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BAC这种超大质粒转染试剂用什么
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BAC这种超大质粒转染试剂用什么# Biology - 生物学
c*k
1
Engineer的postdoc了很长时间,混乐个GC
找了很长时间的工作。
感觉一般只能找到Start up的小公司。
感觉大公司很难进啊。
而且动不动就是要求10年8年的
经验
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s*a
2
个位可在回贴中
列出配置 和 价钱 本人已有显示器
当然还有联系方式
谢谢
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s*a
3
有没有同志有经验?
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J*n
4
原来postdoc也是这个感受。。。

【在 c******k 的大作中提到】
: Engineer的postdoc了很长时间,混乐个GC
: 找了很长时间的工作。
: 感觉一般只能找到Start up的小公司。
: 感觉大公司很难进啊。
: 而且动不动就是要求10年8年的
: 经验

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l*3
5
正在玩crysis 2,感觉关键在显卡,我的GTX 460 SLI,200刀的卡(单卡或者双卡SLI/
CF),足矣。至于平台,配2500K的大众机型就可以了。
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s*s
6
以前ms讨论过。我们用lipofectamin ltx

【在 s******a 的大作中提到】
: 有没有同志有经验?
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w*n
7
弄反了
毕业之后先进大公司赚reputation和experience,比如investment bank
然后再去小一点的公司赚钱,比如hedge fund

【在 c******k 的大作中提到】
: Engineer的postdoc了很长时间,混乐个GC
: 找了很长时间的工作。
: 感觉一般只能找到Start up的小公司。
: 感觉大公司很难进啊。
: 而且动不动就是要求10年8年的
: 经验

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W*3
8
XPS 8300 with ATI 5770, everything max out, you can get it below $700.
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c*k
10
关键是大公司不要咱们啊

【在 w*****n 的大作中提到】
: 弄反了
: 毕业之后先进大公司赚reputation和experience,比如investment bank
: 然后再去小一点的公司赚钱,比如hedge fund

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l*g
11
i7 2600k +gtx 460 se或
athlon 4200 +GS 8800, 均可流畅运行,把anti-alias 关掉,1920X1080没问题。
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w*n
13
继续努力

【在 c******k 的大作中提到】
: 关键是大公司不要咱们啊
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r*y
14
does 2500k + 560 gti + 16gb memory good??
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s*s
15
,其实效率不重要,反正最后你多半挑克隆,有那么几个就行了

【在 s******a 的大作中提到】
: 谢谢两位
: 我决定先试试lipofectamine 2000
: (实验室刚好有)

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s*a
16
实在不好意思,又把这个帖子顶起来。
从国内回来一个月了,一直在转我的BAC DNA,一直在失败。
我想总结一下失败的经验,并且继续求教大家:
我需要转染的细胞是Hepa 1-6,小鼠肝癌细胞,8-well plate 每孔种10000个细胞 ,
第二天转染。固定lipofectamine用量(量大毒性大),优化的主要是DNA和
lipofectamine的比例。每孔转10 ng 到数 ug之间的range都试过,没有能够work的。
用普通质粒作为阳性对照,转染效率相当高,80-90%是有的。
这篇nature method文章用lipofectamine转BAC到小鼠ES细胞,10 cm2 的碟用10 ul
lipo转150-350 ng BAC DNA(protocol在supplementary,但是有typo,写的是150-350
ug)。我和文章作者email也联系过,他们转染的效率也只有1-2%。
所以现在唯一能确定的是转BAC DNA(我的约250kb)还是比普通质粒要难很多的。目前
对于lipo2000也已经没有idea了。
我现在开始尝试电转,第一次参数不合适细胞全死了,接下去准备降低电压和电容再试
试。
做过BAC转染的能否指点一下呢?
题外话:
实验室另一PhD,之前用lipo转过BAC,一开始口口声声他的protocol工作(同样的细胞
),不让我优化,我最后实在转不出来才开始优化。后来,我得知他所谓work就是8-
well nunc一个well中有5个阳性细胞(转染后48小时,这时候细胞已经很密)。就这他
还高高上上的教育我,有1个细胞就可以了。

【在 s*********t 的大作中提到】
: 不难的,跟转普通质粒差不多。
: http://www.nature.com/nmeth/journal/v5/n5/abs/nmeth.1199.html
: Lipofectamine 2000都可以的
: http://www.nature.com/nmeth/journal/v5/n5/extref/nmeth.1199-S1.
: 详细的protocol,照着做就行了。

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s*s
17
确实有一个细胞转上就行了。效率低是肯定的

350

【在 s******a 的大作中提到】
: 实在不好意思,又把这个帖子顶起来。
: 从国内回来一个月了,一直在转我的BAC DNA,一直在失败。
: 我想总结一下失败的经验,并且继续求教大家:
: 我需要转染的细胞是Hepa 1-6,小鼠肝癌细胞,8-well plate 每孔种10000个细胞 ,
: 第二天转染。固定lipofectamine用量(量大毒性大),优化的主要是DNA和
: lipofectamine的比例。每孔转10 ng 到数 ug之间的range都试过,没有能够work的。
: 用普通质粒作为阳性对照,转染效率相当高,80-90%是有的。
: 这篇nature method文章用lipofectamine转BAC到小鼠ES细胞,10 cm2 的碟用10 ul
: lipo转150-350 ng BAC DNA(protocol在supplementary,但是有typo,写的是150-350
: ug)。我和文章作者email也联系过,他们转染的效率也只有1-2%。

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s*a
18
问题是现在一个细胞也转不上:(

【在 s******s 的大作中提到】
: 确实有一个细胞转上就行了。效率低是肯定的
:
: 350

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s*s
19
你得细胞转普通质粒啥的好转么?有的细胞难搞
我一般也就转转fibroblast, 还是很容易的

【在 s******a 的大作中提到】
: 问题是现在一个细胞也转不上:(
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s*a
20
非常好,80-90%,你没有仔细读我上面的帖子啊。

【在 s******s 的大作中提到】
: 你得细胞转普通质粒啥的好转么?有的细胞难搞
: 我一般也就转转fibroblast, 还是很容易的

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l*y
21
1% efficiency is good enough, my cells can't even get 1%.
I have tried both electroporation and nucleofection for BAC, both work fine.
nucleofection is better and easier because reagents and parameters are
already optimized with the commerial kit.

350

【在 s******a 的大作中提到】
: 实在不好意思,又把这个帖子顶起来。
: 从国内回来一个月了,一直在转我的BAC DNA,一直在失败。
: 我想总结一下失败的经验,并且继续求教大家:
: 我需要转染的细胞是Hepa 1-6,小鼠肝癌细胞,8-well plate 每孔种10000个细胞 ,
: 第二天转染。固定lipofectamine用量(量大毒性大),优化的主要是DNA和
: lipofectamine的比例。每孔转10 ng 到数 ug之间的range都试过,没有能够work的。
: 用普通质粒作为阳性对照,转染效率相当高,80-90%是有的。
: 这篇nature method文章用lipofectamine转BAC到小鼠ES细胞,10 cm2 的碟用10 ul
: lipo转150-350 ng BAC DNA(protocol在supplementary,但是有typo,写的是150-350
: ug)。我和文章作者email也联系过,他们转染的效率也只有1-2%。

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s*a
22
Thanks! I would have a try on nucleofection.

fine.

【在 l***y 的大作中提到】
: 1% efficiency is good enough, my cells can't even get 1%.
: I have tried both electroporation and nucleofection for BAC, both work fine.
: nucleofection is better and easier because reagents and parameters are
: already optimized with the commerial kit.
:
: 350

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h*y
23
我建议你尝试几种不同的转染试剂,这比尝试DNA和lipofectamine的不同比例效率要高
。特定的转染试剂有时候在你的细胞株中就是不WORK,你怎么试也得不到好的效果。转
染中,DNA的量对结果影响最小,如果你用100ng的BAC DNA,即使是300Kb的大BAC,你也
有几亿个copy了,每个细胞能分到几十万个。
所以我建议你固定DNA的量,改变转染试剂的用量。
常用的转染试剂比如lipofectamine,lipofectamine 2000,FuGene 6, FuGene HD和
PEI都可以拿来试试。按照厂家建议的常用组合,每种试剂试3-4种就行了。这些试剂都
不贵。比起你1个月的时间来,都是小钱。
另外你用的是8-well plate?是不是typo?是6-well?试的时候用24-well就行了,这
样可以节省试剂,而且可以多试几种组合。细胞的接种密度也很重要,多试几个,大致
保证24小时后细胞密度在20-60% (1-3倍的初始接种密度差)。

350

【在 s******a 的大作中提到】
: 实在不好意思,又把这个帖子顶起来。
: 从国内回来一个月了,一直在转我的BAC DNA,一直在失败。
: 我想总结一下失败的经验,并且继续求教大家:
: 我需要转染的细胞是Hepa 1-6,小鼠肝癌细胞,8-well plate 每孔种10000个细胞 ,
: 第二天转染。固定lipofectamine用量(量大毒性大),优化的主要是DNA和
: lipofectamine的比例。每孔转10 ng 到数 ug之间的range都试过,没有能够work的。
: 用普通质粒作为阳性对照,转染效率相当高,80-90%是有的。
: 这篇nature method文章用lipofectamine转BAC到小鼠ES细胞,10 cm2 的碟用10 ul
: lipo转150-350 ng BAC DNA(protocol在supplementary,但是有typo,写的是150-350
: ug)。我和文章作者email也联系过,他们转染的效率也只有1-2%。

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s*t
24
嗯 细胞密度重要
按楼上说的试试
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s*a
25
有没有同志有经验?
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s*s
26
以前ms讨论过。我们用lipofectamin ltx

【在 s******a 的大作中提到】
: 有没有同志有经验?
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s*s
29
,其实效率不重要,反正最后你多半挑克隆,有那么几个就行了

【在 s******a 的大作中提到】
: 谢谢两位
: 我决定先试试lipofectamine 2000
: (实验室刚好有)

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s*a
30
实在不好意思,又把这个帖子顶起来。
从国内回来一个月了,一直在转我的BAC DNA,一直在失败。
我想总结一下失败的经验,并且继续求教大家:
我需要转染的细胞是Hepa 1-6,小鼠肝癌细胞,8-well plate 每孔种10000个细胞 ,
第二天转染。固定lipofectamine用量(量大毒性大),优化的主要是DNA和
lipofectamine的比例。每孔转10 ng 到数 ug之间的range都试过,没有能够work的。
用普通质粒作为阳性对照,转染效率相当高,80-90%是有的。
这篇nature method文章用lipofectamine转BAC到小鼠ES细胞,10 cm2 的碟用10 ul
lipo转150-350 ng BAC DNA(protocol在supplementary,但是有typo,写的是150-350
ug)。我和文章作者email也联系过,他们转染的效率也只有1-2%。
所以现在唯一能确定的是转BAC DNA(我的约250kb)还是比普通质粒要难很多的。目前
对于lipo2000也已经没有idea了。
我现在开始尝试电转,第一次参数不合适细胞全死了,接下去准备降低电压和电容再试
试。
做过BAC转染的能否指点一下呢?
题外话:
实验室另一PhD,之前用lipo转过BAC,一开始口口声声他的protocol工作(同样的细胞
),不让我优化,我最后实在转不出来才开始优化。后来,我得知他所谓work就是8-
well nunc一个well中有5个阳性细胞(转染后48小时,这时候细胞已经很密)。就这他
还高高上上的教育我,有1个细胞就可以了。

【在 s*********t 的大作中提到】
: 不难的,跟转普通质粒差不多。
: http://www.nature.com/nmeth/journal/v5/n5/abs/nmeth.1199.html
: Lipofectamine 2000都可以的
: http://www.nature.com/nmeth/journal/v5/n5/extref/nmeth.1199-S1.
: 详细的protocol,照着做就行了。

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s*s
31
确实有一个细胞转上就行了。效率低是肯定的

350

【在 s******a 的大作中提到】
: 实在不好意思,又把这个帖子顶起来。
: 从国内回来一个月了,一直在转我的BAC DNA,一直在失败。
: 我想总结一下失败的经验,并且继续求教大家:
: 我需要转染的细胞是Hepa 1-6,小鼠肝癌细胞,8-well plate 每孔种10000个细胞 ,
: 第二天转染。固定lipofectamine用量(量大毒性大),优化的主要是DNA和
: lipofectamine的比例。每孔转10 ng 到数 ug之间的range都试过,没有能够work的。
: 用普通质粒作为阳性对照,转染效率相当高,80-90%是有的。
: 这篇nature method文章用lipofectamine转BAC到小鼠ES细胞,10 cm2 的碟用10 ul
: lipo转150-350 ng BAC DNA(protocol在supplementary,但是有typo,写的是150-350
: ug)。我和文章作者email也联系过,他们转染的效率也只有1-2%。

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s*a
32
问题是现在一个细胞也转不上:(

【在 s******s 的大作中提到】
: 确实有一个细胞转上就行了。效率低是肯定的
:
: 350

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s*s
33
你得细胞转普通质粒啥的好转么?有的细胞难搞
我一般也就转转fibroblast, 还是很容易的

【在 s******a 的大作中提到】
: 问题是现在一个细胞也转不上:(
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s*a
34
非常好,80-90%,你没有仔细读我上面的帖子啊。

【在 s******s 的大作中提到】
: 你得细胞转普通质粒啥的好转么?有的细胞难搞
: 我一般也就转转fibroblast, 还是很容易的

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l*y
35
1% efficiency is good enough, my cells can't even get 1%.
I have tried both electroporation and nucleofection for BAC, both work fine.
nucleofection is better and easier because reagents and parameters are
already optimized with the commerial kit.

350

【在 s******a 的大作中提到】
: 实在不好意思,又把这个帖子顶起来。
: 从国内回来一个月了,一直在转我的BAC DNA,一直在失败。
: 我想总结一下失败的经验,并且继续求教大家:
: 我需要转染的细胞是Hepa 1-6,小鼠肝癌细胞,8-well plate 每孔种10000个细胞 ,
: 第二天转染。固定lipofectamine用量(量大毒性大),优化的主要是DNA和
: lipofectamine的比例。每孔转10 ng 到数 ug之间的range都试过,没有能够work的。
: 用普通质粒作为阳性对照,转染效率相当高,80-90%是有的。
: 这篇nature method文章用lipofectamine转BAC到小鼠ES细胞,10 cm2 的碟用10 ul
: lipo转150-350 ng BAC DNA(protocol在supplementary,但是有typo,写的是150-350
: ug)。我和文章作者email也联系过,他们转染的效率也只有1-2%。

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s*a
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Thanks! I would have a try on nucleofection.

fine.

【在 l***y 的大作中提到】
: 1% efficiency is good enough, my cells can't even get 1%.
: I have tried both electroporation and nucleofection for BAC, both work fine.
: nucleofection is better and easier because reagents and parameters are
: already optimized with the commerial kit.
:
: 350

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h*y
37
我建议你尝试几种不同的转染试剂,这比尝试DNA和lipofectamine的不同比例效率要高
。特定的转染试剂有时候在你的细胞株中就是不WORK,你怎么试也得不到好的效果。转
染中,DNA的量对结果影响最小,如果你用100ng的BAC DNA,即使是300Kb的大BAC,你也
有几亿个copy了,每个细胞能分到几十万个。
所以我建议你固定DNA的量,改变转染试剂的用量。
常用的转染试剂比如lipofectamine,lipofectamine 2000,FuGene 6, FuGene HD和
PEI都可以拿来试试。按照厂家建议的常用组合,每种试剂试3-4种就行了。这些试剂都
不贵。比起你1个月的时间来,都是小钱。
另外你用的是8-well plate?是不是typo?是6-well?试的时候用24-well就行了,这
样可以节省试剂,而且可以多试几种组合。细胞的接种密度也很重要,多试几个,大致
保证24小时后细胞密度在20-60% (1-3倍的初始接种密度差)。

350

【在 s******a 的大作中提到】
: 实在不好意思,又把这个帖子顶起来。
: 从国内回来一个月了,一直在转我的BAC DNA,一直在失败。
: 我想总结一下失败的经验,并且继续求教大家:
: 我需要转染的细胞是Hepa 1-6,小鼠肝癌细胞,8-well plate 每孔种10000个细胞 ,
: 第二天转染。固定lipofectamine用量(量大毒性大),优化的主要是DNA和
: lipofectamine的比例。每孔转10 ng 到数 ug之间的range都试过,没有能够work的。
: 用普通质粒作为阳性对照,转染效率相当高,80-90%是有的。
: 这篇nature method文章用lipofectamine转BAC到小鼠ES细胞,10 cm2 的碟用10 ul
: lipo转150-350 ng BAC DNA(protocol在supplementary,但是有typo,写的是150-350
: ug)。我和文章作者email也联系过,他们转染的效率也只有1-2%。

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嗯 细胞密度重要
按楼上说的试试
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39
不是typo,8-well Nunc plate,和ibidi差不多,做imaging用。
谢谢你的建议。

【在 h******y 的大作中提到】
: 我建议你尝试几种不同的转染试剂,这比尝试DNA和lipofectamine的不同比例效率要高
: 。特定的转染试剂有时候在你的细胞株中就是不WORK,你怎么试也得不到好的效果。转
: 染中,DNA的量对结果影响最小,如果你用100ng的BAC DNA,即使是300Kb的大BAC,你也
: 有几亿个copy了,每个细胞能分到几十万个。
: 所以我建议你固定DNA的量,改变转染试剂的用量。
: 常用的转染试剂比如lipofectamine,lipofectamine 2000,FuGene 6, FuGene HD和
: PEI都可以拿来试试。按照厂家建议的常用组合,每种试剂试3-4种就行了。这些试剂都
: 不贵。比起你1个月的时间来,都是小钱。
: 另外你用的是8-well plate?是不是typo?是6-well?试的时候用24-well就行了,这
: 样可以节省试剂,而且可以多试几种组合。细胞的接种密度也很重要,多试几个,大致

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