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没有写代码经验，如何进行Gene Ontology/Function Classficati

没有写代码经验，如何进行Gene Ontology/Function Classficati# Biology - 生物学

v*a2016-10-21 07:10

1 楼

通过测序手段获得的一堆上调或者下降的基因(excel)
如何对其进行Gene Ontology/Function Annotation 分析
筛选到和该疾病相关的基因，从而进行下游分析？
没有编码经验，求指导，谢谢

j*g2016-10-21 07:10

2 楼

easy。
不需要会代码。
Google gene ontology加上关键词 g:profiler 或者 gorilla 或者 DAVID 或者
Metascape。把你的基因放进去就行。
如果想同时考虑基因的表达情况，可以用Broad Institute的GSEA，也是用户友好软件
，不需要写代码。这个可以考虑基因的表达高低，比如TPM或者fold change，需要发表
过的reference gene datasets，Broad网站提供各种下载，你读读手册就会用。
[在 vicillibra (vicillibra) 的大作中提到：]
:通过测序手段获得的一堆上调或者下降的基因(excel)
:如何对其进行Gene Ontology/Function Annotation 分析
:筛选到和该疾病相关的基因，从而进行下游分析？
:没有编码经验，求指导，谢谢