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cDNA克隆的编码区缺失一个核苷酸?
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cDNA克隆的编码区缺失一个核苷酸?# Biology - 生物学
s*u
1
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T*y
2
我研究的基因有两个cDNA克隆,当我把它们和已知的来自于基因组的CDs比对时,发现
这两个cDNA克隆各有一个核苷酸的缺失,处于不同位置。我原来推测可能是cDNA克隆序
列不对,但后来测序其中一个cDNA克隆,证实确有一个氨基酸的缺失;当然也有其他的
突变,我推测是SNP。请问造成这种核苷酸缺失的原因是什么?
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D*S
3
Thanks for sharing!
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b*r
4
这个不叫SNP,这个是deletion
买来的克隆有突变一点也不奇怪,所以买来第一件事应该就是全程测序
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s*s
5
看不懂。你开头没测序怎么“发现”的?你的cDNA哪里来的?

【在 T*********y 的大作中提到】
: 我研究的基因有两个cDNA克隆,当我把它们和已知的来自于基因组的CDs比对时,发现
: 这两个cDNA克隆各有一个核苷酸的缺失,处于不同位置。我原来推测可能是cDNA克隆序
: 列不对,但后来测序其中一个cDNA克隆,证实确有一个氨基酸的缺失;当然也有其他的
: 突变,我推测是SNP。请问造成这种核苷酸缺失的原因是什么?

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s*t
6
到底是nucleotide deletion or amino acid deletion?
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T*y
7
是的,买来的克隆有突变一点不奇怪。
很奇怪的是有nucleotide deletion.
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T*y
8
网上有提供的cDNA序列,从专门的resource center 买来的。和公布的genomic region
的序列比对,发现有one nucleotide deletion, 我买来后测序也确证有。

【在 s******s 的大作中提到】
: 看不懂。你开头没测序怎么“发现”的?你的cDNA哪里来的?
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T*y
9
one nucleotide deletion.

【在 s****t 的大作中提到】
: 到底是nucleotide deletion or amino acid deletion?
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o*r
10
fs还能表达?

【在 T*********y 的大作中提到】
: one nucleotide deletion.
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m*p
11
Nobody can be sure their cDNAs are 100% right, even published in the NCBI.
You are just not lucky. Put that one in, if you think it is a real deletion.
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