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how to analyze microRNA and mRNA microarray data set together?
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S*e
2
当初他敲定了T和苹果的合作,垄断了iPhone一段时间,不过T也没有比别人好。现在手
里收了一堆破烂。。。尽管如此,他那时的眼光还算可以吧(听他经过那时他看到乔布
斯给他的爱疯的原型演示,就下本钱大力支持)?
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c*e
3
I have two sets of microarray data, mRNA and microRNA, in the same samples.
I need a bioinformatic tool to help me find the connection between the
significantly differentially expressed microRNA and mRNA, and identify the
pathway involved in this interaction. Anybody has good suggestions? Thanks!!
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g*t
5
第一:
人身上带一个headless android盒子作为control。屏幕作为view放在别的设备上。这
个是可能的。
(view 不可能是glasses。我多年前和goog glasses的人做过项目。调试过好几个月。
后来因为鸡毛鸭血的问题,... 本身这个设备很好。但是无法覆盖大多数场景。
康宁,就是以前Steve Jobs找来做玻璃那个公司以前有个广告的思路我觉得是对的)
view 可以半年更新一次。control可以3年更新一次。
市场证明了的软件的MVC结构,本身就证明这种硬件布局是合理的。
假设现在的硬件布局为X. 新布局为Y. Y也是一个平衡点。
这点我认为合理。然而要有足够的资金来推动。这个要详细测算才行。
说实话ATT乱的一屁。内部manger都跟外面有长期关系好的外包公司。曾经居然还有
manager写
slides七扭八歪找到我给支招。
第二:
在Steve Jobs以前。手机公司都是跪着的。ATT这些公司是手机公司的爷爷。Steve
Jobs是第一个站着把钱赚了的。这CEO的意思就是要回去过去的格局。这一点,很难让
做硬件的买账。你要把Android联盟清理掉,难度太高了。试问一人可以把蟑螂杀光吗
?是个人就能定制Android,开个自己的app store。
综合来讲。我觉得他也就是说说。Steve Jobs都收拾不了Android,他行吗?
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j*x
6
推荐Partek Genomics Suite,个人认为是目前最好的高通量数据分析软件:跨平台,
能够整合分析各类芯片及NGS数据,下游扩展也很丰富。不过软件卖的比较贵。
如果你对bioinformatics及其相关软件不是很熟悉,那么不建议从原始数据开始处理。
通常一般从公司或者core facility拿到processed data之后,那么可以尝试使用一些
现成的webserver,比如:
MicroRNA and mRNA integrated analysis (MMIA): a web tool for examining
biological functions of microRNA expression
Nucl. Acids Res. (2009) 37 (suppl 2): W356-W362.
http://129.79.244.122/~MMIA/

.
!!

【在 c****e 的大作中提到】
: I have two sets of microarray data, mRNA and microRNA, in the same samples.
: I need a bioinformatic tool to help me find the connection between the
: significantly differentially expressed microRNA and mRNA, and identify the
: pathway involved in this interaction. Anybody has good suggestions? Thanks!!

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d*c
7
康明斯一般专指柴油机公司,你说的一般叫康宁
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t*d
8
很好的信息。谢谢!
顺便打听一下 Partek Genomics Suite 价钱?是不是按年收费?

【在 j****x 的大作中提到】
: 推荐Partek Genomics Suite,个人认为是目前最好的高通量数据分析软件:跨平台,
: 能够整合分析各类芯片及NGS数据,下游扩展也很丰富。不过软件卖的比较贵。
: 如果你对bioinformatics及其相关软件不是很熟悉,那么不建议从原始数据开始处理。
: 通常一般从公司或者core facility拿到processed data之后,那么可以尝试使用一些
: 现成的webserver,比如:
: MicroRNA and mRNA integrated analysis (MMIA): a web tool for examining
: biological functions of microRNA expression
: Nucl. Acids Res. (2009) 37 (suppl 2): W356-W362.
: http://129.79.244.122/~MMIA/
:

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g*t
9
fixed, thanks

【在 d******c 的大作中提到】
: 康明斯一般专指柴油机公司,你说的一般叫康宁
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j*x
10
有几种不同的授权方式,自个儿实验室单买的话大概是2000$/Year。目前有很多大学/
研究所都买的group license,但是算下来也不便宜。

【在 t*d 的大作中提到】
: 很好的信息。谢谢!
: 顺便打听一下 Partek Genomics Suite 价钱?是不是按年收费?

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n*t
11
Jobs 并不一定想收拾android,他最多就是看到狗这个东西恶心而已。
没有狗,就有无数别的硬件公司和他竞争。现在他和狗分别处在垄断地位,但是一般人
还看不出来不会被拆。

【在 g****t 的大作中提到】
: 第一:
: 人身上带一个headless android盒子作为control。屏幕作为view放在别的设备上。这
: 个是可能的。
: (view 不可能是glasses。我多年前和goog glasses的人做过项目。调试过好几个月。
: 后来因为鸡毛鸭血的问题,... 本身这个设备很好。但是无法覆盖大多数场景。
: 康宁,就是以前Steve Jobs找来做玻璃那个公司以前有个广告的思路我觉得是对的)
: view 可以半年更新一次。control可以3年更新一次。
: 市场证明了的软件的MVC结构,本身就证明这种硬件布局是合理的。
: 假设现在的硬件布局为X. 新布局为Y. Y也是一个平衡点。
: 这点我认为合理。然而要有足够的资金来推动。这个要详细测算才行。

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t*d
12
非常感谢!
这个价钱还不算太黑。毕竟是小众软件。

【在 j****x 的大作中提到】
: 有几种不同的授权方式,自个儿实验室单买的话大概是2000$/Year。目前有很多大学/
: 研究所都买的group license,但是算下来也不便宜。

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g*t
13
是這樣的。地球上最大的社會學家,世界體系學說的發明人臥樂斯坦,他有一個理論。
他就說美國和
蘇聯的冷戰是一場針對第三世界國家的陰謀。是一個聯合起來共同管理世界,剝削其他國
家的架構。所以毛泽东弄了个第三世界理论,让周恩来去开万隆会议。从战略高度的层
面来讲,太祖水平还是不错的。不过有点眼高手低了。


: Jobs 并不一定想收拾android,他最多就是看到狗这个东西恶心而已。

: 没有狗,就有无数别的硬件公司和他竞争。现在他和狗分别处在垄断地位
,但是
一般人

: 还看不出来不会被拆。



【在 n******t 的大作中提到】
: Jobs 并不一定想收拾android,他最多就是看到狗这个东西恶心而已。
: 没有狗,就有无数别的硬件公司和他竞争。现在他和狗分别处在垄断地位,但是一般人
: 还看不出来不会被拆。

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c*e
14
I am learning MMIA now. Thanks for the information.
Is cytospace a good tool to do this too?
Besides microRNA and mRNA, I also have 450K DNA methylation array data from the
same matched samples. Will Partek Genomics Suite integrate all of the data together?
Thanks!

【在 j****x 的大作中提到】
: 推荐Partek Genomics Suite,个人认为是目前最好的高通量数据分析软件:跨平台,
: 能够整合分析各类芯片及NGS数据,下游扩展也很丰富。不过软件卖的比较贵。
: 如果你对bioinformatics及其相关软件不是很熟悉,那么不建议从原始数据开始处理。
: 通常一般从公司或者core facility拿到processed data之后,那么可以尝试使用一些
: 现成的webserver,比如:
: MicroRNA and mRNA integrated analysis (MMIA): a web tool for examining
: biological functions of microRNA expression
: Nucl. Acids Res. (2009) 37 (suppl 2): W356-W362.
: http://129.79.244.122/~MMIA/
:

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n*t
15
我覺得,美國和蘇聯的陰謀,不光是針對第三世界的。美國的真正敵人其實一直是歐洲
,美國的文明程度,人口素質並不比歐洲高。由蘇聯這個屌絲盯住歐洲,自己可以維持
壟斷。
中共可怕的地方在於讓美國意識到自己可以用來取代蘇聯的位置,這一點明確之後,美
國對共產黨的人權問題就完全是睜一隻眼閉一隻眼了。

他國

【在 g****t 的大作中提到】
: 是這樣的。地球上最大的社會學家,世界體系學說的發明人臥樂斯坦,他有一個理論。
: 他就說美國和
: 蘇聯的冷戰是一場針對第三世界國家的陰謀。是一個聯合起來共同管理世界,剝削其他國
: 家的架構。所以毛泽东弄了个第三世界理论,让周恩来去开万隆会议。从战略高度的层
: 面来讲,太祖水平还是不错的。不过有点眼高手低了。
:
:
: Jobs 并不一定想收拾android,他最多就是看到狗这个东西恶心而已。
:
: 没有狗,就有无数别的硬件公司和他竞争。现在他和狗分别处在垄断地位
: ,但是
: 一般人

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