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号外：NASA发现新细菌的DNA由砷构成 (转载)
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号外：NASA发现新细菌的DNA由砷构成 (转载)# Biology - 生物学
s*f
1 楼
暂时不能办h1b。。。。所以过几周回国去签j1。我是在美国拿的phd，不是公派留学，
以前也没有签j1的经历。我这种情况网上的资料不多，或者是我没有找到？版上有没有
谁有这个经历的，能分享一下问道的问题吗？谢谢了。
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F*r
2 楼
脑白金转到我手下后态度也是一如既往的蛮横，而且牢骚更加直白。他原来就是主管级
别的，后来因为特殊任务丢了职位而汇报到另外个主管手下。现在就更恶心了，他得汇
报到一个同是高级经理的人，而且这个人比他小20多岁，而且还是一个外国人。我只好
安抚军心，跟他说，我并不是造成这个情况的人，我也理解他的思想状态。不过，既然
公司做了这样的按排，我们还是得公事公办。与此同时，我也和大老板和人事部副总裁
商量怎么处理脑白金。人事部副总裁的意识很简单，脑白金不好惹，也不好管。交给我
，就是要看看我怎么处理，有没有领导艺术。大老板的意识则是因人而易，充分挖掘脑
白金的技术背景和知识。当然了，我感谢大老板和人事部副总裁对我的信任，同时也知
道，我老板这招也很狠。首先，脑白金转到我手下，我并没有得到提拔；再次，脑白金
比较难对付，会是我的心头病；最后，如果要开掉脑白金，也是我下狠手而不是他做的
。不过从面上说，这个按排是我不得不接受的挑战，而且还反映出我老板对我十分关心
，为我以后提拔在不懈努力。
既然我无法避免这样一个困难境地，我就必须考虑总体策略。首先，我得多了解脑白金
的真正任务，然后看能不能分拆脑白金的工作。能把脑白金的工作分拆，我对他的依赖
性就会小很多。即使哪天脑白金要鱼死网破地干一仗，我也有后备方案。同时也不会使
大老板担心大部门的总体运作；第二，既然人事副总裁要看我的领导才能，我不能只是
采取狠打狠压的策略，而是要高出一个档次。所以我决定是要改变脑白金，让他浪子回
头，回到正确的轨道上来。第一步对脑白金工作的分拆还算顺利。三个月后，我基本只
把脑白金定位于只有他能做，但是即使哪天他没了，团队和公司的运作也不会受很大影
响的地步。这一步完成后，脑白金也知道他自己在公司的份量了。换句话说，他的生死
基本是在我手上了。当然，我并没有太多喧哗这个事。因为那是我自己的棋子，别人不
需要知道。而且，他们越认为脑白金难处理，我的‘成就’也就会更高。但是，那时我
还没有直接启动脑白金扭转方案的契机。我得等到年终评比，然后拿大家对脑白金的评
价来和他交流。
为了准备脑白金的年终评比，我用了360度调查，收集书面意见和评价。到了2月份的评
比阶段，我作为一个高级经理参加了主管级别以上的讨论会上（Calibration meeting
）。因为我级别不够，我是第一个发言，然后就要退场的。我坐在会议室的最顶头，根
据360度调查，给脑白金做了他的年终总结。其实当时在座的很多人也是参加了脑白金
360调查的。可想而知，所有列席会议的主管及以上的高管都一致对脑白金表示了强烈
的不满。老史威严地说：你是不是要给他4分，甚至5分。前面文章说过，评比4分就得
上PIP，而5分就直接走人。我心里跳得厉害，觉得一旦我听从了建议，我就得开脑白金
。在此之前我还没有开过人，而且这也不是我的计划。这时大家都齐刷刷地看着坐在桌
尾的我。我停顿了一下，安静了下自己，半大声地苦笑了一下，然后无可奈何地说，脑
白金也许真的很差。但是，从9月份转过来，他跟我半年时间都不到。我觉得由我给他4
分或者5分有点不公平。大家能不能再给我三个月时间。我想让脑白金浪子回头（turn-
around）。我老板听我这样说，使劲地摇摆手指，让我闭嘴。我用眼光来回看大老板和
人事部副总裁，征求他们的意见。没有回应，但是对我来说，没有否定我的建议就是胜
利。我赶紧说，谢谢大家，我会和人事部密切合作处理脑白金的事的。谢谢大家给我机
会参加主管级别以上会议做脑白金的年终评比。人事部主管这时才接嘴说，好吧，谢谢
你。我听了，马上就站起来，离开了会议室，长长地舒了一口气。
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m*u
3 楼
7月3日，西安财经学院一名女大学生在宿舍内自缢身亡。后经学校确定：该生因患抑郁
症而自杀。
6月25日，《求是》杂志副总编、著名杂文家朱铁志疑因抑郁症自缢辞世。
7月2日，沈阳皇姑区一名45岁女子从小区楼道缓步台窗户跳下身亡。据亲属称，女
子患有抑郁症。
……
最近，有关抑郁症患者的新闻屡有发生。今年2月底，已出版两本专著、被誉为“
史学奇才”的西安高中学生林嘉文因抑郁症跳楼身亡。作为全球性主要的精神问题疾病
，抑郁症再次引起广大市民的关注。
案例
抑郁症小伙离家出走
浙江夫妇西安寻子
7月1日中午，曲江新区芙蓉南路上，来自浙江的61岁的老李夫妇显得疲惫不堪，老
李手里紧攥着的厚厚一沓寻人启事，遇到路边的小摊贩或者保洁员，他们便急忙拿出寻
人启事上的照片，每遇对方摇头，他们便一脸失落。
寻人启事上的小伙子是他们的儿子，确切地说是他们患抑郁症的儿子。“我要出去
挣大钱！”5月28日，儿子小李丢下这么一句话，撇下老两口和未满月的女儿悄然离家
，夫妇俩一路追着撵着，似乎与儿子多次擦肩而过。6月12日上午，通过汽车站的监控
，夫妇俩发现儿子坐上一辆绵阳到西安的长途大巴，于是追到了西安。6月29日，听人
说儿子曾在东门外出现，老两口又赶忙来到东关南街派出所查监控。
儿子曾是老李夫妇的骄傲。小李今年29岁，从小成绩优异，7年前从北京一所知名
高校毕业，回到家乡进了一家国有银行。在亲朋好友和同学眼中，儿子是别人羡慕的对
象。银行职员有拉存款的任务，但对来自农村的小李来说，一个季度500万元的任务“
鸭梨山大”。慢慢地，小李变沉默了，心里总窝着事儿，谁也不愿意理，“整天喊着自
己没用”，后来经确诊为抑郁症。老李夫妇至今记得，患上抑郁症后，儿子换了手机卡
，“删掉所有同学的联系方式，断绝了与所有人的来往，去年更是辞掉了银行的工作。
”今年5月初，小李的妻子难产，这次意外让小李受到了更大的刺激，5月28日，小李独
自离家，紧接着，老李夫妇踏上漫漫寻子路。
街上被人多看一眼
他会觉得对方不怀好意
对市民高先生一家来说，表弟为何患上抑郁症，他们百思不解。高先生的表弟1984
年出生，是家中独子。高中毕业后，表弟没有继续上学，也没有找工作。拿高先生的话
说，“高中毕业就过起了玩世不恭的生活”。
“他曾经两次向家里要钱，每一次都在10万元以上，说要创业干大事，可也没见他
干出个啥名堂，倒是经常泡酒吧、逛娱乐场所。”高先生说。后来不知为什么，表弟话
越来越少，连他这个从小玩到大的表哥也爱理不理了。“医生说他这是抑郁症，可我们
都纳闷，经常逛娱乐场所的人也会抑郁？”高先生印象中，表弟整天把自己关在家里，
看看书上上网，就是不愿意出门。“这两年更严重了，有时走到街上，别人要是多看他
一眼，他都会觉得别人不怀好意。” 对于儿子患上抑郁症，高先生的姑姑、姑父也想
不明白。
定义
有抑郁情绪
不等于患上抑郁症
张欣，陕西省心理咨询师协会会员、国家二级心理咨询师、心理测评师、德国海德
堡大学医学硕士、陕西大康心理培训学校专职教师。7月6日，得知小李和高先生表弟的
情况，张欣明确告诉记者，两人都是典型的抑郁症患者，并且已经到了较严重的程度。
“抑郁症是一种高患病率、高复发率、高致残率、高自杀率的慢性精神疾病，被称
为健康杀手。公开的数据显示，目前抑郁症已经成为世界第四大疾病，预计到2020年，
将成为仅次于冠心病的人类第二大疾患。” 张欣说，公开数据显示，我国约有9000万
人患有抑郁症，患者中接受治疗的大概只有8%，我国每年约有20万人因抑郁症自杀。
“认识抑郁症要从认识抑郁情绪开始！”张欣说，当前社会竞争日益激烈，几乎每
个人都在超负荷运转，很容易产生不同程度的抑郁情绪，这是一种常见的情感成分。“
生活中经常听到有人说‘郁闷’‘烦躁’‘别理我，烦着呢’等口头禅，实际上都是抑
郁情绪的代名词！”
不过张欣认为，短期的抑郁情绪不能等同于抑郁症。“正常人的抑郁情绪是基于一
定的客观事物，事出有因。而抑郁症则是病理情绪抑郁，通常无缘无故地产生，缺乏客
观精神应激的条件。”张欣说。
特征
消极悲观自我评价低
“一般人情绪变化有一定时限性，人们通过自我调适，充分发挥自我心理防卫功能
，能恢复心理平稳。而抑郁症患者的抑郁症状常持续存在，甚至不经治疗难以自行缓解
，症状还会逐渐恶化。”张欣说，精神医学规定一般抑郁不应超过两周，如果超过一个
月甚至持续数月或半年以上，则可以肯定是病理性抑郁症状。抑郁症患者程度严重，并
且影响患者的工作、学习和生活，无法适应社会，甚至产生严重的消极、自杀言行。
正常人的抑郁情绪当生活事件解决时会自然缓解，而抑郁症会反复发作，每次发作的基
本症状大致相似。
“抑郁症有生物节律性变化的特征，表现为早上严重晚上轻微的变化规律，春季和
秋季也是抑郁症高发的季节。”张欣说，许多抑郁症患者每天清晨时心境特别恶劣，痛
苦不堪，不少病人在此时常有自杀的念头。到下午三四点以后，患者的心境逐渐好转，
但是到了第二天早晨又会陷入病态的煎熬。
那么抑郁症患者都有哪些表现呢？西安市精神卫生中心心理治疗师吴靖萱告诉记者
，抑郁症患者首先是经常失眠，精神状态不好。其次是消极悲观，对任何事情都没有兴
趣。患者常常闭门独居，不喜欢出行。再次就是自我评价低。认为自己什么都不行，一
无是处。“经常伴有自责、内疚、无用感、无价值感等，长期处于这种思想中，患者就
容易产生轻生的念头。”吴靖萱说。
原因
与自身、家庭、成长环境有关
7月3日，西安财经学院一名22岁女大学生王某在宿舍内自缢身亡。据学校通报，这
名女生父亲早年去世，2015年母亲也因故去世，双重打击下女生患上抑郁症。因无法继
续学业，2015年9月，请假休学一年，事发时仍在休学期间。王某的遭遇令人扼腕。7月
4日，《北京青年报》刊发一篇报道，显示北京一所重点大学有40人被确诊为抑郁症，
约占到学校心理咨询中心访问量的两成。
以大学生为代表的年轻人群体，他们的内心世界应引起更多人的关注。张欣说，平
时接受心理咨询与心理治疗的抑郁症患者各个年龄段都有，小的十二三岁，大的四五十
岁，但是二三十岁的年纪较多，近些年甚至呈上升趋势，“智商高、求胜心强的大学生
，已然成为抑郁症高发人群。”张欣分析，这不仅与学生的家庭、成长环境有关，更与
学生自身有关。
在所有治疗对象中，一名21岁的小伙子留给张欣的印象最深。这名小伙子从小上学
都是住在家里，生活被父母照顾得无微不至，甚至衣服都由父母来洗，然而父母对这名
小伙子的内心世界关心不够，甚至完全不懂。“这个孩子性格内向，可以说没有社交能
力，来西安上大学后，要住集体宿舍，人际关系就出问题了。住宿舍摩擦多，先后换了
很多宿舍，总是相处不融洽，他的情绪也越来越低落，到大三时已经很严重了。”张欣
说，大三暑假，这个男生找到了她，他把自己形容成“像是装在麻袋里”，由于缺少与
人沟通，高中时小伙子就有了抑郁倾向，到了大学与舍友相处不好也没人可说，父母也
不知道，也没有主动关心了解，小伙子缺少倾诉对象，时间长了就抑郁了。
张欣说，大学生群体面临升学、就业、情感等问题较多，这个人群需要更多的关注
和关心。
现状
越优秀的人越易患抑郁症
据了解，西安交大一附院是我省较早开设心理咨询治疗的医院，目前该院成立有精
神心理卫生科，有心理咨询室、心理测查室、心理治疗室。7月6日上午，记者在西安交
大一附院精神心理卫生科看到，上午10点多，前来咨询、就诊的患者已经排起了长队，
上午所有的号已经挂完，而排队的大多是30岁左右及以上人群。一位不愿透露姓名的医
生告诉记者，这些前来咨询治疗精神疾病的患者中抑郁症患者约占四分之一，由于每天
咨询就诊者较多，医生主要以开药为主，心理干预等居次。而在省人民医院心理科，虽
然排队等候的患者不多，但不时有患者进出心理咨询室或心理治疗室。
西安市精神卫生中心心理治疗师吴靖萱告诉记者，由于种种原因，到西安市精神卫
生中心咨询就诊的抑郁症患者不是很多。
针对近些年年轻群体抑郁症患者呈现逐年递增的趋势，目前，我省绝大多数高校和
中小学校都成立有专门的心理咨询服务中心，配有专业的心理老师，免费帮助年轻人解
答各种心理问题。“抑郁症患者不分男女，不管是内向还是外向的人，都会患抑郁症，
越是成绩好、越是优秀的人越容易患抑郁症。”张欣说。
36岁的王井（化名）是一名区级党委机关公务员，也是一名抑郁症患者。他工作已
12年，目前职级是副主任科员。“我们经常加班，有时刚下班到家就接到电话，回到办
公室连夜赶材料，周末能休息一天就很不错了，”时间长了，想不开了，越想越郁闷。
后来经过简单咨询，他确定自己患上了轻度抑郁症。
“避免患上抑郁症，其实敞开心扉最为关键。”但像王井这样能敞开心扉的公务员
并不多，从事8年专业心理咨询心理治疗的张欣说，她至今还没有遇到过一例领导干部
咨询或治疗抑郁症的。
治疗
需要亲人
更多的理解和关心
“目前很多人在心理健康的认知上还有一些误区，对有心理疾病的人甚至多报以冷
漠，认为心理有问题的人是精神病，这些情况都会造成患者不愿前往医院咨询或就诊。
” 西安交大一附院精神心理卫生科高成阁说，心理健康知识在国内普及率还比较低，
人们对心理疾病的认知度也不高，往往是那些症状最严重的患者才想起到专业的医疗机
构就医，心理疾病的预防或早期咨询诊断也很少。
张欣告诉记者，目前医学界对抑郁症的认知是生物、心理和社会诸因素共同作用的
结果，甚至还有遗传因素。药物治疗仍然是当前抑郁症治疗的主要手段，而治疗抑郁症
的药物主要还是起到改善睡眠和舒缓情绪的作用。
张欣说，大量证据显示，药物治疗和心理治疗联合方式可以更好地改善抑郁症状，
是一种新趋势。早期通过药物治疗改善患者睡眠，缓解抑郁、焦虑情绪，后期实施心理
治疗，提高患者对自我的认识与理解，从而改善患者抑郁状态。“心理治疗效果受患者
个体因素影响较大，而且心理治疗更强调个案化，像精神分析、家庭治疗以及人际关系
治疗抑郁症都有一定的效果。亲人对抑郁症患者越能理解和关心，患者症状改善更快而
且维持疗效越好。”
预防
面对精神刺激
积极寻求外界帮助
其实，抑郁症不仅是可以治愈的，也是可以预防的。如何预防患上抑郁症？作为陕
西大康心理培训学校的专职教师，张欣提醒可以做以下尝试：
培养良好的人格
面对精神刺激积极寻求外界帮助，增强自信心，提高处理繁杂问题的实际技能，这
也是最关键的，避免外界刺激对自己造成严重的心身损害。
交一批好朋友
要多交朋友，把自己置于集体中，从丰富多彩的集体活动中寻求温暖和友谊。不要
整天把自己关在家里，想些不顺心的事。
保持一份好心情
张欣说，忧郁情绪随时都会发生，遇到不愉快的事，多从好的、积极的方面着想，
保持豁达的情怀。学会直率、坦诚，不要过分自责、自卑、自怜。
保持一份好奇心
张欣说，广泛的兴趣是抑郁症的“救生圈”，当一个人的人生只有一种选择的时候
，他的快乐也只能是单向选择，这种快乐也是不稳定的，应该借助多种方式调节释放自
己。（首席记者 张志杰）
转自澳洲东方传媒网　http://2ornews.com/Technology/medical/37871
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r*t
4 楼
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: thinknet (我是云), 信区: Military
标 题: 号外：NASA发现新细菌的DNA由砷构成
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Dec 2 12:35:49 2010, 美东)
NASA将公布新生命 推翻现有生物学理论
生物学, NASA, 生命, 理论, 公布
本帖最后由 deam 于 2010-12-2 22:44 编辑
驱动之家[原创] 作者：永辉 编辑：永辉　2010-12-02 22:37:55
美国国家航空航天局(NASA)官网11月29日发布消息称，将于当地时间12月2日下午2点(
北京时间3日凌晨3点左右)在其华盛顿总部演播大厅召开新闻发布会，内容将涉及NASA
在生物学方面的一些新发现。
现在距离发布会还有几个小时的时间，已经有媒体提前曝光了NASA发布会的内容，他们
发现了一个全新的生命形态，与地球上现有的任何生物都不一样，这足以推翻现有的所
有生物学教科书和基本理论。
在发布会中，NASA科学家Felisa Wolfe Simon将会宣布他们已经发现了一种完全陌生的
新细菌，其NDA结构与目前所有已知生物完全不同。这种细菌的DNA由砷构成，而不是生
物学普遍认为的磷元素。
现有生物学认为，地球上所有的生命都拥有六种基本元素：碳、氢、氮、氧、磷、硫，
无论是微生物还是大型生物都是这样，所有DNA都由磷构成、由氨基酸构成蛋白质。
NASA的实验室中一直进行着异类生命的实验，他们几年前的报告指出会存在完全不同于
现有已知生物新的生命，比如不需要碳元素而是使用硅元素作为基本构成，DNA也不适
用磷元素而是由砷元素组成。
现在这一理论得到了大自然的证实，在美国加利福尼亚州有一个有毒的湖泊，名为莫诺
湖，该湖是美国盐度最高的琥珀，PH值达到10以上。该湖里面含有大量的砷元素，NASA
的新发现就是该湖中存在的一种基于砷元素的细菌。
这一新发现对于了解生命存在历史和探寻其他星球新生命具有重大的意义，足以改变一
切已知的生物学理论。
http://news.mydrivers.com/1/181/181089.htm
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n*a
5 楼
好看哈，等下文
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r*t
6 楼
大家有什么看法？
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l*t
7 楼
感觉很悲催。你大老板怎么老是让你干开人的事，还都是开干部。

【在 F********r 的大作中提到】
: 脑白金转到我手下后态度也是一如既往的蛮横，而且牢骚更加直白。他原来就是主管级
: 别的，后来因为特殊任务丢了职位而汇报到另外个主管手下。现在就更恶心了，他得汇
: 报到一个同是高级经理的人，而且这个人比他小20多岁，而且还是一个外国人。我只好
: 安抚军心，跟他说，我并不是造成这个情况的人，我也理解他的思想状态。不过，既然
: 公司做了这样的按排，我们还是得公事公办。与此同时，我也和大老板和人事部副总裁
: 商量怎么处理脑白金。人事部副总裁的意识很简单，脑白金不好惹，也不好管。交给我
: ，就是要看看我怎么处理，有没有领导艺术。大老板的意识则是因人而易，充分挖掘脑
: 白金的技术背景和知识。当然了，我感谢大老板和人事部副总裁对我的信任，同时也知
: 道，我老板这招也很狠。首先，脑白金转到我手下，我并没有得到提拔；再次，脑白金
: 比较难对付，会是我的心头病；最后，如果要开掉脑白金，也是我下狠手而不是他做的
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p*n
8 楼
唯一的想法是，如果这是真的，怎么会轮到NASA那帮笨蛋来发现？
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c*2
9 楼

re

【在 l*****t 的大作中提到】
: 感觉很悲催。你大老板怎么老是让你干开人的事，还都是开干部。
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s*y
10 楼
等正式发表了再说。
弄不好其实只是一个能在高浓度Arsenic 里面生长的细菌，那就没有什么意思了

NASA

【在 r*****t 的大作中提到】
: 大家有什么看法？
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F*r
11 楼
大老板是欧洲移民二代。虽然嘴上F炸弹横飞，但是开人却比较手软。我文章里提到的
老舅就是他保护的。所以那些能力不行的人都陆陆续续跑到老舅手下。黑客，脑白金，
麦克（我文章中没有提到，但是也在PIP了）以及后来的老妞都去了老舅那里。在我们
关闭新泽西的一个办公室时，大老板也保护了很多人。结果为了此事，他和人事部副总
裁闹翻了。原来他俩像哥们似的，大家都知道他俩关系铁。
所以拆分老舅的部门就是要干掉老舅和他手下的脑白金，黑客，麦克。脑白金是第一个
目标，结果给我保下来了，因为他还是有点货的人。但是黑客实在太差，保不住就给开
了。因为这事，还有其他原因，大老板真正要开的只有老妞。
老舅还在，汇报到我老板那里。我老板不敢下手开人，最近一直在说把老舅转到我手下
，都被我拒绝了。我知道人事部副总裁一直眼盯着老舅呢。所以总体看起来，真正要杀
人的是人事部副总裁，而不是我大老板。不过在过去的4-5个月，大老板也出了些问题
。我也在尽量帮助他。这些故事以后再慢慢讲。

【在 l*****t 的大作中提到】
: 感觉很悲催。你大老板怎么老是让你干开人的事，还都是开干部。
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h*n
12 楼
呆会谁看了贴个链接吧
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t*n
13 楼
我也觉得挺纳闷的。lz和大宅门的主角一样的，一个又一个麻烦接连不断。除了开人就
是开人。这是小说还是啥的？

【在 l*****t 的大作中提到】
: 感觉很悲催。你大老板怎么老是让你干开人的事，还都是开干部。
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T*t
14 楼
http://www.huffingtonpost.com/2010/12/02/nasa-could-announce-arsenic-eating-bacteria_n_790954.html
WASHINGTON — The discovery of a strange bacteria that can use arsenic as
one of its nutrients widens the scope for finding new forms of life on Earth
and possibly beyond.
While researchers discovered the unusual bacteria here on Earth, they say it
shows that life has possibilities beyond the major elements that have been
considered essential.
"This organism has dual capability. It can grow with either phosphorous or
arsenic. That makes it very peculiar, though it falls short of being some
form of truly 'alien' life," commented Paul C. W. Davies of Arizona State
University, a co-author of the report appearing in Thursday's online edition
of the journal Science.
Six major elements have long been considered essential for life – carbon,
hydrogen, nitrogen, oxygen, phosphorus and sulfur.
But the researchers found that the bacteria, discovered in Mono Lake, Calif.
, is able to continue to grow after substituting arsenic for phosphorous.
"It makes you wonder what else is possible," said Ariel D. Anbar of Arizona
State University, a co-author of the report.
The find is important in the search for life beyond Earth because
researchers need to be able to recognize life, to know what life looks like,
Anbar said.
The study focuses on a microbe found on Earth. However, the announcement of
a news conference to discuss it, which did not disclose details of the find,
generated widespread speculation on the Internet that the report would
disclose the discovery of extraterrestrial life. It didn't.
The discovery "does show that in other planetary environments organisms
might be able to use other elements to drive biochemistry and that the '
standard' set of elements we think are absolutely necessary for life might
not be so fixed," commented Charles Cockell, professor at the Planetary and
Space Sciences Research Institute, Open University, in Milton Keynes, United
Kingdom. Cockell was not part of the research team.
Story continues below
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"This work is novel because it shows the substitution of one element for
another in fundamental biochemistry and biochemical structure," added
Cockell.
It wasn't a chance discovery.
Felisa Wolfe-Simon of NASA's Astrobiology Institute, who led the study,
targeted Mono Lake because it has high arsenic levels.
Arsenic and phosphorous are chemically similar, so she speculated that a
microbe exposed to both might be able to substitute one for the other.
"Arsenic is toxic mainly because its chemical behavior is so similar to that
of phosphorus. As a result, organisms have a hard time telling these
elements apart. But arsenic is different enough that it doesn't work as well
as phosphorus, so it gets in there and sort of gums up the works of our
biochemical machinery," explained Anbar.
The researchers collected the bacteria known as GFAJ-1 and exposed it to
increasing concentrations of arsenic, which it was able to adapt to and grow.
The microbe does grow better on phosphorous, but showing that it can live
with arsenic instead raises the possibility that a life form using arsenic
could occur naturally, either elsewhere on Earth or on another planet or
moon where arsenic is more common.
Jamie S. Foster, an assistant professor of microbiology at the University of
Florida, said the idea that arsenic could be substituted for phosphorous
isn't new, but there has never been example where it was shown to work.
Arsenic was more common in the early times on Earth, she said, so
researchers have speculated that early life forms might have used it.
"It does suggest that that there could be other ways to form life, not just
how life formed on early Earth," said Foster, who was not part of Wolfe-
Simon's research team.
The research was supported by NASA, the Department of Energy and the
National Institutes of Health.
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l*t
15 楼
但是开人都是因为招人不好吧，大老板都怎么招人的，最后还不好好总结要自己手下的
手下的给擦屁股。
读你以前的帖子，总觉得你老板阴，大老板到不错。读到现在，我觉得最应该被开的是
你的大老板呀。

【在 F********r 的大作中提到】
: 大老板是欧洲移民二代。虽然嘴上F炸弹横飞，但是开人却比较手软。我文章里提到的
: 老舅就是他保护的。所以那些能力不行的人都陆陆续续跑到老舅手下。黑客，脑白金，
: 麦克（我文章中没有提到，但是也在PIP了）以及后来的老妞都去了老舅那里。在我们
: 关闭新泽西的一个办公室时，大老板也保护了很多人。结果为了此事，他和人事部副总
: 裁闹翻了。原来他俩像哥们似的，大家都知道他俩关系铁。
: 所以拆分老舅的部门就是要干掉老舅和他手下的脑白金，黑客，麦克。脑白金是第一个
: 目标，结果给我保下来了，因为他还是有点货的人。但是黑客实在太差，保不住就给开
: 了。因为这事，还有其他原因，大老板真正要开的只有老妞。
: 老舅还在，汇报到我老板那里。我老板不敢下手开人，最近一直在说把老舅转到我手下
: ，都被我拒绝了。我知道人事部副总裁一直眼盯着老舅呢。所以总体看起来，真正要杀
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p*n
16 楼
很可能就是能利用一些砷，没说能完全不用磷...
这TMD就是美国赵本山

Earth
it
been

【在 T**********t 的大作中提到】
: http://www.huffingtonpost.com/2010/12/02/nasa-could-announce-arsenic-eating-bacteria_n_790954.html
: WASHINGTON — The discovery of a strange bacteria that can use arsenic as
: one of its nutrients widens the scope for finding new forms of life on Earth
: and possibly beyond.
: While researchers discovered the unusual bacteria here on Earth, they say it
: shows that life has possibilities beyond the major elements that have been
: considered essential.
: "This organism has dual capability. It can grow with either phosphorous or
: arsenic. That makes it very peculiar, though it falls short of being some
: form of truly 'alien' life," commented Paul C. W. Davies of Arizona State
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s*h
17 楼
感觉楼主啃了一个又一个硬骨头，一步一步走过来真不容易啊，仰望一下
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s*y
18 楼
正在看。
她们认为该细菌仍然是用DNA　system, 唯一不同的是磷被砷代替了
因为：
１。该细菌可以在没有磷的培养液里生长
２。提取出来的DNA含有大量的砷
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s*y
19 楼
这样的话其实就没有那么有意思了。
因为这个可以是adaptive evolution, 因为砷和磷的化学性质非常像，
细菌在缺乏磷的环境里，被迫使用砷，这个并不是不可想象的。
如果他们发现了一个全新的遗传系统，比方说用的根本就不是DNA/RNA
这种东西，才有足够的意义。
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s*y
20 楼
当然，这个发现还是很有意思的。
很多科幻小说提出在某些星球上因为缺乏碳和磷，生物形式是由硅和砷组成的。
这个发现提供了一个直接实例

【在 s******y 的大作中提到】
: 这样的话其实就没有那么有意思了。
: 因为这个可以是adaptive evolution, 因为砷和磷的化学性质非常像，
: 细菌在缺乏磷的环境里，被迫使用砷，这个并不是不可想象的。
: 如果他们发现了一个全新的遗传系统，比方说用的根本就不是DNA/RNA
: 这种东西，才有足够的意义。
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h*o
21 楼
要能找到用硅来做dna/rna骨架的，估计也够酷的

【在 s******y 的大作中提到】
: 这样的话其实就没有那么有意思了。
: 因为这个可以是adaptive evolution, 因为砷和磷的化学性质非常像，
: 细菌在缺乏磷的环境里，被迫使用砷，这个并不是不可想象的。
: 如果他们发现了一个全新的遗传系统，比方说用的根本就不是DNA/RNA
: 这种东西，才有足够的意义。
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M*n
22 楼
Where is Craig Venter?
丫找怪细菌那么多年了，居然没有发现这个？
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s*y
23 楼
为什么这么讲啊？
硅的坏处是多联硅不稳定。
但是在某些独特的溶剂，和特殊的氧化／还原环境里面，
我觉得应该是可以用硅来做骨架的

【在 h*****o 的大作中提到】
: 要能找到用硅来做dna/rna骨架的，估计也够酷的
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y*i
25 楼
我觉得这已经很有意思了。完全不同的DNA和RNA! 我觉得这是炸药奖级别的发现。

【在 s******y 的大作中提到】
: 这样的话其实就没有那么有意思了。
: 因为这个可以是adaptive evolution, 因为砷和磷的化学性质非常像，
: 细菌在缺乏磷的环境里，被迫使用砷，这个并不是不可想象的。
: 如果他们发现了一个全新的遗传系统，比方说用的根本就不是DNA/RNA
: 这种东西，才有足够的意义。
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s*y
26 楼
我怎么就没有那么激动呢？。。。
因为我觉得这个本来就是很有可能的呀。
如果需要的话，我甚至可以去合成一个给你看：）

【在 y***i 的大作中提到】
: 我觉得这已经很有意思了。完全不同的DNA和RNA! 我觉得这是炸药奖级别的发现。
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y*i
27 楼
我觉得你真要人工合成一个，就算是依然用砷替换磷，也有可能分享炸药奖 :)

【在 s******y 的大作中提到】
: 我怎么就没有那么激动呢？。。。
: 因为我觉得这个本来就是很有可能的呀。
: 如果需要的话，我甚至可以去合成一个给你看：）
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r*t
28 楼
够炸药奖的平均水平了
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s*g
29 楼
太牛了。如果DNA或者RNA上的磷酸或者ATP之类上面的磷酸在这种细菌里都被砷取代了
的话，简直就是外星生命了。
说不定以后还真能拿硅，砷之类的东西合成DNA
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l*a
30 楼
你说的容易，你去进化或者发现一个试试。我个人觉得这个发现意义很大，再研究10年
，够得上炸药
奖提名了。

【在 s******y 的大作中提到】
: 这样的话其实就没有那么有意思了。
: 因为这个可以是adaptive evolution, 因为砷和磷的化学性质非常像，
: 细菌在缺乏磷的环境里，被迫使用砷，这个并不是不可想象的。
: 如果他们发现了一个全新的遗传系统，比方说用的根本就不是DNA/RNA
: 这种东西，才有足够的意义。
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h*n
31 楼
C,N,P,O的体系跟Si,As,S的化学差很多啊. 软硬完差很多, 电负性有差别.
把大多数的蛋白, DNA,RNA的C,P换成Si, As, 化学和物理性质差很多.
我以前看过一个很傻的科幻片, 讲的就是一种外星生物在地球上疯狂繁殖, 那个生物就是Si, As, S的体系.

【在 s******y 的大作中提到】
: 这样的话其实就没有那么有意思了。
: 因为这个可以是adaptive evolution, 因为砷和磷的化学性质非常像，
: 细菌在缺乏磷的环境里，被迫使用砷，这个并不是不可想象的。
: 如果他们发现了一个全新的遗传系统，比方说用的根本就不是DNA/RNA
: 这种东西，才有足够的意义。
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s*y
32 楼
C和Si这两个差的比较远。
但是As 和P其实差的不是那么远。实际上，砷的毒性就是因为它和磷相差的太小，
容易代替磷形成analog。但是我们的细胞的酶又不会处理砷。
相对而言，硫，硅的毒性就没有那么大，原因之一就是因为他们不太容易形成
足够像的analog。

就是Si, As, S的体系.

【在 h********n 的大作中提到】
: C,N,P,O的体系跟Si,As,S的化学差很多啊. 软硬完差很多, 电负性有差别.
: 把大多数的蛋白, DNA,RNA的C,P换成Si, As, 化学和物理性质差很多.
: 我以前看过一个很傻的科幻片, 讲的就是一种外星生物在地球上疯狂繁殖, 那个生物就是Si, As, S的体系.
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s*y
33 楼
我也觉得这个东西很重要，因为毕竟是第一个实例。
但不知道怎么回事就是觉得不太激动。可能胃口被吊得太高了，所以就失望了

【在 l******a 的大作中提到】
: 你说的容易，你去进化或者发现一个试试。我个人觉得这个发现意义很大，再研究10年
: ，够得上炸药
: 奖提名了。
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W*C
34 楼

怎么会没有意义，　比如根据这个　在一个没有磷元素的星球上仍可能有生命

【在 s******y 的大作中提到】
: 这样的话其实就没有那么有意思了。
: 因为这个可以是adaptive evolution, 因为砷和磷的化学性质非常像，
: 细菌在缺乏磷的环境里，被迫使用砷，这个并不是不可想象的。
: 如果他们发现了一个全新的遗传系统，比方说用的根本就不是DNA/RNA
: 这种东西，才有足够的意义。
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W*C
36 楼
他们主页上好多天前就说有重大消息要公布，　还有人推测是发现了外星人。。。。
这个发现很容易检测，　应该靠谱，　可以说是ＤＮＡ发现以来最大的突破了
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s*y
37 楼
可是这里有一个问题啊。因为这个细菌貌似是进行了adaptive evolution 才
从磷系统过渡到了砷系统的。因为它用的还是我们常见的DNA系统。
那么这里就涉及一个问题：假如一开始就没有磷的话，这个生命能否从头组建起来？

【在 W****C 的大作中提到】
: 他们主页上好多天前就说有重大消息要公布，　还有人推测是发现了外星人。。。。
: 这个发现很容易检测，　应该靠谱，　可以说是ＤＮＡ发现以来最大的突破了
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T*t
38 楼
这个问题至少在地球上是找不到答案的吧，因为前提就不存在。。。但是这个细菌的发
现至少说明有这个可能性，我觉得已经是很groundbreaking的发现了。

【在 s******y 的大作中提到】
: 可是这里有一个问题啊。因为这个细菌貌似是进行了adaptive evolution 才
: 从磷系统过渡到了砷系统的。因为它用的还是我们常见的DNA系统。
: 那么这里就涉及一个问题：假如一开始就没有磷的话，这个生命能否从头组建起来？
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W*C
39 楼

貌似它也能从砷系统穿越回磷系统　　鸡生蛋蛋生鸡？

【在 s******y 的大作中提到】
: 可是这里有一个问题啊。因为这个细菌貌似是进行了adaptive evolution 才
: 从磷系统过渡到了砷系统的。因为它用的还是我们常见的DNA系统。
: 那么这里就涉及一个问题：假如一开始就没有磷的话，这个生命能否从头组建起来？
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n*k
40 楼
what r u still arguing? no matter whatever way it goes through, if they have
shown the As completely replace the Pi in the DNA/RNA, that's huge/
milestone in the textbook unless someone else has demonstrated that before..
.talking about imagination or in fiction, I think many of us have been
wondering why life has to be made of those elements...why not even Fe or
whatever...Why there has to be water or whatever...the alien could be made
of metals and live on Metals as well, who knows...I am crazy now...

【在 s******y 的大作中提到】
: 可是这里有一个问题啊。因为这个细菌貌似是进行了adaptive evolution 才
: 从磷系统过渡到了砷系统的。因为它用的还是我们常见的DNA系统。
: 那么这里就涉及一个问题：假如一开始就没有磷的话，这个生命能否从头组建起来？
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c*n
41 楼
虽然在宇航员下岗的背景下NASA他家压力真不小，也就不怕将来发现有错贻笑大方
现在science上的这篇文章
http://www.sciencemag.org/content/early/2010/12/0/science.1197258.abstract
看着很有道理，虽然机理不明，但是的确证实了砷对磷的替代。不过这真是有点太新奇
了，类似于半个世纪前的米勒实验，好像也是发在science上的。
有同学提议化学合成DNA类似物，其实做这方面生化研究的已经好几十年了，大陆出来
的做的不错的我知道GSU的Zhen Huang就做了不少在DNA里用硒取代氧的工作来方便解晶
体结构。但自下而上的组装还没有听说有人去尝试，因为基本上是没有思路的，除非你
把前一阵子Craig Venter那个大忽悠的成果也算进去。
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W*C
42 楼
用这个做材料，　应该很快会有比较磷ＤＮＡ和砷ＤＮＡ结构功能的ｐａｐｅｒ出来？
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s*y
43 楼
的确是非常重要的一个发现。
我就是被NASA的故作神秘把胃口调得太高了。所以才会失望：）
这个发现的确是会改变教科书，我也说了，虽然科幻家们早就设想过了，但是
找到实例还是第一次：）
哎，都怪NASA的公关部门！

have
..

【在 n********k 的大作中提到】
: what r u still arguing? no matter whatever way it goes through, if they have
: shown the As completely replace the Pi in the DNA/RNA, that's huge/
: milestone in the textbook unless someone else has demonstrated that before..
: .talking about imagination or in fiction, I think many of us have been
: wondering why life has to be made of those elements...why not even Fe or
: whatever...Why there has to be water or whatever...the alien could be made
: of metals and live on Metals as well, who knows...I am crazy now...
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s*y
44 楼
另外啊，某些过渡性金属，还真的说不定可以作为life form basis,
因为它们可以形成稳定多键复合物。

have
..

【在 n********k 的大作中提到】
: what r u still arguing? no matter whatever way it goes through, if they have
: shown the As completely replace the Pi in the DNA/RNA, that's huge/
: milestone in the textbook unless someone else has demonstrated that before..
: .talking about imagination or in fiction, I think many of us have been
: wondering why life has to be made of those elements...why not even Fe or
: whatever...Why there has to be water or whatever...the alien could be made
: of metals and live on Metals as well, who knows...I am crazy now...
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a*k
45 楼
我觉得显然很多结构的实验室都在加班加点，这个太容易解了，而且肯定是大paper

【在 W****C 的大作中提到】
: 用这个做材料，　应该很快会有比较磷ＤＮＡ和砷ＤＮＡ结构功能的ｐａｐｅｒ出来？
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O*e
46 楼
NASA最近在拼命制造新闻争取民众同情，以便减少funding被砍的幅度

【在 p****n 的大作中提到】
: 唯一的想法是，如果这是真的，怎么会轮到NASA那帮笨蛋来发现？
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W*C
47 楼
确实让对自然界还保持着好奇心的人们ｈｉｇｈ了一把。。。。ｈｉｇｈ完了，　还是
回去做自己枯燥的实验啦。。。。
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s*y
48 楼
那就看谁手快啦。
我觉得NASA的那些人如果不傻的话肯定已经在做这个了

【在 a********k 的大作中提到】
: 我觉得显然很多结构的实验室都在加班加点，这个太容易解了，而且肯定是大paper
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W*C
49 楼

不是谁想要这个材料就能拿到吧
十一宫估计拿不到，，，

【在 a********k 的大作中提到】
: 我觉得显然很多结构的实验室都在加班加点，这个太容易解了，而且肯定是大paper
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T*t
50 楼
如果是那样，那我们可以不用担心外星生物入侵地球了，因为地球对他们来说就是个穷
山恶水不适合生存的星球嘛。:)
不过我能理解你的失望，因为这个生物是adaptive evolution的产物，而不是完全
start from scratch构建了一整套与地球生物截然不同的biochemistry machinery。还
不能算是严格意义上的alternative life form。本来我还想如果不依赖磷了，可能连
遗传物质都不是双螺旋结构了呢，可惜只是把DNA里的磷替换一下而已。不过那种形式
的生命存在，可能只能在地球之外寻找吧。

【在 s******y 的大作中提到】
: 另外啊，某些过渡性金属，还真的说不定可以作为life form basis,
: 因为它们可以形成稳定多键复合物。
:
: have
: ..
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s*y
51 楼
握手握手，终于找到一个和我感受一样的人了：）
另外啊，我赞同你的那个关于外星人的假说，
比方说，弄不好他们其实是还原性系统，而不是我们这种
氧化系统。氧气对他们根本没有用，反而是剧毒气体：）

【在 T**********t 的大作中提到】
: 如果是那样，那我们可以不用担心外星生物入侵地球了，因为地球对他们来说就是个穷
: 山恶水不适合生存的星球嘛。:)
: 不过我能理解你的失望，因为这个生物是adaptive evolution的产物，而不是完全
: start from scratch构建了一整套与地球生物截然不同的biochemistry machinery。还
: 不能算是严格意义上的alternative life form。本来我还想如果不依赖磷了，可能连
: 遗传物质都不是双螺旋结构了呢，可惜只是把DNA里的磷替换一下而已。不过那种形式
: 的生命存在，可能只能在地球之外寻找吧。
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s*n
52 楼
不能说就一定是adaptive evolution吧，搞不好还是反过来的，从砷到磷呢，那意义就
更大了。等有下一步的实验结果才能说吧。

【在 T**********t 的大作中提到】
: 如果是那样，那我们可以不用担心外星生物入侵地球了，因为地球对他们来说就是个穷
: 山恶水不适合生存的星球嘛。:)
: 不过我能理解你的失望，因为这个生物是adaptive evolution的产物，而不是完全
: start from scratch构建了一整套与地球生物截然不同的biochemistry machinery。还
: 不能算是严格意义上的alternative life form。本来我还想如果不依赖磷了，可能连
: 遗传物质都不是双螺旋结构了呢，可惜只是把DNA里的磷替换一下而已。不过那种形式
: 的生命存在，可能只能在地球之外寻找吧。
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O*e
53 楼
俺更夸张，连失望都没有
这东西，更象是个政治新闻。俺等看了它们的paper再仔细感觉吧。

【在 T**********t 的大作中提到】
: 如果是那样，那我们可以不用担心外星生物入侵地球了，因为地球对他们来说就是个穷
: 山恶水不适合生存的星球嘛。:)
: 不过我能理解你的失望，因为这个生物是adaptive evolution的产物，而不是完全
: start from scratch构建了一整套与地球生物截然不同的biochemistry machinery。还
: 不能算是严格意义上的alternative life form。本来我还想如果不依赖磷了，可能连
: 遗传物质都不是双螺旋结构了呢，可惜只是把DNA里的磷替换一下而已。不过那种形式
: 的生命存在，可能只能在地球之外寻找吧。
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T*t
54 楼
这个，反过来的可能性是有的，不过觉得发生概率实在太小了。：）不管是哪种可能性
，还是没有摆脱DNA双螺旋的窠臼嘛，所以没那么震撼了。我昨天看到那个帖子，第一
反应就是要是不用磷，那遗传物质可能就不是DNA了，光这一下就够拿好几次炸药奖了。

【在 s********n 的大作中提到】
: 不能说就一定是adaptive evolution吧，搞不好还是反过来的，从砷到磷呢，那意义就
: 更大了。等有下一步的实验结果才能说吧。
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s*t
55 楼
interesting finding if it's indeed the case.
Can anyone send me a copy of science paper, please?
s******[email protected]
thanks.
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s*n
56 楼
但我感觉可能性不小，说不定是化石呢。就算DNA差不多，但磷在其他方面也有很多用
途，最典型就是能量ATP了，还有N多的修饰，搞不好还真不一样了。

了。

【在 T**********t 的大作中提到】
: 这个，反过来的可能性是有的，不过觉得发生概率实在太小了。：）不管是哪种可能性
: ，还是没有摆脱DNA双螺旋的窠臼嘛，所以没那么震撼了。我昨天看到那个帖子，第一
: 反应就是要是不用磷，那遗传物质可能就不是DNA了，光这一下就够拿好几次炸药奖了。
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f*u
57 楼
我特意去看了看NASA发布会的直播，对于是不是adaptive evolution，大家还有疑问。
有个提问比较专业，问那个作者在进化上As是什么时候取代P的，作者答曰不知。
还有人说可能在RNA世界的时候分别有两套生命系统，一套用P，一套用As，
不过这个好像不是很靠普的样子。
嘉宾里还有个化学家，也是NASA的astrobiology大团队的一部分，
他还不是特别的convinced，他说从化学上说As太过活跃，如果完全是As作为DNA骨架，
那么这个骨架是很容易断裂的，除非这个菌有很强大的DNA修复能力，
但即便如此细菌去修复这些断裂也要花掉很多能量，他觉得不可思议。
另外一种解释是有其他的东西比如说蛋白什么的来stabilize DNA的骨架，
但是他说你在提DNA的时候蛋白都会被除掉，文章作者说胶上的DNA的确有断裂，
但化学家觉得DNA的断裂不够多，从化学上他不太相信完全是As的骨架只有这么点断裂。
但是他说，As过于活跃是在常温下，但是他觉得如果是在某些超低温的情况下，
比如他说了一个不知道是木卫几还是土卫几的单词，我天文方面词汇量有限，
只知道好像是某个大行星的卫星，具体不知道是哪一个。
他说在那里温度零下一百多还是更低，As可能是个很好的选择，而且如果那里有生命，
他们还需要想办法提升As的活性，因为温度实在太低了。
文章的作者说他们可以在实验室纯培养细菌，一直到稳定期，他们算过，
如果完全是P作为DNA的骨架，是不可能的，因为P太少了，所以As肯定是在里面的。
化学家说他觉得应该有一个As和P的同位素标记实验，做一系列不同的As和P的比例，
看细菌到底喜欢哪一个。
我个人觉得如果可以在实验室培养细菌，那么后续研究就很容易了。
文章作者也说她们又一篇文章二月份要投，里面是一些更详细的证据，
比如如果只给这些细菌P会怎么样之类的。
她说了她知道一些结果，但是新闻发布会上是不能说unpublished结果的。
她们应该也在跟别人合作解这个新DNA的结构。
个人觉得既使这个是adaptive evolution，也够神的，居然这么fundamental的都能变。
发布会里有嘉宾提到了DNA复制的过程要用dNTP，其中alpha P会留在DNA上，
如果这个新DNA上面是As的话，那么也就是说底物也要改，
在alpha的位置上会变成As，那么相应的在dNTP的合成途径上的酶都要改，
然后转录调控什么的那些酶，包括RNA polymerase，都需要相应的改变。
另外一个有意思的问题时RNA的骨架是什么，如果也是As，那么连ribosome等等都要变。
这里的每一个问题都可能是一片CNS，我很快要毕业了，有点心动，哈哈。
当时一边做实验一边听的发布会，记得的就这些了，还没去看文章。
个人觉得这个发现还是挺颠覆传统的，要说炸药将应该是可以得的。
另外我觉得文章的那个第一兼通讯作者很会和媒体打交道，公众可能很喜欢她，
但是作为专业人士，我总觉得有点不舒服，我更喜欢那个化学家，他更像个科学家。
不过不可否认，那个文章作者应该是比较善于公关拉钱的，毕竟议员们都是外行。
我建议有空的都去看看这个发布会，就一个小时，还是很长见识的。

【在 T**********t 的大作中提到】
: 如果是那样，那我们可以不用担心外星生物入侵地球了，因为地球对他们来说就是个穷
: 山恶水不适合生存的星球嘛。:)
: 不过我能理解你的失望，因为这个生物是adaptive evolution的产物，而不是完全
: start from scratch构建了一整套与地球生物截然不同的biochemistry machinery。还
: 不能算是严格意义上的alternative life form。本来我还想如果不依赖磷了，可能连
: 遗传物质都不是双螺旋结构了呢，可惜只是把DNA里的磷替换一下而已。不过那种形式
: 的生命存在，可能只能在地球之外寻找吧。
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s*g
58 楼
I send you the paper.

【在 s****t 的大作中提到】
: interesting finding if it's indeed the case.
: Can anyone send me a copy of science paper, please?
: s******[email protected]
: thanks.
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y*i
59 楼
Nice.

【在 f**u 的大作中提到】
: 我特意去看了看NASA发布会的直播，对于是不是adaptive evolution，大家还有疑问。
: 有个提问比较专业，问那个作者在进化上As是什么时候取代P的，作者答曰不知。
: 还有人说可能在RNA世界的时候分别有两套生命系统，一套用P，一套用As，
: 不过这个好像不是很靠普的样子。
: 嘉宾里还有个化学家，也是NASA的astrobiology大团队的一部分，
: 他还不是特别的convinced，他说从化学上说As太过活跃，如果完全是As作为DNA骨架，
: 那么这个骨架是很容易断裂的，除非这个菌有很强大的DNA修复能力，
: 但即便如此细菌去修复这些断裂也要花掉很多能量，他觉得不可思议。
: 另外一种解释是有其他的东西比如说蛋白什么的来stabilize DNA的骨架，
: 但是他说你在提DNA的时候蛋白都会被除掉，文章作者说胶上的DNA的确有断裂，
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s*y
60 楼
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C*e
61 楼
非常感谢lz的分享！
我去下了paper
还没有详细拜读
如果一切是真的，那真的是个breakthrough
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l*d
62 楼
能给NASA video的一个连接吗？谢谢。
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j*3
63 楼
哪里看直播啊？link? 谢谢

【在 f**u 的大作中提到】
: 我特意去看了看NASA发布会的直播，对于是不是adaptive evolution，大家还有疑问。
: 有个提问比较专业，问那个作者在进化上As是什么时候取代P的，作者答曰不知。
: 还有人说可能在RNA世界的时候分别有两套生命系统，一套用P，一套用As，
: 不过这个好像不是很靠普的样子。
: 嘉宾里还有个化学家，也是NASA的astrobiology大团队的一部分，
: 他还不是特别的convinced，他说从化学上说As太过活跃，如果完全是As作为DNA骨架，
: 那么这个骨架是很容易断裂的，除非这个菌有很强大的DNA修复能力，
: 但即便如此细菌去修复这些断裂也要花掉很多能量，他觉得不可思议。
: 另外一种解释是有其他的东西比如说蛋白什么的来stabilize DNA的骨架，
: 但是他说你在提DNA的时候蛋白都会被除掉，文章作者说胶上的DNA的确有断裂，
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s*n
64 楼
虽然细菌很能适应不同的环境，但这么根本性变化还是可能性很小的。上面的原文就提
出原始的地球环境比较多砷，可能以砷作为基础，然后进化成用磷的生物，如果是的话
这个细菌就可能是化石了，既可以用砷也能用磷。当然一切都需要下一步的研究才能知
道了。

变。
变。

【在 s******y 的大作中提到】

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h*o
65 楼
这个东西有什么比较实际的应用可能吗？
我看大家都激动的在想这个突破要拿诺奖了。当年米勒的氨基酸实验也是概念上的一个
突破吧，可老头子活到九十多岁都没有诺奖。光有突破不够，还得有潜在应用，特别是
这种生命起源相关的领域

【在 f**u 的大作中提到】
: 我特意去看了看NASA发布会的直播，对于是不是adaptive evolution，大家还有疑问。
: 有个提问比较专业，问那个作者在进化上As是什么时候取代P的，作者答曰不知。
: 还有人说可能在RNA世界的时候分别有两套生命系统，一套用P，一套用As，
: 不过这个好像不是很靠普的样子。
: 嘉宾里还有个化学家，也是NASA的astrobiology大团队的一部分，
: 他还不是特别的convinced，他说从化学上说As太过活跃，如果完全是As作为DNA骨架，
: 那么这个骨架是很容易断裂的，除非这个菌有很强大的DNA修复能力，
: 但即便如此细菌去修复这些断裂也要花掉很多能量，他觉得不可思议。
: 另外一种解释是有其他的东西比如说蛋白什么的来stabilize DNA的骨架，
: 但是他说你在提DNA的时候蛋白都会被除掉，文章作者说胶上的DNA的确有断裂，
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s*n
66 楼
还有就是虽然砷和磷看起来相似，但在化学上还是差别非常大的，就像硫和氧，同族但
性质千差万别。
avatar
s*r
67 楼
那是因为诺奖是所谓生理医学奖，关系不是跟大。
但是这可是改变教科书的重大发现，得不得诺奖也无所谓。

这个东西有什么比较实际的应用可能吗？
我看大家都激动的在想这个突破要拿诺奖了。当年米勒的氨基酸实验也是概念上的一个
突破吧，可老头子活到九十多岁都没有诺奖。光有突破不够，还得有潜在应用，特别是
这种生命起源相关的领域

【在 h*****o 的大作中提到】
: 这个东西有什么比较实际的应用可能吗？
: 我看大家都激动的在想这个突破要拿诺奖了。当年米勒的氨基酸实验也是概念上的一个
: 突破吧，可老头子活到九十多岁都没有诺奖。光有突破不够，还得有潜在应用，特别是
: 这种生命起源相关的领域
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f*u
68 楼
我是在NASA的官网上看的直播，那里有个栏目叫做NASATV，
就和一般电视台一样，现在已经在播别的东西了。不知道会不会有重播。
发布会的video好像还没有，youtube上也还没有，可能要等一阵子。

【在 j***3 的大作中提到】
: 哪里看直播啊？link? 谢谢
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f*u
69 楼
的确细菌是很容易进化的，但是通常来说不会涉及到这么根本的东西。
如果你说代谢，那么细菌进化很快，因为细菌可以有无数的方法来从环境获得能量。
如果你说的是外周的结构，细菌也可以进化很快，比如多个鞭毛或者多个capsule什么
的。
但是据我所知有两样东西的进化是很困难的，第一个市中心法则的进化，比如这个发现。
第二个是核心的结构，比如从没有细胞核导有细胞核。
这次发现的是遗传信息的处理过程，也就是最中心的东西发生了改变，
这个还是很不容易的。否则这样的例子会很多很多，也不会这么轰动了。

变。
变。

【在 s******y 的大作中提到】

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t*p
70 楼
如果这是真的，那绝对是惊天地泣鬼神的发现！
我很佩服那些富有想象力和创造性的人。

NASA

【在 r*****t 的大作中提到】
: 够炸药奖的平均水平了
avatar
d*p
71 楼
培养液里没有磷的话，底物磷酸化怎么办？蛋白激酶把身价到底物上去？

【在 s******y 的大作中提到】
: 正在看。
: 她们认为该细菌仍然是用DNA　system, 唯一不同的是磷被砷代替了
: 因为：
: １。该细菌可以在没有磷的培养液里生长
: ２。提取出来的DNA含有大量的砷
avatar
s*n
72 楼
对呀，我刚才也说了，生命有很多过程都需要磷，这些方面也是很大的突破。Genomic
sequence啊，好期待的说...

【在 d**p 的大作中提到】
: 培养液里没有磷的话，底物磷酸化怎么办？蛋白激酶把身价到底物上去？
avatar
s*n
73 楼
Agree，Carl Woese提出三界论也是微生物邻域的划时代突破，没的诺奖，但不影响他
的地位。

【在 s******r 的大作中提到】
: 那是因为诺奖是所谓生理医学奖，关系不是跟大。
: 但是这可是改变教科书的重大发现，得不得诺奖也无所谓。
:
: 这个东西有什么比较实际的应用可能吗？
: 我看大家都激动的在想这个突破要拿诺奖了。当年米勒的氨基酸实验也是概念上的一个
: 突破吧，可老头子活到九十多岁都没有诺奖。光有突破不够，还得有潜在应用，特别是
: 这种生命起源相关的领域
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L*d
74 楼
有意思

【在 f**u 的大作中提到】
: 我特意去看了看NASA发布会的直播，对于是不是adaptive evolution，大家还有疑问。
: 有个提问比较专业，问那个作者在进化上As是什么时候取代P的，作者答曰不知。
: 还有人说可能在RNA世界的时候分别有两套生命系统，一套用P，一套用As，
: 不过这个好像不是很靠普的样子。
: 嘉宾里还有个化学家，也是NASA的astrobiology大团队的一部分，
: 他还不是特别的convinced，他说从化学上说As太过活跃，如果完全是As作为DNA骨架，
: 那么这个骨架是很容易断裂的，除非这个菌有很强大的DNA修复能力，
: 但即便如此细菌去修复这些断裂也要花掉很多能量，他觉得不可思议。
: 另外一种解释是有其他的东西比如说蛋白什么的来stabilize DNA的骨架，
: 但是他说你在提DNA的时候蛋白都会被除掉，文章作者说胶上的DNA的确有断裂，
avatar
P*d
76 楼
哪位懂RNA chemistry，给8一下？砷化RNA对活性有什么影响，像RNase P和ribosome？
谢了！
avatar
s*y
77 楼
既然连DNA 都用砷了，那么那个细菌里面的什么ATP 其实就变成了ATAs
别忘了我们所谓的能量分子大部分都是核酸。

【在 d**p 的大作中提到】
: 培养液里没有磷的话，底物磷酸化怎么办？蛋白激酶把身价到底物上去？
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s*y
78 楼
这个，其实我一向觉得啊，这种对于某些法则的特例啊，其实应该非常多。
我们作为人类，受限于我们自己这个机体的生化限制，所以不太有足够的
机会去看那些奇怪的角落而已。因为那些可能会生存着其他生命形式的地方，
几乎毫无意外的都对我们这种生命形式不利。（这个在进化上非常容易理解）
因此，我们对那些所谓的什么什么法则的推导，几乎无一例外的是从研究和
我们一样机制的机体上得出来的结论。
所以我们对生命形式在根本上的理解，可能一开始就是狭隘的和错误的。
所以我觉得这种例外肯定还有更多的地方有。
那个新闻里面也提到，那个巨毒的湖里，还有藻类生长。这么说来，那些藻类，
如果认真的去看的话，可能也是用砷的。

现。

【在 f**u 的大作中提到】
: 的确细菌是很容易进化的，但是通常来说不会涉及到这么根本的东西。
: 如果你说代谢，那么细菌进化很快，因为细菌可以有无数的方法来从环境获得能量。
: 如果你说的是外周的结构，细菌也可以进化很快，比如多个鞭毛或者多个capsule什么
: 的。
: 但是据我所知有两样东西的进化是很困难的，第一个市中心法则的进化，比如这个发现。
: 第二个是核心的结构，比如从没有细胞核导有细胞核。
: 这次发现的是遗传信息的处理过程，也就是最中心的东西发生了改变，
: 这个还是很不容易的。否则这样的例子会很多很多，也不会这么轰动了。
:
: 变。
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P*d
79 楼
ATAs的能量是更高还是更低？As-RNA是更稳定还是更不稳定？-OH更容易与之反映还是
更不容易反映？唉，什么亲电亲核的，都还给老师了。汗颜。
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s*y
80 楼
能量更高，
在一般的RNA结构下会比较不稳定
反应后生成的 O-As 键貌似不如 O-P 键稳定。

【在 P****d 的大作中提到】
: ATAs的能量是更高还是更低？As-RNA是更稳定还是更不稳定？-OH更容易与之反映还是
: 更不容易反映？唉，什么亲电亲核的，都还给老师了。汗颜。
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o*y
81 楼
我觉得Si更可能，以后可能会研究这个元素

NASA

【在 r*****t 的大作中提到】
: 够炸药奖的平均水平了
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n*k
82 楼
In fact, it opens up tons of questions/opportunity---in term of DNA. RNA and
Protein functions and regulation as well...so a next key question would be
whether it is just an evolution accident or it has wider implication, e.g:
it ever happens in other organism such as human, do As ever get into our DNA
/RNA/protein and play any functional/regulatory roles?
BTW, u are too greedy...if it doesn't need this DNA stuff, it would be an
instant nobel....However, I always think everything is possible, life could
well exist in isoforms other than us, it could be like a coahesive liquid,
or like you said, use reduction, so O2 is toxic...

【在 s******y 的大作中提到】
: 这个，其实我一向觉得啊，这种对于某些法则的特例啊，其实应该非常多。
: 我们作为人类，受限于我们自己这个机体的生化限制，所以不太有足够的
: 机会去看那些奇怪的角落而已。因为那些可能会生存着其他生命形式的地方，
: 几乎毫无意外的都对我们这种生命形式不利。（这个在进化上非常容易理解）
: 因此，我们对那些所谓的什么什么法则的推导，几乎无一例外的是从研究和
: 我们一样机制的机体上得出来的结论。
: 所以我们对生命形式在根本上的理解，可能一开始就是狭隘的和错误的。
: 所以我觉得这种例外肯定还有更多的地方有。
: 那个新闻里面也提到，那个巨毒的湖里，还有藻类生长。这么说来，那些藻类，
: 如果认真的去看的话，可能也是用砷的。
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f*u
83 楼
我也相信例外永远是有的，但是例外的概率却要看你找的是什么的例外。
我想说的只是基本上越根本的东西越不容易被例外，这个我想不同意的人不会太多吧。
之所以说是基本上，是因为这个也是有例外的，比如说sex determination。
sex很重要大家没意见，但是sex determination确有非常diverse。
生物里面永远是有例外的，这是生物学的魅力之一，
但是在这么根本的东西上面例外，的确让我很惊讶。
另外你说的那些藻类，我估计很可能只是能tolerate As，
这个和利用As还是很不一样的。

【在 s******y 的大作中提到】
: 这个，其实我一向觉得啊，这种对于某些法则的特例啊，其实应该非常多。
: 我们作为人类，受限于我们自己这个机体的生化限制，所以不太有足够的
: 机会去看那些奇怪的角落而已。因为那些可能会生存着其他生命形式的地方，
: 几乎毫无意外的都对我们这种生命形式不利。（这个在进化上非常容易理解）
: 因此，我们对那些所谓的什么什么法则的推导，几乎无一例外的是从研究和
: 我们一样机制的机体上得出来的结论。
: 所以我们对生命形式在根本上的理解，可能一开始就是狭隘的和错误的。
: 所以我觉得这种例外肯定还有更多的地方有。
: 那个新闻里面也提到，那个巨毒的湖里，还有藻类生长。这么说来，那些藻类，
: 如果认真的去看的话，可能也是用砷的。
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f*u
84 楼
这个也不一定。
至少我能想到的还有两个可能，
Adenosine-As-P-P，或者Adenosine-As-As-P。
问题更加扑朔迷离了，哈哈。
说实话这里面可做的有意思的问题太多了，
我真得在很serious的考虑要不要做这个方向的postdoc了，
如果以后回中国了，也可以发挥我们祖国地大物博的优势，找找有什么更古怪的冬冬。

【在 s******y 的大作中提到】
: 既然连DNA 都用砷了，那么那个细菌里面的什么ATP 其实就变成了ATAs
: 别忘了我们所谓的能量分子大部分都是核酸。
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f*u
85 楼
感觉你好像是做生化的，看来你还有真正的化学背景，那正好这个问题仍给你了。
我在想，既然核酸里面的磷可以被砷取代，
那么能不能上地球上的哪个角落找找看有没有蛋白质里的氮全都被磷取代了的细菌，
如果找不到也可以试试看在实验室里弄个出来，那个好像也会非常非常地酷，
从化学上来说你觉得可能吗？

【在 s******y 的大作中提到】
: 能量更高，
: 在一般的RNA结构下会比较不稳定
: 反应后生成的 O-As 键貌似不如 O-P 键稳定。
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y*i
86 楼
如果是从菌落开始摇细菌，那细菌数量增长了无穷多倍，那点磷根本不够，必然有很
多细菌完全用砷替代。

【在 f**u 的大作中提到】
: 这个也不一定。
: 至少我能想到的还有两个可能，
: Adenosine-As-P-P，或者Adenosine-As-As-P。
: 问题更加扑朔迷离了，哈哈。
: 说实话这里面可做的有意思的问题太多了，
: 我真得在很serious的考虑要不要做这个方向的postdoc了，
: 如果以后回中国了，也可以发挥我们祖国地大物博的优势，找找有什么更古怪的冬冬。
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S*G
87 楼
作为一个学化学的，我不相信。

NASA

【在 r*****t 的大作中提到】
: 够炸药奖的平均水平了
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S*G
88 楼
我看了觉得大家激动太早了。报道只是说细菌能在高浓度的砷里面存活，现在有任何证
据表明遗传物质里面的磷被砷取代吗？如果是取代了，是全部被取代还是部分被取代了
？如果是部分被取代了，是那些部分呢？
RNA和DNA就像化学里面的催化剂，有的反应需要很大量的催化剂，有的反应只需要几个
ppm的催化剂。也许这种细菌的机制是对自身的遗传物质的保护很好也未可知。或者这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的ATP，它只需要1ppb。
我瞎说哈，还是你们生物学家接着聊。

【在 S******G 的大作中提到】
: 作为一个学化学的，我不相信。
:
: NASA
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S*G
89 楼
对，细菌到底是survive呢还是能无限繁殖呢，这个区别很大。

【在 y***i 的大作中提到】
: 如果是从菌落开始摇细菌，那细菌数量增长了无穷多倍，那点磷根本不够，必然有很
: 多细菌完全用砷替代。
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s*y
90 楼
这个很麻烦，因为三价磷不如四价磷稳定，在氧存在的情况下，很难把
蛋白质里的氮代替成磷。
不过也许在某一定的还原条件下可能做出来

【在 f**u 的大作中提到】
: 感觉你好像是做生化的，看来你还有真正的化学背景，那正好这个问题仍给你了。
: 我在想，既然核酸里面的磷可以被砷取代，
: 那么能不能上地球上的哪个角落找找看有没有蛋白质里的氮全都被磷取代了的细菌，
: 如果找不到也可以试试看在实验室里弄个出来，那个好像也会非常非常地酷，
: 从化学上来说你觉得可能吗？
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s*s
91 楼
同意你不是学生物的。
开个玩笑。文章里说是取代DNA里面的磷了，剩下的磷是trace amount，
根据DNA结构的重复性，大量取代和完全取代没有区别；倒是有可能有
部分蛋白质仍然用磷，这个需要更长时间的传代来说明

这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的
ATP，它只需要1ppb。

【在 S******G 的大作中提到】
: 我看了觉得大家激动太早了。报道只是说细菌能在高浓度的砷里面存活，现在有任何证
: 据表明遗传物质里面的磷被砷取代吗？如果是取代了，是全部被取代还是部分被取代了
: ？如果是部分被取代了，是那些部分呢？
: RNA和DNA就像化学里面的催化剂，有的反应需要很大量的催化剂，有的反应只需要几个
: ppm的催化剂。也许这种细菌的机制是对自身的遗传物质的保护很好也未可知。或者这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的ATP，它只需要1ppb。
: 我瞎说哈，还是你们生物学家接着聊。
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s*y
92 楼
关于那个藻类，这个还真不一定。
那些科学家一开始想到那个湖，就是因为湖里含有高浓度砷，但是磷含量非常低。
而因为砷很容易形成磷的analog,所以才引出了她们去找那些细菌的动机

【在 f**u 的大作中提到】
: 我也相信例外永远是有的，但是例外的概率却要看你找的是什么的例外。
: 我想说的只是基本上越根本的东西越不容易被例外，这个我想不同意的人不会太多吧。
: 之所以说是基本上，是因为这个也是有例外的，比如说sex determination。
: sex很重要大家没意见，但是sex determination确有非常diverse。
: 生物里面永远是有例外的，这是生物学的魅力之一，
: 但是在这么根本的东西上面例外，的确让我很惊讶。
: 另外你说的那些藻类，我估计很可能只是能tolerate As，
: 这个和利用As还是很不一样的。
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s*s
93 楼
我觉得前面有个谁说的对，这个生物本来就很有趣，
但是如果有普遍性就更有趣了。比如mice在砷中毒以后
DNA里面是不是也有砷了，这条DNA是不是也能稳定遗传？
DNA是不是突变增加了？是不是调控发生改变，等等。

【在 s******y 的大作中提到】
: 关于那个藻类，这个还真不一定。
: 那些科学家一开始想到那个湖，就是因为湖里含有高浓度砷，但是磷含量非常低。
: 而因为砷很容易形成磷的analog,所以才引出了她们去找那些细菌的动机
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s*y
94 楼
他们的证据是这个东西在缺乏磷的培养基里面可以繁殖增长好几代，所以说明这个东西
不需要磷也能繁殖。
另外，他们从那个细菌提取出来的DNA含有高量的砷

这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的
ATP，它只需要1ppb。

【在 S******G 的大作中提到】
: 我看了觉得大家激动太早了。报道只是说细菌能在高浓度的砷里面存活，现在有任何证
: 据表明遗传物质里面的磷被砷取代吗？如果是取代了，是全部被取代还是部分被取代了
: ？如果是部分被取代了，是那些部分呢？
: RNA和DNA就像化学里面的催化剂，有的反应需要很大量的催化剂，有的反应只需要几个
: ppm的催化剂。也许这种细菌的机制是对自身的遗传物质的保护很好也未可知。或者这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的ATP，它只需要1ppb。
: 我瞎说哈，还是你们生物学家接着聊。
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S*G
95 楼
问个问题，是不是所有已知生物体里面的磷的相对含量都是一样的，比如说1ppm mass？
其他的物质，比如说RNA，DNA，ATP的相对含量也都是一样的？

【在 s******s 的大作中提到】
: 同意你不是学生物的。
: 开个玩笑。文章里说是取代DNA里面的磷了，剩下的磷是trace amount，
: 根据DNA结构的重复性，大量取代和完全取代没有区别；倒是有可能有
: 部分蛋白质仍然用磷，这个需要更长时间的传代来说明
:
: 这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的
: ATP，它只需要1ppb。
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S*G
96 楼
没有磷也能繁殖is an overstatement。
之多他们可以说，trace amount的磷 +　很多砷可以sustain, 至于需不需要这trace
amount的磷，那还很难说咧。

【在 s******y 的大作中提到】
: 他们的证据是这个东西在缺乏磷的培养基里面可以繁殖增长好几代，所以说明这个东西
: 不需要磷也能繁殖。
: 另外，他们从那个细菌提取出来的DNA含有高量的砷
:
: 这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的
: ATP，它只需要1ppb。
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a*e
97 楼
这个鬼东西在砷湖里活了那么长时间
估计里面本来就进化出一套套处理砷，变废为宝的机制，酶啊什么的
这个无磷环境可能导致把那套东西激活放大
再过上几代，把他们换出来忽然扔进有磷无砷，不定一下子统统中毒身亡

【在 s******y 的大作中提到】
: 他们的证据是这个东西在缺乏磷的培养基里面可以繁殖增长好几代，所以说明这个东西
: 不需要磷也能繁殖。
: 另外，他们从那个细菌提取出来的DNA含有高量的砷
:
: 这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的
: ATP，它只需要1ppb。
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s*s
98 楼
support你的说法。不过这么少磷，就算有地方必须用磷，
比如我说kinase这些信号传导，大多数地方，尤其是DNA，
ATP，都是用砷的，而且竟然对生长的影响不算太大，这个
就很amazing了。

【在 S******G 的大作中提到】
: 没有磷也能繁殖is an overstatement。
: 之多他们可以说，trace amount的磷 +　很多砷可以sustain, 至于需不需要这trace
: amount的磷，那还很难说咧。
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w*a
99 楼
我觉得更有趣的问题是，这些细菌体内到底存在了一群什么样的酶可以handle这么多的
砷。而对于普通的细胞，trace amount的砷就足够致死了吧。

【在 s******y 的大作中提到】
: 他们的证据是这个东西在缺乏磷的培养基里面可以繁殖增长好几代，所以说明这个东西
: 不需要磷也能繁殖。
: 另外，他们从那个细菌提取出来的DNA含有高量的砷
:
: 这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的
: ATP，它只需要1ppb。
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a*e
100 楼
那是，不过要是菌落长大了几个量级
这个就不好说了

【在 S******G 的大作中提到】
: 没有磷也能繁殖is an overstatement。
: 之多他们可以说，trace amount的磷 +　很多砷可以sustain, 至于需不需要这trace
: amount的磷，那还很难说咧。
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s*s
101 楼
看我的上文，基本上磷仍然是default, 只是合成了一个
多聚物来buffer砷酸的不稳定性以及和磷酸的差异而已。

【在 a***e 的大作中提到】
: 这个鬼东西在砷湖里活了那么长时间
: 估计里面本来就进化出一套套处理砷，变废为宝的机制，酶啊什么的
: 这个无磷环境可能导致把那套东西激活放大
: 再过上几代，把他们换出来忽然扔进有磷无砷，不定一下子统统中毒身亡
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f*u
102 楼
mark一下，明天再来看
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s*y
103 楼
所以大家就看出了你不是学生物的。呵呵。磷作为能量分子什么的，可以省，
但是作为DNA, RNA这些分子的基本骨架，是没有办法省的。
生物在每繁殖一次，就必须复制一次DNA,而且做出一堆RNA, 所以这个磷肯定要
每次都用的。不是你想省就能省的。
所以他们的解释是砷代替了磷，这个解释还是合理的。
另外，大部分生物里面的磷元素的含量是有一个底线的。因为DNA必须有一定长度
才能编出足够数量的蛋白。而每个蛋白本身都必须有一个mRNA和它对应，再加上
所有必须的tRNA, 和ribosome里面的一大堆rRNA, 这个磷的含量可不低！

mass？

【在 S******G 的大作中提到】
: 问个问题，是不是所有已知生物体里面的磷的相对含量都是一样的，比如说1ppm mass？
: 其他的物质，比如说RNA，DNA，ATP的相对含量也都是一样的？
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Q*K
104 楼
很牛逼的发现啊
估计现在大家都要去极端环境下找怪异细菌了。。。，呵呵
不知道这种系列的DNA能不能进化出来高级生命。。。

NASA

【在 r*****t 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
: 发信人: thinknet (我是云), 信区: Military
: 标 题: 号外：NASA发现新细菌的DNA由砷构成
: 发信站: BBS 未名空间站 (Thu Dec 2 12:35:49 2010, 美东)
: NASA将公布新生命 推翻现有生物学理论
: 生物学, NASA, 生命, 理论, 公布
: 本帖最后由 deam 于 2010-12-2 22:44 编辑
: 驱动之家[原创] 作者：永辉 编辑：永辉　2010-12-02 22:37:55
: 美国国家航空航天局(NASA)官网11月29日发布消息称，将于当地时间12月2日下午2点(
: 北京时间3日凌晨3点左右)在其华盛顿总部演播大厅召开新闻发布会，内容将涉及NASA
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s*r
105 楼
没有看他们的paper，如果是砷骨架的DNA，那里面的各种元素比例应该能测出来吧。

所以大家就看出了你不是学生物的。呵呵。磷作为能量分子什么的，可以省，
但是作为DNA, RNA这些分子的基本骨架，是没有办法省的。
生物在每繁殖一次，就必须复制一次DNA,而且做出一堆RNA, 所以这个磷肯定要
每次都用的。不是你想省就能省的。
所以他们的解释是砷代替了磷，这个解释还是合理的。
mass？

【在 s******y 的大作中提到】
: 所以大家就看出了你不是学生物的。呵呵。磷作为能量分子什么的，可以省，
: 但是作为DNA, RNA这些分子的基本骨架，是没有办法省的。
: 生物在每繁殖一次，就必须复制一次DNA,而且做出一堆RNA, 所以这个磷肯定要
: 每次都用的。不是你想省就能省的。
: 所以他们的解释是砷代替了磷，这个解释还是合理的。
: 另外，大部分生物里面的磷元素的含量是有一个底线的。因为DNA必须有一定长度
: 才能编出足够数量的蛋白。而每个蛋白本身都必须有一个mRNA和它对应，再加上
: 所有必须的tRNA, 和ribosome里面的一大堆rRNA, 这个磷的含量可不低！
:
: mass？
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s*s
106 楼
这篇paper明显是rush出来的，很多实验都没做

【在 s******r 的大作中提到】
: 没有看他们的paper，如果是砷骨架的DNA，那里面的各种元素比例应该能测出来吧。
:
: 所以大家就看出了你不是学生物的。呵呵。磷作为能量分子什么的，可以省，
: 但是作为DNA, RNA这些分子的基本骨架，是没有办法省的。
: 生物在每繁殖一次，就必须复制一次DNA,而且做出一堆RNA, 所以这个磷肯定要
: 每次都用的。不是你想省就能省的。
: 所以他们的解释是砷代替了磷，这个解释还是合理的。
: mass？
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s*y
107 楼
这个可能得等他们下一片文章了

【在 s******r 的大作中提到】
: 没有看他们的paper，如果是砷骨架的DNA，那里面的各种元素比例应该能测出来吧。
:
: 所以大家就看出了你不是学生物的。呵呵。磷作为能量分子什么的，可以省，
: 但是作为DNA, RNA这些分子的基本骨架，是没有办法省的。
: 生物在每繁殖一次，就必须复制一次DNA,而且做出一堆RNA, 所以这个磷肯定要
: 每次都用的。不是你想省就能省的。
: 所以他们的解释是砷代替了磷，这个解释还是合理的。
: mass？
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b*r
108 楼
硅太重了，很难作为生物的主要成分在气相液相固相里循环
当然了，谁知道啊，宇宙环境千差万别的，说不定那些甲烷星球里有很多鱼一样的东西
在游泳

【在 s******y 的大作中提到】
: 为什么这么讲啊？
: 硅的坏处是多联硅不稳定。
: 但是在某些独特的溶剂，和特殊的氧化／还原环境里面，
: 我觉得应该是可以用硅来做骨架的
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S*G
109 楼
"复制一次DNA,而且做出一堆RNA"
师妹你这个陈述能量化吗？我的疑问的根本是：并不是所有的繁殖都需要一样多的DNA
，我猜想一般细胞里面的dna的copy是有多余的，复制出来的RNA也有多余的， 这个繁殖的turnover的速度肯定也是不一样的。

【在 s******y 的大作中提到】
: 所以大家就看出了你不是学生物的。呵呵。磷作为能量分子什么的，可以省，
: 但是作为DNA, RNA这些分子的基本骨架，是没有办法省的。
: 生物在每繁殖一次，就必须复制一次DNA,而且做出一堆RNA, 所以这个磷肯定要
: 每次都用的。不是你想省就能省的。
: 所以他们的解释是砷代替了磷，这个解释还是合理的。
: 另外，大部分生物里面的磷元素的含量是有一个底线的。因为DNA必须有一定长度
: 才能编出足够数量的蛋白。而每个蛋白本身都必须有一个mRNA和它对应，再加上
: 所有必须的tRNA, 和ribosome里面的一大堆rRNA, 这个磷的含量可不低！
:
: mass？
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s*y
110 楼
这个重不重得看当地的星球的引力系数吧？

【在 b****r 的大作中提到】
: 硅太重了，很难作为生物的主要成分在气相液相固相里循环
: 当然了，谁知道啊，宇宙环境千差万别的，说不定那些甲烷星球里有很多鱼一样的东西
: 在游泳
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c*y
111 楼
细菌有磷酸化吗？

【在 d**p 的大作中提到】
: 培养液里没有磷的话，底物磷酸化怎么办？蛋白激酶把身价到底物上去？
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s*y
112 楼
大部分生物体，在复制的时候，都会把DNA 完整的复制一次，然后一个版本留给自己，
另外一个版本交给下代。
少数情况下，的确有些生物留有多余的版本（四倍体八倍体什么的），然后可以省一省
不做复制而传几个代。但这个是有限的，不可能没完没了的这么传下去。
他们的文章我还没有具体看，不知道他们有没有考虑这个因素。但从别人的描述看来，
似乎文章中的证据不支持这个因素

DNA
繁殖的turnover的速度肯定也是不一样的。

【在 S******G 的大作中提到】
: "复制一次DNA,而且做出一堆RNA"
: 师妹你这个陈述能量化吗？我的疑问的根本是：并不是所有的繁殖都需要一样多的DNA
: ，我猜想一般细胞里面的dna的copy是有多余的，复制出来的RNA也有多余的， 这个繁殖的turnover的速度肯定也是不一样的。
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s*y
113 楼
有。

【在 c***y 的大作中提到】
: 细菌有磷酸化吗？
avatar
s*y
114 楼
有。

【在 c***y 的大作中提到】
: 细菌有磷酸化吗？
avatar
c*l
115 楼
有不有可能这个细菌可以把砷转化成磷啊？ 核聚变。。。。。。

【在 s******y 的大作中提到】
: 有。
avatar
y*i
116 楼
拿这个菌做实验是挺可怕的。做LB plate，摇菌，得用多少砷啊。
avatar
f*u
117 楼
是啊。砷中毒的原因好像是在氧化磷酸化的过程中间，
这套东西是超级保守的，那么这些细菌肯定有什么办法来一直砷的毒性。

【在 w***a 的大作中提到】
: 我觉得更有趣的问题是，这些细菌体内到底存在了一群什么样的酶可以handle这么多的
: 砷。而对于普通的细胞，trace amount的砷就足够致死了吧。
avatar
W*C
118 楼

没有 能量上解释不通吧

【在 c****l 的大作中提到】
: 有不有可能这个细菌可以把砷转化成磷啊？ 核聚变。。。。。。
avatar
f*s
119 楼
合成dna，rna的时候，它们可不是像催化剂，是聚合酶起到催化剂的作用，dna或rna是
反应底物／产物。
不过，从化学反应角度想，一切都取决于能量，酶的作用就是拉近反应基团，降低能级
，所以到底是什么使细菌里的各种酶能够无障碍的识别砷，是个问题。但是再想想，其
实对酶来说，真正识别反应基团的 amino acid residue 就那么几个。细菌本身的
adpation快， 或者说是mutation 速度快。比如砷最开始的可能就是某一两位置上取代
了磷，如果又没有特定的修复机制，就会保存下去，会加速整个系统突变的过程。不用
产生新的酶，只要原有酶上的某个关键位点改变了，这样突变的过程会无限制的扩大下
去。如果是做酶的，这个根dna damage 的研究路线可以很相似的。
而且，看了这个我都想回去继续做我的polymerase了，人工合成些dntp，在a,b,r位置
放上砷，然后把进化线上的各种细菌，真菌，哺乳动物的酶都拿来试试，看看谁可以合
成，合成到什么程度，说不准低级的可以，到某高一级上发现就不可以了，然后就再找
哪个位点最重要，不用很大工作量，很容易出paper呀，呵呵。

这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的
ATP，它只需要1ppb。

【在 S******G 的大作中提到】
: 我看了觉得大家激动太早了。报道只是说细菌能在高浓度的砷里面存活，现在有任何证
: 据表明遗传物质里面的磷被砷取代吗？如果是取代了，是全部被取代还是部分被取代了
: ？如果是部分被取代了，是那些部分呢？
: RNA和DNA就像化学里面的催化剂，有的反应需要很大量的催化剂，有的反应只需要几个
: ppm的催化剂。也许这种细菌的机制是对自身的遗传物质的保护很好也未可知。或者这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的ATP，它只需要1ppb。
: 我瞎说哈，还是你们生物学家接着聊。
avatar
o*n
120 楼
为啥一定是细菌？
avatar
o*n
121 楼
细菌能把As变成磷吗？
avatar
h*o
122 楼
直接给细菌颁个诺贝尔化学奖

【在 o******n 的大作中提到】
: 细菌能把As变成磷吗？
avatar
o*n
123 楼
我就是对化学不熟才问嘛。

【在 h*****o 的大作中提到】
: 直接给细菌颁个诺贝尔化学奖
avatar
a*e
124 楼
那么简单？
要是不用C用Si，不用P用As。。。。。
那就意味着生命有可能不用水不用氧气了吧。

【在 s******y 的大作中提到】
: 我怎么就没有那么激动呢？。。。
: 因为我觉得这个本来就是很有可能的呀。
: 如果需要的话，我甚至可以去合成一个给你看：）
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s*n
125 楼
不用氧气的早就有了，一大堆的厌氧微生物。

【在 a*****e 的大作中提到】
: 那么简单？
: 要是不用C用Si，不用P用As。。。。。
: 那就意味着生命有可能不用水不用氧气了吧。
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C*e
126 楼
那个研究者那么年轻
06年才拿到的phD
然后做了3年博后
现在刚刚开始自己的career
就弄了这么个东东～

【在 f**u 的大作中提到】
: 我特意去看了看NASA发布会的直播，对于是不是adaptive evolution，大家还有疑问。
: 有个提问比较专业，问那个作者在进化上As是什么时候取代P的，作者答曰不知。
: 还有人说可能在RNA世界的时候分别有两套生命系统，一套用P，一套用As，
: 不过这个好像不是很靠普的样子。
: 嘉宾里还有个化学家，也是NASA的astrobiology大团队的一部分，
: 他还不是特别的convinced，他说从化学上说As太过活跃，如果完全是As作为DNA骨架，
: 那么这个骨架是很容易断裂的，除非这个菌有很强大的DNA修复能力，
: 但即便如此细菌去修复这些断裂也要花掉很多能量，他觉得不可思议。
: 另外一种解释是有其他的东西比如说蛋白什么的来stabilize DNA的骨架，
: 但是他说你在提DNA的时候蛋白都会被除掉，文章作者说胶上的DNA的确有断裂，
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z*t
127 楼
不过他们说细菌大概是需要特殊的环境的（gamma-羟基丁酸？）聚合酶的对As偏好作用
也要在这种条件下筛选吧。我倒觉得按你的思路这种菌的polymerase倒是很好的研究对象

【在 f******s 的大作中提到】
: 合成dna，rna的时候，它们可不是像催化剂，是聚合酶起到催化剂的作用，dna或rna是
: 反应底物／产物。
: 不过，从化学反应角度想，一切都取决于能量，酶的作用就是拉近反应基团，降低能级
: ，所以到底是什么使细菌里的各种酶能够无障碍的识别砷，是个问题。但是再想想，其
: 实对酶来说，真正识别反应基团的 amino acid residue 就那么几个。细菌本身的
: adpation快， 或者说是mutation 速度快。比如砷最开始的可能就是某一两位置上取代
: 了磷，如果又没有特定的修复机制，就会保存下去，会加速整个系统突变的过程。不用
: 产生新的酶，只要原有酶上的某个关键位点改变了，这样突变的过程会无限制的扩大下
: 去。如果是做酶的，这个根dna damage 的研究路线可以很相似的。
: 而且，看了这个我都想回去继续做我的polymerase了，人工合成些dntp，在a,b,r位置
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c*n
128 楼
NASA真是不要脸啊！
这他妈什么旧消息了， 好几年前就有人发现这种细菌了
Oremland, R. S., T. R. Kulp, J. Switzer Blum, S. E. Hoeft, S. Baesman, L. G. Miller, and J. F. Stolz. 2005. A microbial arsenic cycle in a salt-saturated, extreme environment: Searles Lake, California. Science. 308:1305-1308.
http://www.microbemagazine.org/index.php/02-2010-home/1358-microbial-arsenic-metabolism-new-twists-on-an-old-poison

NASA

【在 r*****t 的大作中提到】
: 够炸药奖的平均水平了
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c*n
129 楼
不用氧气的生命多的是，你身上一大堆

【在 a*****e 的大作中提到】
: 那么简单？
: 要是不用C用Si，不用P用As。。。。。
: 那就意味着生命有可能不用水不用氧气了吧。
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a*a
130 楼
lol，谁来说说nasa是不是不要脸，我觉得很有喜感

G. Miller, and J. F. Stolz. 2005. A microbial arsenic cycle in a salt-
saturated, extreme environment: Searles Lake, California. Science. 308:1305-
1308.

【在 c******n 的大作中提到】
: NASA真是不要脸啊！
: 这他妈什么旧消息了， 好几年前就有人发现这种细菌了
: Oremland, R. S., T. R. Kulp, J. Switzer Blum, S. E. Hoeft, S. Baesman, L. G. Miller, and J. F. Stolz. 2005. A microbial arsenic cycle in a salt-saturated, extreme environment: Searles Lake, California. Science. 308:1305-1308.
: http://www.microbemagazine.org/index.php/02-2010-home/1358-microbial-arsenic-metabolism-new-twists-on-an-old-poison
:
: NASA
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g*d
131 楼
NASA不要脸!

L. G. Miller, and J. F. Stolz. 2005. A microbial arsenic cycle in a salt-
saturated, extreme environment: Searles Lake, California. Science.
308:1305-1308.
arsenic-metabolism-new-twists-on-an-old-poison

【在 c******n 的大作中提到】
: NASA真是不要脸啊！
: 这他妈什么旧消息了， 好几年前就有人发现这种细菌了
: Oremland, R. S., T. R. Kulp, J. Switzer Blum, S. E. Hoeft, S. Baesman, L. G. Miller, and J. F. Stolz. 2005. A microbial arsenic cycle in a salt-saturated, extreme environment: Searles Lake, California. Science. 308:1305-1308.
: http://www.microbemagazine.org/index.php/02-2010-home/1358-microbial-arsenic-metabolism-new-twists-on-an-old-poison
:
: NASA
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c*g
132 楼
Some paper said that the cost of As resistance is low. And As resistance has
been identified in many different species.
For this strain (NASA have found), the growth rate is really slow(this is
normal for such strains). After 480h, the total cells just increased about
10 folds(from 10e6/ml to 10e7/ml). So the demanding of phosphorus may be
small.
And after 120h, this strain reaches stationary phase. I don't know if they
are still alive after 480h.
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s*7
133 楼

L. G. Miller, and J. F. Stolz. 2005. A microbial arsenic cycle in a salt-
saturated, extreme environment: Searles Lake, California. Science.
308:1305-1308.
arsenic-metabolism-new-twists-on-an-old-poison
it is a different story. this paper is about a bacteria using As as energy
source. nasa's paper is using As in DNA.

【在 c******n 的大作中提到】
: NASA真是不要脸啊！
: 这他妈什么旧消息了， 好几年前就有人发现这种细菌了
: Oremland, R. S., T. R. Kulp, J. Switzer Blum, S. E. Hoeft, S. Baesman, L. G. Miller, and J. F. Stolz. 2005. A microbial arsenic cycle in a salt-saturated, extreme environment: Searles Lake, California. Science. 308:1305-1308.
: http://www.microbemagazine.org/index.php/02-2010-home/1358-microbial-arsenic-metabolism-new-twists-on-an-old-poison
:
: NASA
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l*s
134 楼
有没有资料显示，MARS上有丰富的砷？
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s*r
135 楼
这绝对是个大金矿
问题不仅仅局限在DNA/RNA上，还涉及基本代谢，生理表征，繁衍与发育。
最简单的几个问题：
1）由Arsenic构成的DNA/RNA系统，转录翻译有何不同
2）ATP被ATA取代？
3）信号传递系统是否不同？
4）代谢系统，包括酶系统是怎么构成的？
5）细胞如何繁衍？
6）Arsenic 系统和 phosphate 系统之间可否融合？
...
太多太多问题需要解决。
基本上，生命科学进入了新的一章。
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O*e
136 楼
这下子微生物学领域要热闹一阵子了。
大家多讨论讨论现在这个“外星细菌”跟以往研究的相似和不同？

G. Miller, and J. F. Stolz. 2005. A microbial arsenic cycle in a salt-
saturated, extreme environment: Searles Lake, California. Science. 308:1305-
1308.

【在 c******n 的大作中提到】
: NASA真是不要脸啊！
: 这他妈什么旧消息了， 好几年前就有人发现这种细菌了
: Oremland, R. S., T. R. Kulp, J. Switzer Blum, S. E. Hoeft, S. Baesman, L. G. Miller, and J. F. Stolz. 2005. A microbial arsenic cycle in a salt-saturated, extreme environment: Searles Lake, California. Science. 308:1305-1308.
: http://www.microbemagazine.org/index.php/02-2010-home/1358-microbial-arsenic-metabolism-new-twists-on-an-old-poison
:
: NASA
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O*e
137 楼
稀奇古怪的生物那么多，哪能都这么研究法，现在主体的那些问题都没搞清楚呢。
再说了，即便这些细菌是真的，你把你列的这些问题搞清楚，有什么用处么？这种
细菌代表了地球早期生命进化的一支啊还是代表了哪个星球的生命形式啊？
我倒是想到了它的潜在工业用途－－除砷。可惜一般环境中的砷含量很低，你把这些
细菌放到那里，人家早乐呵呵地去用磷了－－用磷长得好得多。

【在 s****r 的大作中提到】
: 这绝对是个大金矿
: 问题不仅仅局限在DNA/RNA上，还涉及基本代谢，生理表征，繁衍与发育。
: 最简单的几个问题：
: 1）由Arsenic构成的DNA/RNA系统，转录翻译有何不同
: 2）ATP被ATA取代？
: 3）信号传递系统是否不同？
: 4）代谢系统，包括酶系统是怎么构成的？
: 5）细胞如何繁衍？
: 6）Arsenic 系统和 phosphate 系统之间可否融合？
: ...
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s*s
138 楼
我的理论就是没啥不同，就是PHB buffer一下，As就当P用了，
到时候PHB一去，还能继续用P。否则就要backup两套系统，一套
正常基因组，一套适应As的基因组(或者至少几百个和P有关的基
因），两套共存，这个太不经济了。
另外，前面有人说可能一两个蛋白先进化，然后慢慢覆盖其他
的蛋白。这个也不太可能，As如果和P系统不compatible, 一两个
蛋白进化更本没有任何好处。所以一定是一个global的switch，
也就是我说的PHB buffer系统，或者还有其他的微调系统，比如
蛋白修饰系统，能够同时并且reversible的让所有相关蛋白在两
个系统内转换。

【在 s****r 的大作中提到】
: 这绝对是个大金矿
: 问题不仅仅局限在DNA/RNA上，还涉及基本代谢，生理表征，繁衍与发育。
: 最简单的几个问题：
: 1）由Arsenic构成的DNA/RNA系统，转录翻译有何不同
: 2）ATP被ATA取代？
: 3）信号传递系统是否不同？
: 4）代谢系统，包括酶系统是怎么构成的？
: 5）细胞如何繁衍？
: 6）Arsenic 系统和 phosphate 系统之间可否融合？
: ...
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c*7
139 楼
很正常，几乎在预料之中，一点都不意外。
二十多年前，俺读高中的时候，俺在生物课课堂上面就提出了，外星生命构成可能与地
球生命不同，比如，外星生命可能不是用碳水化合物、或者氮磷化合物等地球生命常用
的元素化合物的生命形式，而是用相近或者相似的同族元素替代。。。
结果，当时的生物课老师还和俺争论了一会儿，最后还表扬了俺，说俺的思路新颖。。。
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l*s
140 楼
it is just adaptive evolution, what is so exciting? Besides,the announcement is way too premature.
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f*9
141 楼
说这种话有啥意思啊,10年前我就指出房价一定会涨,结果也没攒下一套房子

。。

【在 c*******7 的大作中提到】
: 很正常，几乎在预料之中，一点都不意外。
: 二十多年前，俺读高中的时候，俺在生物课课堂上面就提出了，外星生命构成可能与地
: 球生命不同，比如，外星生命可能不是用碳水化合物、或者氮磷化合物等地球生命常用
: 的元素化合物的生命形式，而是用相近或者相似的同族元素替代。。。
: 结果，当时的生物课老师还和俺争论了一会儿，最后还表扬了俺，说俺的思路新颖。。。
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s*s
142 楼
老怪，你咋这么牛B呢？
你要是当了老板，还不得把学生屎都累出来啊？

【在 s****r 的大作中提到】
: 这绝对是个大金矿
: 问题不仅仅局限在DNA/RNA上，还涉及基本代谢，生理表征，繁衍与发育。
: 最简单的几个问题：
: 1）由Arsenic构成的DNA/RNA系统，转录翻译有何不同
: 2）ATP被ATA取代？
: 3）信号传递系统是否不同？
: 4）代谢系统，包括酶系统是怎么构成的？
: 5）细胞如何繁衍？
: 6）Arsenic 系统和 phosphate 系统之间可否融合？
: ...
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a*k
143 楼
实验室每周用砷一公斤。。。博士毕业条件是看有没有砷中毒！

【在 s*******s 的大作中提到】
: 老怪，你咋这么牛B呢？
: 你要是当了老板，还不得把学生屎都累出来啊？
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z*h
144 楼
Good findings.

G. Miller, and J. F. Stolz. 2005. A microbial arsenic cycle in a salt-
saturated, extreme environment: Searles Lake, California. Science. 308:1305-
1308.

【在 c******n 的大作中提到】
: NASA真是不要脸啊！
: 这他妈什么旧消息了， 好几年前就有人发现这种细菌了
: Oremland, R. S., T. R. Kulp, J. Switzer Blum, S. E. Hoeft, S. Baesman, L. G. Miller, and J. F. Stolz. 2005. A microbial arsenic cycle in a salt-saturated, extreme environment: Searles Lake, California. Science. 308:1305-1308.
: http://www.microbemagazine.org/index.php/02-2010-home/1358-microbial-arsenic-metabolism-new-twists-on-an-old-poison
:
: NASA
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b*n
145 楼
哈哈，可以找到用三聚氰胺代替正常蛋白质的怪异生物

【在 f**u 的大作中提到】
: 这个也不一定。
: 至少我能想到的还有两个可能，
: Adenosine-As-P-P，或者Adenosine-As-As-P。
: 问题更加扑朔迷离了，哈哈。
: 说实话这里面可做的有意思的问题太多了，
: 我真得在很serious的考虑要不要做这个方向的postdoc了，
: 如果以后回中国了，也可以发挥我们祖国地大物博的优势，找找有什么更古怪的冬冬。
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h*r
146 楼
Accumulation of PHB is very common in the bacteria under imbalanced growth
conditions, especially nitrogen/Pi limitation. This is one of storage
compounds. Furthermore, some algae can produce higher content of lipids
under such conditions. Maybe PHB has other functions.

【在 s******s 的大作中提到】
: 我的理论就是没啥不同，就是PHB buffer一下，As就当P用了，
: 到时候PHB一去，还能继续用P。否则就要backup两套系统，一套
: 正常基因组，一套适应As的基因组(或者至少几百个和P有关的基
: 因），两套共存，这个太不经济了。
: 另外，前面有人说可能一两个蛋白先进化，然后慢慢覆盖其他
: 的蛋白。这个也不太可能，As如果和P系统不compatible, 一两个
: 蛋白进化更本没有任何好处。所以一定是一个global的switch，
: 也就是我说的PHB buffer系统，或者还有其他的微调系统，比如
: 蛋白修饰系统，能够同时并且reversible的让所有相关蛋白在两
: 个系统内转换。
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c*1
147 楼
I saw the news yesterday and have a chance to read the paper in detail
today. It was very exciting if proved, but right now I'm still not 100%
convinced for the following reasons:
1. The authors showed that cells grow better in media containing +As/-P,
than -As/-P. Could that be explained that As (40 mM Arsenate) stimulate
the cells to uptake PO4? The author never really got rid of trace amount
of PO4 in his experiment to give a clear conclusion. Also, the authors
only showed one concentration of arsenate (40 mM), it will be more
convincing if they show a better growth of the cells with a gradient
concentrations of Arsenate in the media (Fig. 1A).
2. One of the most important data to show the amount of As in cells in the
+As/-P media is worthless: 0.19+/-0.25 is meaningless. The author's
explanation was that because the cells were harvested at stationary phase,
then why didn't they take cells at late log phase since this data is so
important for his conclusion?
3. The authors showed As was incorporated into biomolecules including DNA,
proteins and metabolites by showing isolated biomolecures contain As. But
how to determine whether As was incorporated during the cell growth or
were simply labeled during the extraction process since there is plenty of
As in the media?
4. I'm curious whether this strain contains a Arsenate detoxification
gene, and the role of this gene in the cells. Can the cells still grow
better with Arsenate in media if this gene is knocked out? This might be
related to question 1.
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c*1
148 楼
I saw the news yesterday and have a chance to read the paper in detail
today. It was very exciting if proved, but right now I'm still not 100%
convinced for the following reasons:
1. The authors showed that cells grow better in media containing +As/-P,
than -As/-P. Could that be explained that As (40 mM Arsenate) stimulate
the cells to uptake PO4? The author never really got rid of trace amount
of PO4 in his experiment to give a clear conclusion. Also, the authors
only showed one concentration of arsenate (40 mM), it will be more
convincing if they show a better growth of the cells with a gradient
concentrations of Arsenate in the media (Fig. 1A).
2. One of the most important data to show the amount of As in cells in the
+As/-P media is worthless: 0.19+/-0.25 is meaningless. The author's
explanation was that because the cells were harvested at stationary phase,
then why didn't they take cells at late log phase since this data is so
important for his conclusion?
3. The authors showed As was incorporated into biomolecules including DNA,
proteins and metabolites by showing isolated biomolecures contain As. But
how to determine whether As was incorporated during the cell growth or
were simply labeled during the extraction process since there is plenty of
As in the media?
4. I'm curious whether this strain contains a Arsenate detoxification
gene, and the role of this gene in the cells. Can the cells still grow
better with Arsenate in media if this gene is knocked out? This might be
related to question 1.
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S*I
149 楼
如果能提取纯化细菌的DNA做个晶体结构就清楚了。

【在 c********1 的大作中提到】
: I saw the news yesterday and have a chance to read the paper in detail
: today. It was very exciting if proved, but right now I'm still not 100%
: convinced for the following reasons:
: 1. The authors showed that cells grow better in media containing +As/-P,
: than -As/-P. Could that be explained that As (40 mM Arsenate) stimulate
: the cells to uptake PO4? The author never really got rid of trace amount
: of PO4 in his experiment to give a clear conclusion. Also, the authors
: only showed one concentration of arsenate (40 mM), it will be more
: convincing if they show a better growth of the cells with a gradient
: concentrations of Arsenate in the media (Fig. 1A).
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M*a
150 楼
They are totally different stories.
Some dissimilatory metal-reducers can use As(V) as an electron acceptor and
reduce As(V) to As(III). Lots of papers are available. Some bacteria such as
Shewanella and Geobacter spp. can even reduce U(VI) to U(IV). These are
dissimilatory reduction.
The recent NASA discovery talks about incorporating an alternative element
of one of the so called "essential elements" for life in bacterial biomass.
In their experiments, oxygen was the electron acceptor.
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b*l
151 楼
但不是无磷环境啊。。。

何证
代了
几个

【在 s******y 的大作中提到】
: 他们的证据是这个东西在缺乏磷的培养基里面可以繁殖增长好几代，所以说明这个东西
: 不需要磷也能繁殖。
: 另外，他们从那个细菌提取出来的DNA含有高量的砷
:
: 这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的
: ATP，它只需要1ppb。
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b*l
152 楼
这还用问么？他们肯定试过无磷环境，肯定失败了。而且，甚至可以猜，现在这个磷的
水平，是能够拿到比较好的数据的最低水平了。
当然了，意义还是巨大的。就比如说，发现了吃观音土配一丁点儿粮食竟然也能存活并
且生儿育女。

东西

【在 S******G 的大作中提到】
: 没有磷也能繁殖is an overstatement。
: 之多他们可以说，trace amount的磷 +　很多砷可以sustain, 至于需不需要这trace
: amount的磷，那还很难说咧。
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z*h
153 楼
When I was graduate, I did plant cell culture without phosphate. Clearly,
cells grew by several-fold without phosphate or arsenic. Can I claim that a
special plant cell culture can grow without phosphate, only five elements
needed. The real trick is that the plant cells store a lot of phosphate in
the initially-tested cells. The NASA paper may have the same situation.
Some one has commented this possibility in the same issue of Science.
Clearly, Science editors are zo shameless to ignore this possibility and do
not ask the authors to test this possibility. In fact, this possibility can
be eliminated easily. Transferring the stationary of cells growing on
arsenic-only medium to another fresh arsenic-only media for growth testing.
My guess is no growth at all.
Do not take Science papers seriously any more. Recently they published so
many non-sense or weak papers.
avatar
c*1
154 楼
not enough evidence yet
avatar
f*u
155 楼
http://www.youtube.com/watch?v=JVSJLUIQrA0
完整版，一个小时

【在 f**u 的大作中提到】
: 我特意去看了看NASA发布会的直播，对于是不是adaptive evolution，大家还有疑问。
: 有个提问比较专业，问那个作者在进化上As是什么时候取代P的，作者答曰不知。
: 还有人说可能在RNA世界的时候分别有两套生命系统，一套用P，一套用As，
: 不过这个好像不是很靠普的样子。
: 嘉宾里还有个化学家，也是NASA的astrobiology大团队的一部分，
: 他还不是特别的convinced，他说从化学上说As太过活跃，如果完全是As作为DNA骨架，
: 那么这个骨架是很容易断裂的，除非这个菌有很强大的DNA修复能力，
: 但即便如此细菌去修复这些断裂也要花掉很多能量，他觉得不可思议。
: 另外一种解释是有其他的东西比如说蛋白什么的来stabilize DNA的骨架，
: 但是他说你在提DNA的时候蛋白都会被除掉，文章作者说胶上的DNA的确有断裂，
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Y*I
157 楼
哇，那目前的测序技术也不能测这个细菌了。。咋整。。。

【在 f**u 的大作中提到】
: 我特意去看了看NASA发布会的直播，对于是不是adaptive evolution，大家还有疑问。
: 有个提问比较专业，问那个作者在进化上As是什么时候取代P的，作者答曰不知。
: 还有人说可能在RNA世界的时候分别有两套生命系统，一套用P，一套用As，
: 不过这个好像不是很靠普的样子。
: 嘉宾里还有个化学家，也是NASA的astrobiology大团队的一部分，
: 他还不是特别的convinced，他说从化学上说As太过活跃，如果完全是As作为DNA骨架，
: 那么这个骨架是很容易断裂的，除非这个菌有很强大的DNA修复能力，
: 但即便如此细菌去修复这些断裂也要花掉很多能量，他觉得不可思议。
: 另外一种解释是有其他的东西比如说蛋白什么的来stabilize DNA的骨架，
: 但是他说你在提DNA的时候蛋白都会被除掉，文章作者说胶上的DNA的确有断裂，
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s*n
158 楼
赞这个："发现了吃观音土配一丁点儿粮食竟然也能存活并且生儿育女"。

【在 b*****l 的大作中提到】
: 这还用问么？他们肯定试过无磷环境，肯定失败了。而且，甚至可以猜，现在这个磷的
: 水平，是能够拿到比较好的数据的最低水平了。
: 当然了，意义还是巨大的。就比如说，发现了吃观音土配一丁点儿粮食竟然也能存活并
: 且生儿育女。
:
: 东西
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s*n
159 楼
测序没有问题啊，可以在有磷条件下生长提DNA测序，我觉得genomic DNA的序列不会变
的。

【在 Y**I 的大作中提到】
: 哇，那目前的测序技术也不能测这个细菌了。。咋整。。。
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b*r
160 楼
咋回事，内行解释下
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a*e
161 楼
这个事情可能更牛叉些
早些年不定砷系的多，毕竟活性大，还丰富
可是这个用砷的不稳定，时不时就变异了
于是今天鸡下的蛋明天孵出鸭子，这个肯定导致很多家庭破裂，
不利社会安定团结，天下大乱，史称第一次生物大爆炸
后来变出个磷的，不但稳定了，还能长得更长，更复杂
不过砷骨架也不是一朝一夕能排除的，改革是痛苦的
这个过程出来了更多的怪胎，还是大个的，史称第二次生物大爆炸
然后就成现在这鬼样子了，
不过总是有那么些遗老遗少在墙缝里偷藏禁书，这次被抓了

【在 s******y 的大作中提到】
: 所以大家就看出了你不是学生物的。呵呵。磷作为能量分子什么的，可以省，
: 但是作为DNA, RNA这些分子的基本骨架，是没有办法省的。
: 生物在每繁殖一次，就必须复制一次DNA,而且做出一堆RNA, 所以这个磷肯定要
: 每次都用的。不是你想省就能省的。
: 所以他们的解释是砷代替了磷，这个解释还是合理的。
: 另外，大部分生物里面的磷元素的含量是有一个底线的。因为DNA必须有一定长度
: 才能编出足够数量的蛋白。而每个蛋白本身都必须有一个mRNA和它对应，再加上
: 所有必须的tRNA, 和ribosome里面的一大堆rRNA, 这个磷的含量可不低！
:
: mass？
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