j*z
2 楼
同问，最近想做，发现只有一家日本的公司有这个kit。
求大牛介绍下经验。
【在 a**********3 的大作中提到】
: 如题，有知道这个技术的吗，cap analysis of gene expression.
求大牛介绍下经验。
【在 a**********3 的大作中提到】
: 如题，有知道这个技术的吗，cap analysis of gene expression.
Z*5
3 楼
不知道这个技术相对于RNA-seq有啥优势。 现在测序一个G才60块钱所有。理论上把转
录本都测了，能得到的信息比CAGE要多得多。
录本都测了，能得到的信息比CAGE要多得多。
a*3
4 楼
坐标日本。我完全不懂这个技术。最近科室的教授提起来，说这个技术是日本的理研开
发的，
日本的公司每天平均只收到两个分析需求，好像很新的样子。
【在 Z******5 的大作中提到】
: 不知道这个技术相对于RNA-seq有啥优势。 现在测序一个G才60块钱所有。理论上把转
: 录本都测了，能得到的信息比CAGE要多得多。
b*9
5 楼
其实方法都差不多，没有一种是最完美的，都有优缺点。大概可以分为线性扩增（T7转
录），指数扩增（PCR）和RCA三大类，具体的可以参考这篇NAR：
SURVEY AND SUMMARY
Single-cell RNA-seq: advances and future challenges
具体到你提到的CAGE，可以去看看Illumina收集的方法：在第40页
https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/
research_reviews/rna-sequencing-methods-review-web.pdf
录），指数扩增（PCR）和RCA三大类，具体的可以参考这篇NAR：
SURVEY AND SUMMARY
Single-cell RNA-seq: advances and future challenges
具体到你提到的CAGE，可以去看看Illumina收集的方法：在第40页
https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/
research_reviews/rna-sequencing-methods-review-web.pdf
j*z
6 楼
我的理解是Cage的优势在于map new unannotated TSS
比如这篇nature genetics文章：
https://www.nature.com/articles/ng.3889?WT.feed_name=subjects_genetics
【在 b******9 的大作中提到】
: 其实方法都差不多，没有一种是最完美的，都有优缺点。大概可以分为线性扩增（T7转
: 录），指数扩增（PCR）和RCA三大类，具体的可以参考这篇NAR：
: SURVEY AND SUMMARY
: Single-cell RNA-seq: advances and future challenges
: 具体到你提到的CAGE，可以去看看Illumina收集的方法：在第40页
: https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/
: research_reviews/rna-sequencing-methods-review-web.pdf
比如这篇nature genetics文章：
https://www.nature.com/articles/ng.3889?WT.feed_name=subjects_genetics
【在 b******9 的大作中提到】
: 其实方法都差不多，没有一种是最完美的，都有优缺点。大概可以分为线性扩增（T7转
: 录），指数扩增（PCR）和RCA三大类，具体的可以参考这篇NAR：
: SURVEY AND SUMMARY
: Single-cell RNA-seq: advances and future challenges
: 具体到你提到的CAGE，可以去看看Illumina收集的方法：在第40页
: https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/
: research_reviews/rna-sequencing-methods-review-web.pdf
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