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请教ChIP 引物的设计
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请教ChIP 引物的设计# Biology - 生物学
V*g
1
9号上海B2有人拿到了吗? 现在网上查护照状态: 你所输入的护照号码并没有状态。
啥意思?
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q*p
2
我家西红柿长得很大,如果中间没有掐枝的话,估计比现在的还要高大。那细瘦瘦的架
子根本都架不住啊,尤其结果之后。
大家的西红柿都能用架子架好吗?还是自己用木条搭架子多些?
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g*f
3
大家好,我现在打算用ChIP 做一个转录因子对IL8 的作用,看到一篇JBC文章上的
ChIP IL8 promoter 的引物,可是我primer blast 发现根本就不是IL8, 看来只好自
己设计了,我想请问一下有没有专门的转录因子结合位点的序列数据库,比如IL8
promoter 上 NFkappaB 结合位点的序列等。多谢了
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i*e
4
你买的尺寸 太小了
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X*n
5
JBC竟然有这么低级的错误?好像Harvard有个数据库收集所有报道的ChIP-qPCR的引物
。结合位点的
话Genome Browser里打开Regulaion里面TFBS的track应该能看到。
顺便问一下你的sonication的条件。

【在 g*******f 的大作中提到】
: 大家好,我现在打算用ChIP 做一个转录因子对IL8 的作用,看到一篇JBC文章上的
: ChIP IL8 promoter 的引物,可是我primer blast 发现根本就不是IL8, 看来只好自
: 己设计了,我想请问一下有没有专门的转录因子结合位点的序列数据库,比如IL8
: promoter 上 NFkappaB 结合位点的序列等。多谢了

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m*5
7
同问sonication 条件
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l*z
8
最大的也不过54“, 还是不够。 sweet100能长两米多高。

【在 i*******e 的大作中提到】
: 你买的尺寸 太小了
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Z*5
9
不同的超声破碎仪,不同种类的细胞,不同密度的细胞,条件会不一样吧。根据
upstate EZ-ChIP上推荐的条件,把功率调高或调低点,做三四个梯度足够了,自己试
试,很简单的实验,一天就可以搞定这一步。
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c*p
10
是的,我去年两颗无限生长型的就长成了树林,今年全部打顶

【在 l****z 的大作中提到】
: 最大的也不过54“, 还是不够。 sweet100能长两米多高。
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Z*5
11
http://jaspar.binf.ku.dk/cgi-bin/jaspar_db.pl
http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess
结合序列可以到这两个网站找。
推荐你先到UCSC上看看有没有你感兴趣的TF的whole genome ChIP-seq。NFKB的已经有
了,在GM19193,GM19099,GM18526,GM12892,GM12878等细胞中对IL8 TSS 左右2kb范围
内都没有明显的结合信号。也有一种可能就是NFKB在某些刺激条件下才会结合到IL8的
promoter调控其表达。这个就要你自己做实验验证了。
c-Jun,JunD,TCF4都有明显的结合信号。尤其是TCF4,调控IL8的可能性非常大。
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l*z
13
封顶了,可一不注意侧枝又长老高了

【在 c***p 的大作中提到】
: 是的,我去年两颗无限生长型的就长成了树林,今年全部打顶
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c*p
14
继续剪!否则只能挨电线杆种

【在 l****z 的大作中提到】
: 封顶了,可一不注意侧枝又长老高了
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l*z
15
我今年把黄瓜种向日葵边上了,真不错,省的没地方爬了

【在 c***p 的大作中提到】
: 继续剪!否则只能挨电线杆种
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q*p
17
尺寸不小,可就是觉得那几根颤巍巍的铁丝圈太不结实了,前段时间来过几次storm之
后就七到八歪的了。。。当然storm来之前就有些承不了西红柿树之重了。。

【在 i*******e 的大作中提到】
: 你买的尺寸 太小了
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q*p
18
哎呀 太对了!

【在 l****z 的大作中提到】
: 封顶了,可一不注意侧枝又长老高了
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c*p
19
油菜油菜!
向日葵开花了么?没见你BSO

【在 l****z 的大作中提到】
: 我今年把黄瓜种向日葵边上了,真不错,省的没地方爬了
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l*z
20
开了。 去年show过,没有新意了。
以后黄瓜/油豆角我都这么种了,省得搭架子了。

【在 c***p 的大作中提到】
: 油菜油菜!
: 向日葵开花了么?没见你BSO

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c*p
21
挺喜欢向日葵的,很阳光的颜色,做成干花应该不错

【在 l****z 的大作中提到】
: 开了。 去年show过,没有新意了。
: 以后黄瓜/油豆角我都这么种了,省得搭架子了。

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l*z
22
还真被说,做了,黄的瓣颜色没有变,就是全掉了。

【在 c***p 的大作中提到】
: 挺喜欢向日葵的,很阳光的颜色,做成干花应该不错
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c*p
23
啊!!这么娇气啊
结瓜籽了么?

【在 l****z 的大作中提到】
: 还真被说,做了,黄的瓣颜色没有变,就是全掉了。
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l*z
24
没有,是开的挺好的花。 过两天再试试。 不是所有的花都适合做干花。 目前发现
绣球最容易。

【在 c***p 的大作中提到】
: 啊!!这么娇气啊
: 结瓜籽了么?

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c*p
25
我家的绣球快谢了,这几天谢得特别快

【在 l****z 的大作中提到】
: 没有,是开的挺好的花。 过两天再试试。 不是所有的花都适合做干花。 目前发现
: 绣球最容易。

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l*z
26
是快过季了,不知道我的endless summer什么时候再开。

【在 c***p 的大作中提到】
: 我家的绣球快谢了,这几天谢得特别快
avatar
c*p
27
有新花苞么?从花苞到开要好长时间

【在 l****z 的大作中提到】
: 是快过季了,不知道我的endless summer什么时候再开。
avatar
l*z
28
没有,但有发新枝。 不会骗人把,rorona的也没有再开。 刚给施肥了,观望
中。。。。。。。

【在 c***p 的大作中提到】
: 有新花苞么?从花苞到开要好长时间
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m*T
29
你种了sweet100?
发个pp来看好不?很想知道这个品种是不是真的可以接那么多。

【在 l****z 的大作中提到】
: 最大的也不过54“, 还是不够。 sweet100能长两米多高。
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l*z
30
结了很多很多,应该叫sweet1000都不过分。长的东倒西歪,很难照。 我周
末试试看。

【在 m*******T 的大作中提到】
: 你种了sweet100?
: 发个pp来看好不?很想知道这个品种是不是真的可以接那么多。

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