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Drug discovery 的high throughput screening data怎么分析呢？ (转载)

Drug discovery 的high throughput screening data怎么分析呢？ (转载)# Biology - 生物学

b*e2013-11-05 08:11

1 楼

H1-H4-H1, I transferred from H1 to H4 on October, and transferred from H4 to
H1 on November. H1 was processed in premium process and got approved, but
H4 is still pending. Will this cause a problem? What should I do?

T*n2013-11-05 08:11

2 楼

【以下文字转载自 Postdoc 讨论区】
发信人: Tonyvan (Tony), 信区: Postdoc
标题: Drug discovery 的high throughput screening data怎么分析呢？-诚心求教！！！
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Nov 5 20:19:07 2013, 美东)
问一下，Drug discovery 的high throughput screening data怎么分析呢？刚刚回到
一个做这方面的领域，感觉挺喜欢的，但自己没这方面的经验，不知道怎么分析。老板
只是打击我，不肯指导我。现在很郁闷，诚心求教！！！

l*52013-11-05 08:11

3 楼

按 "last action rule", 当你的H4批准后, 你的H1将自动失效. 你能联系CIS CANCEL
这个H4 CASE最好, 否则你只有两条路可走: 重新申请H1和出境重新激活H1

j*n2013-11-05 08:11

4 楼

看你想分析什么了如果只是找hit 那就计算下ratio, fold change，或者z score然后
画个threshold就行了一般excel就可以做完 Metacore可以辅助完成这个工作还可以
看具体的化合物靶点信息啥的 Spotfire可以在数据本身方面做一些分析

m*h2013-11-05 08:11

5 楼

去把H4的申请cancel掉

to

【在 b*****e 的大作中提到】

: H1-H4-H1, I transferred from H1 to H4 on October, and transferred from H4 to
: H1 on November. H1 was processed in premium process and got approved, but
: H4 is still pending. Will this cause a problem? What should I do?

C*n2013-11-05 08:11

6 楼

How would you calculate fold change? Thanks!

【在 j******n 的大作中提到】

: 看你想分析什么了如果只是找hit 那就计算下ratio, fold change，或者z score然后
: 画个threshold就行了一般excel就可以做完 Metacore可以辅助完成这个工作还可以
: 看具体的化合物靶点信息啥的 Spotfire可以在数据本身方面做一些分析

R*n2013-11-05 08:11

7 楼

Where is the database?

教！！！

【在 T*****n 的大作中提到】

: 【以下文字转载自 Postdoc 讨论区】
: 发信人: Tonyvan (Tony), 信区: Postdoc
: 标题: Drug discovery 的high throughput screening data怎么分析呢？-诚心求教！！！
: 发信站: BBS 未名空间站 (Tue Nov 5 20:19:07 2013, 美东)
: 问一下，Drug discovery 的high throughput screening data怎么分析呢？刚刚回到
: 一个做这方面的领域，感觉挺喜欢的，但自己没这方面的经验，不知道怎么分析。老板
: 只是打击我，不肯指导我。现在很郁闷，诚心求教！！！

j*n2013-11-05 08:11

8 楼

实验点数据除以control的数据如果大于1那就是fold change 小于1求负倒数（0.5的
Fold change=-2)

【在 C******n 的大作中提到】

: How would you calculate fold change? Thanks!

s*l2013-11-05 08:11

9 楼

简单的分析hit rate，选top hit的话，用excel就够了（把positive control设置为
100%response，把你的DMSO(negative control)设置为0%response）。
不过最好联系你做screen的center，他们都有informatic scientist，他们有专业软件
可以做其他的深入分析，你也可以问一下可不可以让你学习使用一下，很多其实蛮简单
的。

教！！！

【在 T*****n 的大作中提到】