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genotype 的价格

genotype 的价格# Biology - 生物学

l*o2011-12-18 08:12

1 楼

带艾迪出门办事，发现今天是holiday, 所有的office都关门了，结果啥事也没办成。
然后去狗公园，找了个离公园门口比较远的停车场，中间是一段树林中的小路。下车时
发现自己居然没有带leash! 只好硬着头皮让艾迪off leash的去走trail，第一次看见
别的狗过去时，她过去骚扰别人，那个主人有点生气。我只好一看到别的狗在远处时，
就抓住艾迪的collar, 弯腰带她走过去。今天路上狗还特别多...
决定以后在车上常备一条leash...

b*e2011-12-18 08:12

2 楼

最近需要测定一些被试人群的几个特定基因的polymorphism,
包括5-httlpr,APOE, DAT1,DRD2,DRD4,COMT,MAO-A等常见与特定精神疾病有关联的基因
，总共不超过10个，因为预算有限，原来又没有做过，所以想来了解一下行情。
另外，目前从saliva测基因的技术可靠性和性价比如何，与测血样相比？
采血样的成本和人力的要求比较高，还有不少被试不愿意，
如果能从saliva测最好。
thanks for any advices.

m*j2011-12-18 08:12

3 楼

哈哈，和我那天去接AFU　KC回家一样。
当时还下着雨，最后只好，直接从VET抱上车
到家直接从车里抱进屋里

H*g2011-12-18 08:12

4 楼

如果都是SNP的话，Sequenom应该挺便宜，十几cents per snp per sample.
saliva提出的DNA做genotyping一般没什么问题

b*e2011-12-18 08:12

5 楼

多谢。能不能说得更详细一些，或者指点一下哪里可以找到相关的信息？

H*g2011-12-18 08:12

6 楼

这个是sequenom的网站上关于genotyping的介绍。这个方法最多可以把40个SNP
multiplex在一个pool里面，对于你们要做的这种genotyping比较适用。Illumina也有
低通量的genotyping的array，你也可以试试看。Taqman也有genotyping的assay。一般
他么的网站上都会介绍。具体要看你们那里的core facility喜欢用哪种了。

H*g2011-12-18 08:12

7 楼

sequenom link： http://www.sequenom.com/home/products---services/genetic-analysis/applications/snp-genotyping-with-iplex-gold/

b*e2011-12-18 08:12

8 楼

thanks a lot.

b*e2011-12-18 08:12

9 楼

有没有人能给一个大概的估价，每个被试做10个左右的SNP genotyping，预算大概需要
多少？总共计划做500人左右，$100/人够不够？要去和大老板申请经费了。
thanks,