像已经不支持iPod classic了,你给的link应该是已经更新过了,里面
没有提到
ipod classic,也没有提到baseline profile。
我今天早上在DVDFab中用target device是DroidX的设置又试了一下,还是不成。我是
不打算再在
这上费时间了。 要rip DVD时过两遍就过两遍吧,反正我也不需要常做这事。

【在 s********i 的大作中提到】
: 你这四个选项不是压缩的参数,是encoder/decoder的选项。
: 参考http://www.dvdfab.com/tutorial/Convert-DVD-to-iPod
: ipod classic用的是baseline。

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a*g
64
Greg Hannon has some data of the binding,
not only coding, but also 5' UTR....

to guide mRNA

【在 t*d 的大作中提到】
: 下一个要证明的是:
: mammalian miRNAs bind to both coding region and 3'UTR with equal chances to guide mRNA
: degradation or block of translation.
: 从此以后,世界就清静了。

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s*y
65
难道不是这样的么?
我不在具体作这个field, 可是我觉得,凭什么人家一定要结合到3'-UTR?
爱那那,有什么不行的?

to guide mRNA

【在 t*d 的大作中提到】
: 下一个要证明的是:
: mammalian miRNAs bind to both coding region and 3'UTR with equal chances to guide mRNA
: degradation or block of translation.
: 从此以后,世界就清静了。

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t*d
66
我也觉得这个不合理。不过目前大部分人认为主要结合位点是 3'-UTR。所有的miRNA
target 预测都只看 3'-UTR region。也有些文章声称发现了菲 3'-utr 的binding
site。情况和以前 blocking、degradation的模糊状态差不多。

【在 s******y 的大作中提到】
: 难道不是这样的么?
: 我不在具体作这个field, 可是我觉得,凭什么人家一定要结合到3'-UTR?
: 爱那那,有什么不行的?
:
: to guide mRNA

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a*a
67
MARK.

RNA

【在 l******n 的大作中提到】
: 对,之前大家都被1993年microRNA lin-4主要抑制lin-14 RNA的翻译、而对lin-14 RNA
: 降解影响很小的情况误导了。
: 后来用cDNA microarray发现microRNA减少target RNA量的幅度非常小,就还是以为
: microRNA主要是直接抑制target RNA的翻译,促进target RNA的降解是次要的。
: 实际上现在Bartel证明microRNA整个减少target蛋白的作用幅度就非常小(已经发表的
: 绝大部分direct target蛋白减少非常显著的文章,其实都是特例,因为target蛋白减
: 少幅度很小的情况很难发表文章),而且其中至少84%甚至90%都是促进target RNA的
: 降解产生的,直接抑制target RNA的翻译只占16%,甚至只占10%。
: 过去做microRNA抑制翻译的生化机理的实验几乎全是用串联3个,甚至7个microRNA
: target的artificial 3'UTR来做,很可能根本不反映生理情况下的作用机制。

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n*7
68
从文献和我们以前的分析来看,虽然cds也能坚定到一些target,但是信号比3'utr差太
多了
至于5utr 我觉得问题在于太短,很多mrna就没有
一年多没关注这个了,欢迎指正

【在 s******y 的大作中提到】
: 难道不是这样的么?
: 我不在具体作这个field, 可是我觉得,凭什么人家一定要结合到3'-UTR?
: 爱那那,有什么不行的?
:
: to guide mRNA

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