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polysome profiling vs ribosome profiling 有什么区别啊？

polysome profiling vs ribosome profiling 有什么区别啊？# Biology - 生物学

o*42014-04-07 07:04

1 楼

我有个蛋白对于ribosome biogenesis有影响，
怎么检测这种影响呢？哪个protocol更好呢？
不知道这两个protocol有什么区别呢？
谢谢

m*u2014-04-07 07:04

2 楼

这是大小概念的意思吧。后者包含前者。ribosome profile，前面的fraction就是
ribosome 独立的大、小亚基，中间是monosome，后面的fraction就是polysome了。这
个profileing使用来检测活性翻译的mRNA的，所以叫profiling。我看过你另外的那个
帖子了，这个方法不是你想要的。你要的是核糖体活性差异，而不是mRNA的
tanslatiblity的差异。你再想想其他办法，或者至少要多这个方法做些modification
。

m*u2014-04-07 07:04

3 楼

对你那个帖子的问题就问的很好。这么检测ribosome的含量和活性。ribosome
profiling有点太间接了。对照不仅仅是loading的总蛋白量或总RNA量，我觉得细胞数
才是重要的。因为我在那个回帖中说了，核糖体数目或活性受到影响细胞生长会受到影
响。细想，比用总蛋白或总RNA做profiling，得到的pattern完全一致也是可能的。但
你用相同细胞数来作核糖体蛋白滴定，核糖体少的当然就是信号弱了，一个WB或一个
northern试验就够了。

o*42014-04-07 07:04

4 楼

“但
你用相同细胞数来作核糖体蛋白滴定”
这个咋做简单？ WB没问题， northern 有点麻烦啊

【在 m******u 的大作中提到】

: 对你那个帖子的问题就问的很好。这么检测ribosome的含量和活性。ribosome
: profiling有点太间接了。对照不仅仅是loading的总蛋白量或总RNA量，我觉得细胞数
: 才是重要的。因为我在那个回帖中说了，核糖体数目或活性受到影响细胞生长会受到影
: 响。细想，比用总蛋白或总RNA做profiling，得到的pattern完全一致也是可能的。但
: 你用相同细胞数来作核糖体蛋白滴定，核糖体少的当然就是信号弱了，一个WB或一个
: northern试验就够了。