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谈谈和蛋白打交道的日子(二)转行IT当码农还是继续生物艰辛路?
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谈谈和蛋白打交道的日子(二)转行IT当码农还是继续生物艰辛路?# Biology - 生物学
t*1
1
握个手。我说绿卡啊,不是什么ead,ead解决不了换专业的问题,坑爹!!
avatar
r*r
2
笔记本是dell inspiron 17,原装win8 home version,自己装了win7。用了1年多没有
任何问题。最近频繁发生wifi掉线,仔细一看发现wifi驱动从硬件列表中莫名其妙消失
了。卸载并重装wifi驱动之后仅能正常工作几天,然后就是多次蓝屏死机。卸掉wifi驱
动后系统恢复正常。
这到底是怎么回事?
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c*n
3
谈谈和蛋白打交道的日子 (二)
前言
本来打算这篇要构思的全面些后再拿出来的。由于第一篇有跟帖提到了学IT比 Bio要强
的多, 而且主要是经济上的优势。咱们这个生物版也经常看见这样纠结的议题。这个
dilemma笔者n年前也曾碰到过。这里就分享一下这方面的一些亲身体会吧。
其实对于大多数人,运气和财气都是守恒的。是你的想逃都逃不掉,不是你的就要学会
放下。实在想要得到,就尽全力去争取。这样得不到时就不会留下遗憾。不管怎样,都
要真心祝福得到的人,那就省下了最伤自己的抱怨。这就是实实在在的“正能量“了吧。
第二篇 转行IT当码农还是继续生物艰辛路?
先从“梦”想照进现实开始说起。
读博时有一段时间总会梦见在大学里考线性代数,卷子上没有一道题看得懂,然后惊醒
。每次都要静下来好一阵子才明白,其实自己从来都没有修过这门课。相似的事情在现
实生活中真的发生了。那天坐在教室里参加Computer Science Master degree第一门必
修课的期末考试,居然没有一道题知道是在问什么。第一反应是,在做梦吗?然后深吸
一口气,佯装镇定地举手叫来监考的TA, 问这次的考题是不是发错了?TA看了看, 说
, 没有啊, 就是 CS-3YY呀。一听, 松了口气,原来是进错考场了。但马上又紧张了
起来, 那么, CS-3XX在哪里考试呢?这一问,才发现,一个屋子里, 有不少来错教
室的,于是很多人站起来去另一个考场。 有几个熟悉的人相互打量着,是咱们生物行
业同样在读博的中国同胞们, 很惺惺相惜的样子。大家找到了考场,没误多少,记得
最后自己考了个A-, 还算过得去。
通过这一门课,学到了IT思维和处理问题的与生物很不一样的方式, 比较启发人。但
学完这门CS课程以后,决定生物还是自己的最爱,IT就平时自我提高用用吧, 不读完
这个MS degree了, 于是日子又回到安下心来每天忙当时好像很无前途的蛋白研究中。
那阵子IT太火,生物又不好找工作,加上学校给研究生们cover所有课程的费用,于是
,很多生物同仁都兼修了一个CS的MS degree。学校对这个一开始没怎么注意, 很多人
就不花钱读了双学位。但后来实在是人皆CS,搞得不少导师教授们很头疼,中间闹出过
许多闲闻趣事,很丰富了茶余饭后的谈资。当年这些转行的, 现在有的还在做IT,有
的在做bioinformatics, 也有回归生物在lab里做实验的例子,是个自然进化的现实版。
这里我来讲几个生物与IT的小故事,希望给还在纠结中的生物老乡们轻松一刻吧。
第一个故事涉及到一个业界大师的经历。
蛋白3D结构里面藏着很多只有God才知道的生命的秘密。发现这些秘密的时候就是个
epiphany moment。自己是个无神论者, 但是很崇尚这个理论。
一次开会,晚饭坐在业界X-ray蛋白晶体结构大师的旁边。他是个意气风发,有着美英
澳杂交口音的英俊爱尔兰后裔,当时刚在一个重磅杂志上发表了一个癌症biomarker
kinase的结构。这里复述一下他的原话 “My postdoc came to my office and showed
me this structure he’s just got. It felt so right! The sidechain of
phenylalanine is in such a position that I told the lad, hey, now only YOU
and I in this room and GOD know how this thing works!” 当时他的表情和语气经
常在我做实验遇到难处时出现 - 嗯,别着急,再坚持一下,奇迹会出现的!这个大师
的研究成果后来成为一个新药研发公司的技术支柱, 他也转行当了CSO。他的公司
develop了很多screening methods和bioinformatics tools,是生物与IT及市场结合的
典范了,那时给不少生物码农们制造了就业机会。然而,新药研发是个漫长而充满风险
的过程。在经历了一番商场的风雨沉浮之后,大师又回归了科研院校。真正有实力的人
任何时候down了都会东山再起,他就是个好的例子。不管是生物, 还是IT, 或者其他
行业,最后总是实力说话。
第二个故事涉及到我做数据库时的经历。
很多自然界的秘密只有把大量数据集中到数据库,然后用一些informatics tool去mine
去测试你的点子以后才会被发现, 金子就藏在这些数据库里等你来挖了。蛋白的NMR
chemical shift database就是这样的一个宝藏。
刚开始建库的时候,可没有别的办法。是从历年发表过的文献里手工提出来的。一些经
典文献当时只有paper版,那就要先扫描成pdf,再把表格提出来。一开始只能靠人力
brute force, 等慢慢攒出经验,就找来了IT人员来做tools提高效率。其中一个IT
part time是个在修IT课程的学生物的女生。
这个女生那时面对很多找工作的诱惑,所以没有几个tools真正做到位的, 却总觉得自
己是被大材小用了,着实让人心疼。每天工作时谈的是今天这个local bioinformatics
公司给了n万的offer,但是自己很不满意,没前途;明天那个IT公司给了n+1万的
offer, stock option 没有,再等等。后来终于等来了西雅图的召唤,面试回来后对
于那个paid龙虾晚宴念念不忘。至今想到那句“没想到在中国饭店也能不费力的一个人
消费100美金”,我还是会忍俊不止。以后经历了IT bubble的大时代,一个生物转IT码
农的这炉沉香也就最终回归家庭了。
回到数据库上。那时我在解一个蛋白的结构,一共4对二硫键。之前有一个group发表过
好几篇文献,详细研究了4对二硫键的order,有充分的数据支持。 可是我的NMR数据运
算结果却得出了另一个完全不一样的二硫键形成的方式。当时真是头疼极了,怎么办?
在做蛋白chemical shift 数据库时,我留心了一下类似蛋白序列的cysteine Ca和Cb
的chemical shifts, 发现其中有一些隐约可见的规律。自己做了个小分析软件, 但
是不给力,试了几次都没有mine出什么靠谱的规律。这时候,另一个group做了个很好
的软件来分析我们收集的数据库,研究的也是cysteine Ca和Cb chemical shifts与二
硫键形成之间的关系。我是文章的reviewer者之一,第一手看见了他们的结论, 很激
动,因为总结的二硫键规律符合我的蛋白结构。这给了我很大的信心,自己的文章很快
就写完顺利发表了。到现在还会想,如果我拥有更多IT的知识,那么这个二硫键规律可
以更早点被发现,就不用自己头疼那么长时间了。
梦想和现实其实是可以很接近的, 就像生物和IT是密不可分的,而且越来越会是这样
。面对生物大数据时代的到来,没有什么必要再去纠结要不要当码农,还是继续生物路
了。任何人都有权利和义务让自己和家人的生活在物质上过的更好一些,如果觉得IT行
业可以为自己带来这些,那去学就好了。如果舍不得生物,也尽量为自己增添点IT的知
识,因为你的下一个epiphany moment说不定就在那个生物与IT的交叉路口等着你来偶
遇呢。
- CoinbyCoin
2014 元月
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f*c
4
你都快排到了

【在 t******1 的大作中提到】
: 握个手。我说绿卡啊,不是什么ead,ead解决不了换专业的问题,坑爹!!
avatar
a9
5
不 兼 容

【在 r****r 的大作中提到】
: 笔记本是dell inspiron 17,原装win8 home version,自己装了win7。用了1年多没有
: 任何问题。最近频繁发生wifi掉线,仔细一看发现wifi驱动从硬件列表中莫名其妙消失
: 了。卸载并重装wifi驱动之后仅能正常工作几天,然后就是多次蓝屏死机。卸掉wifi驱
: 动后系统恢复正常。
: 这到底是怎么回事?

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f*u
6
这个要顶一下

吧。

【在 c********n 的大作中提到】
: 谈谈和蛋白打交道的日子 (二)
: 前言
: 本来打算这篇要构思的全面些后再拿出来的。由于第一篇有跟帖提到了学IT比 Bio要强
: 的多, 而且主要是经济上的优势。咱们这个生物版也经常看见这样纠结的议题。这个
: dilemma笔者n年前也曾碰到过。这里就分享一下这方面的一些亲身体会吧。
: 其实对于大多数人,运气和财气都是守恒的。是你的想逃都逃不掉,不是你的就要学会
: 放下。实在想要得到,就尽全力去争取。这样得不到时就不会留下遗憾。不管怎样,都
: 要真心祝福得到的人,那就省下了最伤自己的抱怨。这就是实实在在的“正能量“了吧。
: 第二篇 转行IT当码农还是继续生物艰辛路?
: 先从“梦”想照进现实开始说起。

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t*1
7
已经等的快吐血了

【在 f*c 的大作中提到】
: 你都快排到了
avatar
r*r
8
如果是不兼容,怎么解释过去这一年多没出过问题?

【在 a9 的大作中提到】
: 不 兼 容
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l*a
9
归根结底看来还是要学点CS方面的知识哈。。PS:此贴必火
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y*0
10
一天都不想多熬。可是,。。。。
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a*f
11
如果你后来装过一些其他的软件或者驱动这正常,驱动文件和新装的软件或者驱动程序
有冲突

【在 r****r 的大作中提到】
: 如果是不兼容,怎么解释过去这一年多没出过问题?
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e*o
12
it 比 bio 的优势可远远不是经济上的优势。
lz 所谓的运气财气守恒,这个有数据支持?哈哈。自己真正想要的东西就一定要去争
取。
---------
能成为牛人干那一行都行。关键是不能成为牛人咋办?
cs 能混毕业,就能找份还不算差的工作?生物呢?
cs 和 stat 对任何一个学科的研究都是很重要的。
生物教授应该强制学生学CS或者统计master
http://www.mitbbs.com/article0/Biology/31821061_0.html
学校老师阻止限制学生的选课自由,就是为了保障cheap labor供应。
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q*c
13
是啊,我想开公司,也有idea,技术,就他马的没驴卡,很悲催.
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r*r
14
你这个说法是正解。谢谢!

【在 a*f 的大作中提到】
: 如果你后来装过一些其他的软件或者驱动这正常,驱动文件和新装的软件或者驱动程序
: 有冲突

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c*n
15
生物强制学cs或者stat统计,老板的经费恐怕闹不住啊。。。

【在 e*******o 的大作中提到】
: it 比 bio 的优势可远远不是经济上的优势。
: lz 所谓的运气财气守恒,这个有数据支持?哈哈。自己真正想要的东西就一定要去争
: 取。
: ---------
: 能成为牛人干那一行都行。关键是不能成为牛人咋办?
: cs 能混毕业,就能找份还不算差的工作?生物呢?
: cs 和 stat 对任何一个学科的研究都是很重要的。
: 生物教授应该强制学生学CS或者统计master
: http://www.mitbbs.com/article0/Biology/31821061_0.html
: 学校老师阻止限制学生的选课自由,就是为了保障cheap labor供应。

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c*4
16
在这个版上说了很多遍,开公司无需绿卡。退一万步讲,你的公司不会只你一个吧,找
个公民/绿卡搭档就那么难?真是那样,要好好想想值不值得辞职开公司了。

【在 q********c 的大作中提到】
: 是啊,我想开公司,也有idea,技术,就他马的没驴卡,很悲催.
avatar
s*n
17
多谢前辈的文章。这阵IT也很火。
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c*o
18
那就每天给我发信。

【在 t******1 的大作中提到】
: 已经等的快吐血了
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l*1
19
Tell that PI/Boss
from now without R and Bioconductor no way to perform RNA-seq or NGS 2.5 or
3.0 analysis..
PMID 23975260
Nat Protoc. 2013 Sep;8(9):1765-86.
Count-based differential expression analysis of RNA sequencing data using R
and Bioconductor.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23975260
or
http://bayesian.org/forums/jobs/7181

【在 c**********n 的大作中提到】
: 生物强制学cs或者stat统计,老板的经费恐怕闹不住啊。。。
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c*4
20
要绿卡才能去的公司小心被栽赃送到局子里面去。开个玩笑。

【在 t******1 的大作中提到】
: 握个手。我说绿卡啊,不是什么ead,ead解决不了换专业的问题,坑爹!!
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e*o
21
这是一般鼠目寸光的包工头的看法,而不是负责,有远见的教授的看法。
比如lz 这样的,找个cs的工作也不是问题,为啥不转行?真喜欢搞科研。lz 当年选的
cs的课,作用大大的吧。
有个人问我转行的事情,说自己正在申请phd, 如果申请不到找programmer的工作(他
自学了一些编程)。我告诉他,你马上开始找工作,看看一个工作的offer 和一个 生
物phd offer,之间你会选什么。
很多人做生物,是因为没有别的选择,结果就是现在的状况。
另外,真想转行,不让选课是堵不住的,我一门cs的课都没选,不一样能当马工。

【在 c**********n 的大作中提到】
: 生物强制学cs或者stat统计,老板的经费恐怕闹不住啊。。。
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x*u
22
It really plays an important role in career selection, even for company
startup trials, as I am with the same situation as well.
But you can still do a lot of things beforehand while waiting for GC with
your current employment. The key thing is actually how you can allocate your
time and regulate your daily activities. Blaming GC is understandable but
blaming everything on it is too much.
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e*o
23
it 一直很火。就业最烂的时候也比生物强。
趁火的时候入行容易,门槛低,转是最佳时机。

【在 s*********n 的大作中提到】
: 多谢前辈的文章。这阵IT也很火。
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k*b
24
纸上谈兵,做起来全不是那么简单

【在 c*****4 的大作中提到】
: 在这个版上说了很多遍,开公司无需绿卡。退一万步讲,你的公司不会只你一个吧,找
: 个公民/绿卡搭档就那么难?真是那样,要好好想想值不值得辞职开公司了。

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c*n
25
IT编码最让人喜欢的地方是,每做一件事都很快就可以有看得见的结果,确实让人心里
踏实和舒服
生物研究和R&D则是比较考验人的耐心和毅力的一件事, 很多时候要take a leap of
faith
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g*a
26
me!快熬不下去了!!!
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W*o
27
写的不错,让我想起lad和lass这俩词了,呵呵

吧。

【在 c********n 的大作中提到】
: 谈谈和蛋白打交道的日子 (二)
: 前言
: 本来打算这篇要构思的全面些后再拿出来的。由于第一篇有跟帖提到了学IT比 Bio要强
: 的多, 而且主要是经济上的优势。咱们这个生物版也经常看见这样纠结的议题。这个
: dilemma笔者n年前也曾碰到过。这里就分享一下这方面的一些亲身体会吧。
: 其实对于大多数人,运气和财气都是守恒的。是你的想逃都逃不掉,不是你的就要学会
: 放下。实在想要得到,就尽全力去争取。这样得不到时就不会留下遗憾。不管怎样,都
: 要真心祝福得到的人,那就省下了最伤自己的抱怨。这就是实实在在的“正能量“了吧。
: 第二篇 转行IT当码农还是继续生物艰辛路?
: 先从“梦”想照进现实开始说起。

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S*E
28
握手。
我最近的三个面试,两个猎头的第一个问题就是你的身份?然后就渺无音信了。

【在 t******1 的大作中提到】
: 握个手。我说绿卡啊,不是什么ead,ead解决不了换专业的问题,坑爹!!
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s*n
29
看过你的不少文章,知道你的故事。很佩服你的执行力。
我对于写code和计算其实蛮有激情的,也许比较适合做码工。

【在 e*******o 的大作中提到】
: 这是一般鼠目寸光的包工头的看法,而不是负责,有远见的教授的看法。
: 比如lz 这样的,找个cs的工作也不是问题,为啥不转行?真喜欢搞科研。lz 当年选的
: cs的课,作用大大的吧。
: 有个人问我转行的事情,说自己正在申请phd, 如果申请不到找programmer的工作(他
: 自学了一些编程)。我告诉他,你马上开始找工作,看看一个工作的offer 和一个 生
: 物phd offer,之间你会选什么。
: 很多人做生物,是因为没有别的选择,结果就是现在的状况。
: 另外,真想转行,不让选课是堵不住的,我一门cs的课都没选,不一样能当马工。

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t*1
30
这个Ead可以解决

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8

【在 S***E 的大作中提到】
: 握手。
: 我最近的三个面试,两个猎头的第一个问题就是你的身份?然后就渺无音信了。

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b*r
31
好文
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l*7
32
急等ead renewal啊,啊,啊!
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m*a
33
up
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w*s
34
还要等3年半,要疯了,现在的公司一天也不想呆了!!!!!!!!!!!
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h*8
35
写的真好
真心祝福每一个找到自己的兴趣点并能够发挥自己长处的兄弟姐妹们
不管是做生物还是不再做生物

吧。

【在 c********n 的大作中提到】
: 谈谈和蛋白打交道的日子 (二)
: 前言
: 本来打算这篇要构思的全面些后再拿出来的。由于第一篇有跟帖提到了学IT比 Bio要强
: 的多, 而且主要是经济上的优势。咱们这个生物版也经常看见这样纠结的议题。这个
: dilemma笔者n年前也曾碰到过。这里就分享一下这方面的一些亲身体会吧。
: 其实对于大多数人,运气和财气都是守恒的。是你的想逃都逃不掉,不是你的就要学会
: 放下。实在想要得到,就尽全力去争取。这样得不到时就不会留下遗憾。不管怎样,都
: 要真心祝福得到的人,那就省下了最伤自己的抱怨。这就是实实在在的“正能量“了吧。
: 第二篇 转行IT当码农还是继续生物艰辛路?
: 先从“梦”想照进现实开始说起。

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b*2
36
我也是这么个状况!

【在 w*****s 的大作中提到】
: 还要等3年半,要疯了,现在的公司一天也不想呆了!!!!!!!!!!!
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H*r
37
If you are doing research in CS, it's not easy either.

【在 c********n 的大作中提到】
: IT编码最让人喜欢的地方是,每做一件事都很快就可以有看得见的结果,确实让人心里
: 踏实和舒服
: 生物研究和R&D则是比较考验人的耐心和毅力的一件事, 很多时候要take a leap of
: faith

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t*1
38
Same here!

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8

【在 b******2 的大作中提到】
: 我也是这么个状况!
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c*n
39
谈谈和蛋白打交道的日子 (二)
前言
本来打算这篇要构思的全面些后再拿出来的。由于第一篇有跟帖提到了学IT比 Bio要强
的多, 而且主要是经济上的优势。咱们这个生物版也经常看见这样纠结的议题。这个
dilemma笔者n年前也曾碰到过。这里就分享一下这方面的一些亲身体会吧。
其实对于大多数人,运气和财气都是守恒的。是你的想逃都逃不掉,不是你的就要学会
放下。实在想要得到,就尽全力去争取。这样得不到时就不会留下遗憾。不管怎样,都
要真心祝福得到的人,那就省下了最伤自己的抱怨。这就是实实在在的“正能量“了吧。
第二篇 转行IT当码农还是继续生物艰辛路?
先从“梦”想照进现实开始说起。
读博时有一段时间总会梦见在大学里考线性代数,卷子上没有一道题看得懂,然后惊醒
。每次都要静下来好一阵子才明白,其实自己从来都没有修过这门课。相似的事情在现
实生活中真的发生了。那天坐在教室里参加Computer Science Master degree第一门必
修课的期末考试,居然没有一道题知道是在问什么。第一反应是,在做梦吗?然后深吸
一口气,佯装镇定地举手叫来监考的TA, 问这次的考题是不是发错了?TA看了看, 说
, 没有啊, 就是 CS-3YY呀。一听, 松了口气,原来是进错考场了。但马上又紧张了
起来, 那么, CS-3XX在哪里考试呢?这一问,才发现,一个屋子里, 有不少来错教
室的,于是很多人站起来去另一个考场。 有几个熟悉的人相互打量着,是咱们生物行
业同样在读博的中国同胞们, 很惺惺相惜的样子。大家找到了考场,没误多少,记得
最后自己考了个A-, 还算过得去。
通过这一门课,学到了IT思维和处理问题的与生物很不一样的方式, 比较启发人。但
学完这门CS课程以后,决定生物还是自己的最爱,IT就平时自我提高用用吧, 不读完
这个MS degree了, 于是日子又回到安下心来每天忙当时好像很无前途的蛋白研究中。
那阵子IT太火,生物又不好找工作,加上学校给研究生们cover所有课程的费用,于是
,很多生物同仁都兼修了一个CS的MS degree。学校对这个一开始没怎么注意, 很多人
就不花钱读了双学位。但后来实在是人皆CS,搞得不少导师教授们很头疼,中间闹出过
许多闲闻趣事,很丰富了茶余饭后的谈资。当年这些转行的, 现在有的还在做IT,有
的在做bioinformatics, 也有回归生物在lab里做实验的例子,是个自然进化的现实版。
这里我来讲几个生物与IT的小故事,希望给还在纠结中的生物老乡们轻松一刻吧。
第一个故事涉及到一个业界大师的经历。
蛋白3D结构里面藏着很多只有God才知道的生命的秘密。发现这些秘密的时候就是个
epiphany moment。自己是个无神论者, 但是很崇尚这个理论。
一次开会,晚饭坐在业界X-ray蛋白晶体结构大师的旁边。他是个意气风发,有着美英
澳杂交口音的英俊爱尔兰后裔,当时刚在一个重磅杂志上发表了一个癌症biomarker
kinase的结构。这里复述一下他的原话 “My postdoc came to my office and showed
me this structure he’s just got. It felt so right! The sidechain of
phenylalanine is in such a position that I told the lad, hey, now only YOU
and I in this room and GOD know how this thing works!” 当时他的表情和语气经
常在我做实验遇到难处时出现 - 嗯,别着急,再坚持一下,奇迹会出现的!这个大师
的研究成果后来成为一个新药研发公司的技术支柱, 他也转行当了CSO。他的公司
develop了很多screening methods和bioinformatics tools,是生物与IT及市场结合的
典范了,那时给不少生物码农们制造了就业机会。然而,新药研发是个漫长而充满风险
的过程。在经历了一番商场的风雨沉浮之后,大师又回归了科研院校。真正有实力的人
任何时候down了都会东山再起,他就是个好的例子。不管是生物, 还是IT, 或者其他
行业,最后总是实力说话。
第二个故事涉及到我做数据库时的经历。
很多自然界的秘密只有把大量数据集中到数据库,然后用一些informatics tool去mine
去测试你的点子以后才会被发现, 金子就藏在这些数据库里等你来挖了。蛋白的NMR
chemical shift database就是这样的一个宝藏。
刚开始建库的时候,可没有别的办法。是从历年发表过的文献里手工提出来的。一些经
典文献当时只有paper版,那就要先扫描成pdf,再把表格提出来。一开始只能靠人力
brute force, 等慢慢攒出经验,就找来了IT人员来做tools提高效率。其中一个IT
part time是个在修IT课程的学生物的女生。
这个女生那时面对很多找工作的诱惑,所以没有几个tools真正做到位的, 却总觉得自
己是被大材小用了,着实让人心疼。每天工作时谈的是今天这个local bioinformatics
公司给了n万的offer,但是自己很不满意,没前途;明天那个IT公司给了n+1万的
offer, stock option 没有,再等等。后来终于等来了西雅图的召唤,面试回来后对
于那个paid龙虾晚宴念念不忘。至今想到那句“没想到在中国饭店也能不费力的一个人
消费100美金”,我还是会忍俊不止。以后经历了IT bubble的大时代,一个生物转IT码
农的这炉沉香也就最终回归家庭了。
回到数据库上。那时我在解一个蛋白的结构,一共4对二硫键。之前有一个group发表过
好几篇文献,详细研究了4对二硫键的order,有充分的数据支持。 可是我的NMR数据运
算结果却得出了另一个完全不一样的二硫键形成的方式。当时真是头疼极了,怎么办?
在做蛋白chemical shift 数据库时,我留心了一下类似蛋白序列的cysteine Ca和Cb
的chemical shifts, 发现其中有一些隐约可见的规律。自己做了个小分析软件, 但
是不给力,试了几次都没有mine出什么靠谱的规律。这时候,另一个group做了个很好
的软件来分析我们收集的数据库,研究的也是cysteine Ca和Cb chemical shifts与二
硫键形成之间的关系。我是文章的reviewer者之一,第一手看见了他们的结论, 很激
动,因为总结的二硫键规律符合我的蛋白结构。这给了我很大的信心,自己的文章很快
就写完顺利发表了。到现在还会想,如果我拥有更多IT的知识,那么这个二硫键规律可
以更早点被发现,就不用自己头疼那么长时间了。
梦想和现实其实是可以很接近的, 就像生物和IT是密不可分的,而且越来越会是这样
。面对生物大数据时代的到来,没有什么必要再去纠结要不要当码农,还是继续生物路
了。任何人都有权利和义务让自己和家人的生活在物质上过的更好一些,如果觉得IT行
业可以为自己带来这些,那去学就好了。如果舍不得生物,也尽量为自己增添点IT的知
识,因为你的下一个epiphany moment说不定就在那个生物与IT的交叉路口等着你来偶
遇呢。
- CoinbyCoin
2014 元月
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c*g
40
算我一个
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f*u
41
这个要顶一下

吧。

【在 c********n 的大作中提到】
: 谈谈和蛋白打交道的日子 (二)
: 前言
: 本来打算这篇要构思的全面些后再拿出来的。由于第一篇有跟帖提到了学IT比 Bio要强
: 的多, 而且主要是经济上的优势。咱们这个生物版也经常看见这样纠结的议题。这个
: dilemma笔者n年前也曾碰到过。这里就分享一下这方面的一些亲身体会吧。
: 其实对于大多数人,运气和财气都是守恒的。是你的想逃都逃不掉,不是你的就要学会
: 放下。实在想要得到,就尽全力去争取。这样得不到时就不会留下遗憾。不管怎样,都
: 要真心祝福得到的人,那就省下了最伤自己的抱怨。这就是实实在在的“正能量“了吧。
: 第二篇 转行IT当码农还是继续生物艰辛路?
: 先从“梦”想照进现实开始说起。

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s*3
42
Count me!!
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l*a
43
归根结底看来还是要学点CS方面的知识哈。。PS:此贴必火
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e*o
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it 比 bio 的优势可远远不是经济上的优势。
lz 所谓的运气财气守恒,这个有数据支持?哈哈。自己真正想要的东西就一定要去争
取。
---------
能成为牛人干那一行都行。关键是不能成为牛人咋办?
cs 能混毕业,就能找份还不算差的工作?生物呢?
cs 和 stat 对任何一个学科的研究都是很重要的。
生物教授应该强制学生学CS或者统计master
http://www.mitbbs.com/article0/Biology/31821061_0.html
学校老师阻止限制学生的选课自由,就是为了保障cheap labor供应。
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c*n
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生物强制学cs或者stat统计,老板的经费恐怕闹不住啊。。。

【在 e*******o 的大作中提到】
: it 比 bio 的优势可远远不是经济上的优势。
: lz 所谓的运气财气守恒,这个有数据支持?哈哈。自己真正想要的东西就一定要去争
: 取。
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: 能成为牛人干那一行都行。关键是不能成为牛人咋办?
: cs 能混毕业,就能找份还不算差的工作?生物呢?
: cs 和 stat 对任何一个学科的研究都是很重要的。
: 生物教授应该强制学生学CS或者统计master
: http://www.mitbbs.com/article0/Biology/31821061_0.html
: 学校老师阻止限制学生的选课自由,就是为了保障cheap labor供应。

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s*n
46
多谢前辈的文章。这阵IT也很火。
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l*1
47
Tell that PI/Boss
from now without R and Bioconductor no way to perform RNA-seq or NGS 2.5 or
3.0 analysis..
PMID 23975260
Nat Protoc. 2013 Sep;8(9):1765-86.
Count-based differential expression analysis of RNA sequencing data using R
and Bioconductor.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23975260
or
http://bayesian.org/forums/jobs/7181

【在 c**********n 的大作中提到】
: 生物强制学cs或者stat统计,老板的经费恐怕闹不住啊。。。
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e*o
48
这是一般鼠目寸光的包工头的看法,而不是负责,有远见的教授的看法。
比如lz 这样的,找个cs的工作也不是问题,为啥不转行?真喜欢搞科研。lz 当年选的
cs的课,作用大大的吧。
有个人问我转行的事情,说自己正在申请phd, 如果申请不到找programmer的工作(他
自学了一些编程)。我告诉他,你马上开始找工作,看看一个工作的offer 和一个 生
物phd offer,之间你会选什么。
很多人做生物,是因为没有别的选择,结果就是现在的状况。
另外,真想转行,不让选课是堵不住的,我一门cs的课都没选,不一样能当马工。

【在 c**********n 的大作中提到】
: 生物强制学cs或者stat统计,老板的经费恐怕闹不住啊。。。
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e*o
49
it 一直很火。就业最烂的时候也比生物强。
趁火的时候入行容易,门槛低,转是最佳时机。

【在 s*********n 的大作中提到】
: 多谢前辈的文章。这阵IT也很火。
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c*n
50
IT编码最让人喜欢的地方是,每做一件事都很快就可以有看得见的结果,确实让人心里
踏实和舒服
生物研究和R&D则是比较考验人的耐心和毅力的一件事, 很多时候要take a leap of
faith
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W*o
51
写的不错,让我想起lad和lass这俩词了,呵呵

吧。

【在 c********n 的大作中提到】
: 谈谈和蛋白打交道的日子 (二)
: 前言
: 本来打算这篇要构思的全面些后再拿出来的。由于第一篇有跟帖提到了学IT比 Bio要强
: 的多, 而且主要是经济上的优势。咱们这个生物版也经常看见这样纠结的议题。这个
: dilemma笔者n年前也曾碰到过。这里就分享一下这方面的一些亲身体会吧。
: 其实对于大多数人,运气和财气都是守恒的。是你的想逃都逃不掉,不是你的就要学会
: 放下。实在想要得到,就尽全力去争取。这样得不到时就不会留下遗憾。不管怎样,都
: 要真心祝福得到的人,那就省下了最伤自己的抱怨。这就是实实在在的“正能量“了吧。
: 第二篇 转行IT当码农还是继续生物艰辛路?
: 先从“梦”想照进现实开始说起。

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s*n
52
看过你的不少文章,知道你的故事。很佩服你的执行力。
我对于写code和计算其实蛮有激情的,也许比较适合做码工。

【在 e*******o 的大作中提到】
: 这是一般鼠目寸光的包工头的看法,而不是负责,有远见的教授的看法。
: 比如lz 这样的,找个cs的工作也不是问题,为啥不转行?真喜欢搞科研。lz 当年选的
: cs的课,作用大大的吧。
: 有个人问我转行的事情,说自己正在申请phd, 如果申请不到找programmer的工作(他
: 自学了一些编程)。我告诉他,你马上开始找工作,看看一个工作的offer 和一个 生
: 物phd offer,之间你会选什么。
: 很多人做生物,是因为没有别的选择,结果就是现在的状况。
: 另外,真想转行,不让选课是堵不住的,我一门cs的课都没选,不一样能当马工。

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b*r
53
好文
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m*a
54
up
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h*8
55
写的真好
真心祝福每一个找到自己的兴趣点并能够发挥自己长处的兄弟姐妹们
不管是做生物还是不再做生物

吧。

【在 c********n 的大作中提到】
: 谈谈和蛋白打交道的日子 (二)
: 前言
: 本来打算这篇要构思的全面些后再拿出来的。由于第一篇有跟帖提到了学IT比 Bio要强
: 的多, 而且主要是经济上的优势。咱们这个生物版也经常看见这样纠结的议题。这个
: dilemma笔者n年前也曾碰到过。这里就分享一下这方面的一些亲身体会吧。
: 其实对于大多数人,运气和财气都是守恒的。是你的想逃都逃不掉,不是你的就要学会
: 放下。实在想要得到,就尽全力去争取。这样得不到时就不会留下遗憾。不管怎样,都
: 要真心祝福得到的人,那就省下了最伤自己的抱怨。这就是实实在在的“正能量“了吧。
: 第二篇 转行IT当码农还是继续生物艰辛路?
: 先从“梦”想照进现实开始说起。

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H*r
56
If you are doing research in CS, it's not easy either.

【在 c********n 的大作中提到】
: IT编码最让人喜欢的地方是,每做一件事都很快就可以有看得见的结果,确实让人心里
: 踏实和舒服
: 生物研究和R&D则是比较考验人的耐心和毅力的一件事, 很多时候要take a leap of
: faith

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s*y
57
好文。楼主加油
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s*g
58
“通过这一门课,学到了IT思维和处理问题的与生物很不一样的方式, 比较启发人。”
---
你只是说了皮毛。真正融合两者的太少了。能融合好的更少了。就有转了的一位兄弟和
我说,现在很没有接地气的感觉,因为所有IT再牛,都得围着真正做生物的转。。。。
自己就一个服务员。
你已经很不错了。很多人做的还没有你的好。什么软件,模型能忽悠就忽悠。这不单单
是生物医学行业。包括机械发动机的模型计算,没有相当功力,非本行的,做的都有忽
悠混钱的嫌疑--尽管自己自认为是所谓的专家。
其实很多人转或不转,都没有把手头的事情干到精致。因此就有这样那样的抱怨和无奈
!甚至到了那里都是混。。。混得最高境界就是挣了多少。。。。
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