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CoIP- mass spectrum 求助
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CoIP- mass spectrum 求助# Biology - 生物学
y*1
1
Location: Shanghai China
Company: Unilever
Major: Chemistry Materials and Related.
Masters and PHDs welcome.
Send resume or questions to l***********[email protected] if interested.
Thanks.
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N*t
2
给我的第一个offer
Get a $5 rebate from Offermatic when you purchase a Costco Membership
Certificate online only!
附近没有这货,信用卡也从来没刷过这货...
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s*t
3
小弟最近刚开始做CoIP-Mass spectrum。请问版上没有大虾有好的protocol
我的实验是这样的在293细胞里面转染Flag的目的蛋白,然后pulldown flag
然后跑SDS-PAGE胶,但是出了很多band,请问有没有好的办法除去非特异的band。
多谢~ 5个包子
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C*R
4
thanks:)

【在 y***1 的大作中提到】
: Location: Shanghai China
: Company: Unilever
: Major: Chemistry Materials and Related.
: Masters and PHDs welcome.
: Send resume or questions to l***********[email protected] if interested.
: Thanks.

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b*i
5
move on
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s*t
6
小弟最近刚开始做CoIP-Mass spectrum。请问版上没有大虾有好的protocol
我的实验是这样的在293细胞里面转染Flag的目的蛋白,然后pulldown flag
然后跑SDS-PAGE胶,但是出了很多band,请问有没有好的办法除去非特异的band。
多谢~ 5个包子
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h*n
7
same here, lol.

【在 N*********t 的大作中提到】
: 给我的第一个offer
: Get a $5 rebate from Offermatic when you purchase a Costco Membership
: Certificate online only!
: 附近没有这货,信用卡也从来没刷过这货...

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a*c
8
如果IP后bands很多,可能是lysate的微小的不溶性pellet沉淀的原因,同时也和
antibody特异性有关。可以这样改进,细胞lysate IP前,超高速离心15分钟,上清用
protein A beads preclear。在lysate里加一抗binding不要超过一小时。加protein A
beads前,先用5% BSA 将beads 在4度block一小时。
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c*7
9
上个周的好,是amazon的。已经拿到
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s*t
10
非常感谢~你的建议很有用~
请问在pull down完了以后你洗beads的时候有没有什么strigent的办法多洗掉一些band?
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N*t
11
这玩意现在是每周一个offer?

【在 c*********7 的大作中提到】
: 上个周的好,是amazon的。已经拿到
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s*t
12
350mM/甚至420/500 NaCl
0.1% NP-40
洗5遍

band?

【在 s*****t 的大作中提到】
: 非常感谢~你的建议很有用~
: 请问在pull down完了以后你洗beads的时候有没有什么strigent的办法多洗掉一些band?

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s*r
13
没收到这个。。。每周收到的都是垃圾offer,直接move on

【在 c*********7 的大作中提到】
: 上个周的好,是amazon的。已经拿到
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g*5
14
您能不能给给各完整的protocol?谢谢。

【在 s*********t 的大作中提到】
: 350mM/甚至420/500 NaCl
: 0.1% NP-40
: 洗5遍
:
: band?

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s*g
15
每个人的不一样
我今天也收到了
没兴趣升级我的membership

【在 N*********t 的大作中提到】
: 这玩意现在是每周一个offer?
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g*5
16
我用的是sigma的flag resin,用flag peptide 洗脱的。
不过得到很多蛋白,后续IP没有验证出来...

band?

【在 s*****t 的大作中提到】
: 非常感谢~你的建议很有用~
: 请问在pull down完了以后你洗beads的时候有没有什么strigent的办法多洗掉一些band?

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d*y
17
我也收到这个,直接pass了
话说我没有每周一个offer啊,一般都两周才有一个。。。大部分还都是鸡肋offer
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s*t
18
protocol一搜一大把呀 找篇大文章method部分 自己修改下就能用
M2 resin有几个常见的contamination
最好有个control对照一下
用agrose beads preclear一下也行 不过不是必须的
盐浓度和detergent也比较重要

【在 g*********5 的大作中提到】
: 您能不能给给各完整的protocol?谢谢。
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a*c
19
我一直觉得,用更strigent的washing的办法,其实远不如在binding上下功夫摸索更好
的IP条件。我遇到过的一个真实例子是,我已经用含有SDS的RIPA buffer作为细胞裂解
和washing beads的buffer了,control IP那里仍有signal。最后采用缩短Antibody
binding的时间的办法,最后解决了这个问题。
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g*5
20
据Invitrogen网站上的介绍,一些短暂结合的蛋白应该binding小于4个小时,甚至1.5
小时...
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l*y
21
the best way is metabolic isotopic labeling, then quantitative mass spec.

【在 s*****t 的大作中提到】
: 小弟最近刚开始做CoIP-Mass spectrum。请问版上没有大虾有好的protocol
: 我的实验是这样的在293细胞里面转染Flag的目的蛋白,然后pulldown flag
: 然后跑SDS-PAGE胶,但是出了很多band,请问有没有好的办法除去非特异的band。
: 多谢~ 5个包子

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F*K
22
how do you guys like tandem affinity purification?

【在 l****y 的大作中提到】
: the best way is metabolic isotopic labeling, then quantitative mass spec.
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K*S
23
you still get some non specific bindings and you need a lot more starting
materials.

【在 F*K 的大作中提到】
: how do you guys like tandem affinity purification?
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p*i
24
再加个HAtag,把IP下来的东西再IP一次。
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b*u
25
Can you list any "M2 resin有几个常见的contamination"? Thanks a lot!
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s*t
26
如果是nuclear extract 的话,好像有PRMT5, 还有某HDAC。当然如果看到HSP70/80之
类,不过HSP不是M2特有的咯

【在 b*****u 的大作中提到】
: Can you list any "M2 resin有几个常见的contamination"? Thanks a lot!
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t*P
27
学习了
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C*2
28
1,加个HA试试。
2,可以考虑用GLYCIN洗脱,感觉比3*FLAG好,特别是如果你已经用了3*FLAG构建了表
达载体。也可考虑用ARGININE洗脱。
搭车问个问题,有人做过非人类细胞的MS吗?具体的难点在哪里,DATABASE的不足?

【在 s*****t 的大作中提到】
: 小弟最近刚开始做CoIP-Mass spectrum。请问版上没有大虾有好的protocol
: 我的实验是这样的在293细胞里面转染Flag的目的蛋白,然后pulldown flag
: 然后跑SDS-PAGE胶,但是出了很多band,请问有没有好的办法除去非特异的band。
: 多谢~ 5个包子

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F*K
29
不太清楚,老鼠细胞也会有问题吗?

【在 C******2 的大作中提到】
: 1,加个HA试试。
: 2,可以考虑用GLYCIN洗脱,感觉比3*FLAG好,特别是如果你已经用了3*FLAG构建了表
: 达载体。也可考虑用ARGININE洗脱。
: 搭车问个问题,有人做过非人类细胞的MS吗?具体的难点在哪里,DATABASE的不足?

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l*1
30
是呀 大猩猩 Chimp (Pan troglodytes) 的ES 细胞会有问题吗?
//genome.ucsc.edu/Neandertal/
//genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway

【在 F*K 的大作中提到】
: 不太清楚,老鼠细胞也会有问题吗?
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