ChIP之前有没有其他代替sonication的方法去 shear chromatin？# Biology - 生物学
b*8
1 楼
想做ChIP，之前一直用的diagenode的bioruptor处理样品，但是现在的实验室条件不行
，没有类似设备，有没有其他方法处理样品？求推荐，最好是成套的试剂盒那就更方便
了，
，没有类似设备，有没有其他方法处理样品？求推荐，最好是成套的试剂盒那就更方便
了，
D*A
2 楼
有种像mini prep column一样的东西，只要离心就可以切成特定大小，忘记是那个公司
了。
那个公司说单次使用，实际可以反复使用，大大降低成本。
了。
那个公司说单次使用，实际可以反复使用，大大降低成本。
g*6
3 楼
Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
k*n
4 楼
你那没有branson sonicator么？
那个比较稳定
那个比较稳定
b*8
5 楼
你说的是这个公司吗？
http://www.activemotif.com/catalog/16.html
【在 D**A 的大作中提到】
: 有种像mini prep column一样的东西，只要离心就可以切成特定大小，忘记是那个公司
: 了。
: 那个公司说单次使用，实际可以反复使用，大大降低成本。
http://www.activemotif.com/catalog/16.html
【在 D**A 的大作中提到】
: 有种像mini prep column一样的东西，只要离心就可以切成特定大小，忘记是那个公司
: 了。
: 那个公司说单次使用，实际可以反复使用，大大降低成本。
b*8
6 楼
谢谢，貌似比较靠谱
【在 g********6 的大作中提到】
: Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
: http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
【在 g********6 的大作中提到】
: Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
: http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
b*8
7 楼
刚看了下，mnase digestion之后还是需要做sonication，遗憾。
【在 g********6 的大作中提到】
: Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
: http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
【在 g********6 的大作中提到】
: Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
: http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
K*R
8 楼
似乎有个N Chip酶切的，Xchip都是要打成一段一段
你查查，有比较成熟protocol，我记得nature protocol有一个讲的很详细。不需要
sonicator.
另外如果代替，也可以你用western超声蛋白的那个可以代替，不过条件自己摸索，一
定要在冰上打。
你查查，有比较成熟protocol，我记得nature protocol有一个讲的很详细。不需要
sonicator.
另外如果代替，也可以你用western超声蛋白的那个可以代替，不过条件自己摸索，一
定要在冰上打。
g*6
9 楼
MNase digestion之后可以用普通的探头sonicator随便超两下,这个也没有？
【在 b**********8 的大作中提到】
: 刚看了下，mnase digestion之后还是需要做sonication，遗憾。
【在 b**********8 的大作中提到】
: 刚看了下，mnase digestion之后还是需要做sonication，遗憾。
d*7
10 楼
You can use probe sonicator. A lot of people are using that for ChIP.
Or check this paper from Steven Henikoff:
http://www.nature.com/nmeth/journal/v11/n2/full/nmeth.2766.html
Though I don't get it how this paper manages to get published on Nature
methods.
【在 b**********8 的大作中提到】
: 想做ChIP，之前一直用的diagenode的bioruptor处理样品，但是现在的实验室条件不行
: ，没有类似设备，有没有其他方法处理样品？求推荐，最好是成套的试剂盒那就更方便
: 了，
Or check this paper from Steven Henikoff:
http://www.nature.com/nmeth/journal/v11/n2/full/nmeth.2766.html
Though I don't get it how this paper manages to get published on Nature
methods.
【在 b**********8 的大作中提到】
: 想做ChIP，之前一直用的diagenode的bioruptor处理样品，但是现在的实验室条件不行
: ，没有类似设备，有没有其他方法处理样品？求推荐，最好是成套的试剂盒那就更方便
: 了，
g*6
11 楼
或者用这位大哥发的方法，MNase消化，然后将上清过针头打断未消化的染色质降低粘
稠度，这个方法跟CST试剂盒原理一样。
【在 d****7 的大作中提到】
: You can use probe sonicator. A lot of people are using that for ChIP.
: Or check this paper from Steven Henikoff:
: http://www.nature.com/nmeth/journal/v11/n2/full/nmeth.2766.html
: Though I don't get it how this paper manages to get published on Nature
: methods.
稠度，这个方法跟CST试剂盒原理一样。
【在 d****7 的大作中提到】
: You can use probe sonicator. A lot of people are using that for ChIP.
: Or check this paper from Steven Henikoff:
: http://www.nature.com/nmeth/journal/v11/n2/full/nmeth.2766.html
: Though I don't get it how this paper manages to get published on Nature
: methods.
d*i
12 楼
http://www.fhcrc.org/en/news/spotlight/imports/no-formaldehyde-
CST的kit也蛮好。
【在 d****7 的大作中提到】
: You can use probe sonicator. A lot of people are using that for ChIP.
: Or check this paper from Steven Henikoff:
: http://www.nature.com/nmeth/journal/v11/n2/full/nmeth.2766.html
: Though I don't get it how this paper manages to get published on Nature
: methods.
s*t
13 楼
mark
d*s
14 楼
mark
B*U
15 楼
mnase很tricky的,digest时间一定要掌握好
【在 g********6 的大作中提到】
: Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
: http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
【在 g********6 的大作中提到】
: Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
: http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
k*n
16 楼
biorupter
【在 b**********8 的大作中提到】
: 想做ChIP，之前一直用的diagenode的bioruptor处理样品，但是现在的实验室条件不行
: ，没有类似设备，有没有其他方法处理样品？求推荐，最好是成套的试剂盒那就更方便
: 了，
【在 b**********8 的大作中提到】
: 想做ChIP，之前一直用的diagenode的bioruptor处理样品，但是现在的实验室条件不行
: ，没有类似设备，有没有其他方法处理样品？求推荐，最好是成套的试剂盒那就更方便
: 了，
m*z
17 楼
pierece 有mnase不sonication的
【在 b**********8 的大作中提到】
: 刚看了下，mnase digestion之后还是需要做sonication，遗憾。
【在 b**********8 的大作中提到】
: 刚看了下，mnase digestion之后还是需要做sonication，遗憾。
b*8
18 楼
给个link，谢谢
【在 m*****z 的大作中提到】
: pierece 有mnase不sonication的
【在 m*****z 的大作中提到】
: pierece 有mnase不sonication的
b*8
19 楼
想做ChIP，之前一直用的diagenode的bioruptor处理样品，但是现在的实验室条件不行
，没有类似设备，有没有其他方法处理样品？求推荐，最好是成套的试剂盒那就更方便
了，
，没有类似设备，有没有其他方法处理样品？求推荐，最好是成套的试剂盒那就更方便
了，
D*A
20 楼
有种像mini prep column一样的东西，只要离心就可以切成特定大小，忘记是那个公司
了。
那个公司说单次使用，实际可以反复使用，大大降低成本。
了。
那个公司说单次使用，实际可以反复使用，大大降低成本。
g*6
21 楼
Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
k*n
22 楼
你那没有branson sonicator么？
那个比较稳定
那个比较稳定
b*8
23 楼
你说的是这个公司吗？
http://www.activemotif.com/catalog/16.html
【在 D**A 的大作中提到】
: 有种像mini prep column一样的东西，只要离心就可以切成特定大小，忘记是那个公司
: 了。
: 那个公司说单次使用，实际可以反复使用，大大降低成本。
http://www.activemotif.com/catalog/16.html
【在 D**A 的大作中提到】
: 有种像mini prep column一样的东西，只要离心就可以切成特定大小，忘记是那个公司
: 了。
: 那个公司说单次使用，实际可以反复使用，大大降低成本。
b*8
24 楼
谢谢，貌似比较靠谱
【在 g********6 的大作中提到】
: Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
: http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
【在 g********6 的大作中提到】
: Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
: http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
b*8
25 楼
刚看了下，mnase digestion之后还是需要做sonication，遗憾。
【在 g********6 的大作中提到】
: Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
: http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
【在 g********6 的大作中提到】
: Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
: http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
K*R
26 楼
似乎有个N Chip酶切的，Xchip都是要打成一段一段
你查查，有比较成熟protocol，我记得nature protocol有一个讲的很详细。不需要
sonicator.
另外如果代替，也可以你用western超声蛋白的那个可以代替，不过条件自己摸索，一
定要在冰上打。
你查查，有比较成熟protocol，我记得nature protocol有一个讲的很详细。不需要
sonicator.
另外如果代替，也可以你用western超声蛋白的那个可以代替，不过条件自己摸索，一
定要在冰上打。
g*6
27 楼
MNase digestion之后可以用普通的探头sonicator随便超两下,这个也没有？
【在 b**********8 的大作中提到】
: 刚看了下，mnase digestion之后还是需要做sonication，遗憾。
【在 b**********8 的大作中提到】
: 刚看了下，mnase digestion之后还是需要做sonication，遗憾。
d*7
28 楼
You can use probe sonicator. A lot of people are using that for ChIP.
Or check this paper from Steven Henikoff:
http://www.nature.com/nmeth/journal/v11/n2/full/nmeth.2766.html
Though I don't get it how this paper manages to get published on Nature
methods.
【在 b**********8 的大作中提到】
: 想做ChIP，之前一直用的diagenode的bioruptor处理样品，但是现在的实验室条件不行
: ，没有类似设备，有没有其他方法处理样品？求推荐，最好是成套的试剂盒那就更方便
: 了，
Or check this paper from Steven Henikoff:
http://www.nature.com/nmeth/journal/v11/n2/full/nmeth.2766.html
Though I don't get it how this paper manages to get published on Nature
methods.
【在 b**********8 的大作中提到】
: 想做ChIP，之前一直用的diagenode的bioruptor处理样品，但是现在的实验室条件不行
: ，没有类似设备，有没有其他方法处理样品？求推荐，最好是成套的试剂盒那就更方便
: 了，
g*6
29 楼
或者用这位大哥发的方法，MNase消化，然后将上清过针头打断未消化的染色质降低粘
稠度，这个方法跟CST试剂盒原理一样。
【在 d****7 的大作中提到】
: You can use probe sonicator. A lot of people are using that for ChIP.
: Or check this paper from Steven Henikoff:
: http://www.nature.com/nmeth/journal/v11/n2/full/nmeth.2766.html
: Though I don't get it how this paper manages to get published on Nature
: methods.
稠度，这个方法跟CST试剂盒原理一样。
【在 d****7 的大作中提到】
: You can use probe sonicator. A lot of people are using that for ChIP.
: Or check this paper from Steven Henikoff:
: http://www.nature.com/nmeth/journal/v11/n2/full/nmeth.2766.html
: Though I don't get it how this paper manages to get published on Nature
: methods.
d*i
30 楼
http://www.fhcrc.org/en/news/spotlight/imports/no-formaldehyde-
CST的kit也蛮好。
【在 d****7 的大作中提到】
: You can use probe sonicator. A lot of people are using that for ChIP.
: Or check this paper from Steven Henikoff:
: http://www.nature.com/nmeth/journal/v11/n2/full/nmeth.2766.html
: Though I don't get it how this paper manages to get published on Nature
: methods.
s*t
31 楼
mark
d*s
32 楼
mark
B*U
33 楼
mnase很tricky的,digest时间一定要掌握好
【在 g********6 的大作中提到】
: Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
: http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
【在 g********6 的大作中提到】
: Cst有个试剂盒，用mnase不用超声
: http://www.cellsignal.com/technologies/chip_kits.html
k*n
34 楼
biorupter
【在 b**********8 的大作中提到】
: 想做ChIP，之前一直用的diagenode的bioruptor处理样品，但是现在的实验室条件不行
: ，没有类似设备，有没有其他方法处理样品？求推荐，最好是成套的试剂盒那就更方便
: 了，
【在 b**********8 的大作中提到】
: 想做ChIP，之前一直用的diagenode的bioruptor处理样品，但是现在的实验室条件不行
: ，没有类似设备，有没有其他方法处理样品？求推荐，最好是成套的试剂盒那就更方便
: 了，
m*z
35 楼
pierece 有mnase不sonication的
【在 b**********8 的大作中提到】
: 刚看了下，mnase digestion之后还是需要做sonication，遗憾。
【在 b**********8 的大作中提到】
: 刚看了下，mnase digestion之后还是需要做sonication，遗憾。
b*8
36 楼
给个link，谢谢
【在 m*****z 的大作中提到】
: pierece 有mnase不sonication的
【在 m*****z 的大作中提到】
: pierece 有mnase不sonication的
m*z
37 楼
http://www.piercenet.com/product/pierce-agarose-chip-kit
worked pretty good to me.
【在 b**********8 的大作中提到】
: 给个link，谢谢
worked pretty good to me.
【在 b**********8 的大作中提到】
: 给个link，谢谢
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