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问一个Pymol的问题,谢谢!
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问一个Pymol的问题,谢谢!# Biology - 生物学
y*w
1
我现在得到一个mutant,我想在原来native的structure 的 active sites 中把
mutation展示出来,同时保留原来native 的residue (就是做一个residue 的
mutagenesis and overlay)。请问大家知道是怎么做的嘛?
我知道Pymol 中有mutagenesis function, 但是这个function就是直接把原来的
residue替代了,我还想把原来的residue保留,这样可以看到一些比较。
因为是pymol的初级使用者,十分感谢大家的帮忙!
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b*n
2
两张图(mutant和wt)overlay就行了吧

【在 y*****w 的大作中提到】
: 我现在得到一个mutant,我想在原来native的structure 的 active sites 中把
: mutation展示出来,同时保留原来native 的residue (就是做一个residue 的
: mutagenesis and overlay)。请问大家知道是怎么做的嘛?
: 我知道Pymol 中有mutagenesis function, 但是这个function就是直接把原来的
: residue替代了,我还想把原来的residue保留,这样可以看到一些比较。
: 因为是pymol的初级使用者,十分感谢大家的帮忙!

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C*e
3
把mutant residue存成另外一个object
然后跟native structure一起显示
或者整个mutant structure另存
两个结构一起打开显示
mutant只显示active site,别的隐藏
不过你这个mutant的结构没有拿到吧
也是以native structure为模版建的模型吧
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y*w
4
Thank you very much! Your instruction works.
Yes, I did not get the structure for the mutant. I am just curious what
the difference might be between the WT and mutant.

【在 C*******e 的大作中提到】
: 把mutant residue存成另外一个object
: 然后跟native structure一起显示
: 或者整个mutant structure另存
: 两个结构一起打开显示
: mutant只显示active site,别的隐藏
: 不过你这个mutant的结构没有拿到吧
: 也是以native structure为模版建的模型吧

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