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Paper help!! ChemBioChem

Paper help!! ChemBioChem# Chemistry - 化学

x*x2010-02-10 08:02

1 楼

菜名：鱼香茄子
材料：
茄子, 葱4根, 四川辣豆瓣酱（郫县豆瓣酱）, 甜辣椒酱, 盐, 味精, 蒜一头, 糖、醋
、姜(用量稍少于蒜), 猪碎肉, 水淀粉
做法/步骤：
（百度知道）
1. 将茄子从上至下剖成两半, 然后用刀把茄子表面切成鱼鳞状, 注意不要把茄子切断
了. 先顺着一个方向在茄子表面切出一道道细缝, 然后换个方向, 再一刀刀切下去, 这
样茄子表面就成鱼鳞状了. 将改好的半边茄子一分为四.
2. 锅内烧油, 待油温6成热的时候, 放入茄子炸至变软捞起待用 (注意, 不要太软, 否
则一炒就会烂掉的) 蒜, 姜切成细沫, 葱切花
3. 茄子是很吸油的, 所以炒的时候锅内只需放很少的油甚至不放油, 然后将茄子里渗
出来的油到进锅内, 待锅烧到5成热的时候, 到入四川辣豆酱翻炒, 待到油变红, 豆瓣
酱水份快收干的时候放入切好的蒜, 姜沫, 香味出来后, 倒入碎猪肉, 炒熟后倒入甜辣
椒酱, 翻炒后倒入炸好的茄子, 盐, 炒匀后加入少许清水. 大火烧至水份快干时, 加入
味精, 然后水淀粉勾芡, 最后放入葱花, 起锅装盘.
特点：
鱼香味主要是由泡辣椒, 豆瓣酱和葱花的味道混

s*g2010-02-10 08:02

2 楼

1）身份是resident alien，我J1，有工资收入，J2无工作，无收入，孩子10年出生，
三人都有SSN。
2）我的W2表上第一栏为0，1042s上box2约为40000；
3）银行利息约300刀，收到1099-INT表，上面只有我的利息数300刀，没有其它任何信
息。没有说交了多少税，也没说税款截留，总之没有box1，box2等等。
我应该填1040，married filling jointly。
如果按章网上的做法把1042s上的工资填到line7，然后从line21减去，这样我就可以拿到
child tax credit和make work pay credit,EIC，差不多1000刀；如果line7填0，那就
一分也拿不到。
我该怎么填呢？
我没有交税，倒过来要钱，总觉得伤人品。
请大家给个意见，明天寄表。

L*d2010-02-10 08:02

3 楼

s*a2010-02-10 08:02

4 楼

好了，今天就讲这么多

d*02010-02-10 08:02

5 楼

贾政一房有哪个人流露过对隔壁爵位的羡慕没有？爵位到底不是最核心的矛盾。大家最关心的是啥：皇恩和圣眷。不信可以仔细看看贾赦大老爷几次被皇帝召见？得到过皇帝的什么赏赐？元春受封贤德妃，皇帝只召贾政一人入朝，却跟名义上的一家之主贾赦没啥事，远近亲疏一目了然。根据元春的判词：榴花开处照宫闱可知，贾家上下最大的梦想便是元妃能产下皇子，母以子贵，贾家也能沾光。要是皇子有机会登上帝位，贾家定
能位极人臣。

f*a2010-02-10 08:02

6 楼

编程水平不行，用Python的readline和C++的getline写的code慢死了，求高效算法。
问题如下：
两个输入文件，文件1是fastq格式，几千万行，每行最多100个字符
（每4行是一个序列的信息，其中的第2行是序列本身）:
@SEQ_ID1
GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT
+
!''*((((***+))%%%++)(%%%%).1***-+*''))**55CCF>>>>>>CCCCCCC65
@SEQ_ID2
AATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT
+
+''*((((***+))%%%++)(%%%%).1***-+*''))**55CCF>>>>>>CCCCCCC65
@SEQ_ID3
TAGGCGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT
+
C''F((((***+))%%%++)(%%%%).1***-+*''))**55CCF>>>>>>CCCCCCCAA
...
文件2是两列的文本，1000行：
BC1 GATTT
BC2 TAGGC
....
程序1：对于文件2中每个BC，计算文件1中有多少序列是以该BC的序列开头的。
例如：对于BC1，在文件1中的第4N+2行中有多少是GATTT开头的。
程序2：和程序1有点类似，不过要求是对于文件2中每个BC，
把文件1中以该BC序列开头的所有序列的4行信息写入单独的文件。
例如：对于BC1，在文件1中的第4N+2行中查找所有是GATTT开头的
把每个匹配的4行信息写入文件BC1.txt
第一个匹配写入的是：
@SEQ_ID1
GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT
+
!''*((((***+))%%%++)(%%%%).1***-+*''))**55CCF>>>>>>CCCCCCC65

t*s2010-02-10 08:02

7 楼

给一个 local public accounting firm 公司的 partner 发信，晓之以礼，动之以
情。终于将会有一个 phone interview 。请教有经验的同学门，都应该怎样准备？
这是我第一次 phone interview , 之前有过几次 campus interview 。
万分感谢了！

c*o2010-02-10 08:02

8 楼

The folding and unfolding kinetics of the i-motif structure formed by the C-
rich strand of human telomere DNA

x*x2010-02-10 08:02

9 楼

加一张图

【在 x***x 的大作中提到】

: 菜名：鱼香茄子
: 材料：
: 茄子, 葱4根, 四川辣豆瓣酱（郫县豆瓣酱）, 甜辣椒酱, 盐, 味精, 蒜一头, 糖、醋
: 、姜(用量稍少于蒜), 猪碎肉, 水淀粉
: 做法/步骤：
: （百度知道）
: 1. 将茄子从上至下剖成两半, 然后用刀把茄子表面切成鱼鳞状, 注意不要把茄子切断
: 了. 先顺着一个方向在茄子表面切出一道道细缝, 然后换个方向, 再一刀刀切下去, 这
: 样茄子表面就成鱼鳞状了. 将改好的半边茄子一分为四.
: 2. 锅内烧油, 待油温6成热的时候, 放入茄子炸至变软捞起待用 (注意, 不要太软, 否

t*g2010-02-10 08:02

10 楼

你四万的收入,一个孩子,估计不能拿EIC了,所以你也别不好意思,因为irs倒贴给你的是
additional child tax credit和work pay credit,这两个你都是该拿的.
我建议你把1042S box2 放到1040 line 7作为你的收入,然后1040的21行虚线写china t
reaty exempt, article 19,后面写(1042S box2的数值)等于把这个再减掉,以后的就都
一样了,你1042S的box2就算是你的earned income.

拿到

【在 s*********g 的大作中提到】

: 1）身份是resident alien，我J1，有工资收入，J2无工作，无收入，孩子10年出生，
: 三人都有SSN。
: 2）我的W2表上第一栏为0，1042s上box2约为40000；
: 3）银行利息约300刀，收到1099-INT表，上面只有我的利息数300刀，没有其它任何信
: 息。没有说交了多少税，也没说税款截留，总之没有box1，box2等等。
: 我应该填1040，married filling jointly。
: 如果按章网上的做法把1042s上的工资填到line7，然后从line21减去，这样我就可以拿到
: child tax credit和make work pay credit,EIC，差不多1000刀；如果line7填0，那就
: 一分也拿不到。
: 我该怎么填呢？

i*w2010-02-10 08:02

11 楼

my case two months ago, 3 weeks. check www.checkee.info for more cases.

【在 L********d 的大作中提到】

: rt

r*n2010-02-10 08:02

12 楼

你打算娶美女还是丑女？
或者说
你是高帅富么？

【在 s********a 的大作中提到】

: 好了，今天就讲这么多

T*r2010-02-10 08:02

13 楼

其实这话对，贾政住正房，因为女儿是皇家媳妇

最关心的是啥：皇恩和圣眷。不信可以仔细看看贾赦大老爷几次被皇帝召见？得到过皇
帝的什么赏赐？元春受封贤德妃，皇帝只召贾政一人入朝，却跟名义上的一家之主贾赦
没啥事，远近亲疏一目了然

【在 d*****0 的大作中提到】

: 贾政一房有哪个人流露过对隔壁爵位的羡慕没有？爵位到底不是最核心的矛盾。大家最关心的是啥：皇恩和圣眷。不信可以仔细看看贾赦大老爷几次被皇帝召见？得到过皇帝的什么赏赐？元春受封贤德妃，皇帝只召贾政一人入朝，却跟名义上的一家之主贾赦没啥事，远近亲疏一目了然。根据元春的判词：榴花开处照宫闱可知，贾家上下最大的梦想便是元妃能产下皇子，母以子贵，贾家也能沾光。要是皇子有机会登上帝位，贾家定
: 能位极人臣。

w*w2010-02-10 08:02

14 楼

文件2中第二列长度都是6？

n*y2010-02-10 08:02

15 楼

跟campus interview一样准备，但是估计得侧重准备BQ，目前为止我的phone
interview多半是BQ，我还有一次video interview，很有意思，哈哈

f*i2010-02-10 08:02

16 楼

http://u.115.com/file/t83ca67834

C-

【在 c*********o 的大作中提到】

: The folding and unfolding kinetics of the i-motif structure formed by the C-
: rich strand of human telomere DNA

s*g2010-02-10 08:02

17 楼

谢谢tiangeng的回复。我准备这样填。我还有几个问题请教一下：
1）这样是否合法？如果被IRS发现了怎么办，会不会处罚？这是我最关心的。
2）为什么有的人在line21填-5000？而我是填1042s上的数字，难道treaty的条款不一
样？
2）我附上1042s，应该不用填8833了吧？
3）我老婆没有工作，但有SSN，是不是也可以申请Making work pay credit？

s*a2010-02-10 08:02

18 楼

yes
yes

【在 r****n 的大作中提到】

: 你打算娶美女还是丑女？
: 或者说
: 你是高帅富么？

f*a2010-02-10 08:02

19 楼

不是的，从6到15不等。
我现在的方法是对文件1循环，每次读4行。同时建立1000个BC#.txt文件，比较每个BC
和读入的第二行，再计数或写入。程序可以运行，不过很慢。

[发表自未名空间手机版 - m.mitbbs.com]

【在 w****w 的大作中提到】

: 文件2中第二列长度都是6？

t*s2010-02-10 08:02

20 楼

谢谢 niggy mm 的 reply ！看你的经验总结贴，有了很多感触。能不能分享下你电话
面世的经验？

【在 n***y 的大作中提到】

: 跟campus interview一样准备，但是估计得侧重准备BQ，目前为止我的phone
: interview多半是BQ，我还有一次video interview，很有意思，哈哈

c*o2010-02-10 08:02

21 楼

WOW how did you find it????So qiang!!!!Thank you so much

【在 f*******i 的大作中提到】

: http://u.115.com/file/t83ca67834
:
: C-

t*g2010-02-10 08:02

22 楼

1.我不觉得不合法,1042S上也是你的收入啊.
2.他们填-5000是F1学生的treaty,你是J1学者.
3.应该不用8833
4.没有SSN的都行.

【在 s*********g 的大作中提到】

: 谢谢tiangeng的回复。我准备这样填。我还有几个问题请教一下：
: 1）这样是否合法？如果被IRS发现了怎么办，会不会处罚？这是我最关心的。
: 2）为什么有的人在line21填-5000？而我是填1042s上的数字，难道treaty的条款不一
: 样？
: 2）我附上1042s，应该不用填8833了吧？
: 3）我老婆没有工作，但有SSN，是不是也可以申请Making work pay credit？

l*g2010-02-10 08:02

23 楼

你证明一下你是高副帅？

【在 s********a 的大作中提到】

: yes
: yes

w*w2010-02-10 08:02

24 楼

最好把它们都搞成15，这样只要查一次就可以了。
以第二列为key, (count,file)为value建dictionary,然后取seq开始的6，..., 15，查
dictionary。

BC

【在 f*****a 的大作中提到】

: 不是的，从6到15不等。
: 我现在的方法是对文件1循环，每次读4行。同时建立1000个BC#.txt文件，比较每个BC
: 和读入的第二行，再计数或写入。程序可以运行，不过很慢。
:
: [发表自未名空间手机版 - m.mitbbs.com]

n*y2010-02-10 08:02

25 楼

电面找个安静的信号好的地方，自己手头拿一份自己的简历，读熟。然后你可以把我的
那些精华问题打出来，有别人问你的问题，和你要问别人的问题。人家问你的问题，这
个部分你自己先要准备好，可以拿张纸把每个常规的interview question你的答案写下
来，读熟，背熟。然后等你问别人问题的部分，你就可以先从那些精华问题里面选5个
左右你最想问的，标注出来，到时候挨个的问，但是也要先读熟，不打结。如果谈到身
份问题，务必诚实交代。说你有OPT可以先工作一年，但是一年之后需要sponsorship
for H1B visa。It is not very difficult to get the H1B visa, it is just a
working permit. Like if I am about to apply to school, i have to get the F1
visa, now if I want to stay a couple years more to working for you, i have
to obtain the H1B visa. The company only need to file some documents for me,
and the whole process we could find a lawyer to do that. If the company
worry about the cost, i would love to share the cost with you.
基本就这些了

【在 t*******s 的大作中提到】

: 谢谢 niggy mm 的 reply ！看你的经验总结贴，有了很多感触。能不能分享下你电话
: 面世的经验？

f*i2010-02-10 08:02

26 楼

just google~

【在 c*********o 的大作中提到】

: WOW how did you find it????So qiang!!!!Thank you so much

r*n2010-02-10 08:02

27 楼

你能达180 180 180 的标准么

【在 s********a 的大作中提到】

: yes
: yes

f*a2010-02-10 08:02

28 楼

不太明白，可否给个python的code? 多谢!

[发表自未名空间手机版 - m.mitbbs.com]

【在 w****w 的大作中提到】

: 最好把它们都搞成15，这样只要查一次就可以了。
: 以第二列为key, (count,file)为value建dictionary,然后取seq开始的6，..., 15，查
: dictionary。
:
: BC

t*s2010-02-10 08:02

29 楼

thank you very much!
我一定要好好珍惜这次机会，好好准备！就算失败了也是增长经验！

F1
me,

【在 n***y 的大作中提到】

: 电面找个安静的信号好的地方，自己手头拿一份自己的简历，读熟。然后你可以把我的
: 那些精华问题打出来，有别人问你的问题，和你要问别人的问题。人家问你的问题，这
: 个部分你自己先要准备好，可以拿张纸把每个常规的interview question你的答案写下
: 来，读熟，背熟。然后等你问别人问题的部分，你就可以先从那些精华问题里面选5个
: 左右你最想问的，标注出来，到时候挨个的问，但是也要先读熟，不打结。如果谈到身
: 份问题，务必诚实交代。说你有OPT可以先工作一年，但是一年之后需要sponsorship
: for H1B visa。It is not very difficult to get the H1B visa, it is just a
: working permit. Like if I am about to apply to school, i have to get the F1
: visa, now if I want to stay a couple years more to working for you, i have
: to obtain the H1B visa. The company only need to file some documents for me,

s*a2010-02-10 08:02

30 楼

这么低的标准，对我们高副摔简直就是侮辱

【在 r****n 的大作中提到】

: 你能达180 180 180 的标准么

k*g2010-02-10 08:02

31 楼

http://stackoverflow.com/questions/843154/fastest-way-to-find-t
As a sidenote,
(1) Make sure your text file is not Unicode, and make sure its end-of-line
marker is consistent. The processing of variable-length Unicode-encoded
character is what prevents the standard library writers from making
optimizations.
(2) If the BC sequences have very short length (such as 5), and the
alphabets allowed in BC sequences are just {C, G, T, A} then the exhaustive
number of possible BC sequences is only 4 to the power of 5 = 1024. Thus
you can build a histogram of all BC sequences (whether they appear in File 2
or not) with length 5 or less.

b*s2010-02-10 08:02

32 楼

加油加油，合伙人问你问题，多是顺着你的简历来。

l*h2010-02-10 08:02

33 楼

那你介绍一下自己的参数

【在 s********a 的大作中提到】

: 这么低的标准，对我们高副摔简直就是侮辱

w*w2010-02-10 08:02

34 楼

http://webbew.dyx.com/forum/viewtopic.php?f=2&t=8

【在 f*****a 的大作中提到】

: 不太明白，可否给个python的code? 多谢!
:
: [发表自未名空间手机版 - m.mitbbs.com]

b*s2010-02-10 08:02

35 楼

tongtongs 你电了么？怎么样？对了BQ 就是business question 还是behavior
question? 会计审计税务的专业问题问不问？我经历过的面试全是问简历。谢谢了。

r*n2010-02-10 08:02

36 楼

你奔一个证明

【在 s********a 的大作中提到】

: 这么低的标准，对我们高副摔简直就是侮辱

m*n2010-02-10 08:02

37 楼

If you build a prefix tree out of the BCs first, you'll only need to walk
the tree once to find the match.

BC

【在 f*****a 的大作中提到】

t*s2010-02-10 08:02

38 楼

hi 谢谢你的提醒。早上电了，主要是围绕简历和behavior question. 没有涉及专业的
问题。
对方是HR，今天work from home,用手机打的所以效果不是特别清楚，有两个问题我都
是问了两边才知道什么意思。我后来问她什么时候可以有结果，她说1-2周吧。我就在
想，这么长，应该就是没戏了吧。不管怎么样，增加了一次经验，还是move on！
也祝你好运！

【在 b*********s 的大作中提到】

: tongtongs 你电了么？怎么样？对了BQ 就是business question 还是behavior
: question? 会计审计税务的专业问题问不问？我经历过的面试全是问简历。谢谢了。

s*a2010-02-10 08:02

39 楼

好吧

【在 r****n 的大作中提到】

: 你奔一个证明

d*n2010-02-10 08:02

40 楼

FASTQ file customize deindex?
step1, use klib->kseq to read fastq files. No other lib is faster than this.
step 2, build a hash base on your barcode list, and open 1000 file handlers
as the hash values.
step3. iterate through your fastq files,(using kseq), when a
barcode match a key write it to the value(file hanlder)
I bet you no other solution is faster than this.

【在 f*****a 的大作中提到】

: 编程水平不行，用Python的readline和C++的getline写的code慢死了，求高效算法。
: 问题如下：
: 两个输入文件，文件1是fastq格式，几千万行，每行最多100个字符
: （每4行是一个序列的信息，其中的第2行是序列本身）:
: @SEQ_ID1
: GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT
: +
: !''*((((***+))%%%++)(%%%%).1***-+*''))**55CCF>>>>>>CCCCCCC65
: @SEQ_ID2
: AATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT

l*h2010-02-10 08:02

41 楼

我觉得这个啥也看不出来

【在 s********a 的大作中提到】

: 好吧

o*p2010-02-10 08:02

42 楼

如果长度不等，可以用10 (=15-6+1)个dictionary，每个对应相对的长度：
ds = []
for i in range(10): ds.append({})
for line in open('file2.txt').readlines():
name, seq = line.strip().split()
length = len(seq)
ds[length - 6][seq] = 0
这样第一个文件的每一个序列需要与ds的每一个dictionary相比，对应不同的长度：
for seq in seqs: #省略了FASTQ reading
for i in range(10):
prefix = seq[6 + i]
if prefix in ds[i]:
ds[i] += 0
这样比直接比较应该快很多。

【在 w****w 的大作中提到】

: 最好把它们都搞成15，这样只要查一次就可以了。
: 以第二列为key, (count,file)为value建dictionary,然后取seq开始的6，..., 15，查
: dictionary。
:
: BC

r*n2010-02-10 08:02

43 楼

没看出来180 180 180

【在 s********a 的大作中提到】

: 好吧

f*a2010-02-10 08:02

44 楼

多谢。比我的代码快好几倍。

【在 w****w 的大作中提到】

: http://webbew.dyx.com/forum/viewtopic.php?f=2&t=8

s*a2010-02-10 08:02

45 楼

这应看出来了吧？

【在 r****n 的大作中提到】

: 没看出来180 180 180

f*a2010-02-10 08:02

46 楼

多谢。没用过klib。
这个和前面的python算法基本一样
如果用c++来算会更快么？

this.
handlers

【在 d****n 的大作中提到】

: FASTQ file customize deindex?
: step1, use klib->kseq to read fastq files. No other lib is faster than this.
: step 2, build a hash base on your barcode list, and open 1000 file handlers
: as the hash values.
: step3. iterate through your fastq files,(using kseq), when a
: barcode match a key write it to the value(file hanlder)
: I bet you no other solution is faster than this.

r*n2010-02-10 08:02

47 楼

这个太高了

【在 s********a 的大作中提到】

: 这应看出来了吧？