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tools for merging assembled genome
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tools for merging assembled genome# Biology - 生物学
s*y
1
撞在柜子角上,门牙,有点松,出血了。我们现在在让他含着冰牛奶,想止血。
现在也约不了牙医,明天会约的。
有没有家长有过经验,现在该怎么办?以后自己能长好吗?
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d*0
2
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: lkk (lkk), 信区: Military
标 题: 华盛顿的地铁为我静等了6分钟(ZZ)
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jan 17 17:38:27 2012, 美东)
题记:一个伟大的国家不在于他的步伐有多快,而在于他肯不肯为了他的人民而放慢脚
步。
还几天就开学了,今天我与朋友去了位于美国首都Washington的National Zoo,游玩归
来,在地铁站我与朋友一遍闲谈,一遍甩着绑着钥匙的带子。
突然,我手指一滑,整个绑着钥匙的绳子,直径飞向了地铁轨道,落在了铁轨边缘的下
面。
当时我整个人就傻在了那里,我身后等车的一位女士看了也“啊”得一声。
绳子上面总共有三个钥匙,一个是我现在住的公寓的,一个是我宿舍的,还有一个是我
自行车的。
虽然我知道这三把钥匙没了不会有什么大碍,但是会添很多麻烦,因为要补办两把钥匙
,提供各种在外求学的证明还要交罚金。
我和朋友决定去找本站地铁的Officer,其实我们俩觉得,估计Officer不会管我们,总
不能让整个地铁瘫痪吧,只能怪我们自己不小心!
随后我们向一个负责人说明了情况,他随我们看了我的钥匙掉到了哪,然后回去打了电
话并用对讲机通话了好几次。
这时,最令我想不到的事发生了:
Officer回来后,不断跟对讲机通话,我只听见了“wait”"a customer dropped a key
""stop"等词。我们脚边,地铁站台沿上的红灯也灭了。
然后我看见,地铁时间显示牌上本来是等待10分钟变成等待16分钟。
片刻后,工作人员跳下站台帮我捡起了钥匙。
整整6分钟,世界第一的美国的首都——华盛顿的地铁的5条线路为我一个人整整静止了
6分钟。
我不知道这6分钟影响了多少人,或许有人错过了飞机和火车,有人错过了与爱人的约
会,或许有人错过了与客户的见面。总之我知道,DC的地铁为我一个不小心静止了6分
钟!
拿到钥匙后,我不断对那个帮我的人说:Thank you! I appreciate it!
后来回家后,我在浏览校内,看到一篇文章说:许多农民工因为不会或者不便使用电脑
,订不到春节回家的火车票!
铁道部推出网上订票系统后,许多农民工更订不到票!至少以前还能拼身体,但现在毫
无优势!
而后,更有甚者(某官员)提出:为何不去网吧?
为何不去网吧??!!亏这位人民公仆能说出这种的话。
这里有个故事大家都听说过吧:
时天下荒饥,百姓饿死,帝闻之,曰:何不食肉糜?
意思就是天下饥荒,那个皇帝见到后问侍从:没有饭吃,为什么不吃肉粥呢?
我怎么感觉这两句话这么像呢!难道是我语文老师教错了???
我掉了钥匙,我回不了家。
农民工没有车票,也回不了家。
为了帮我拿回一个“无关紧要”的钥匙,整个华盛顿地铁为我一个人停运了6分钟。
为了帮农民工买到“非常重要“的车票,我们的公仆让他们去网吧自己看着办。
看到着,我相信,大家心里自有评论。
这是我亲自经历的事,心中自然无限感触。
还是最初的那句话:
一个伟大的国家不在于他的步伐有多快,而在于他肯不肯为了他的人民而放慢脚步。
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c*y
3
昆虫细胞genome, 预期500M, 早起illumina shotgun data (外面公司做的), 做了一
个assembly, but very fragmented; 最近pacbio data (core facility), 又有一
个assembly. pacbio assembly was polished by pilon with illumina reads.
想请教下有没有tool, 可以merge pacbio assembly and illumina assembly.
多谢了!
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m*1
4
看伤得如何,一般会长好, 有可能再也没有原来坚固,不过再过两三年也要换了。看
牙医也就是叫你回家观察几个月内有没有长脓包。
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h*n
5
呃,真tmd能借题发挥啊。

【在 d*****0 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
: 发信人: lkk (lkk), 信区: Military
: 标 题: 华盛顿的地铁为我静等了6分钟(ZZ)
: 发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jan 17 17:38:27 2012, 美东)
: 题记:一个伟大的国家不在于他的步伐有多快,而在于他肯不肯为了他的人民而放慢脚
: 步。
: 还几天就开学了,今天我与朋友去了位于美国首都Washington的National Zoo,游玩归
: 来,在地铁站我与朋友一遍闲谈,一遍甩着绑着钥匙的带子。
: 突然,我手指一滑,整个绑着钥匙的绳子,直径飞向了地铁轨道,落在了铁轨边缘的下
: 面。

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S*8
6
interesting.
如果没有现成工具,应该可以叫CS 的人做出来。。

【在 c***y 的大作中提到】
: 昆虫细胞genome, 预期500M, 早起illumina shotgun data (外面公司做的), 做了一
: 个assembly, but very fragmented; 最近pacbio data (core facility), 又有一
: 个assembly. pacbio assembly was polished by pilon with illumina reads.
: 想请教下有没有tool, 可以merge pacbio assembly and illumina assembly.
: 多谢了!

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a*s
7
没事,如果有点移位的话就用手指把它复位,然后冰敷止血。
过一阵子就好了。不用看牙医。当然看了也没坏处。

【在 s********y 的大作中提到】
: 撞在柜子角上,门牙,有点松,出血了。我们现在在让他含着冰牛奶,想止血。
: 现在也约不了牙医,明天会约的。
: 有没有家长有过经验,现在该怎么办?以后自己能长好吗?

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v*s
8
学术一下,如果不捡起来,地铁是不是真的会出轨?

【在 d*****0 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
: 发信人: lkk (lkk), 信区: Military
: 标 题: 华盛顿的地铁为我静等了6分钟(ZZ)
: 发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jan 17 17:38:27 2012, 美东)
: 题记:一个伟大的国家不在于他的步伐有多快,而在于他肯不肯为了他的人民而放慢脚
: 步。
: 还几天就开学了,今天我与朋友去了位于美国首都Washington的National Zoo,游玩归
: 来,在地铁站我与朋友一遍闲谈,一遍甩着绑着钥匙的带子。
: 突然,我手指一滑,整个绑着钥匙的绳子,直径飞向了地铁轨道,落在了铁轨边缘的下
: 面。

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n*7
9
直接做hybrid assembly
当年pacbio就靠这个活过来的
我之前做过一个细菌的,结果完美
当时用的一个叫ace啥的俄罗斯软件
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w*h
10
检查一下牙齿是不是完整,相对其他边上牙齿有没有位移, 是否影响咬合。
牙齿可能会变色。 建议看牙医拍片子看牙根是否有损伤。
放张照片上来可以帮你看一下。
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f*m
11
标题应该改成 为了6分钟,我把菊花献给民主国
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g*6
12
你这个Pacbio assembly已经用Illumina data polish过了,再merge有什么意义?
Pacbio测得不够深?
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f*r
13
找牙医吧,拍个片就知道具体情况了。很多情况下都是可以补好的。
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b*e
14
赞美

【在 d*****0 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
: 发信人: lkk (lkk), 信区: Military
: 标 题: 华盛顿的地铁为我静等了6分钟(ZZ)
: 发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jan 17 17:38:27 2012, 美东)
: 题记:一个伟大的国家不在于他的步伐有多快,而在于他肯不肯为了他的人民而放慢脚
: 步。
: 还几天就开学了,今天我与朋友去了位于美国首都Washington的National Zoo,游玩归
: 来,在地铁站我与朋友一遍闲谈,一遍甩着绑着钥匙的带子。
: 突然,我手指一滑,整个绑着钥匙的绳子,直径飞向了地铁轨道,落在了铁轨边缘的下
: 面。

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c*y
15
Pilon used bam. But independent Illumina assembly should contain more
information than that.
所以相比较下

【在 g********6 的大作中提到】
: 你这个Pacbio assembly已经用Illumina data polish过了,再merge有什么意义?
: Pacbio测得不够深?

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p*s
16
相当读者体啊

【在 d*****0 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
: 发信人: lkk (lkk), 信区: Military
: 标 题: 华盛顿的地铁为我静等了6分钟(ZZ)
: 发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jan 17 17:38:27 2012, 美东)
: 题记:一个伟大的国家不在于他的步伐有多快,而在于他肯不肯为了他的人民而放慢脚
: 步。
: 还几天就开学了,今天我与朋友去了位于美国首都Washington的National Zoo,游玩归
: 来,在地铁站我与朋友一遍闲谈,一遍甩着绑着钥匙的带子。
: 突然,我手指一滑,整个绑着钥匙的绳子,直径飞向了地铁轨道,落在了铁轨边缘的下
: 面。

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c*y
17
这个就是太花时间了

【在 n******7 的大作中提到】
: 直接做hybrid assembly
: 当年pacbio就靠这个活过来的
: 我之前做过一个细菌的,结果完美
: 当时用的一个叫ace啥的俄罗斯软件

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z*n
18
如果跳下去,会为你等几个小时
赶紧跳吧

【在 d*****0 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
: 发信人: lkk (lkk), 信区: Military
: 标 题: 华盛顿的地铁为我静等了6分钟(ZZ)
: 发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jan 17 17:38:27 2012, 美东)
: 题记:一个伟大的国家不在于他的步伐有多快,而在于他肯不肯为了他的人民而放慢脚
: 步。
: 还几天就开学了,今天我与朋友去了位于美国首都Washington的National Zoo,游玩归
: 来,在地铁站我与朋友一遍闲谈,一遍甩着绑着钥匙的带子。
: 突然,我手指一滑,整个绑着钥匙的绳子,直径飞向了地铁轨道,落在了铁轨边缘的下
: 面。

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f*w
19
01/16 北京的地铁为我用钳子捡起了钥匙,没耽误其它乘客,华盛顿6分钟停地铁弱爆
了... 来源: 余小栎KrisFish的日志
北京的地铁为我用钳子捡起了钥匙,没耽误其它乘客,华盛顿6分钟停地铁弱爆了...
题记:
一个伟大的国家不在于他的能停地铁6分钟,而在于他肯不肯用聪明的钳子捡煞笔的钥
匙,而不妨碍其它的人民。
还几天就new semster了,今天我与朋友去了位于祖国首都Beijing的Weigongcun West
Kou,游玩归来,在地铁站我与朋友一遍chat,一遍甩着绑着钥匙的ribbon。
突然,我手指一滑,整个绑着钥匙的ribbon,直径飞向了地铁轨道,落在了铁轨边缘的
下面。
当时我整个人就totally dumbfounded了,我身后等车的一位为索南看了也“啊”得一
声。
绳子上面总共有三个钥匙,一个是我现在住的地下室的,一个是我宿舍的,还有一个是
我自行车的。
虽然我知道这三把钥匙没了no biggie,但是很troublesome,因为要补办两把钥匙,提
供各种北京求学的material还要交penalty。
我和朋友决定去找本站地铁的Policemen,其实我们俩觉得,估计Policemen不会管我们
,总不能让整个地铁paralyze吧,只能怪我们自己不小心!
随后我们向一个Policemen说明了情况,他随我们看了我的钥匙掉到了哪,然后回去打
了电话并用walkie talkie了好几次。
这时,最incredible的事发生了:
Policemen回来后,help我用钳子捡起了钥匙,没耽误其它乘客。
然后我看见,地铁时间显示牌上本来是等待10分钟还是等待10分钟,比Washington那个
掉钥匙的同学事件efficiency高多了!!。
一瞬间!世界第二的People's Republic of China的Capital city——Beijing的Metro
的all subway lines没有受到任何影响!
我不知道如果像Washington用6分钟影响了别人的话:或许有人错过了飞机和火车,有
人错过了与爱人的约会,或许有人错过了与客户的见面。总之我知道,
一瞬间!世界第二的People's Republic of China的Capital city——Beijing的Metro
的all subway lines没有受到任何影响!
拿到钥匙后,我不断对那个帮我的人说:谢谢,中国警察了不起!
后来回家后,我在浏览校内,看到一篇文章说:许多migrant workers因为不会或者不
便使用电脑,订不到春节回家的火车票!Ministry of Railways (MOR)推出网上订票系
统后,许多migrant workers更订不到票!至少以前还能拼身体,但现在毫无优势!而
后,更有甚者(某官员)提出:为何不去网吧?我觉得很煞笔,所以我们大学生开始组
织帮migrant workers买票的志愿者活动。都在为国家进步而出力呢!

看到着,我相信,大家心里自有评论。
这是我own experience,心中自然无限感触。
还是最初的那句话:
一个伟大的国家不在于他的能停地铁6分钟,而在于他肯不肯用聪明的钳子捡煞笔的钥
匙,而不妨碍其它的人民。
我真的没想到这篇日志一下子这么popular,我本来只是想记下生活中的一些值得思考
的事情,没想到已经被传播那么远了!真心感叹互联网的力量啊!
在此我想我有必要做以下explications:
1.我是一个在Beijing的大一学生。我老妈经常说让我平时写写东西,一方面可以锻炼
思维能力,另一方面,因为来China Capital City后几乎不用写English,人不能忘本
啊!所有那些说我是写手的就不要再争论啦~
2.了解我的人都知道,我是一个很爱国的人,而不是大家所说的愤青。所以,我自然不
是什么崇洋媚外的极端分子。
回到家之后,我不禁sigh sigh万千。我们世界第一的美利坚合众国竟然养育着无数如
此stupid,lazy,dumb的人民。我们的government拿着我们taxpayers的金钱四处为所
谓的别国“human rights”战斗,有充足的精力把本应该幸福生活的年轻人骗上枪林弹
雨而且永无休止的battkefield!但是,就是这个自豪向世界宣布自己国家是世界上GDP
总量最高的国家,却没有精力与时间真正用心去解决我们citizens最小的事。在中国,
他们只需要不到20美元的拾物钳和10秒钟,就能在毫不影响他人的情况下解决我们国家
需要停止整个城市metro 6分钟的问题!!!!!!!!我们能登上月球,能把宇宙飞
船送到milky way以外,却不能动动脑子去解决原本这么简单的问题!!!!!
就是这玩意!!!
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b*n
20
呕麦高
我又一次读懂了人权

【在 d*****0 的大作中提到】
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: 标 题: 华盛顿的地铁为我静等了6分钟(ZZ)
: 发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jan 17 17:38:27 2012, 美东)
: 题记:一个伟大的国家不在于他的步伐有多快,而在于他肯不肯为了他的人民而放慢脚
: 步。
: 还几天就开学了,今天我与朋友去了位于美国首都Washington的National Zoo,游玩归
: 来,在地铁站我与朋友一遍闲谈,一遍甩着绑着钥匙的带子。
: 突然,我手指一滑,整个绑着钥匙的绳子,直径飞向了地铁轨道,落在了铁轨边缘的下
: 面。

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b*e
21
你这个五毛

West

【在 f****w 的大作中提到】
: 01/16 北京的地铁为我用钳子捡起了钥匙,没耽误其它乘客,华盛顿6分钟停地铁弱爆
: 了... 来源: 余小栎KrisFish的日志
: 北京的地铁为我用钳子捡起了钥匙,没耽误其它乘客,华盛顿6分钟停地铁弱爆了...
: 题记:
: 一个伟大的国家不在于他的能停地铁6分钟,而在于他肯不肯用聪明的钳子捡煞笔的钥
: 匙,而不妨碍其它的人民。
: 还几天就new semster了,今天我与朋友去了位于祖国首都Beijing的Weigongcun West
: Kou,游玩归来,在地铁站我与朋友一遍chat,一遍甩着绑着钥匙的ribbon。
: 突然,我手指一滑,整个绑着钥匙的ribbon,直径飞向了地铁轨道,落在了铁轨边缘的
: 下面。

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f*w
22
转贴不给发钱

【在 b*****e 的大作中提到】
: 你这个五毛
:
: West

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w*e
23
我吐了
avatar
R*a
24
胜顿警察,OK

【在 d*****0 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
: 发信人: lkk (lkk), 信区: Military
: 标 题: 华盛顿的地铁为我静等了6分钟(ZZ)
: 发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jan 17 17:38:27 2012, 美东)
: 题记:一个伟大的国家不在于他的步伐有多快,而在于他肯不肯为了他的人民而放慢脚
: 步。
: 还几天就开学了,今天我与朋友去了位于美国首都Washington的National Zoo,游玩归
: 来,在地铁站我与朋友一遍闲谈,一遍甩着绑着钥匙的带子。
: 突然,我手指一滑,整个绑着钥匙的绳子,直径飞向了地铁轨道,落在了铁轨边缘的下
: 面。

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d*z
25
靠,脑残现在不是已经有医院接收治疗了吗?
avatar
l*k
26
楼上全是网评员啊

【在 d****z 的大作中提到】
: 靠,脑残现在不是已经有医院接收治疗了吗?
avatar
v*s
27
ft,lz居然没转最后的精华部分
1.我是一个在Washington,DC留学的大一学生。我老妈经常说让我平时写写东西,一方
面可以锻炼思维能力,另一方面,因为出国后几乎不用写中文,人不能忘本啊!所有那
些说我是写手的就不要再争论啦~
2.了解我的人都知道,我是一个很爱国的人,而不是大家所说的愤青。出门在外一直觉
得国家还是根,中国的快速发展也塑造我们这一代有能力留学的孩子。所以,我自然不
是什么崇洋媚外的极端分子。
接下来就是一些细节问题
3.华盛顿地铁没有隔离门,所以钥匙掉下去是有可能的。
4.我特意说了,我钥匙掉到了铁轨旁边的下面,地铁是根本压不到的,在我们跑去找
Officer的途中,已经有一辆地铁开过,回去再看,钥匙依旧完好无损。
5.当时钥匙刚掉下去的时候,我曾想过跳下去拣,但是后来没有行动,因为这样实在太
危险!而且我觉得现在应该是电车,所以铁轨上会有高压电。当然我也不知道我这个猜
测对不对,换位思考下,你是我,你总不能先跳下去试试有没有高压电吧!
6.DC的地铁系统真的很复杂,不像北京一样是每条线都有自己的轨道,DC地铁是多条线
共用一条轨道的。之所以能井井有条,全靠调度!所以,停一条线,其它线必受牵连。
7.我觉得大家有自己的看法很好,我也不介意大家抨击我,但是我觉得骂爹骂娘就没必
要了吧。

【在 d****z 的大作中提到】
: 靠,脑残现在不是已经有医院接收治疗了吗?
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k*7
28
为什么我看到的版本是这样的?
还几天就开学了,今天我与朋友去了位于日本首都东京的S1,游玩归来,在地铁站我与
朋友一遍闲谈,一遍甩着绑着钥匙的带子。
突然,我手指一滑,整个绑着钥匙的绳子,直径飞向了地铁里的A片拍摄现场,落
在了加藤鹰老师的下面。
当时我整个人就傻在了那里,我身后的苍井空老师看了也“啊”得一声。
绳子上面总共有三个钥匙,一个是我现在住的公寓的,一个是我宿舍的,还有一个
是我自行车的。
虽然我知道这三把钥匙没了不会有什么大碍,但是会添很多麻烦,因为要补办两把
钥匙,提供各种在外求学的证明还要交罚金。
我和朋友决定去找本片的导演,其实我们俩觉得,估计导演不会管我们,总不能让
整个场景NG吧,只能怪我们自己不小心!
随后我们向一个负责人说明了情况,他随我们看了我的钥匙掉到了哪,然后回去打
断了加藤鹰老师并用对讲机通话了好几次。
这时,最令我想不到的事发生了:
Officer回来后,不断跟加藤鹰老师对话,我只听见了“Yamete”"Yada""stop"等
词。我们脚边,剧务举的红灯也灭了。
然后我看见,加藤鹰老师发射预备时间显示牌上本来是等待10分钟变成等待16分钟。
片刻后,工作人员跳进片场帮我捡起了钥匙。
整整6分钟,世界第一的日本的首都——东京的地铁里的东京热拍摄现场为我一个
人整整静止了6分钟。
我不知道这6分钟影响了多少人,或许有人错过了飞机和火车,有人错过了与爱人
的约会,或许有人错过了与客户的见面,而加藤鹰老师多忍了6分钟。总之我知道,日
本的A片产业为我一个不小心静止了6分钟!
拿到钥匙后,我不断对那个帮我的人说:Thank you! I appreciate it!
后来回家后,我在浏览校内,看到一篇文章说:许多吊丝因为不会或者不便使用电
脑,下不到苍老师最新的电影。
工信部推出绿坝后,许多吊丝更下不到片!至少以前还能拼身体,但现在毫无优势!
而后,更有甚者(某高富帅)提出:为何不去找失足?
为何不去找失足??!!亏这位高富帅能说出这种的话。
这里有个故事大家都听说过吧:
时天下荒饥,百姓饿死,帝闻之,曰:何不食肉糜?
意思就是天下饥荒,那个皇帝见到后问侍从:没有饭吃,为什么不吃肉粥呢?
我怎么感觉这两句话这么像呢!难道是我语文老师教错了???
我掉了钥匙,我没法回家啪啪啪。
吊丝下不到片,也没法回家啪啪啪。
为了帮我拿回一个“无关紧要”的钥匙,整个东京热为我一个人停止了6分钟。
为了帮吊丝下到“非常重要“的片,我们的高富帅让他们去找失足自己看着办。
看到着,我相信,大家心里自有评论。
这是我亲自经历的事,心中自然无限感触。
还是最初的那句话:
一个伟大的国家不在于他的拍片速度有多快,而在于他肯不肯为了他的人民而停止
拍片。
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h*n
29
re

【在 l**k 的大作中提到】
: 楼上全是网评员啊
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o*p
30
哈哈,中英文混杂,笑4我了

West

【在 f****w 的大作中提到】
: 转贴不给发钱
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l*u
31
不知道,几率问题吧,不过有可能会飞出来根一个子弹一样

【在 v*****s 的大作中提到】
: 学术一下,如果不捡起来,地铁是不是真的会出轨?
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