n*a
2 楼
下降通道的股你也碰？
【在 v**s 的大作中提到】
: 哪位生物大牛帮忙看看Foundation Medicine (FMI) 公司有前途吗？
: Edinburgher (比尔 阿克曼)在吗？帮忙看看.
【在 v**s 的大作中提到】
: 哪位生物大牛帮忙看看Foundation Medicine (FMI) 公司有前途吗？
: Edinburgher (比尔 阿克曼)在吗？帮忙看看.
v*s
3 楼
老听朋友提测序，说有大钱图，这个是Bill Gates投的吧，跌了很多，想抄点儿。底在
哪?
哪?
E*r
4 楼
简单看了一下那个公司，湾区这边类似的公司很多，都号称可以诊断癌症。在公司的介
绍中，注意一句句子...often expands treatment options by matching each
patient with targeted therapies that are relevant to the molecular changes
in their tumor. 尤其特别注意Molecular这个词。肿瘤的形成原因很多，至今还无法
搞清，DNA上的变化当然是比较基本的，包括突变、重组、增加或减少某个片段等。这
些可以通过测序发现，但是这些变化并不一定会形成肿瘤，同样的变化，有些人得了肿
瘤，有些人没有，这当中包括一些抑癌基因的表达增强，或者免疫系统杀死肿瘤细胞等
等。还有不少肿瘤是属于Epigenetics范畴，譬如甲基化和乙酰化等，还有在蛋白水平
的变化，和病毒引起的肿瘤等等，总之，测序仅仅提供了基因的序列，至于这些基因如
何表达，基因和基因之间的相关性和调控而引发肿瘤，测序是无法提供信息的。目前测
序还是停留在学术领域，进入临床有一些，还未普及，停留在初期阶段，应该会有一
些很好的应用，但是要到那个时候看了再说了。
绍中，注意一句句子...often expands treatment options by matching each
patient with targeted therapies that are relevant to the molecular changes
in their tumor. 尤其特别注意Molecular这个词。肿瘤的形成原因很多，至今还无法
搞清，DNA上的变化当然是比较基本的，包括突变、重组、增加或减少某个片段等。这
些可以通过测序发现，但是这些变化并不一定会形成肿瘤，同样的变化，有些人得了肿
瘤，有些人没有，这当中包括一些抑癌基因的表达增强，或者免疫系统杀死肿瘤细胞等
等。还有不少肿瘤是属于Epigenetics范畴，譬如甲基化和乙酰化等，还有在蛋白水平
的变化，和病毒引起的肿瘤等等，总之，测序仅仅提供了基因的序列，至于这些基因如
何表达，基因和基因之间的相关性和调控而引发肿瘤，测序是无法提供信息的。目前测
序还是停留在学术领域，进入临床有一些，还未普及，停留在初期阶段，应该会有一
些很好的应用，但是要到那个时候看了再说了。
v*s
5 楼
多谢了，Edinburgher， you are the man!
E*r
6 楼
值得一提的是，我不是测序方面的专家，抛砖引玉，肯定有这方面的牛人了解得更多。
我只是从分子生物学的中心法则（Central Dogma）DNA-RNA-Protein 来设想测序的应
用。测序解决的是第一部DNA的序列。就我所知道的，分析癌症的公司往往是利用生物
统计学来找出正常人和肿瘤患者在DNA序列上的变化，从而总结出一套诊断方法，还是
那句话，这只是中心法则的第一步。 至于后两步的话，DNA测序起不了太大作用，需要
生化的技术去解决了。当然必须指出，DNA测序还是有很大的用处，尤其是分析小儿遗
传性疾病，以及在个性化医疗方面可以提供很多的信息。 问题是随着下一代测序技术
的完善，测序门槛降低，价格也便宜很多，这方面的竞争也会激烈，我不觉得会出现一
家独大的局面。
我只是从分子生物学的中心法则（Central Dogma）DNA-RNA-Protein 来设想测序的应
用。测序解决的是第一部DNA的序列。就我所知道的，分析癌症的公司往往是利用生物
统计学来找出正常人和肿瘤患者在DNA序列上的变化，从而总结出一套诊断方法，还是
那句话，这只是中心法则的第一步。 至于后两步的话，DNA测序起不了太大作用，需要
生化的技术去解决了。当然必须指出，DNA测序还是有很大的用处，尤其是分析小儿遗
传性疾病，以及在个性化医疗方面可以提供很多的信息。 问题是随着下一代测序技术
的完善，测序门槛降低，价格也便宜很多，这方面的竞争也会激烈，我不觉得会出现一
家独大的局面。
v*s
7 楼
看来人体太复杂了，又有个体化差异，还是等技术成熟后再考虑投资吧。一个朋友的同
学教授不做了，去San Diego做测序的startup了。
学教授不做了，去San Diego做测序的startup了。
l*i
8 楼
很多特异性的基因突变用测序检测，是可以指导治疗的，比如黑色素瘤的RAF基因突变
，有针对性药物，其他例子还有很多。至于在诊断上的应用也有很多。
【在 E*********r 的大作中提到】
: 简单看了一下那个公司，湾区这边类似的公司很多，都号称可以诊断癌症。在公司的介
: 绍中，注意一句句子...often expands treatment options by matching each
: patient with targeted therapies that are relevant to the molecular changes
: in their tumor. 尤其特别注意Molecular这个词。肿瘤的形成原因很多，至今还无法
: 搞清，DNA上的变化当然是比较基本的，包括突变、重组、增加或减少某个片段等。这
: 些可以通过测序发现，但是这些变化并不一定会形成肿瘤，同样的变化，有些人得了肿
: 瘤，有些人没有，这当中包括一些抑癌基因的表达增强，或者免疫系统杀死肿瘤细胞等
: 等。还有不少肿瘤是属于Epigenetics范畴，譬如甲基化和乙酰化等，还有在蛋白水平
: 的变化，和病毒引起的肿瘤等等，总之，测序仅仅提供了基因的序列，至于这些基因如
: 何表达，基因和基因之间的相关性和调控而引发肿瘤，测序是无法提供信息的。目前测
，有针对性药物，其他例子还有很多。至于在诊断上的应用也有很多。
【在 E*********r 的大作中提到】
: 简单看了一下那个公司，湾区这边类似的公司很多，都号称可以诊断癌症。在公司的介
: 绍中，注意一句句子...often expands treatment options by matching each
: patient with targeted therapies that are relevant to the molecular changes
: in their tumor. 尤其特别注意Molecular这个词。肿瘤的形成原因很多，至今还无法
: 搞清，DNA上的变化当然是比较基本的，包括突变、重组、增加或减少某个片段等。这
: 些可以通过测序发现，但是这些变化并不一定会形成肿瘤，同样的变化，有些人得了肿
: 瘤，有些人没有，这当中包括一些抑癌基因的表达增强，或者免疫系统杀死肿瘤细胞等
: 等。还有不少肿瘤是属于Epigenetics范畴，譬如甲基化和乙酰化等，还有在蛋白水平
: 的变化，和病毒引起的肿瘤等等，总之，测序仅仅提供了基因的序列，至于这些基因如
: 何表达，基因和基因之间的相关性和调控而引发肿瘤，测序是无法提供信息的。目前测
c*m
9 楼
基因组测序带来的影响不只是疾病， 还有你全部的遗传信息，包括每个人各方面的性
状特征， 智商，身高，肥胖， 皮肤，体质，当然很多和后天有关系。 解决这些问题
还需要一段时间， 不过应该在20年内会渐渐成熟。
状特征， 智商，身高，肥胖， 皮肤，体质，当然很多和后天有关系。 解决这些问题
还需要一段时间， 不过应该在20年内会渐渐成熟。
r*m
10 楼
现在测序不是单纯测DNA， 也可以直接测RNA，这就更基因表达直接相关了。
问题不在于某种方法有没有前途，而在于成功的概率，如果别人的方法比你好一点点，
便宜一点点，你就没戏了。
问题不在于某种方法有没有前途，而在于成功的概率，如果别人的方法比你好一点点，
便宜一点点，你就没戏了。
G*n
11 楼
现在测序已经不是那么热了，价格也越来越低的。现在的瓶颈是怎么去分析、利用这些
序列，就看谁的分析、软件团队更牛掰了。
序列，就看谁的分析、软件团队更牛掰了。
E*r
12 楼
问题是根本不需要用到下一代测序，用现有的桑格测序法就可以解决。拉个PCR，去测
一下序列。在诊断领域下一代测序只是做胎儿的Inborn Errors有一些，其它方面我还
真没听说过多少。我和Ion Torrent的Product Manager还有Illumina的都很熟，谈起临
床的问题，他们也承认目前应用不多。
Luminex现在有专门做SNP的试剂盒。不需要测序也可以很快找到SNP。
【在 l********i 的大作中提到】
: 很多特异性的基因突变用测序检测，是可以指导治疗的，比如黑色素瘤的RAF基因突变
: ，有针对性药物，其他例子还有很多。至于在诊断上的应用也有很多。
一下序列。在诊断领域下一代测序只是做胎儿的Inborn Errors有一些，其它方面我还
真没听说过多少。我和Ion Torrent的Product Manager还有Illumina的都很熟，谈起临
床的问题，他们也承认目前应用不多。
Luminex现在有专门做SNP的试剂盒。不需要测序也可以很快找到SNP。
【在 l********i 的大作中提到】
: 很多特异性的基因突变用测序检测，是可以指导治疗的，比如黑色素瘤的RAF基因突变
: ，有针对性药物，其他例子还有很多。至于在诊断上的应用也有很多。
E*r
13 楼
我听说过直接测RNA，不知道如何解决降解的问题。我以前用过Nugen的试剂盒，是用
Randomised Primer来解决Cover全长RNA的问题。这些Primers一半是RNA，一半是DNA，
我想测RNA可能也是同样的道理，然后通过软件来分析。 问题是如果肿瘤和甲基化有关
，你测序也没用。 还有病毒引起的肿瘤， EBV病毒，这些都是Target Tumour
Suppressor Proteins， 和基因序列毛关系都没有。
我觉得价格因素，方法个方面各有千秋，关键问题是基因序列到底能够给出多少信息？
我想现在搞序列的都是运用Bioinformatics的手段在找疾病和序列的关系，作用是肯
定有了，但是基因表达不仅仅是靠Structure，更重要的是Regulation。这方面恐怕光
看序列是没用的。
【在 r*m 的大作中提到】
: 现在测序不是单纯测DNA， 也可以直接测RNA，这就更基因表达直接相关了。
: 问题不在于某种方法有没有前途，而在于成功的概率，如果别人的方法比你好一点点，
: 便宜一点点，你就没戏了。
Randomised Primer来解决Cover全长RNA的问题。这些Primers一半是RNA，一半是DNA，
我想测RNA可能也是同样的道理，然后通过软件来分析。 问题是如果肿瘤和甲基化有关
，你测序也没用。 还有病毒引起的肿瘤， EBV病毒，这些都是Target Tumour
Suppressor Proteins， 和基因序列毛关系都没有。
我觉得价格因素，方法个方面各有千秋，关键问题是基因序列到底能够给出多少信息？
我想现在搞序列的都是运用Bioinformatics的手段在找疾病和序列的关系，作用是肯
定有了，但是基因表达不仅仅是靠Structure，更重要的是Regulation。这方面恐怕光
看序列是没用的。
【在 r*m 的大作中提到】
: 现在测序不是单纯测DNA， 也可以直接测RNA，这就更基因表达直接相关了。
: 问题不在于某种方法有没有前途，而在于成功的概率，如果别人的方法比你好一点点，
: 便宜一点点，你就没戏了。
E*r
14 楼
呵呵，都是这么说，好几年前加州Davis就有一家公司号称能够测整个Genome，然后预
测每个人在若干年后得病的概率。 结果三年后破产倒闭了。还是那句话，仅仅序列是
不够的。科学家实际上很早意识到这点，所以后来又出现研究Transcription Factor热
，基因的调控被归结为这些Transcription Factors之间的作用，为此Robert Tjian红
了好一阵子。
【在 c***m 的大作中提到】
: 基因组测序带来的影响不只是疾病， 还有你全部的遗传信息，包括每个人各方面的性
: 状特征， 智商，身高，肥胖， 皮肤，体质，当然很多和后天有关系。 解决这些问题
: 还需要一段时间， 不过应该在20年内会渐渐成熟。
测每个人在若干年后得病的概率。 结果三年后破产倒闭了。还是那句话，仅仅序列是
不够的。科学家实际上很早意识到这点，所以后来又出现研究Transcription Factor热
，基因的调控被归结为这些Transcription Factors之间的作用，为此Robert Tjian红
了好一阵子。
【在 c***m 的大作中提到】
: 基因组测序带来的影响不只是疾病， 还有你全部的遗传信息，包括每个人各方面的性
: 状特征， 智商，身高，肥胖， 皮肤，体质，当然很多和后天有关系。 解决这些问题
: 还需要一段时间， 不过应该在20年内会渐渐成熟。
E*r
15 楼
同意，分析序列比序列本身有意思得多。当然这里又有一个问题，看谁的Cohort里的病
人多，代表性强了。
【在 G******n 的大作中提到】
: 现在测序已经不是那么热了，价格也越来越低的。现在的瓶颈是怎么去分析、利用这些
: 序列，就看谁的分析、软件团队更牛掰了。
人多，代表性强了。
【在 G******n 的大作中提到】
: 现在测序已经不是那么热了，价格也越来越低的。现在的瓶颈是怎么去分析、利用这些
: 序列，就看谁的分析、软件团队更牛掰了。
E*r
16 楼
我在想直接测RNA也不全面，应该还要测ＤＮＡ才能解决Alternative Splicing 问题
【在 r*m 的大作中提到】
: 现在测序不是单纯测DNA， 也可以直接测RNA，这就更基因表达直接相关了。
: 问题不在于某种方法有没有前途，而在于成功的概率，如果别人的方法比你好一点点，
: 便宜一点点，你就没戏了。
【在 r*m 的大作中提到】
: 现在测序不是单纯测DNA， 也可以直接测RNA，这就更基因表达直接相关了。
: 问题不在于某种方法有没有前途，而在于成功的概率，如果别人的方法比你好一点点，
: 便宜一点点，你就没戏了。
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