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ChIP试验做不出结果怎么办? (转载)
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ChIP试验做不出结果怎么办? (转载)# Biology - 生物学
T*n
1
【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
发信人: Tonyvan (Tony), 信区: Postdoc
标 题: ChIP试验做不出结果怎么办?
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 7 22:42:18 2012, 美东)
ChIP试验做不出结果怎么办?用的是Active Motif的KIT。现在optimize the shearing
conditions, 但老不出结果。怎么回事?请大家指教。谢谢!
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a*k
2
你确认有结果。。。无数发表的ChIP里面的猫腻多着呢,别人能做出来不代表你就能做
出来。

shearing

【在 T*****n 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
: 发信人: Tonyvan (Tony), 信区: Postdoc
: 标 题: ChIP试验做不出结果怎么办?
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 7 22:42:18 2012, 美东)
: ChIP试验做不出结果怎么办?用的是Active Motif的KIT。现在optimize the shearing
: conditions, 但老不出结果。怎么回事?请大家指教。谢谢!

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L*e
3
ChIP 有的好做很容易就做出来,有的很难,最关键的是抗体要好。我最近一个用常规
方法怎么都做不出来,后来用了一种 biotin ChIP, 就是将目的基因和一种 biotin
ligase 同时表达,让目的基因biotinated, 然后用streptavadin dynal bead 做ChIP
,这个biotin 最大的好处就是非常特异。你不妨试一试
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C*Y
4
That's a good kit. Maybe your antibody is not good.

shearing

【在 T*****n 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
: 发信人: Tonyvan (Tony), 信区: Postdoc
: 标 题: ChIP试验做不出结果怎么办?
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 7 22:42:18 2012, 美东)
: ChIP试验做不出结果怎么办?用的是Active Motif的KIT。现在optimize the shearing
: conditions, 但老不出结果。怎么回事?请大家指教。谢谢!

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T*n
5
【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
发信人: Tonyvan (Tony), 信区: Postdoc
标 题: ChIP试验做不出结果怎么办?
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 7 22:42:18 2012, 美东)
ChIP试验做不出结果怎么办?用的是Active Motif的KIT。现在optimize the shearing
conditions, 但老不出结果。怎么回事?请大家指教。谢谢!
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a*k
6
你确认有结果。。。无数发表的ChIP里面的猫腻多着呢,别人能做出来不代表你就能做
出来。

shearing

【在 T*****n 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
: 发信人: Tonyvan (Tony), 信区: Postdoc
: 标 题: ChIP试验做不出结果怎么办?
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 7 22:42:18 2012, 美东)
: ChIP试验做不出结果怎么办?用的是Active Motif的KIT。现在optimize the shearing
: conditions, 但老不出结果。怎么回事?请大家指教。谢谢!

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L*e
7
ChIP 有的好做很容易就做出来,有的很难,最关键的是抗体要好。我最近一个用常规
方法怎么都做不出来,后来用了一种 biotin ChIP, 就是将目的基因和一种 biotin
ligase 同时表达,让目的基因biotinated, 然后用streptavadin dynal bead 做ChIP
,这个biotin 最大的好处就是非常特异。你不妨试一试
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C*Y
8
That's a good kit. Maybe your antibody is not good.

shearing

【在 T*****n 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
: 发信人: Tonyvan (Tony), 信区: Postdoc
: 标 题: ChIP试验做不出结果怎么办?
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 7 22:42:18 2012, 美东)
: ChIP试验做不出结果怎么办?用的是Active Motif的KIT。现在optimize the shearing
: conditions, 但老不出结果。怎么回事?请大家指教。谢谢!

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T*n
9
我试了active motif Express kit and High Sensitivity Kit. 结果都是第一次结果
很好,然后再也重复不出来了,即使用同一ChIP DNA. 现在搞得我很郁闷。结果出来时
老板很高兴,结果不能重复,我们又都郁闷了。大家用过这两个试剂盒吗?对这两个试
剂盒有何评价?如何才能解决出现的问题?
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t*k
10
做不出来,这里面多少原因啊。。ps chip一直都是自家配试剂做的
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T*n
11
这个好像不是抗体的原因,因为第一次结果出来了。是不是enriched DNA 不稳定?但
是后来又重新做ChIP,也还是出不来。

【在 t******k 的大作中提到】
: 做不出来,这里面多少原因啊。。ps chip一直都是自家配试剂做的
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k*n
12
make sure your crosslinking and sonication are consistent. take Pol II as
system control.

【在 T*****n 的大作中提到】
: 这个好像不是抗体的原因,因为第一次结果出来了。是不是enriched DNA 不稳定?但
: 是后来又重新做ChIP,也还是出不来。

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