请教基因测序# Biology - 生物学
m*e
1 楼
请教这里的各位，像23andme这样99美元的基因测序，大概需要什么样的设备？主要步
骤是什么？需要几个工作人员？我主要是想了解一下，组建这样一个实验室，要怎样的
规模和成本。多谢了。
骤是什么？需要几个工作人员？我主要是想了解一下，组建这样一个实验室，要怎样的
规模和成本。多谢了。
f*g
2 楼
你去查查23andme投资了多少钱。
【在 m*****e 的大作中提到】
: 请教这里的各位，像23andme这样99美元的基因测序，大概需要什么样的设备？主要步
: 骤是什么？需要几个工作人员？我主要是想了解一下，组建这样一个实验室，要怎样的
: 规模和成本。多谢了。
【在 m*****e 的大作中提到】
: 请教这里的各位，像23andme这样99美元的基因测序，大概需要什么样的设备？主要步
: 骤是什么？需要几个工作人员？我主要是想了解一下，组建这样一个实验室，要怎样的
: 规模和成本。多谢了。
m*e
3 楼
再问一个问题，国内可有实验室做23andme这样的测序？可否給几个链接？
s*s
4 楼
23andme应该不是测序, 而是SNP芯片.
23andme这样的实验室你就别想了, google创始人老婆(或者快成前老婆)开的.
【在 m*****e 的大作中提到】
: 请教这里的各位，像23andme这样99美元的基因测序，大概需要什么样的设备？主要步
: 骤是什么？需要几个工作人员？我主要是想了解一下，组建这样一个实验室，要怎样的
: 规模和成本。多谢了。
23andme这样的实验室你就别想了, google创始人老婆(或者快成前老婆)开的.
【在 m*****e 的大作中提到】
: 请教这里的各位，像23andme这样99美元的基因测序，大概需要什么样的设备？主要步
: 骤是什么？需要几个工作人员？我主要是想了解一下，组建这样一个实验室，要怎样的
: 规模和成本。多谢了。
w*a
5 楼
关键还不是测序，是背后不断update的database。
这玩意不是凑几个wsn那么容易就山寨出来的。
【在 m*****e 的大作中提到】
: 请教这里的各位，像23andme这样99美元的基因测序，大概需要什么样的设备？主要步
: 骤是什么？需要几个工作人员？我主要是想了解一下，组建这样一个实验室，要怎样的
: 规模和成本。多谢了。
这玩意不是凑几个wsn那么容易就山寨出来的。
【在 m*****e 的大作中提到】
: 请教这里的各位，像23andme这样99美元的基因测序，大概需要什么样的设备？主要步
: 骤是什么？需要几个工作人员？我主要是想了解一下，组建这样一个实验室，要怎样的
: 规模和成本。多谢了。
M*n
6 楼
SNP很便宜了
你打算回中国骗钱？
你打算回中国骗钱？
A*u
7 楼
国内一般都去复旦测
Y染色体STR 几百块钱 全部SNP 一千多块钱人民币
线粒体全序列 两千
跟23andme比价格如何？
【在 M*****n 的大作中提到】
: SNP很便宜了
: 你打算回中国骗钱？
Y染色体STR 几百块钱 全部SNP 一千多块钱人民币
线粒体全序列 两千
跟23andme比价格如何？
【在 M*****n 的大作中提到】
: SNP很便宜了
: 你打算回中国骗钱？
A*u
8 楼
当然有了
复旦大学现代人类学教育部重点实验室
家族遗传测试服务
【在 m*****e 的大作中提到】
: 再问一个问题，国内可有实验室做23andme这样的测序？可否給几个链接？
复旦大学现代人类学教育部重点实验室
家族遗传测试服务
【在 m*****e 的大作中提到】
: 再问一个问题，国内可有实验室做23andme这样的测序？可否給几个链接？
M*n
9 楼
SNP对临床诊断可用吗？
如果没有FDA批准，是不能做诊断的，只能大家测着玩吧。
【在 A******u 的大作中提到】
: 国内一般都去复旦测
: Y染色体STR 几百块钱 全部SNP 一千多块钱人民币
: 线粒体全序列 两千
: 跟23andme比价格如何？
如果没有FDA批准，是不能做诊断的，只能大家测着玩吧。
【在 A******u 的大作中提到】
: 国内一般都去复旦测
: Y染色体STR 几百块钱 全部SNP 一千多块钱人民币
: 线粒体全序列 两千
: 跟23andme比价格如何？
A*u
10 楼
Y染色体SNP跟疾病关系不大吧，复旦那个就是搞家族溯源的，供有这方面爱好的人玩的。
国内这方面的市场不小，一些人很重视家族源流的，还有修家谱什么的。
要是能跟疾病联系起来，估计就更有商业前途了。
华大有做这方面的，但是貌似不太成功。
楼主回国搞这一块，确实是有一定商业前景的啊。
【在 M*****n 的大作中提到】
: SNP对临床诊断可用吗？
: 如果没有FDA批准，是不能做诊断的，只能大家测着玩吧。
国内这方面的市场不小，一些人很重视家族源流的，还有修家谱什么的。
要是能跟疾病联系起来，估计就更有商业前途了。
华大有做这方面的，但是貌似不太成功。
楼主回国搞这一块，确实是有一定商业前景的啊。
【在 M*****n 的大作中提到】
: SNP对临床诊断可用吗？
: 如果没有FDA批准，是不能做诊断的，只能大家测着玩吧。
M*n
11 楼
Y 那么小一段儿，能有多少SNP? 复旦岂不是要赚死了？是不是金力卢大儒在搞？
的。
【在 A******u 的大作中提到】
: Y染色体SNP跟疾病关系不大吧，复旦那个就是搞家族溯源的，供有这方面爱好的人玩的。
: 国内这方面的市场不小，一些人很重视家族源流的，还有修家谱什么的。
: 要是能跟疾病联系起来，估计就更有商业前途了。
: 华大有做这方面的，但是貌似不太成功。
: 楼主回国搞这一块，确实是有一定商业前景的啊。
的。
【在 A******u 的大作中提到】
: Y染色体SNP跟疾病关系不大吧，复旦那个就是搞家族溯源的，供有这方面爱好的人玩的。
: 国内这方面的市场不小，一些人很重视家族源流的，还有修家谱什么的。
: 要是能跟疾病联系起来，估计就更有商业前途了。
: 华大有做这方面的，但是貌似不太成功。
: 楼主回国搞这一块，确实是有一定商业前景的啊。
A*u
12 楼
不少了，听说常用来做遗传分析的SNP有800多个。
金力不屑搞这点钱。下面的青椒副教授们搞的，也不完全是盈利为目的，没开公司。
所以楼主要是商业化起来，还是有点意思的。
【在 M*****n 的大作中提到】
: Y 那么小一段儿，能有多少SNP? 复旦岂不是要赚死了？是不是金力卢大儒在搞？
:
: 的。
金力不屑搞这点钱。下面的青椒副教授们搞的，也不完全是盈利为目的，没开公司。
所以楼主要是商业化起来，还是有点意思的。
【在 M*****n 的大作中提到】
: Y 那么小一段儿，能有多少SNP? 复旦岂不是要赚死了？是不是金力卢大儒在搞？
:
: 的。
a*k
13 楼
23andme做全基因组SNP的总费用才200刀左右，他现在每年赔钱占领市场，千万刀级别
的赔钱。有google在后面撑腰罢了，闲杂人等还是算了。
如果Illumina送你仪器，（23andme和一些大公司的仪器很多是送的），几十万就差不
多了。
【在 m*****e 的大作中提到】
: 请教这里的各位，像23andme这样99美元的基因测序，大概需要什么样的设备？主要步
: 骤是什么？需要几个工作人员？我主要是想了解一下，组建这样一个实验室，要怎样的
: 规模和成本。多谢了。
的赔钱。有google在后面撑腰罢了，闲杂人等还是算了。
如果Illumina送你仪器，（23andme和一些大公司的仪器很多是送的），几十万就差不
多了。
【在 m*****e 的大作中提到】
: 请教这里的各位，像23andme这样99美元的基因测序，大概需要什么样的设备？主要步
: 骤是什么？需要几个工作人员？我主要是想了解一下，组建这样一个实验室，要怎样的
: 规模和成本。多谢了。
w*w
14 楼
有没有类似http://pkdb.mayo.edu 这样的包含其它基因和疾病的数据库？如果有的话临床应该很有用。
【在 w***a 的大作中提到】
: 关键还不是测序，是背后不断update的database。
: 这玩意不是凑几个wsn那么容易就山寨出来的。
【在 w***a 的大作中提到】
: 关键还不是测序，是背后不断update的database。
: 这玩意不是凑几个wsn那么容易就山寨出来的。
b*r
15 楼
HGMD，非常好用的数据库，据我所知基本是手工trim的。估计你砸几千万刀和几年时间
，还赶不上它数据质量，更别说声誉了
这行虽然动静不大，其实门槛已经相当高了。要找个niche很不容易。我觉得这个领域
的大突破应该还是会来自于技术方面，比如新的测序技术或者array技术，可惜那应该
基本是物理或者化学或者工程领域的东西
【在 w****w 的大作中提到】
: 有没有类似http://pkdb.mayo.edu 这样的包含其它基因和疾病的数据库？如果有的话临床应该很有用。
，还赶不上它数据质量，更别说声誉了
这行虽然动静不大，其实门槛已经相当高了。要找个niche很不容易。我觉得这个领域
的大突破应该还是会来自于技术方面，比如新的测序技术或者array技术，可惜那应该
基本是物理或者化学或者工程领域的东西
【在 w****w 的大作中提到】
: 有没有类似http://pkdb.mayo.edu 这样的包含其它基因和疾病的数据库？如果有的话临床应该很有用。
b*r
16 楼
我倒觉得这个数据库几个wsn就能搞个大概了。我最近考虑过做一个相关的检测项目，
研究过一下，基本上都是基于well known 的mutation，数量并不是太大，更新也谈不
上多快，而且又没有太大的法律风险，反正不是诊断
【在 w***a 的大作中提到】
: 关键还不是测序，是背后不断update的database。
: 这玩意不是凑几个wsn那么容易就山寨出来的。
研究过一下，基本上都是基于well known 的mutation，数量并不是太大，更新也谈不
上多快，而且又没有太大的法律风险，反正不是诊断
【在 w***a 的大作中提到】
: 关键还不是测序，是背后不断update的database。
: 这玩意不是凑几个wsn那么容易就山寨出来的。
w*w
17 楼
现有的测序技术还不够？我觉得如果某个疾病病人足够多，应该搞得起来。
【在 b****r 的大作中提到】
: HGMD，非常好用的数据库，据我所知基本是手工trim的。估计你砸几千万刀和几年时间
: ，还赶不上它数据质量，更别说声誉了
: 这行虽然动静不大，其实门槛已经相当高了。要找个niche很不容易。我觉得这个领域
: 的大突破应该还是会来自于技术方面，比如新的测序技术或者array技术，可惜那应该
: 基本是物理或者化学或者工程领域的东西
【在 b****r 的大作中提到】
: HGMD，非常好用的数据库，据我所知基本是手工trim的。估计你砸几千万刀和几年时间
: ，还赶不上它数据质量，更别说声誉了
: 这行虽然动静不大，其实门槛已经相当高了。要找个niche很不容易。我觉得这个领域
: 的大突破应该还是会来自于技术方面，比如新的测序技术或者array技术，可惜那应该
: 基本是物理或者化学或者工程领域的东西
w*w
18 楼
关键还在市场。我帮人写了个癌症风险检测软件，生意好像不怎么样。
【在 b****r 的大作中提到】
: 我倒觉得这个数据库几个wsn就能搞个大概了。我最近考虑过做一个相关的检测项目，
: 研究过一下，基本上都是基于well known 的mutation，数量并不是太大，更新也谈不
: 上多快，而且又没有太大的法律风险，反正不是诊断
【在 b****r 的大作中提到】
: 我倒觉得这个数据库几个wsn就能搞个大概了。我最近考虑过做一个相关的检测项目，
: 研究过一下，基本上都是基于well known 的mutation，数量并不是太大，更新也谈不
: 上多快，而且又没有太大的法律风险，反正不是诊断
b*r
19 楼
做生意第一考虑得就应该是性价比
现在的测序还是太贵太贵，而且除了单基因病，其他信息的临床用途还非常有限
【在 w****w 的大作中提到】
: 现有的测序技术还不够？我觉得如果某个疾病病人足够多，应该搞得起来。
现在的测序还是太贵太贵，而且除了单基因病，其他信息的临床用途还非常有限
【在 w****w 的大作中提到】
: 现有的测序技术还不够？我觉得如果某个疾病病人足够多，应该搞得起来。
b*r
20 楼
可能接近一半的人会死于肿瘤，对于肿瘤，关键我觉得不是市场，而是你的预测能力到
底多准
打个比方，吸烟对肿瘤的预测那么准了，大家仍然觉得不够，还是会去吸
换一个思路，没有病的任何有病的人对健康的追求是不一样的，如果你预测的是肿瘤患
者对什么化疗药物敏感，那对预测能力的要求就会低多了
【在 w****w 的大作中提到】
: 关键还在市场。我帮人写了个癌症风险检测软件，生意好像不怎么样。
底多准
打个比方，吸烟对肿瘤的预测那么准了，大家仍然觉得不够，还是会去吸
换一个思路，没有病的任何有病的人对健康的追求是不一样的，如果你预测的是肿瘤患
者对什么化疗药物敏感，那对预测能力的要求就会低多了
【在 w****w 的大作中提到】
: 关键还在市场。我帮人写了个癌症风险检测软件，生意好像不怎么样。
a*k
21 楼
去年AACC的仪器奖给了Life，每个SNP成本已经做到了6 cents。现在大公司基本都在换
他家的仪器了。
【在 b****r 的大作中提到】
: 做生意第一考虑得就应该是性价比
: 现在的测序还是太贵太贵，而且除了单基因病，其他信息的临床用途还非常有限
他家的仪器了。
【在 b****r 的大作中提到】
: 做生意第一考虑得就应该是性价比
: 现在的测序还是太贵太贵，而且除了单基因病，其他信息的临床用途还非常有限
a*k
22 楼
不是测序太贵，是FDA的regulation太贵。
research实验室送个exon的bidirectional也就是$4-$5
到了诊断实验室给病人就到了$400-$500
【在 b****r 的大作中提到】
: 做生意第一考虑得就应该是性价比
: 现在的测序还是太贵太贵，而且除了单基因病，其他信息的临床用途还非常有限
research实验室送个exon的bidirectional也就是$4-$5
到了诊断实验室给病人就到了$400-$500
【在 b****r 的大作中提到】
: 做生意第一考虑得就应该是性价比
: 现在的测序还是太贵太贵，而且除了单基因病，其他信息的临床用途还非常有限
w*w
23 楼
就几个SNP，不可能很准的。而且如果false positive,没给癌搞死，先给吓死，不像测
家谱那样可以测着玩。
【在 b****r 的大作中提到】
: 可能接近一半的人会死于肿瘤，对于肿瘤，关键我觉得不是市场，而是你的预测能力到
: 底多准
: 打个比方，吸烟对肿瘤的预测那么准了，大家仍然觉得不够，还是会去吸
: 换一个思路，没有病的任何有病的人对健康的追求是不一样的，如果你预测的是肿瘤患
: 者对什么化疗药物敏感，那对预测能力的要求就会低多了
家谱那样可以测着玩。
【在 b****r 的大作中提到】
: 可能接近一半的人会死于肿瘤，对于肿瘤，关键我觉得不是市场，而是你的预测能力到
: 底多准
: 打个比方，吸烟对肿瘤的预测那么准了，大家仍然觉得不够，还是会去吸
: 换一个思路，没有病的任何有病的人对健康的追求是不一样的，如果你预测的是肿瘤患
: 者对什么化疗药物敏感，那对预测能力的要求就会低多了
w*a
24 楼
本来就是风险报告，又不是诊断。
炒股有风险，还不是乌泱乌泱的去炒，被吓死的没几个吧。
【在 w****w 的大作中提到】
: 就几个SNP，不可能很准的。而且如果false positive,没给癌搞死，先给吓死，不像测
: 家谱那样可以测着玩。
炒股有风险，还不是乌泱乌泱的去炒，被吓死的没几个吧。
【在 w****w 的大作中提到】
: 就几个SNP，不可能很准的。而且如果false positive,没给癌搞死，先给吓死，不像测
: 家谱那样可以测着玩。
w*w
25 楼
Pharmacogenetics说起来容易，但要涉及医生，药房，药厂，弄起来还是挺麻烦的。
【在 b****r 的大作中提到】
: 可能接近一半的人会死于肿瘤，对于肿瘤，关键我觉得不是市场，而是你的预测能力到
: 底多准
: 打个比方，吸烟对肿瘤的预测那么准了，大家仍然觉得不够，还是会去吸
: 换一个思路，没有病的任何有病的人对健康的追求是不一样的，如果你预测的是肿瘤患
: 者对什么化疗药物敏感，那对预测能力的要求就会低多了
【在 b****r 的大作中提到】
: 可能接近一半的人会死于肿瘤，对于肿瘤，关键我觉得不是市场，而是你的预测能力到
: 底多准
: 打个比方，吸烟对肿瘤的预测那么准了，大家仍然觉得不够，还是会去吸
: 换一个思路，没有病的任何有病的人对健康的追求是不一样的，如果你预测的是肿瘤患
: 者对什么化疗药物敏感，那对预测能力的要求就会低多了
b*r
26 楼
你说的有一点点对，嗬嗬
FDA也就是今年才开始加入这事，之前其实是由其他机构管理的。FDA近来以后，成本还
要更高
你这个类比不知道你是故意的，还是确实没有基本知识。4-5刀的，那是最便宜的情况
了，客户要批量都弄好引物模版，只要排枪上机器跑一下
诊断实验室拿到的是全血，从抽DNA，买引物模条件，作出PCR,测出很清楚的双向序列
，人工分析完数据，人工写好报告， 所有加一起算。而且有突变总还要再确证一次吧
，又是从抽dna 开始做一遍，这都是质控之外的。而且你不会以为一个基因只要一对引
物吧？单基因检测可以说是临床实验室非常不赚钱的项目，更多是社会服务目的。
【在 a********k 的大作中提到】
: 不是测序太贵，是FDA的regulation太贵。
: research实验室送个exon的bidirectional也就是$4-$5
: 到了诊断实验室给病人就到了$400-$500
FDA也就是今年才开始加入这事，之前其实是由其他机构管理的。FDA近来以后，成本还
要更高
你这个类比不知道你是故意的，还是确实没有基本知识。4-5刀的，那是最便宜的情况
了，客户要批量都弄好引物模版，只要排枪上机器跑一下
诊断实验室拿到的是全血，从抽DNA，买引物模条件，作出PCR,测出很清楚的双向序列
，人工分析完数据，人工写好报告， 所有加一起算。而且有突变总还要再确证一次吧
，又是从抽dna 开始做一遍，这都是质控之外的。而且你不会以为一个基因只要一对引
物吧？单基因检测可以说是临床实验室非常不赚钱的项目，更多是社会服务目的。
【在 a********k 的大作中提到】
: 不是测序太贵，是FDA的regulation太贵。
: research实验室送个exon的bidirectional也就是$4-$5
: 到了诊断实验室给病人就到了$400-$500
b*r
27 楼
再说现在大家都搞NGS 我们开始说得也都是NGS.当然了，成本的算法也是类似的了。更
别说临床上的检测结果关系到患者的健康，就是没有监管，你也得多花点功夫认真做吧？
【在 a********k 的大作中提到】
: 不是测序太贵，是FDA的regulation太贵。
: research实验室送个exon的bidirectional也就是$4-$5
: 到了诊断实验室给病人就到了$400-$500
别说临床上的检测结果关系到患者的健康，就是没有监管，你也得多花点功夫认真做吧？
【在 a********k 的大作中提到】
: 不是测序太贵，是FDA的regulation太贵。
: research实验室送个exon的bidirectional也就是$4-$5
: 到了诊断实验室给病人就到了$400-$500
w*w
28 楼
比较了一下PKD1的nonsense/missense mutation:
HGMD 407,Mayo 884,大概300多一点共同。
这里其实mutation matching不是很重要，关键还是准确测序，减少false positive,早
期诊断就有用了。
这个先做long range PCR,不知是否很准确？
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10854095?dopt=Abstract
【在 b****r 的大作中提到】
: HGMD，非常好用的数据库，据我所知基本是手工trim的。估计你砸几千万刀和几年时间
: ，还赶不上它数据质量，更别说声誉了
: 这行虽然动静不大，其实门槛已经相当高了。要找个niche很不容易。我觉得这个领域
: 的大突破应该还是会来自于技术方面，比如新的测序技术或者array技术，可惜那应该
: 基本是物理或者化学或者工程领域的东西
HGMD 407,Mayo 884,大概300多一点共同。
这里其实mutation matching不是很重要，关键还是准确测序，减少false positive,早
期诊断就有用了。
这个先做long range PCR,不知是否很准确？
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10854095?dopt=Abstract
【在 b****r 的大作中提到】
: HGMD，非常好用的数据库，据我所知基本是手工trim的。估计你砸几千万刀和几年时间
: ，还赶不上它数据质量，更别说声誉了
: 这行虽然动静不大，其实门槛已经相当高了。要找个niche很不容易。我觉得这个领域
: 的大突破应该还是会来自于技术方面，比如新的测序技术或者array技术，可惜那应该
: 基本是物理或者化学或者工程领域的东西
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