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seeking recommendation for clustering analyses

seeking recommendation for clustering analyses# Biology - 生物学

l*r2011-08-25 07:08

1 楼

This will be my first time to attend ACS spring meeting. I submitted my
abstract last year, and got email that my oral presentation was accepted.
But that email did not list the time and location of the presentation. Since
I do not like to stay for the whole meeting ( 5 days) in Dallas, I am
wondering how to find out the schedule for my presentation. Thank you very
much!

e*l2011-08-25 07:08

2 楼

今天晚上有点饿就想吃点CHICKEN NUGGETS 打开冰箱想了想又翻了一片面包出来这
样把面包放在下面就不用费劲洗盘子了自己边吃边想真是天平座懒得可以 SIGH。。
。。。。

n*r2011-08-25 07:08

3 楼

ID:
nyer
歌名:
石头记
创作说明:
这个应该用什么感情唱呢？
歌曲链接:
曲作者:
刘以达
词作者:
陈少琪
原唱:
达明一派
歌词:
看遍了冷冷清风
吹飘雪
渐厚
鞋踏破路湿透
再看遍远远青山
吹飞絮
弱柳
曾独醉病消瘦
听遍那渺渺世间
轻飘送
乐韵
人独舞乱衣鬓
一心把思绪抛却似虚如真
深院内旧梦复浮沉
一心把生关死结与酒同饮
焉知那笑黡藏泪印
丝丝点点计算
偏偏相差太远
兜兜转转
化作段段尘缘
纷纷扰扰作嫁
春宵恋恋变卦
真真假假
悉悲欢恩怨原是诈（花色香皆看化）

n*k2011-08-25 07:08

4 楼

I have two series data (from miRNA array analysis), each comprising of data
from 6 time points either experimental or control groups...Now I desire to
do a cluster analysis for them to sort out genes which change in the same
or different dynamics between the two groups...Any recommendation on the
software? thanks

j*n2011-08-25 07:08

5 楼

哈哈，还真是。。。
每次都充满期待的打开秤子们的主题贴，幻想秤子们会如何倾诉自己。。。
然后每次打开一看，都是两三行。。。。
哈哈，很笨的白杨式玩笑阿，别介意 = =；
。。。

z*n2011-08-25 07:08

6 楼

e*t2011-08-25 07:08

7 楼

M*t2011-08-25 07:08

8 楼

比懒我很有兴趣
我在一个公寓里住过一年，烤箱一次都没用过

【在 e*****l 的大作中提到】

: 今天晚上有点饿就想吃点CHICKEN NUGGETS 打开冰箱想了想又翻了一片面包出来这
: 样把面包放在下面就不用费劲洗盘子了自己边吃边想真是天平座懒得可以 SIGH。。
: 。。。。

a*g2011-08-25 07:08

9 楼

bd
那哥的签名档好像换新的了？是啥意思啊？

n*k2011-08-25 07:08

10 楼

thanks, I am a idiotbird, so no R...need something user friendly:))

【在 e*****t 的大作中提到】

: R

e*l2011-08-25 07:08

11 楼

我不怎么会写东西看别人说的天平这个那个的时候觉得自己挺像的嘿嘿

【在 j**n 的大作中提到】

: 哈哈，还真是。。。
: 每次都充满期待的打开秤子们的主题贴，幻想秤子们会如何倾诉自己。。。
: 然后每次打开一看，都是两三行。。。。
: 哈哈，很笨的白杨式玩笑阿，别介意 = =；
: 。。。

b*a2011-08-25 07:08

12 楼

唱的一如既往的牛啊
第二句那里是你说了一句话吗？吓了我一跳

f*e2011-08-25 07:08

13 楼

rapidminer

e*l2011-08-25 07:08

14 楼

我是小事情懒稍微大点的事情挺能折腾的：）

【在 M****t 的大作中提到】

: 比懒我很有兴趣
: 我在一个公寓里住过一年，烤箱一次都没用过

b*b2011-08-25 07:08

15 楼

你以前是搞专业的吧！！赞！

【在 n**r 的大作中提到】

: ID:
: nyer
: 歌名:
: 石头记
: 创作说明:
: 这个应该用什么感情唱呢？
: 歌曲链接:
: 曲作者:
: 刘以达
: 词作者:

j*x2011-08-25 07:08

16 楼

hehe,以后凡是这种只回答“R”或者“Bioconductor”而不指明package的，版主应该
扣包子
miRNA Time-series和传统的mRNA Time-series Clustering没有太大的差别，我以前都
是先在genespring下面用k-means聚类大致看一下，再决定怎么往下走。
绝大部分商业芯片分析软件都有相应功能，你那里要是有的话就翻翻manual。要是不想
花钱就看看下面这个Short Time-series Expression Miner (STEM)，挺不错的。
http://gene.ml.cmu.edu/stem/

【在 n********k 的大作中提到】

: thanks, I am a idiotbird, so no R...need something user friendly:))

S*P2011-08-25 07:08

17 楼

第一懒星座

【在 e*****l 的大作中提到】

s*32011-08-25 07:08

18 楼

哇，石头记是我听过的达明的唯一的一首歌，但是喜欢了很多年，这歌写得非常飘
逸脱俗。但是我自从看了周星星的《食神》里那个“老衲法号xx”的刘以达之后，我
再听达明的歌就有了一种很颠覆的感觉。。。。
nyer唱的很赞！开始那个“一起唱啊”的旁白，是你说的么？

【在 n**r 的大作中提到】

: ID:
: nyer
: 歌名:
: 石头记
: 创作说明:
: 这个应该用什么感情唱呢？
: 歌曲链接:
: 曲作者:
: 刘以达
: 词作者:

n*k2011-08-25 07:08

19 楼

thanks, I know that, I have been trying to general cluster analysis software
... it is not that user-friendly in term of input data format, 2. no link
for the miRNA genes...I could live with the second problem but the first one
has been annoying...Free is better at this moment...

【在 j****x 的大作中提到】

: hehe,以后凡是这种只回答“R”或者“Bioconductor”而不指明package的，版主应该
: 扣包子
: miRNA Time-series和传统的mRNA Time-series Clustering没有太大的差别，我以前都
: 是先在genespring下面用k-means聚类大致看一下，再决定怎么往下走。
: 绝大部分商业芯片分析软件都有相应功能，你那里要是有的话就翻翻manual。要是不想
: 花钱就看看下面这个Short Time-series Expression Miner (STEM)，挺不错的。
: http://gene.ml.cmu.edu/stem/

x*s2011-08-25 07:08

20 楼

懒得一年没做过饭了

c*s2011-08-25 07:08

21 楼

很喜欢的一首歌！意境幽远的歌词。
楼主唱“春光乍泄”吧，你的嗓音很适合。

t*d2011-08-25 07:08

22 楼

都不是问题。第一个更不是问题。耐心点，任何有人用的软件都肯定能把数据弄进去。
当然免费软件一般很少说明，或说明不清楚。
碰到输入出问题时，试试下面几招：
1. 确定每个数据的前后没有多余的空格;
2. 确定数据中没有奇怪的符号。
3. 确定数据文件的分行符和软件的要求匹配。MAC，windows 和linux用的分行符各不
相同。
4. 确定最后一行有分行符。
还有什么，大家补充一下吧。

software
one

【在 n********k 的大作中提到】

: thanks, I know that, I have been trying to general cluster analysis software
: ... it is not that user-friendly in term of input data format, 2. no link
: for the miRNA genes...I could live with the second problem but the first one
: has been annoying...Free is better at this moment...

c*u2011-08-25 07:08

23 楼

聪明

今天晚上有点饿就想吃点CHICKEN NUGGETS 打开冰箱想了想又翻了一片面包出来这
样把面包放在下面就不用费劲洗盘子了自己边吃边想真是天平座懒得可以 SIGH。。
。。。。

【在 e*****l 的大作中提到】

n*r2011-08-25 07:08

24 楼

想天上人间啦，哈哈

【在 a****g 的大作中提到】

: bd
: 那哥的签名档好像换新的了？是啥意思啊？

c*y2011-08-25 07:08

25 楼

啊，那上升天平会不会越来越懒啊。

【在 e*****l 的大作中提到】

n*r2011-08-25 07:08

26 楼

@botaoyaya 和超级猫，那句是伴奏带的
@bbppb，专业唱歌的在楼上，我是曲校专业毕业的，哈哈
@crazysongs，春光乍泄可以试试不敢保证，我以前在karaoke点过一次结果是重新编曲
的版本，那以后我就精神错乱找不着调了

【在 b*******a 的大作中提到】

: 唱的一如既往的牛啊
: 第二句那里是你说了一句话吗？吓了我一跳

E*i2011-08-25 07:08

27 楼

你小心哦，我不知道我是不是上升天平，不过越来越懒是真的.

【在 c****y 的大作中提到】

: 啊，那上升天平会不会越来越懒啊。

z*n2011-08-25 07:08

28 楼

你就不怕周未回家跪搓板。。。

【在 n**r 的大作中提到】

: 想天上人间啦，哈哈

j*n2011-08-25 07:08

29 楼

发现天平大事都很令得清，这点很佩服

【在 e*****l 的大作中提到】

: 我是小事情懒稍微大点的事情挺能折腾的：）

n*r2011-08-25 07:08

30 楼

呃，我说的是王菲的歌，天上人间，哈哈

【在 z******n 的大作中提到】

: 你就不怕周未回家跪搓板。。。

c*u2011-08-25 07:08

31 楼

上海的？

【在 j**n 的大作中提到】

: 发现天平大事都很令得清，这点很佩服

w*w2011-08-25 07:08

32 楼

达明一派，好久远的记忆了

j*t2011-08-25 07:08

33 楼

oh yeah 我小时候喜欢过的歌
nyer一唱满是沧桑啊

【在 n**r 的大作中提到】

: ID:
: nyer
: 歌名:
: 石头记
: 创作说明:
: 这个应该用什么感情唱呢？
: 歌曲链接:
: 曲作者:
: 刘以达
: 词作者:

n*r2011-08-25 07:08

34 楼

我就这一个调调啊

【在 j*****t 的大作中提到】

: oh yeah 我小时候喜欢过的歌
: nyer一唱满是沧桑啊

j*t2011-08-25 07:08

35 楼

跟我一样，我现在唱来唱去也就是一个调调，太boring了

【在 n**r 的大作中提到】

: 我就这一个调调啊

b*f2011-08-25 07:08

36 楼

呱唧呱唧～又来一个native speaker...

w*w2011-08-25 07:08

37 楼

流水落花春去也

a*e2011-08-25 07:08

38 楼

那个演唱会的话不是你说的吧，怎么听上去和唱的声音很像啊？

S*e2011-08-25 07:08

39 楼

我不赶脚很沧桑啊~ 倒是听出了几分油情~ 咔咔~

n*r2011-08-25 07:08

40 楼

话不是我说的，最后鼓掌的是我自己，哈哈

【在 a***e 的大作中提到】

: 那个演唱会的话不是你说的吧，怎么听上去和唱的声音很像啊？

a*g2011-08-25 07:08

41 楼

难道是“此曲只因天上有？”

【在 n**r 的大作中提到】

: 想天上人间啦，哈哈

n*r2011-08-25 07:08

42 楼

没有啦，就是觉的时间过得太快，刷刷的

【在 a****g 的大作中提到】

: 难道是“此曲只因天上有？”

w*w2011-08-25 07:08

43 楼

也为你鼓掌了~~

【在 n**r 的大作中提到】

: 话不是我说的，最后鼓掌的是我自己，哈哈

f*a2011-08-25 07:08

44 楼

这个歌为什么一直没有好的伴奏啊。只有这个演唱会现场的
照说就算拿原唱cd里面那个消音，效果也比这个好啊

f*a2011-08-25 07:08

45 楼

You can try to get the instrumental part from the following link
http://www.youtube.com/watch?v=xKTDP9ud80o
Here is the original MV

a*u2011-08-25 07:08

46 楼

这个事情群众估计不是没有干过。
当年好像豪哥在这的时候就一直说起过。
但是达明一派的这张专辑的混音是中间也有，旁边也有，
所以消音就杯具了。。。
还有一招是去找个midi文件，然后再来自己给加上音源，
来点效果，说不定还能行。

【在 f***a 的大作中提到】

: 这个歌为什么一直没有好的伴奏啊。只有这个演唱会现场的
: 照说就算拿原唱cd里面那个消音，效果也比这个好啊

f*a2011-08-25 07:08

47 楼

要不我回家用这个给你消音一个试试？？？
实在不忍受你的声音和这个现场版演唱会伴奏放一起

f*a2011-08-25 07:08

48 楼

这里有个midi版本的，效果还行
就是主旋律部分演奏者跑调。。。。
http://bz.5sing.com/957875.html

a*u2011-08-25 07:08

49 楼

现在我总算明白为啥当年的达明一派是前卫的了。
就是说，现在听起来和看起来还是不老套的。

【在 f***a 的大作中提到】

: You can try to get the instrumental part from the following link
: http://www.youtube.com/watch?v=xKTDP9ud80o
: Here is the original MV

a*u2011-08-25 07:08

50 楼

不行，这个已经是mp3文件了，
要是mid文件才好挂虚拟乐器。

【在 f***a 的大作中提到】

: 这里有个midi版本的，效果还行
: 就是主旋律部分演奏者跑调。。。。
: http://bz.5sing.com/957875.html

f*a2011-08-25 07:08

51 楼

我刚才贴的那个链接的效果就还行，就是节奏不稳加上有些跑调
我回头去拼接一下，争取搞个好点儿的版本
其实消音不必要，就是处理人声。人声大伴奏声音小的时候，就拼命减高频和中频
人声小伴奏大的时候就把整体音量调低
虽然单独听伴奏不咋得，但是你再合成上自己唱的那轨音量大些，基本上一点儿也听不
出来

【在 a*******u 的大作中提到】

: 这个事情群众估计不是没有干过。
: 当年好像豪哥在这的时候就一直说起过。
: 但是达明一派的这张专辑的混音是中间也有，旁边也有，
: 所以消音就杯具了。。。
: 还有一招是去找个midi文件，然后再来自己给加上音源，
: 来点效果，说不定还能行。

f*a2011-08-25 07:08

52 楼

我是说这个是midi做的mp3文件。
其实这个应该可以满足nyer的要求了
稍微假了一些，我再把前奏和间奏等没有人声的地方，用原始音频拼接上去，就天衣无
缝了。

【在 a*******u 的大作中提到】

: 不行，这个已经是mp3文件了，
: 要是mid文件才好挂虚拟乐器。

a*u2011-08-25 07:08

53 楼

哦，好，这个我要学习！

【在 f***a 的大作中提到】

: 我是说这个是midi做的mp3文件。
: 其实这个应该可以满足nyer的要求了
: 稍微假了一些，我再把前奏和间奏等没有人声的地方，用原始音频拼接上去，就天衣无
: 缝了。

f*a2011-08-25 07:08

54 楼

看我今天晚上要不要弄一个出来，哈哈哈哈

【在 a*******u 的大作中提到】

: 哦，好，这个我要学习！

n*r2011-08-25 07:08

55 楼

我估摸着这个就能把你炸出来，就是没想到反应这么大。。。

【在 f***a 的大作中提到】

: 我刚才贴的那个链接的效果就还行，就是节奏不稳加上有些跑调
: 我回头去拼接一下，争取搞个好点儿的版本
: 其实消音不必要，就是处理人声。人声大伴奏声音小的时候，就拼命减高频和中频
: 人声小伴奏大的时候就把整体音量调低
: 虽然单独听伴奏不咋得，但是你再合成上自己唱的那轨音量大些，基本上一点儿也听不
: 出来

f*a2011-08-25 07:08

56 楼

我就是忍受不了偶像的歌喉配这破伴奏！！！！！！
最好让睡鼠妹子给你做做后期

【在 n**r 的大作中提到】

: 我估摸着这个就能把你炸出来，就是没想到反应这么大。。。

n*r2011-08-25 07:08

57 楼

我属于抽风性质的录歌，没嘛要求，不能拖累别人一起抽！

【在 f***a 的大作中提到】

: 我就是忍受不了偶像的歌喉配这破伴奏！！！！！！
: 最好让睡鼠妹子给你做做后期

w*w2011-08-25 07:08

58 楼

一起抽风吧~~
时刻关注

n*y2011-08-25 07:08

59 楼

这歌。。。我以前总唱。。。

a*g2011-08-25 07:08

60 楼

看了你写的感觉俺觉悟太低了，老拉着别人跟俺一起抽风，看来俺需要好好反省一下了！

【在 n**r 的大作中提到】

: 我属于抽风性质的录歌，没嘛要求，不能拖累别人一起抽！

n*r2011-08-25 07:08

61 楼

呃呃呃，我的意思是我那破锣嗓子吼的不值得整！

了！

【在 a****g 的大作中提到】

: 看了你写的感觉俺觉悟太低了，老拉着别人跟俺一起抽风，看来俺需要好好反省一下了！