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问问houston几个实验室的情况

问问houston几个实验室的情况# Biology - 生物学

k*e2011-07-19 07:07

1 楼

我们有一个web app，是帮助study team发布人体研究，然后根据注册志愿者的profile
进行匹配，给study team推荐符合研究的志愿者，也给志愿者推荐他们也许感兴趣的研
究。
后端是spring + hibernate的restful api 传统的controller，service，dao，前端是
reactjs+redux，数据库有oracle和redis
目前有大概30k的用户，2k个研究，主要都是local的用户。现在有好几个其他城市的单
位想用我们的app，让我们host，但是他们所在的城市人口比我们多很多，估计用户会
上200k-500k
每次用户更改profile，或者study team更改研究都会触发匹配，更新推荐，要花1分钟
左右，这期间整个ui是block的
我们做过一些优化，比如志愿者和研究的信息存在cache里，匹配的结果存在redis里等
，但是如果我们要scale up，还需要做那些优化呢？
我们考虑能不能不block ui，我们在考虑使用reactive programming，但是看了半天觉
得有点迷糊，后端我们想可不可以用webflux。另外前端rxjs或者reactive redux这些
有用吗？

a*s2011-07-19 07:07

2 楼

MD Anderson 的Guillermina Lozano，
Edward TH Yeh
BCM的Margaret Goodell，
Bert W. O'Malley，
Huda Y. Zoghbi
他们实验室的情况，老板的personality，了解的tx能介绍一下吗？
最近在找postdoc，连连被拒，郁闷死了。。。

g*t2011-07-19 07:07

3 楼

这个得看你们的算法速度吧？假如用户多了。匹配计算要花10分钟。那不block的话，
你打算给用户看什么呢？我觉得得先办法先把匹配算法花费的时间用软件硬件的办法提
高。瓶颈和网页前端怎么做关系不大。
假如你们的瓶颈不是算法而是传统的读或者写什么的，那应该查一查就有成法可以用。

p*n2011-07-19 07:07

4 楼

俺可以负责任地告诉你，Goodell跟Zoghbi都很好很有钱，可是等人家搭理你了再来问吧

【在 a**********s 的大作中提到】

: MD Anderson 的Guillermina Lozano，
: Edward TH Yeh
: BCM的Margaret Goodell，
: Bert W. O'Malley，
: Huda Y. Zoghbi
: 他们实验室的情况，老板的personality，了解的tx能介绍一下吗？
: 最近在找postdoc，连连被拒，郁闷死了。。。

h*k2011-07-19 07:07

5 楼

这种情况，用户忍耐度极高，响应时间无所谓了。
就做成异步形式，用户提交请求后立即返还，过几分钟结果出来了再通知。
你现有的结构改改就够了，不用引进新framework了。

b*r2011-07-19 07:07

6 楼

看楼主挑的这些顶级牛lab，你这口味不连连悲剧才奇怪

c*n2011-07-19 07:07

7 楼

re
rxjs对你这个不适用
你这个更符合microservices
其他地方另开一个专门做计算
用户提交之后给个地方现实状态是processing 其他一点不用block
唯一可以reactive就是另一边跑完了发给主backend给用户显示一个提醒

【在 h******k 的大作中提到】

: 这种情况，用户忍耐度极高，响应时间无所谓了。
: 就做成异步形式，用户提交请求后立即返还，过几分钟结果出来了再通知。
: 你现有的结构改改就够了，不用引进新framework了。

O*e2011-07-19 07:07

8 楼

MD Anderson那两个其实只是一般吧
Goodell比Zoghbi还是差得远

问吧

【在 p****n 的大作中提到】

: 俺可以负责任地告诉你，Goodell跟Zoghbi都很好很有钱，可是等人家搭理你了再来问吧

k*e2011-07-19 07:07

9 楼

谢谢
rxjs适用在什么地方呢？

【在 c******n 的大作中提到】

: re
: rxjs对你这个不适用
: 你这个更符合microservices
: 其他地方另开一个专门做计算
: 用户提交之后给个地方现实状态是processing 其他一点不用block
: 唯一可以reactive就是另一边跑完了发给主backend给用户显示一个提醒

a*s2011-07-19 07:07

10 楼

呵呵，我也知道希望不大，只是尝试一下，
刚开始申请，有一个实验室要了reference，觉得有希望，就想上来了解一下

【在 b****r 的大作中提到】

: 看楼主挑的这些顶级牛lab，你这口味不连连悲剧才奇怪

g*t2011-07-19 07:07

11 楼

他现在的架构恐怕没办法用非阻塞。因为计算任务是页面UI定义的。
计算完成后，假如回来发现页面改了，那么计算结果可能和页面不一致。
例如计算从现在城市到北京上海天津的最小距离。
开始用户写的现在城市是广州。然后计算开始，1分钟后结果出来了，然而因为异步，
用户的现在城市可能已经改成武汉了。这就对不上了。
我以前碰到过这个问题。还在板上问过.
解决办法是，
计算返回《定义，结果》对，而不是只有结果。然后开新的页面展示之前的计算结果。

【在 c******n 的大作中提到】

a*s2011-07-19 07:07

12 楼

谢谢oncogene。
看Goodell的publication非常强啊，而且她做的方向也很吸引人。
能多提供一点这两个老板实验的情况吗？

【在 O******e 的大作中提到】

: MD Anderson那两个其实只是一般吧
: Goodell比Zoghbi还是差得远
:
: 问吧

k*e2011-07-19 07:07

13 楼

好的谢谢
最好不用引进新framework 对方希望我们host一年后他们能接管，所以不大改是最好
的了

【在 h******k 的大作中提到】

a*s2011-07-19 07:07

14 楼

谢谢回复。
有几个实验室是帮lp问的，已经有老板答应去面试，所以才上来问问。
能提供更多一些的信息吗？谢谢！！

问吧

【在 p****n 的大作中提到】

: 俺可以负责任地告诉你，Goodell跟Zoghbi都很好很有钱，可是等人家搭理你了再来问吧

k*e2011-07-19 07:07

15 楼

对基本是什么情况
志愿者更新了自己的medical condition，比如说添加自己有糖尿病，志愿者点击更新
后，整个ui是block的，匹配完以后当前页面上有一个推荐研究数会更新，颜色也会变
化提示用户有新的研究
study team更新了study的eligibility criteria，也是一样，结束以后会更新匹配的
人数

【在 g****t 的大作中提到】

: 他现在的架构恐怕没办法用非阻塞。因为计算任务是页面UI定义的。
: 计算完成后，假如回来发现页面改了，那么计算结果可能和页面不一致。
: 例如计算从现在城市到北京上海天津的最小距离。
: 开始用户写的现在城市是广州。然后计算开始，1分钟后结果出来了，然而因为异步，
: 用户的现在城市可能已经改成武汉了。这就对不上了。
: 我以前碰到过这个问题。还在板上问过.
: 解决办法是，
: 计算返回《定义，结果》对，而不是只有结果。然后开新的页面展示之前的计算结果。

z*t2011-07-19 07:07

16 楼

说说我了解的老板吧
goodell比较低调，而且paper没有huda那么炫。。。她对stem cell的分离方法和
weissman的方法有很大不同，而且她并不focus on cancer stem cell这点决定她在地
位和一些title上不能和weissman几个弟子相比。但她的方法目前有独到的地方，对
stem cell内亚群有很好的分离。实事求是讲，她的眼界及idea不在weissman弟子之下。
Huda更偏向于human genetics,侧重neurology这一块，对小鼠之类基本以构建人类疾病
的model为主。她本人的思路相当清晰，talk给的非常漂亮。影响也很大，她实验室
postdoc的行情基本是1-2 CNS。
OMarlley大叔接触不多，只知道考试喜欢出怪题，他实验室很大，手下几个小老板在管
实验室，而且和BCM这边很多人一起都在做激素受体这些东西，蛋白组实验做得多一点

【在 O******e 的大作中提到】

: MD Anderson那两个其实只是一般吧
: Goodell比Zoghbi还是差得远
:
: 问吧

c*n2011-07-19 07:07

17 楼

我现在理解主要是用在前端一些改善ux的地方
debounce啊，retry啊
我还在尝试中估计用angular的会更有体会

【在 k***e 的大作中提到】

: 谢谢
: rxjs适用在什么地方呢？

c*r2011-07-19 07:07

18 楼

我听小道消息说 huda zoghbi很变态，当然可能是一面之词。。。做得好没得说。

c*n2011-07-19 07:07

19 楼

我之前有个类似的项目
就是提交了之后给你个提醒提交成功然后你可以回dashboard等处理状态
因为应用不同所以也不用再去锁状态不让用户改用户可以直接开个新的在等旧的同时

【在 g****t 的大作中提到】

p*n2011-07-19 07:07

20 楼

具体说说？

【在 c********r 的大作中提到】

: 我听小道消息说 huda zoghbi很变态，当然可能是一面之词。。。做得好没得说。

c*n2011-07-19 07:07

21 楼

在看了遍你的问题其实有点像我之前问过camelcamelcamel是怎么处理这样大量数据更
新的
https://www.mitbbs.com/article_t/Programming/31539565.html

【在 k***e 的大作中提到】

: 对基本是什么情况
: 志愿者更新了自己的medical condition，比如说添加自己有糖尿病，志愿者点击更新
: 后，整个ui是block的，匹配完以后当前页面上有一个推荐研究数会更新，颜色也会变
: 化提示用户有新的研究
: study team更新了study的eligibility criteria，也是一样，结束以后会更新匹配的
: 人数

X*n2011-07-19 07:07

22 楼

说到Ｈｕｄａ，看到她和ＣＣＳＢ的合作的几篇有关ｉｎｔｅｒａｃｔｏｍｅ的文章，
做得挺有意思。但对文章说用Ｙ２Ｈ居然可以达到８５％以上的准确率，表示怀疑。

a*s2011-07-19 07:07

23 楼

非常感谢给了这么多information！！

【在 z*t 的大作中提到】

: 说说我了解的老板吧
: goodell比较低调，而且paper没有huda那么炫。。。她对stem cell的分离方法和
: weissman的方法有很大不同，而且她并不focus on cancer stem cell这点决定她在地
: 位和一些title上不能和weissman几个弟子相比。但她的方法目前有独到的地方，对
: stem cell内亚群有很好的分离。实事求是讲，她的眼界及idea不在weissman弟子之下。
: Huda更偏向于human genetics,侧重neurology这一块，对小鼠之类基本以构建人类疾病
: 的model为主。她本人的思路相当清晰，talk给的非常漂亮。影响也很大，她实验室
: postdoc的行情基本是1-2 CNS。
: OMarlley大叔接触不多，只知道考试喜欢出怪题，他实验室很大，手下几个小老板在管
: 实验室，而且和BCM这边很多人一起都在做激素受体这些东西，蛋白组实验做得多一点

a*s2011-07-19 07:07

24 楼

co-ask

【在 p****n 的大作中提到】

: 具体说说？