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SiRNA or ShRNA for drug development
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SiRNA or ShRNA for drug development# Biology - 生物学
a*a
1
会不会煮裂开?
谢谢!
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a*v
2
you have a class A, where you set ctor to be private, so a client can't
call
"A a;"
to create obj on stack.
But someday another developer add a new ctor:
"A(int)"
and try to call "A a(1);" inside main(). So this will create a obj on
stack. How do you prevent that?
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a*g
3
大家还记得这个情节吗?他们第一次穿越虫洞时,女主用手指着窗外,手指都变形弯曲
了。女主表情很惊讶,她旁边的男主还关心的问怎么回事?
后面,影片快结尾时揭示了。原来是在高维的男主与女主有了交流。谁能够解释这个现
象?
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g*y
4
大家好,
我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
)引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
预见的可能问题及解决方法:
1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者
ShRNA的序列(避免同源序列)来降低非特异抑制,请问大家还有什么办法来提高特异性
吗?
2:体外合成的SiRNA在体内容易被降解:
通过对SiRNA进行一定的修饰可以提高稳定性,但是我觉得通过病毒介导表达ShRNA 可
能是一个更好的办法,因为这个是由基因突变(Gain of function)产生的疾病,体外
合成的SiRNA不能永久的抑制基因表达。
3:病毒载体的安全性:
有的病毒载体(retro, lentivirus)会整合基因组,从而可能破坏一些重要基因的表
达而引起一些副作用。所以我打算选用相对安全的AAV载体。
4:AAV载体的靶向问题,
AAV载体通过静脉注射到小鼠,高效地感染肝脏之类的器官,但是对于血液系统的感染
效率相对低。可以在病毒的Capsid上插入表达一段能特异识别T细胞的蛋白(我还不知
道什么蛋白)来提高T细胞的感染效率。
5:ShRNA能否特异的抑制肿瘤细胞里面的癌基因的表达。
因为目前没有病毒载体能特异的感染T细胞,所以进行基因治疗的时候带有ShRNA的病毒
也会感染正常细胞并且抑制这个基因在正常细胞里面的表达,所以我打算用一个T cell
specific promoter 来控制ShRNA的表达,这样虽然其它细胞也能被感染,但是ShRNA
并不表达。
简单的说,我想用AAV携带ShRNA来抑制T cell leukemia 里面的oncogene 的表达,从
而治疗这个基因引起的癌症,可行吗?
目前这个实验还处于思考阶段,不知道可行性怎样,欢迎大家批评和建议。
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d*g
5
我印象里,我外婆就是拿高压锅煮的,水没过粽子,不会煮烈滴
不过我不知道煮多久

【在 a****a 的大作中提到】
: 会不会煮裂开?
: 谢谢!

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J*d
6
加个pure virtual function在里面.

【在 a*****v 的大作中提到】
: you have a class A, where you set ctor to be private, so a client can't
: call
: "A a;"
: to create obj on stack.
: But someday another developer add a new ctor:
: "A(int)"
: and try to call "A a(1);" inside main(). So this will create a obj on
: stack. How do you prevent that?

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d*t
7
时空错乱了呗。

【在 a******g 的大作中提到】
: 大家还记得这个情节吗?他们第一次穿越虫洞时,女主用手指着窗外,手指都变形弯曲
: 了。女主表情很惊讶,她旁边的男主还关心的问怎么回事?
: 后面,影片快结尾时揭示了。原来是在高维的男主与女主有了交流。谁能够解释这个现
: 象?

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w*a
8
如果目的就是灌水的话,这种project做做也没问题。
真要治病,我看还是算了吧。

function

【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者

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a*a
9
thanks mm :)

【在 d******g 的大作中提到】
: 我印象里,我外婆就是拿高压锅煮的,水没过粽子,不会煮烈滴
: 不过我不知道煮多久

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m*g
10
稍微展开说说?

【在 J******d 的大作中提到】
: 加个pure virtual function在里面.
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s*i
11
五维空间里时间可能不止一个方向。甚至可以多余一个维度是时间维度。所以我们世界
的因果律也不适用。我们的世界里,时间是单向的。

【在 a******g 的大作中提到】
: 大家还记得这个情节吗?他们第一次穿越虫洞时,女主用手指着窗外,手指都变形弯曲
: 了。女主表情很惊讶,她旁边的男主还关心的问怎么回事?
: 后面,影片快结尾时揭示了。原来是在高维的男主与女主有了交流。谁能够解释这个现
: 象?

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m*m
12
the off-target effect of shRNA might be a big concern
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l*i
13
可以。不过由于高压锅压力各不相同,你得自己试验看看需要多少时间。基本上可以先
从30-40分钟开始。
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f*4
14
没理解错的话,这是在问你怎么样能禁止在stack上创建obj
除了把ctor声明为private,还有个办法就是把destructor声明为private
这里明显就是想问你后一种情况
你可以try一下private destructor的情况
compiler会报错的

【在 a*****v 的大作中提到】
: you have a class A, where you set ctor to be private, so a client can't
: call
: "A a;"
: to create obj on stack.
: But someday another developer add a new ctor:
: "A(int)"
: and try to call "A a(1);" inside main(). So this will create a obj on
: stack. How do you prevent that?

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a*g
15
我不是问时间回溯。我想知道的是,女主怎么能够看到身在高维的男主,并且还能有接
触?这是什么理论依据?

【在 s**i 的大作中提到】
: 五维空间里时间可能不止一个方向。甚至可以多余一个维度是时间维度。所以我们世界
: 的因果律也不适用。我们的世界里,时间是单向的。

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g*y
16
谢谢评论, 我也觉得ShRNA的特异性是一个很大的问题, 不过目前有一些文献说可以
optimized siRNA design来提高或者解决特异性的问题(当然这些文章可能就是wdgca所
说的灌水文章,赫赫).
考虑到很多药物都有off-target effect, 或者说目前的治疗手段(如化疗)会有大的副
作用, 对于癌症病人来说, 很多时候是存活时间长短的问题, 如果一种手段能把存活期
由一年延伸到5-10年的话,这种手段还是有一定价值的.
回到我的project, 如果我optimized shRNA design, 并且把ShRNA 连到 T Cell
specific promoter 后面, 那就可以把off-target effect限制在T细胞(大部分都是
leukemia)里面, 这样是不是可以提高这个实验设计的可行性呢?
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x*r
17
我每次都是用高压锅煮的,压一个小时左右。
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f*4
18
这个是错的
如果这个class 提供 heap创建的方法,那么你要是在class里定义了pure virtual
function并且没实现的话,compiler会报错;如果你实现了这个pure virtual
function的话,还是能在stack上用新的ctor创建obj

【在 J******d 的大作中提到】
: 加个pure virtual function在里面.
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g*d
19
这是本片的背景设定,不容许质疑

【在 a******g 的大作中提到】
: 我不是问时间回溯。我想知道的是,女主怎么能够看到身在高维的男主,并且还能有接
: 触?这是什么理论依据?

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C*h
20
No, using virus to deliver shRNAs to T cells is not a viable option.
You can never have enough viruses to infect human cells.

function

【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者

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b*e
21
高压锅半小时,不用高压锅估计要等到崩溃
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y*i
22
如果把析构函数声明为私有的,那就是不能用delete了,那在heap上创建对象的话,如
何析构呢?首先要收回heap上allocate的内存的话,只能用placement new对吧?然后
还不能手动调用析构函数,必须要调用一个公用Destroy函数,在这个Destroy函数里调
用析构函数,最后再free在heap上allocate的内存,是这样么?

【在 f****4 的大作中提到】
: 没理解错的话,这是在问你怎么样能禁止在stack上创建obj
: 除了把ctor声明为private,还有个办法就是把destructor声明为private
: 这里明显就是想问你后一种情况
: 你可以try一下private destructor的情况
: compiler会报错的

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l*t
23
没有看到高维的男主 只是和高维的投影接触了下

【在 a******g 的大作中提到】
: 我不是问时间回溯。我想知道的是,女主怎么能够看到身在高维的男主,并且还能有接
: 触?这是什么理论依据?

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C*h
24
You may want to try some ligands that are specific to T cell receptors to
deliver drugs.

function

【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者

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a*r
25
用高压锅最好,我冒气煮一小时。
不用高压锅的话,我记得奶奶要煮一上午。。。
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g*1
26
use explict may work
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a*g
27
两人的手貌似都接触了,大嘴安还露出了很惊讶的表情。怎么可能没看到?

【在 l******t 的大作中提到】
: 没有看到高维的男主 只是和高维的投影接触了下
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g*y
28
To Carwash: Thank you very much for comment
I can't agree more with you about the low efficiency in infecting the T
cells in vivo with virus. That is why I mentioned the potential problem 4(
AAV载体的靶向问题).
As you suggested, we could modify the virus caspid, for example, mutate the
liver cell recognition sequence and express a chimeric protein combining the
AAV capsid protein and the T cell ligand so that we can increase the
infection efficiency in T cells.
Do you think this approach works?
Here are some related papers:
A high-capacity, capsid-modified hybrid adenovirus/adeno-associated virus
vector for stable transduction of human hematopoietic cells. J Virol. 2002
Feb;76(3):1135-43.
Development of novel cell surface CD34-targeted recombinant adenoassociated
virus vectors for gene therapy. Hum Gene Ther. 1998 Sep 1;9(13):1929-37.
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n*k
29
it is hard for me to imagine another way of cooking 粽子 other than using
pressure cooker ...

【在 a****a 的大作中提到】
: 会不会煮裂开?
: 谢谢!

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y*i
30
why?
explictly creating an object on stack is also possible

【在 g**********1 的大作中提到】
: use explict may work
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B*W
31
我觉的是他们在穿虫洞,那儿的时空也是扭曲折叠的,所以与男主的时空有交叉点。当
然也可以是爱在穿越时空,给了时空交叉的动力。

【在 a******g 的大作中提到】
: 我不是问时间回溯。我想知道的是,女主怎么能够看到身在高维的男主,并且还能有接
: 触?这是什么理论依据?

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t*d
32
是不是肝癌通过这种方法治疗更好?

4:AAV载体的靶向问题,
AAV载体通过静脉注射到小鼠,高效地感染肝脏之类的器官,但是对于血液系统的感染
效率相对低。可以在病毒的Capsid上插入表达一段能特异识别T细胞的蛋白(我还不知
道什么蛋白)来提高T细胞的感染效率。

【在 g****y 的大作中提到】
: To Carwash: Thank you very much for comment
: I can't agree more with you about the low efficiency in infecting the T
: cells in vivo with virus. That is why I mentioned the potential problem 4(
: AAV载体的靶向问题).
: As you suggested, we could modify the virus caspid, for example, mutate the
: liver cell recognition sequence and express a chimeric protein combining the
: AAV capsid protein and the T cell ligand so that we can increase the
: infection efficiency in T cells.
: Do you think this approach works?
: Here are some related papers:

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d*1
33
我专门买高压锅煮粽子的
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f*e
34
把ctor声明为私有,也一样不可以创建。
你可以把dtor声明为私有,但是重载operator delete就好了应该,没具体测试。

【在 y**i 的大作中提到】
: 如果把析构函数声明为私有的,那就是不能用delete了,那在heap上创建对象的话,如
: 何析构呢?首先要收回heap上allocate的内存的话,只能用placement new对吧?然后
: 还不能手动调用析构函数,必须要调用一个公用Destroy函数,在这个Destroy函数里调
: 用析构函数,最后再free在heap上allocate的内存,是这样么?

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a*g
35
男女主角之间没有爱,至少在播的影片里没有。
但是,未剪辑前是怎么设计就不知道了。我一直感觉影片剪辑得有点生硬,很多情节给
人一种突兀的感觉。比如,开始那段捕捉飞行器的情节,一点意义都没表现出来。但是
,影片里小女孩用一种惊异的表情跟男主说,不要碰它。这表示这个飞行器应该是有故
事的,但是后来被剪掉了。

【在 B**W 的大作中提到】
: 我觉的是他们在穿虫洞,那儿的时空也是扭曲折叠的,所以与男主的时空有交叉点。当
: 然也可以是爱在穿越时空,给了时空交叉的动力。

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C*h
36
我知道日本有一家公司,他们用一种脂质体,上面经过修饰加工,
带有T cell receptor的ligand,脂质体里面包埋逆转录病毒的RNA。
脂质体把RNA送到T cells里面,再逆转录,整合到genome

the
the

【在 g****y 的大作中提到】
: To Carwash: Thank you very much for comment
: I can't agree more with you about the low efficiency in infecting the T
: cells in vivo with virus. That is why I mentioned the potential problem 4(
: AAV载体的靶向问题).
: As you suggested, we could modify the virus caspid, for example, mutate the
: liver cell recognition sequence and express a chimeric protein combining the
: AAV capsid protein and the T cell ligand so that we can increase the
: infection efficiency in T cells.
: Do you think this approach works?
: Here are some related papers:

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j*f
37
粽子不是问题,问题是糯米万一堵了高压锅的出气孔。。。
如果是高档的高压锅,不会堵,就无所谓了。:)

会不会煮裂开?
谢谢!

【在 a****a 的大作中提到】
: 会不会煮裂开?
: 谢谢!

avatar
r*n
38
靠,难道精神病患者还有一半活在另外的平行空间

【在 s**i 的大作中提到】
: 五维空间里时间可能不止一个方向。甚至可以多余一个维度是时间维度。所以我们世界
: 的因果律也不适用。我们的世界里,时间是单向的。

avatar
t*d
39
off-target effect 是关键问题。如你所说,所有癌症治疗手段都有副作用。问题是副
作用是不是在可承受范围内。每个现在市面上的药都花了大钱从无数先导物里面筛出来
的。如果你能塞出一个副作用在可受范围内的 siRNA,就发财了。
看上去 siRNA 比化学小分子更容易被 rationally des
igned。可是目前 siRNA 这个
领域还没有这样成功的例子。也许只是时间问题?

【在 g****y 的大作中提到】
: 谢谢评论, 我也觉得ShRNA的特异性是一个很大的问题, 不过目前有一些文献说可以
: optimized siRNA design来提高或者解决特异性的问题(当然这些文章可能就是wdgca所
: 说的灌水文章,赫赫).
: 考虑到很多药物都有off-target effect, 或者说目前的治疗手段(如化疗)会有大的副
: 作用, 对于癌症病人来说, 很多时候是存活时间长短的问题, 如果一种手段能把存活期
: 由一年延伸到5-10年的话,这种手段还是有一定价值的.
: 回到我的project, 如果我optimized shRNA design, 并且把ShRNA 连到 T Cell
: specific promoter 后面, 那就可以把off-target effect限制在T细胞(大部分都是
: leukemia)里面, 这样是不是可以提高这个实验设计的可行性呢?

avatar
n*k
40
自己摸索时间,45分钟到一个小时左右。时间太长了有可能会乱七八糟。

【在 j**f 的大作中提到】
: 粽子不是问题,问题是糯米万一堵了高压锅的出气孔。。。
: 如果是高档的高压锅,不会堵,就无所谓了。:)
:
: 会不会煮裂开?
: 谢谢!

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w*a
41
飞行器那段当然有作用。
那是当时地球附近出现了gravity anomaly.
还有很多自行拖拉机也过来了。

【在 a******g 的大作中提到】
: 男女主角之间没有爱,至少在播的影片里没有。
: 但是,未剪辑前是怎么设计就不知道了。我一直感觉影片剪辑得有点生硬,很多情节给
: 人一种突兀的感觉。比如,开始那段捕捉飞行器的情节,一点意义都没表现出来。但是
: ,影片里小女孩用一种惊异的表情跟男主说,不要碰它。这表示这个飞行器应该是有故
: 事的,但是后来被剪掉了。

avatar
g*y
42
谢谢, 能告诉我这家公司的信息吗?

【在 C*****h 的大作中提到】
: 我知道日本有一家公司,他们用一种脂质体,上面经过修饰加工,
: 带有T cell receptor的ligand,脂质体里面包埋逆转录病毒的RNA。
: 脂质体把RNA送到T cells里面,再逆转录,整合到genome
:
: the
: the

avatar
A*a
43
我高压锅煮了1小時,,,我覺得好吃
我媽說煮得太爛了
avatar
r*n
44
我觉得只是单向的交流,前面id 的解释更有意思,她是和男主在另一个时空在当前
时空的投影接触
至于为什么会有机会看到,我感觉或许可以用 fixed point theory 和 contract
mapping 来解释,就好比把世界地图扔地上,地上必有一点和地图上对应的该点相重合
。两个关联的时空间之间或许也有这样的 fixed point

【在 a******g 的大作中提到】
: 大家还记得这个情节吗?他们第一次穿越虫洞时,女主用手指着窗外,手指都变形弯曲
: 了。女主表情很惊讶,她旁边的男主还关心的问怎么回事?
: 后面,影片快结尾时揭示了。原来是在高维的男主与女主有了交流。谁能够解释这个现
: 象?

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g*y
45
To Ttd:
肝癌通过这种方法治疗应该会更好,当然也会面临特异性的问题,
我也觉得SiRNA比小分子化合物更靠铺, 今年AACR的时候和一个药厂的前辈聊天的时候
说到我在筛选小分子化合物来抑制蛋白蛋白之间的相互作用, 前辈直接说这种project
灌水可行, 都是做药物研发不可靠. 我也觉得是这样的,毕竟蛋白质作用的surface比较
大, 小分子药物的特异性不够高.
至于SiRNA的副作用在能不能在可受范围内,这个无法预测, 只有在优化SiRNA的设计并
且提高T细胞的感染效率后去试了才知道.
avatar
a*a
46
谢谢大家回复,实践证明,上气半个小时,已经很熟了
avatar
l*d
47
片尾,跟高维男主交流,我靠,我竟然没注意。

【在 a******g 的大作中提到】
: 大家还记得这个情节吗?他们第一次穿越虫洞时,女主用手指着窗外,手指都变形弯曲
: 了。女主表情很惊讶,她旁边的男主还关心的问怎么回事?
: 后面,影片快结尾时揭示了。原来是在高维的男主与女主有了交流。谁能够解释这个现
: 象?

avatar
C*h
48
takeda.com

【在 g****y 的大作中提到】
: 谢谢, 能告诉我这家公司的信息吗?
avatar
g*y
49
Thanks,

【在 C*****h 的大作中提到】
: takeda.com
avatar
c*3
50
这个我感兴趣,我做siRNA efficacy predition的。
当然从某种角度来说也算是灌水文章,毕竟计算也就是一个概率游戏,不可能得到100%
肯定的结果。
有兴趣可以聊聊
avatar
h*e
51
non viral siRNA delivery体系不少, in vitro silencing efficacy 到95%以上的也
有一些,上临床的也有1-2个,好像没成功
主要现在最大的问题是liver accumulation和毒性

function

【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者

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g*y
52
谢谢,我当然有兴趣了,能不能告诉我siRNA efficacy predition是怎么做的吗? 通
过Blast? 我看有一些文献为了筛选specific的SiRNA, 设计好几个不同的SiRNA去处理
细胞, 然后做Microarray去看这些SiRNA的调控的基因,通过对比来看特异性,不过我
觉得这个好像也不是很可靠,毕竟Microarray里表达量下降的基因很多,我们也不知道
哪些基因是直接由SiRNA抑制的

100%

【在 c***3 的大作中提到】
: 这个我感兴趣,我做siRNA efficacy predition的。
: 当然从某种角度来说也算是灌水文章,毕竟计算也就是一个概率游戏,不可能得到100%
: 肯定的结果。
: 有兴趣可以聊聊

avatar
g*y
53
liver accumulation 可能是因为liver有清除外来异物的功能吧, 我打算用的病毒也
是在liver有很高的感染效率,所以我打算突变掉病毒capsid的肝脏识别序列并替换成T
cell ligand, 希望这样能提高感染T细胞的效率, 不知道这种设想可不可行, 赫赫

【在 h***e 的大作中提到】
: non viral siRNA delivery体系不少, in vitro silencing efficacy 到95%以上的也
: 有一些,上临床的也有1-2个,好像没成功
: 主要现在最大的问题是liver accumulation和毒性
:
: function

avatar
h*e
54
病毒这块我不懂,非病毒的体系没有这么简单,很多GENE DELIVERY的体系体外确实很
好,就是卡在liver 这步

成T

【在 g****y 的大作中提到】
: liver accumulation 可能是因为liver有清除外来异物的功能吧, 我打算用的病毒也
: 是在liver有很高的感染效率,所以我打算突变掉病毒capsid的肝脏识别序列并替换成T
: cell ligand, 希望这样能提高感染T细胞的效率, 不知道这种设想可不可行, 赫赫

avatar
g*y
55
hehe, 这么说治疗肝癌还是比较可行的了,无论病毒还是非病毒,deliver到肝脏都是
小事一桩阿
avatar
h*e
56
ANYWAY,现在CANCER THERAPY的最新方向不是SIRNA了,发好文章没问题,拿FUNDING问
题多多

function

【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者

avatar
h*e
57
对,如果没转移扩散的话

【在 g****y 的大作中提到】
: hehe, 这么说治疗肝癌还是比较可行的了,无论病毒还是非病毒,deliver到肝脏都是
: 小事一桩阿

avatar
g*y
58
现在CANCER THERAPY的最新方向是什么? Immunotherapy? 赫赫,感觉SiRNA都还没有
成为过CANCER THERAPY的重要方向就已经被淘汰了?如果能发好文章也行啊, 有好文
章才有可能拿funding阿,呵呵,题外话了
avatar
d*p
59
siRNA 还是一个不错的方向,毒性和specific delivery是药界的共同的问题,也是
siRNA目前最大障碍了,不过对肝脏疾病我觉得还是很有用的。
avatar
s*t
60
SiRNA is NOT specific.
use Morpholinos oligos (made by Gene Tools,LLC, http://www.gene-tools.com/). It is antisense oligo with high specificity, stable in the cells (can not degraded by RNAase or DNAase or Proteinase etc). I have used Morpholinos in cell culture and mouse. Work really well.
avatar
C*h
61
Antisense oligos are not specific either.

【在 s*******t 的大作中提到】
: SiRNA is NOT specific.
: use Morpholinos oligos (made by Gene Tools,LLC, http://www.gene-tools.com/). It is antisense oligo with high specificity, stable in the cells (can not degraded by RNAase or DNAase or Proteinase etc). I have used Morpholinos in cell culture and mouse. Work really well.

avatar
s*t
62
Not completely true. A well designed antisense oligo along with proper
controls, antisense oligo can be specific.

【在 C*****h 的大作中提到】
: Antisense oligos are not specific either.
avatar
C*h
63
So can be RNAi

【在 s*******t 的大作中提到】
: Not completely true. A well designed antisense oligo along with proper
: controls, antisense oligo can be specific.

avatar
C*S
64
同问,现在新方向是什么啊?为灌水做准备。

【在 h***e 的大作中提到】
: ANYWAY,现在CANCER THERAPY的最新方向不是SIRNA了,发好文章没问题,拿FUNDING问
: 题多多
:
: function

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