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怎么证明一个protein是dimer?
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怎么证明一个protein是dimer?# Biology - 生物学
m*l
1
我想请问西安哪里可以打进口疫苗, 多谢!
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d*r
2
【此篇文章是由自动发信系统所张贴】
⊙ 博彩开启于:Sun Jul 11 17:23:47 2010 类别:多选
⊙ 主题:世界杯决赛对赌:荷兰vs西班牙
⊙ 博彩题目描述:
7/11 决赛:荷兰vs西班牙。
谁能夺取世界杯!!
【打对勾者正确选项】
√(1) 西班牙胜
(2) 荷兰胜
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a*n
3
已经有confirmation.
菜鸟求跟着大牛混。
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t*l
4
做genetic screen找到一个transcription factor. 怎么证明这个TF是dimer
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B*g
5
你是大牛,我以后跟你混win8

【在 a******n 的大作中提到】
: 已经有confirmation.
: 菜鸟求跟着大牛混。

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C*e
6
表达纯化然后gel filtration
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m*d
7
免费发win8吗,how to get invitation?

【在 a******n 的大作中提到】
: 已经有confirmation.
: 菜鸟求跟着大牛混。

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f*f
8
方法很多:
一种是稳定的dimer,比如二硫键形成的dimer,SDS lysis buffer 也不能破坏,
Western blot会有两条带,刚好两倍差别。一定要确定的话可以IP后可以mass-spec
二假如SDS lysis buffer 会破坏,可以先IP后,sucrose gradient或是分子量层析,
至少有2个component
三,假如蛋白能纯化出来的,就更容易了。直接GST-protein过分子筛。
四,IP或pull down用外源蛋白可以沉淀下endogenous protein,说明可以形成dimer或
polymer
五,X-ray and structural determination确定dimer结构

【在 t**l 的大作中提到】
: 做genetic screen找到一个transcription factor. 怎么证明这个TF是dimer
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a*n
9
不知道发啥呀。
湾区的已经漫了
其他地方的google microsfot msdn event

【在 m*d 的大作中提到】
: 免费发win8吗,how to get invitation?
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C*e
10
为什么一定是“GST-protein过分子筛”?
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B*e
11
免费发beta 版

【在 m*d 的大作中提到】
: 免费发win8吗,how to get invitation?
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T*i
12
理论上来说,做两个constructs,分别用两个不同的tag,+/- DNase,然后IP/
western。这能证明是dimer 或更大。如果需要证明不是trimer, tetramer,。。。就
是dimer,需要分子筛。

【在 t**l 的大作中提到】
: 做genetic screen找到一个transcription factor. 怎么证明这个TF是dimer
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a*n
13
以后可以转成正式版吗

【在 B*******e 的大作中提到】
: 免费发beta 版
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f*f
14
不用,只是gst为例,只要能纯化出来就行。

【在 C*******e 的大作中提到】
: 为什么一定是“GST-protein过分子筛”?
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w*u
15
结果会上一看,都是等着领免费电话的老头老太。一说windows,脸上一片迷惘,微软组
织者以头撞墙。
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K*a
16
GST自己不是会形成dimer吗?

【在 f*****f 的大作中提到】
: 不用,只是gst为例,只要能纯化出来就行。
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a*n
17
哈哈, 那我会写hello world岂不是成了其中牛人?
给我发个嘉奖?

【在 w***u 的大作中提到】
: 结果会上一看,都是等着领免费电话的老头老太。一说windows,脸上一片迷惘,微软组
: 织者以头撞墙。

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a*e
18
你说得对
gst 可以induce target protein to form dimer
所以gst tag 不是一个非常好的手段

【在 K****a 的大作中提到】
: GST自己不是会形成dimer吗?
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a*n
19
现场老中也不少啊
看来都不上mitbbs.
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t*l
20
请问一下gel filtration 能给出什么定量的结果吗? 能具体的说明哪块elute是多少
kd.
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B*g
21
午饭给的啥?

【在 a******n 的大作中提到】
: 现场老中也不少啊
: 看来都不上mitbbs.

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s*y
22
有gel filtration的marker卖的

【在 t**l 的大作中提到】
: 请问一下gel filtration 能给出什么定量的结果吗? 能具体的说明哪块elute是多少
: kd.

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a*n
23
早饭咖啡茶点心水果
snacks咖啡茶点心水果
午饭sanwich。 chips.

【在 B*****g 的大作中提到】
: 午饭给的啥?
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p*e
24
after purification, you cleave the GST off.

【在 t**l 的大作中提到】
: 做genetic screen找到一个transcription factor. 怎么证明这个TF是dimer
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a*n
25
啥也没有啊
别去了
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y*n
26

GST tag本身就会形成 dimer.

【在 f*****f 的大作中提到】
: 不用,只是gst为例,只要能纯化出来就行。
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y*n
27

找篇文章看看吧,看怎么确定分子量。一般加对照。

【在 t**l 的大作中提到】
: 请问一下gel filtration 能给出什么定量的结果吗? 能具体的说明哪块elute是多少
: kd.

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g*p
28
这么多tag的例子你不举,偏偏举这个
gst is naturally a dimer

【在 f*****f 的大作中提到】
: 不用,只是gst为例,只要能纯化出来就行。
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t*2
29
最直接有力的证据,也是最常用的方法就是跑变性和非变性胶。
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g*p
30
你可以用接近10种方法来证明
但是无偏的方法学还是纯化蛋白后用静态光散射和超速离心来鉴定

【在 t**l 的大作中提到】
: 做genetic screen找到一个transcription factor. 怎么证明这个TF是dimer
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g*p
31
X光测定可不能证明二体结构
最多可以说明其相关性

【在 f*****f 的大作中提到】
: 方法很多:
: 一种是稳定的dimer,比如二硫键形成的dimer,SDS lysis buffer 也不能破坏,
: Western blot会有两条带,刚好两倍差别。一定要确定的话可以IP后可以mass-spec
: 二假如SDS lysis buffer 会破坏,可以先IP后,sucrose gradient或是分子量层析,
: 至少有2个component
: 三,假如蛋白能纯化出来的,就更容易了。直接GST-protein过分子筛。
: 四,IP或pull down用外源蛋白可以沉淀下endogenous protein,说明可以形成dimer或
: polymer
: 五,X-ray and structural determination确定dimer结构

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b*s
32
跟帖问一句。证明一个TF是dimer还是monomer有什么大的生物学意义吗?当然可能对TF
的function, mobility等有潜在的调控作用。但在我做的传统发育里,看到的大部分都
还是集中在TF的调控基因上。

【在 t**l 的大作中提到】
: 做genetic screen找到一个transcription factor. 怎么证明这个TF是dimer
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H*i
33
LacI的monomer dimer tetramer对synthetic biology的一些设计就很重要,会直接影
响能观测到的现象/表型
而且简单的hill function对很多相关动力学现象的解释就不好,需要加入时间参数,
这个和多聚体就很有关系了。
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d*s
35
我们以前做过eNOS的dimer和monomer,程序如下:
正常提取蛋白,按照常规Western Blot准备标本
将标本分为2份:一份boiled,一份unboiled
在4度下跑SDS-PAGE胶
然后Western blot程序
最好在胶片上判断:Boiled的标本只有1条monomer带,unboiled的标本在2倍monomer分
子量位
置有条带表示是dimer
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C*4
36
不boil的是不是还不能加DTT啊
是否还需要一块非变性胶

【在 d*****s 的大作中提到】
: 我们以前做过eNOS的dimer和monomer,程序如下:
: 正常提取蛋白,按照常规Western Blot准备标本
: 将标本分为2份:一份boiled,一份unboiled
: 在4度下跑SDS-PAGE胶
: 然后Western blot程序
: 最好在胶片上判断:Boiled的标本只有1条monomer带,unboiled的标本在2倍monomer分
: 子量位
: 置有条带表示是dimer

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o*e
37
嗯。得到pure的样品后,看方便用到什么设备了。
以前所在的化学实验室是利用Size Exclusion Chromatography(Gel Permeation
Chromatography) with online Multi-angle light scattering detection.
做Analytical Ultracentrifugation的话就得送外面专门的实验室了。不过这个
实验时间很长,样品的稳定性是一个需要考虑的问题。

【在 g*****p 的大作中提到】
: 你可以用接近10种方法来证明
: 但是无偏的方法学还是纯化蛋白后用静态光散射和超速离心来鉴定

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t*2
38
这就是个jbc的文章。。。。

TF

【在 b******s 的大作中提到】
: 跟帖问一句。证明一个TF是dimer还是monomer有什么大的生物学意义吗?当然可能对TF
: 的function, mobility等有潜在的调控作用。但在我做的传统发育里,看到的大部分都
: 还是集中在TF的调控基因上。

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t*t
39
超级稳定的十聚体呢?
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H*g
40
Sorry couldn't type in Chinese here.
Was the result from this analytic method published?
Did the reviewers buy it?

【在 d*****s 的大作中提到】
: 我们以前做过eNOS的dimer和monomer,程序如下:
: 正常提取蛋白,按照常规Western Blot准备标本
: 将标本分为2份:一份boiled,一份unboiled
: 在4度下跑SDS-PAGE胶
: 然后Western blot程序
: 最好在胶片上判断:Boiled的标本只有1条monomer带,unboiled的标本在2倍monomer分
: 子量位
: 置有条带表示是dimer

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