t*v
2 楼
attached
j*1
3 楼
本人在这个组，刚刚group发布了beta版本。有兴趣的可以试着用用。说是用于
metabolomics，其实对LC-MS的数据普遍可用，需要upload 两组data进行对比分析。
Announcement:如下
The Scripps Center for Metabolomics is pleased to announce XCMS Online, a
new user-friendly approach to process metabolomics data.
XCMS Online provides the same high-quality metabolomic analysis that you are
used to but in a user-friendly, web-based format. XCMS Online allows users
to easily upload LC/MS metabolomic data that can then be processed with a
few simple mouse clicks. Predefined parameter settings for different
instruments (e.g., QTOF, Orbitrap, etc...) will be available as will be
options for customization. Results can be viewed online in an interactive,
customizable table showing statistics, chromatograms, and putative METLIN
identities. All results and images will be available for download as .zip
files.
You can click on the following link (or paste it into a browser address bar)
to access XCMS Online:
http://xcmsonline.scripps.edu">http://xcmsonline.scripps.edu
You will need to register with XCMS Online to use the system and the
software is currently in beta version but works quite well.
Please direct any questions regarding this e-mail to xcmsonline [at] scripps
.edu.
metabolomics，其实对LC-MS的数据普遍可用，需要upload 两组data进行对比分析。
Announcement:如下
The Scripps Center for Metabolomics is pleased to announce XCMS Online, a
new user-friendly approach to process metabolomics data.
XCMS Online provides the same high-quality metabolomic analysis that you are
used to but in a user-friendly, web-based format. XCMS Online allows users
to easily upload LC/MS metabolomic data that can then be processed with a
few simple mouse clicks. Predefined parameter settings for different
instruments (e.g., QTOF, Orbitrap, etc...) will be available as will be
options for customization. Results can be viewed online in an interactive,
customizable table showing statistics, chromatograms, and putative METLIN
identities. All results and images will be available for download as .zip
files.
You can click on the following link (or paste it into a browser address bar)
to access XCMS Online:
http://xcmsonline.scripps.edu">http://xcmsonline.scripps.edu
You will need to register with XCMS Online to use the system and the
software is currently in beta version but works quite well.
Please direct any questions regarding this e-mail to xcmsonline [at] scripps
.edu.
t*v
4 楼
【在 t*v 的大作中提到】
: attached
b*g
5 楼
赞，终于找到人问问题了。。。
s3
6 楼
谢谢啦
还真不错
【在 t*v 的大作中提到】
: attached
还真不错
【在 t*v 的大作中提到】
: attached
j*1
7 楼
中文版本
XCMS在线是一个直观的在线应用程序，不需要下载或安装(当然如果需要，也可以下载
一个老版本)。用户只需通过网站上传自己的数据集。通过网络在线可以直接浏览结果
，结果打包可以下载。你可以在主页【http://xcmsonline.scripps.edu】 看到更多信息，以及用户手册。
也欢迎询问我本人。
XCMS在线是一个直观的在线应用程序，不需要下载或安装(当然如果需要，也可以下载
一个老版本)。用户只需通过网站上传自己的数据集。通过网络在线可以直接浏览结果
，结果打包可以下载。你可以在主页【http://xcmsonline.scripps.edu】 看到更多信息，以及用户手册。
也欢迎询问我本人。
p*r
8 楼
这章过瘾。
【在 t*v 的大作中提到】
【在 t*v 的大作中提到】
c*m
9 楼
Thank you for sharing. I am using AB 4000QTrap for metabolomic studies. All
my file is ".wiff" from Analyst. Is it compatible on XCMS online? Thanks.
are
users
【在 j*********1 的大作中提到】
: 本人在这个组，刚刚group发布了beta版本。有兴趣的可以试着用用。说是用于
: metabolomics，其实对LC-MS的数据普遍可用，需要upload 两组data进行对比分析。
: Announcement:如下
: The Scripps Center for Metabolomics is pleased to announce XCMS Online, a
: new user-friendly approach to process metabolomics data.
: XCMS Online provides the same high-quality metabolomic analysis that you are
: used to but in a user-friendly, web-based format. XCMS Online allows users
: to easily upload LC/MS metabolomic data that can then be processed with a
: few simple mouse clicks. Predefined parameter settings for different
: instruments (e.g., QTOF, Orbitrap, etc...) will be available as will be
my file is ".wiff" from Analyst. Is it compatible on XCMS online? Thanks.
are
users
【在 j*********1 的大作中提到】
: 本人在这个组，刚刚group发布了beta版本。有兴趣的可以试着用用。说是用于
: metabolomics，其实对LC-MS的数据普遍可用，需要upload 两组data进行对比分析。
: Announcement:如下
: The Scripps Center for Metabolomics is pleased to announce XCMS Online, a
: new user-friendly approach to process metabolomics data.
: XCMS Online provides the same high-quality metabolomic analysis that you are
: used to but in a user-friendly, web-based format. XCMS Online allows users
: to easily upload LC/MS metabolomic data that can then be processed with a
: few simple mouse clicks. Predefined parameter settings for different
: instruments (e.g., QTOF, Orbitrap, etc...) will be available as will be
S*s
10 楼
当韩季宣披挂整齐，登上内城城墙之时，他愕然发现，他已经被包围了。随他一道
被困在内城的，还有七八百骑契丹骑兵与近三千名汉军。外城已经陷落，宋军源源不断
的冲入城中，攻击完全没有防备的守兵，因为大雪的缘故，他的弓箭手甚至都没有随身
携带弓箭——因为那样会损害弓的寿命。他的士兵分散在几个军营中，仓促组织起来抵
抗这些从天而降的宋军，既不知道他们有多少人，也不知道他们从何而来，心中的惊慌
侵蚀着他们战斗的意志，理所当然的，大部分人选择了向内城逃跑。他最精锐的契丹骑
兵就驻守内城，但为了掩护这些溃兵，他损失了几乎三百名骑兵。付出如此惨重的代价
，他却甚至不教肯定这些退守内城的辽兵中，有没有混入对方的奸细。此时他唯一的办
法，只有让最信任的将领去看守内城的城门。
好在内城虽小，却十分坚固，储藏了不少的粮食与兵甲。他还可以在此坚守，甚而
夺回外城。但宋军此时却变得十分谨慎，他们包围了内城，却并不急于进攻。
韩季宣马上意识到他们是在等待援军，这只是一支先头部队，他迅速集丵合了麾下
所有的骑兵，又挑选了五百名精锐的步兵弓箭手，打开内城城门，向宋军发动反击。
宋军果然没有想到几乎穷途末路竟然敢主动反攻，双方甫一交锋，正面的宋军兵力
不足，几乎吃了个大亏，但是让韩季宣惊讶的是，这些宋军便如契丹人一样，接战不利
，马上吹起了号角，原本分散的宋军立即向此汇合，猛烈的攻击辽军的侧翼，韩季宣生
怕他的马军有失，连忙下令出城的辽军退回内城。
这一番试探之后，韩季宣已经可以确定，此时是他突围的最好时机，城内的宋军绝
对无法阻挡。但在犹豫一小会之后，韩季宣还是决定放弃突围，宋军的兵力不可能太多
，否则他们应该早有察觉，无论如何，他必须要坚守飞狐，直到援军前来。
守住飞狐，辽军就掌握着蔚州地区的主动权。
但是突围的机会也是稍纵即逝，仅仅大约申正时分，韩季宣刚刚粗略的安排好内城
的防务，宋军的主力便已开拨进城。
此时风雪渐息，可以清楚的看到，最少有数千名宋军，全是头顶斗笠，穿着黑白两
色裘衣，骑着各色的战马，在内护城河外约一百步的地方列阵。
韩季宣默默观察着他的敌人，赤色的战旗上看不清番号，但是可以肯定不是南朝禁
军，他知道那些南朝禁军的旗帜上会很愚蠢的绣上各种标志，这一二十年来，他们甚至
将此当成一种荣誉，但在韩季宣看来，那只是告诉敌人虚实而已。如果不是禁军的话，
这数以千计训练有素的马军，显然只能是某支蕃军。
他招来一个小校，轻声说了两句，那小校快步走到女墙边上，高声喊道：“尔等是
河东折家蕃骑还是吴将军的河套蕃骑？”
一名宋将跃马出阵，高声回道：“我军乃是大宋河套蕃军！韩将军可在城中？
我家吴将军请韩将军说话。”
尽管早已猜到，但听到这些宋军是吴安国的骑兵，韩季宣还是心头微震，他走到城
墙边上，看了那宋将一眼，朗声说道：“某便是韩季宣，吴将军有何话要说？”
只见一名身着白裘，骑着黑马的宋将驱马缓缓出阵数步，抬头望了城头的韩季宣一
眼，沉声说道：“在下吴安国，久仰将军之名，闻将军镇守飞狐，特来会猎。今胜败已
定，将军何不早降？”
韩季宣高声笑道：“吴将军此言差矣。行百里者半九十，内城犹在某手，说什么胜
负已定？将军若能取此城，尽管来取。若是不能，不如早退，否则，恐怕将军一世威名
，要葬送在这飞狐城下。”
城下沉默了一小会。
韩季宣看见吴安国缓缓抬头，似乎是讽刺的朝他笑了一下，“韩将军以为吴某不能
克此弹丸小城么？”他方一怔，便听吴安国又说道：“在下只是听说韩将军当日以少胜
多，大破粘八葛部，亦是我汉人中的英杰，故有此语。某亦不瞒将军，韩将军若是在指
望着蔚州的援军，那恐怕三五日之间，是等不到了。”
韩季宣听到这话，心头一惊，却勉强笑道：“吴将军怕是把话说得太满了。”
吴安国不置可否的说道：“韩将军若是不信，便指望着蔚州的援军到了直谷关后，
能早点转道飞狐口罢！总之，将军若肯降，在下教保将军富贵；将军若不肯降，安国亦
当全将军之志！”
韩季宣虽然心中惊惧，但听着吴安国这“劝降”之语，亦不由哈哈大笑，高声回道
：“多谢将军美意，然你我各为其主，自当各守本份。”
吴安国似乎是微微点了点头，却没有再多说什么，默默的退回阵中。
韩季宣也退后数步，朝左右低声吩咐道：“传令各军，打起精神来，宋军马上便要
攻城。”
他话音刚落，便听到呜呜的角声，从四面八方响起。
但出乎他的意料，宋军并没有攻城，除了吴安国身边的那支宋军，其余的宋军反而
往四方散去，没多久，便听到城内到处都是哭喊声与哀嚎声。
风雪几乎停了下来，天色也渐渐变黑。
韩季宣心里面突然想起什么，脸色沉了下来，快步走到城边，厉声喊道：“吴将军
，你不会是想驱使这城中百姓攻城吧？”
“韩将军尽管放心！”吴安国不紧不慢的说道，“安国虽然不才，倒不至于做那种
下作之事。”
韩季宣吁了一口气，但他的心还没有落下，又被吴安国狠狠的抓了起来，“在下只
不过是要将城中百姓赶出城去，免得待会大火之时，受无妄之灾。”
“大火，你说什么大火？”
“还能有什么大火？”吴安国奇怪的看了他一眼，“在下兵力有限，将军既然不肯
投降，我也不能在此城下白白牺牲部下性命。两全之策，当然是将这飞狐城付之一矩了
。”
“你，你说什么？”韩季宣脸都白了，“你要烧城？”
吴安国没有回答他，但是，韩季宣马上亲眼看到了答案，宋军果然在到处扔掷易燃
之物，显然，只要风雪稍停，吴安国便要放火烧城。
※※※
远处，飞狐外城的北门边上，陈庆远正指挥着一群士兵安放木柴，洒上各种油料、
硝石，一面高声说道：“你过来，把这堆木头摆到那边去。”
陈庆远从来没有想到，他的一项“屠龙之术”，竟然有朝一日真的能派上用场。当
年在朱仙镇之时，他曾经热衷于钻研如何最有效率的烧毁城门，因而孜孜不倦的寻找城
门结构中的脆弱环节。他自己也知道，真到实战之时，他的研究根本不可能用得上，然
而，鬼才知道为何吴安国会下达火烧飞狐城这样的命令。
所有的人都目瞪口呆，只有陈庆远一下子变得兴高采烈。不容分说的便抢下了烧城
门的任务。
※※※
被困在内城的，还有七八百骑契丹骑兵与近三千名汉军。外城已经陷落，宋军源源不断
的冲入城中，攻击完全没有防备的守兵，因为大雪的缘故，他的弓箭手甚至都没有随身
携带弓箭——因为那样会损害弓的寿命。他的士兵分散在几个军营中，仓促组织起来抵
抗这些从天而降的宋军，既不知道他们有多少人，也不知道他们从何而来，心中的惊慌
侵蚀着他们战斗的意志，理所当然的，大部分人选择了向内城逃跑。他最精锐的契丹骑
兵就驻守内城，但为了掩护这些溃兵，他损失了几乎三百名骑兵。付出如此惨重的代价
，他却甚至不教肯定这些退守内城的辽兵中，有没有混入对方的奸细。此时他唯一的办
法，只有让最信任的将领去看守内城的城门。
好在内城虽小，却十分坚固，储藏了不少的粮食与兵甲。他还可以在此坚守，甚而
夺回外城。但宋军此时却变得十分谨慎，他们包围了内城，却并不急于进攻。
韩季宣马上意识到他们是在等待援军，这只是一支先头部队，他迅速集丵合了麾下
所有的骑兵，又挑选了五百名精锐的步兵弓箭手，打开内城城门，向宋军发动反击。
宋军果然没有想到几乎穷途末路竟然敢主动反攻，双方甫一交锋，正面的宋军兵力
不足，几乎吃了个大亏，但是让韩季宣惊讶的是，这些宋军便如契丹人一样，接战不利
，马上吹起了号角，原本分散的宋军立即向此汇合，猛烈的攻击辽军的侧翼，韩季宣生
怕他的马军有失，连忙下令出城的辽军退回内城。
这一番试探之后，韩季宣已经可以确定，此时是他突围的最好时机，城内的宋军绝
对无法阻挡。但在犹豫一小会之后，韩季宣还是决定放弃突围，宋军的兵力不可能太多
，否则他们应该早有察觉，无论如何，他必须要坚守飞狐，直到援军前来。
守住飞狐，辽军就掌握着蔚州地区的主动权。
但是突围的机会也是稍纵即逝，仅仅大约申正时分，韩季宣刚刚粗略的安排好内城
的防务，宋军的主力便已开拨进城。
此时风雪渐息，可以清楚的看到，最少有数千名宋军，全是头顶斗笠，穿着黑白两
色裘衣，骑着各色的战马，在内护城河外约一百步的地方列阵。
韩季宣默默观察着他的敌人，赤色的战旗上看不清番号，但是可以肯定不是南朝禁
军，他知道那些南朝禁军的旗帜上会很愚蠢的绣上各种标志，这一二十年来，他们甚至
将此当成一种荣誉，但在韩季宣看来，那只是告诉敌人虚实而已。如果不是禁军的话，
这数以千计训练有素的马军，显然只能是某支蕃军。
他招来一个小校，轻声说了两句，那小校快步走到女墙边上，高声喊道：“尔等是
河东折家蕃骑还是吴将军的河套蕃骑？”
一名宋将跃马出阵，高声回道：“我军乃是大宋河套蕃军！韩将军可在城中？
我家吴将军请韩将军说话。”
尽管早已猜到，但听到这些宋军是吴安国的骑兵，韩季宣还是心头微震，他走到城
墙边上，看了那宋将一眼，朗声说道：“某便是韩季宣，吴将军有何话要说？”
只见一名身着白裘，骑着黑马的宋将驱马缓缓出阵数步，抬头望了城头的韩季宣一
眼，沉声说道：“在下吴安国，久仰将军之名，闻将军镇守飞狐，特来会猎。今胜败已
定，将军何不早降？”
韩季宣高声笑道：“吴将军此言差矣。行百里者半九十，内城犹在某手，说什么胜
负已定？将军若能取此城，尽管来取。若是不能，不如早退，否则，恐怕将军一世威名
，要葬送在这飞狐城下。”
城下沉默了一小会。
韩季宣看见吴安国缓缓抬头，似乎是讽刺的朝他笑了一下，“韩将军以为吴某不能
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韩季宣听到这话，心头一惊，却勉强笑道：“吴将军怕是把话说得太满了。”
吴安国不置可否的说道：“韩将军若是不信，便指望着蔚州的援军到了直谷关后，
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韩季宣虽然心中惊惧，但听着吴安国这“劝降”之语，亦不由哈哈大笑，高声回道
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吴安国似乎是微微点了点头，却没有再多说什么，默默的退回阵中。
韩季宣也退后数步，朝左右低声吩咐道：“传令各军，打起精神来，宋军马上便要
攻城。”
他话音刚落，便听到呜呜的角声，从四面八方响起。
但出乎他的意料，宋军并没有攻城，除了吴安国身边的那支宋军，其余的宋军反而
往四方散去，没多久，便听到城内到处都是哭喊声与哀嚎声。
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韩季宣心里面突然想起什么，脸色沉了下来，快步走到城边，厉声喊道：“吴将军
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“韩将军尽管放心！”吴安国不紧不慢的说道，“安国虽然不才，倒不至于做那种
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韩季宣吁了一口气，但他的心还没有落下，又被吴安国狠狠的抓了起来，“在下只
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“大火，你说什么大火？”
“还能有什么大火？”吴安国奇怪的看了他一眼，“在下兵力有限，将军既然不肯
投降，我也不能在此城下白白牺牲部下性命。两全之策，当然是将这飞狐城付之一矩了
。”
“你，你说什么？”韩季宣脸都白了，“你要烧城？”
吴安国没有回答他，但是，韩季宣马上亲眼看到了答案，宋军果然在到处扔掷易燃
之物，显然，只要风雪稍停，吴安国便要放火烧城。
※※※
远处，飞狐外城的北门边上，陈庆远正指挥着一群士兵安放木柴，洒上各种油料、
硝石，一面高声说道：“你过来，把这堆木头摆到那边去。”
陈庆远从来没有想到，他的一项“屠龙之术”，竟然有朝一日真的能派上用场。当
年在朱仙镇之时，他曾经热衷于钻研如何最有效率的烧毁城门，因而孜孜不倦的寻找城
门结构中的脆弱环节。他自己也知道，真到实战之时，他的研究根本不可能用得上，然
而，鬼才知道为何吴安国会下达火烧飞狐城这样的命令。
所有的人都目瞪口呆，只有陈庆远一下子变得兴高采烈。不容分说的便抢下了烧城
门的任务。
※※※
j*1
11 楼
.wiff files are not directly supported, yet.
But you can convert them to mzXML using proteowizard, http://proteowizard.sourceforge.net/downloads.shtml
Active the peak picking filter.
Upload the resulting mzXML files on XCMS Online.
We are working on it right now.
But you can convert them to mzXML using proteowizard, http://proteowizard.sourceforge.net/downloads.shtml
Active the peak picking filter.
Upload the resulting mzXML files on XCMS Online.
We are working on it right now.
h*e
12 楼
这个可以比对 wild type 和mutant的LC MS数据不
谢谢
谢谢
R*n
13 楼
Great to know!
j*1
14 楼
就是用来做这个的！
thanks
【在 h***e 的大作中提到】
: 这个可以比对 wild type 和mutant的LC MS数据不
: 谢谢
thanks
【在 h***e 的大作中提到】
: 这个可以比对 wild type 和mutant的LC MS数据不
: 谢谢
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