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为啥没人讨论 J. Craig Venter 最近整的轰动性的东西
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为啥没人讨论 J. Craig Venter 最近整的轰动性的东西# Biology - 生物学
w*n
1 楼
【 以下文字转载自 Joke 讨论区 】
发信人: ElliottJr (Froglet), 信区: Joke
标 题: I Buy IPAD!
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Oct 17 01:24:57 2010, 美东)
再来一个。
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M*r
2 楼
I am calling a exe from python, the exe would occasionally return a nonzero
value and been raised as error. The exe is written in c++ and the main
function is like:
int main(int argc, char *argv[]) {
xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
return 0;
}
I suspected there is some memory leak in the code, but no warning no error
reported when I run it in debug/release mode...
BTW I'm working in VS12 environment.
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l*u
3 楼
有做合成生物学的不？上来评论一下。
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r*y
4 楼
很像达赖

【在 w**n 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Joke 讨论区 】
: 发信人: ElliottJr (Froglet), 信区: Joke
: 标 题: I Buy IPAD!
: 发信站: BBS 未名空间站 (Sun Oct 17 01:24:57 2010, 美东)
: 再来一个。
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n*u
5 楼
内存漏不会导致出错,这种随机出错十有八九是变量没初始化

nonzero

【在 M*******r 的大作中提到】
: I am calling a exe from python, the exe would occasionally return a nonzero
: value and been raised as error. The exe is written in c++ and the main
: function is like:
: int main(int argc, char *argv[]) {
: xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
: return 0;
: }
: I suspected there is some memory leak in the code, but no warning no error
: reported when I run it in debug/release mode...
: BTW I'm working in VS12 environment.
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k*s
6 楼


【在 l******u 的大作中提到】
: 有做合成生物学的不？上来评论一下。
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M*r
7 楼
Thank you very much. Is there a way to track when a unassigned variable
being used?

【在 n*****u 的大作中提到】
: 内存漏不会导致出错,这种随机出错十有八九是变量没初始化
:
: nonzero
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k*s
8 楼
这是一个非常新的领域，感觉这是很有前途的一个方向，是把生物真正大产业化的
欢迎有行内人介绍一下。

【在 l******u 的大作中提到】
: 有做合成生物学的不？上来评论一下。
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l*n
9 楼
Use assert or raise Exception

【在 M*******r 的大作中提到】
: Thank you very much. Is there a way to track when a unassigned variable
: being used?
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a*d
10 楼
帮着贴一个过来，呵呵，前几天lab里面还在讨论这个呢。
First Self-Replicating Synthetic Bacterial Cell
First Self-Replicating, Synthetic Bacterial Cell Constructed by J. Craig
Venter Institute Researchers
ROCKVILLE, MD and San Diego, CA (May 20, 2010)— Researchers at the J. Craig
Venter Institute (JCVI), a not-for-profit genomic research organization,
published results today describing the successful construction of the first
self-replicating, synthetic bacterial cell. The team synthesized the 1.08
million base pair chrom
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M*n
11 楼
valgrind test

：Thank you very much. Is there a way to track when a unassigned variable
：being used?
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X*n
12 楼
http://www.nature.com/news/2010/100520/full/news.2010.255.html
很多牛人已经评论过了。感觉行内很多人并不认为是突破性进展，当然也有人把这个上
升到了双螺旋结构的高度。不管怎么说，synthetic biology 和systems biology让我
们这些做酵母的人又看到了饭碗。

【在 k*******s 的大作中提到】
: 这是一个非常新的领域，感觉这是很有前途的一个方向，是把生物真正大产业化的
: 欢迎有行内人介绍一下。
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i*i
13 楼
猜一个，指针木有初始化，或者越界。
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s*y
14 楼
I personally think it is a boring progress because it is not completely
synthetic. For example, the whole membrane (and its associated sugar
proteins)
was borrowed from another organism.
It may be called semisynthetic, at most.

【在 l******u 的大作中提到】
: 有做合成生物学的不？上来评论一下。
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Y*G
15 楼
https://www.gnu.org/software/libc/manual/html_node/Non_002dLocal-Intro.html#
Non_002dLocal-Intro

nonzero

【在 M*******r 的大作中提到】
: I am calling a exe from python, the exe would occasionally return a nonzero
: value and been raised as error. The exe is written in c++ and the main
: function is like:
: int main(int argc, char *argv[]) {
: xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
: return 0;
: }
: I suspected there is some memory leak in the code, but no warning no error
: reported when I run it in debug/release mode...
: BTW I'm working in VS12 environment.
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k*h
16 楼
自以为聪明勇敢的可怜民族就拿着100次结果里面挑一次发表在CNS的Stupid Cxxxxse
Idea羡慕人家呗

【在 l******u 的大作中提到】
: 有做合成生物学的不？上来评论一下。
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M*r
17 楼
I am calling a exe from python, the exe would occasionally return a nonzero
value and been raised as error. The exe is written in c++ and the main
function is like:
int main(int argc, char *argv[]) {
xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
return 0;
}
I suspected there is some memory leak in the code, but no warning no error
reported when I run it in debug/release mode...
BTW I'm working in VS12 environment.
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s*l
18 楼
我觉得这个研究在理论上的意义非常大,说明了生物与非生命间的差别不是那么大.同时
也在理论上暗示保护濒危动物,复活某个物种或个体是完全有可能的,只是技术上的问题
而已

【在 l******u 的大作中提到】
: 有做合成生物学的不？上来评论一下。
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n*u
19 楼
内存漏不会导致出错,这种随机出错十有八九是变量没初始化

nonzero

【在 M*******r 的大作中提到】
: I am calling a exe from python, the exe would occasionally return a nonzero
: value and been raised as error. The exe is written in c++ and the main
: function is like:
: int main(int argc, char *argv[]) {
: xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
: return 0;
: }
: I suspected there is some memory leak in the code, but no warning no error
: reported when I run it in debug/release mode...
: BTW I'm working in VS12 environment.
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j*a
20 楼
好象以前在版上看到有人鄙视JCVI,说人家连一些ABC都不懂....
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M*r
21 楼
Thank you very much. Is there a way to track when a unassigned variable
being used?

【在 n*****u 的大作中提到】
: 内存漏不会导致出错,这种随机出错十有八九是变量没初始化
:
: nonzero
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p*i
22 楼
是WASTON吗？呵呵

【在 j**********a 的大作中提到】
: 好象以前在版上看到有人鄙视JCVI,说人家连一些ABC都不懂....
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l*n
23 楼
Use assert or raise Exception

【在 M*******r 的大作中提到】
: Thank you very much. Is there a way to track when a unassigned variable
: being used?
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w*y
24 楼
waston自己就是被鄙视的对象
无论是science还是rp

【在 p******i 的大作中提到】
: 是WASTON吗？呵呵
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M*n
25 楼
valgrind test

：Thank you very much. Is there a way to track when a unassigned variable
：being used?
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t*d
26 楼
这期的 The Economist 的封面文章。把它提到了原子弹的高度。

【在 X******n 的大作中提到】
: http://www.nature.com/news/2010/100520/full/news.2010.255.html
: 很多牛人已经评论过了。感觉行内很多人并不认为是突破性进展，当然也有人把这个上
: 升到了双螺旋结构的高度。不管怎么说，synthetic biology 和systems biology让我
: 们这些做酵母的人又看到了饭碗。
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i*i
27 楼
猜一个，指针木有初始化，或者越界。
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n*y
28 楼
算semi-synthetic把， because the recipient cell already exists. 而且这个好像
对recipient cell 有很多要求吧， 很可能外源dna会被降解什么的， 而且现在也只是
bacterium to bacterium transplantation.

【在 s******y 的大作中提到】
: I personally think it is a boring progress because it is not completely
: synthetic. For example, the whole membrane (and its associated sugar
: proteins)
: was borrowed from another organism.
: It may be called semisynthetic, at most.
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Y*G
29 楼
https://www.gnu.org/software/libc/manual/html_node/Non_002dLocal-Intro.html#
Non_002dLocal-Intro

nonzero

【在 M*******r 的大作中提到】
: I am calling a exe from python, the exe would occasionally return a nonzero
: value and been raised as error. The exe is written in c++ and the main
: function is like:
: int main(int argc, char *argv[]) {
: xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
: return 0;
: }
: I suspected there is some memory leak in the code, but no warning no error
: reported when I run it in debug/release mode...
: BTW I'm working in VS12 environment.
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p*i
30 楼
你是指他搞掉了我们老中的诺贝尔吗？

【在 w******y 的大作中提到】
: waston自己就是被鄙视的对象
: 无论是science还是rp
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M*r
31 楼
You guys are awesome!
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g*u
32 楼
Craig Venter就是个大忽悠，真想知道他在整个研究中的作用是什么？收割成果者和圈
钱者？

【在 l******u 的大作中提到】
: 有做合成生物学的不？上来评论一下。
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a*y
33 楼
Technically not THAT difficult. this day was bound to come. And the results
itself is not THAT groundbreaking. wake me up if they designed then gnome
and genes from scratch.
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s*y
34 楼
有点类似。
两个都是技术上/工程上的成就，说明某个事情可以作了。
但是在理论上几乎没有什么成就。

【在 t*d 的大作中提到】
: 这期的 The Economist 的封面文章。把它提到了原子弹的高度。
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n*d
35 楼
相信过几年这个会火的，我感觉会有很多私人基金进来做这种事情的。

【在 l******u 的大作中提到】
: 有做合成生物学的不？上来评论一下。
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s*r
36 楼
火不了，不如直接诱变筛选来的便宜方便。

相信过几年这个会火的，我感觉会有很多私人基金进来做这种事情的。

【在 n******d 的大作中提到】
: 相信过几年这个会火的，我感觉会有很多私人基金进来做这种事情的。
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y*i
37 楼
自然界的东西天生不是为了干活的。所以最终人工组成的效率会远远高于筛选出来的
。我相信这个时间不会很长。

【在 s******r 的大作中提到】
: 火不了，不如直接诱变筛选来的便宜方便。
:
: 相信过几年这个会火的，我感觉会有很多私人基金进来做这种事情的。
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a*o
38 楼
我感觉也是这样，他特别善于制造新闻。最早建立了个Celera公司，测人类基因组，与
多国部队竞争，应该说一定程度上推进了人类基因组计划的进程。现在又创造生命，俨
然成为上帝了。开始他们提取一个细菌的基因组，转到另一个接近的细菌里面去，活了
，有很多新闻。后来，靠合成DNA，拼出一个基因组，转到细菌（本身基因组已除掉）
里，又活了，很吸引眼球。感觉那才是第一次创造生命。这次是加了个能产生颜色的报
告基因，和野生型有明显对比，又有很多新闻。另外，好像他不需要外面资助的，自己
有很多钱来烧的。

【在 g****u 的大作中提到】
: Craig Venter就是个大忽悠，真想知道他在整个研究中的作用是什么？收割成果者和圈
: 钱者？
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l*n
39 楼
他还好了，做的东西虽然噱头，但忽悠到私人的钱做些 popular science，还能 push
人类基因组这样烧纳税人钱的课题快速发展，功不可没。

【在 a**o 的大作中提到】
: 我感觉也是这样，他特别善于制造新闻。最早建立了个Celera公司，测人类基因组，与
: 多国部队竞争，应该说一定程度上推进了人类基因组计划的进程。现在又创造生命，俨
: 然成为上帝了。开始他们提取一个细菌的基因组，转到另一个接近的细菌里面去，活了
: ，有很多新闻。后来，靠合成DNA，拼出一个基因组，转到细菌（本身基因组已除掉）
: 里，又活了，很吸引眼球。感觉那才是第一次创造生命。这次是加了个能产生颜色的报
: 告基因，和野生型有明显对比，又有很多新闻。另外，好像他不需要外面资助的，自己
: 有很多钱来烧的。
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c*s
40 楼
我觉得意料中的而已啊，以后还会很多类似的呢

【在 l******u 的大作中提到】
: 有做合成生物学的不？上来评论一下。
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k*u
41 楼
不觉得有什么很重要的意义。
相对于以前的合成一个蛋白，现在合成一个大DNA罢了。技术上的难关突破了罢了，
想法上的，没什么特别的。
比较关注的是有没有人能设计一个全新的蛋白，完成一个以前很难完成的化学反应，
做revolution所做的work。

【在 l******u 的大作中提到】
: 有做合成生物学的不？上来评论一下。
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S*s
42 楼
我也觉得这个发现纯粹就是哗众取宠。DNA 编码了细胞的整个基因组不假，但是对于整
个细胞的生物功能来说蛋白质和 RNA (rRNA, tRNA etc) 的贡献更大。合成的 DNA 在
酵母菌内利用了酵母菌本身的蛋白和 RNA 才体现了它编码的基因组的功能，但是在报
道的时候片面的突出了合成 DNA 的贡献，结论太偏颇了。发表在 Nucleic Acid
Research 上面的文章反倒上了 ABC CNN 这些新闻，满让我困惑。美国不明真相的群众
太多了。
你提到的合成蛋白，我觉得国内 65 年合成的有生物活性的牛胰岛素比这篇文章更有学
术价值。主要牛在人工合成的蛋白能够折叠成天然蛋白的构型，还能有天然蛋白的活性
。只是牛胰岛素只有 51 个氨基酸，要是什么时候能合成一个大一点的蛋白，比如
ATPase 100kDa，而且在体外能折叠成具有生物活性的蛋白，那绝对是个重大突破。

【在 k********u 的大作中提到】
: 不觉得有什么很重要的意义。
: 相对于以前的合成一个蛋白，现在合成一个大DNA罢了。技术上的难关突破了罢了，
: 想法上的，没什么特别的。
: 比较关注的是有没有人能设计一个全新的蛋白，完成一个以前很难完成的化学反应，
: 做revolution所做的work。
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y*i
43 楼

I totally disagree with you

【在 S*****s 的大作中提到】
: 我也觉得这个发现纯粹就是哗众取宠。DNA 编码了细胞的整个基因组不假，但是对于整
: 个细胞的生物功能来说蛋白质和 RNA (rRNA, tRNA etc) 的贡献更大。合成的 DNA 在
: 酵母菌内利用了酵母菌本身的蛋白和 RNA 才体现了它编码的基因组的功能，但是在报
: 道的时候片面的突出了合成 DNA 的贡献，结论太偏颇了。发表在 Nucleic Acid
: Research 上面的文章反倒上了 ABC CNN 这些新闻，满让我困惑。美国不明真相的群众
: 太多了。
: 你提到的合成蛋白，我觉得国内 65 年合成的有生物活性的牛胰岛素比这篇文章更有学
: 术价值。主要牛在人工合成的蛋白能够折叠成天然蛋白的构型，还能有天然蛋白的活性
: 。只是牛胰岛素只有 51 个氨基酸，要是什么时候能合成一个大一点的蛋白，比如
: ATPase 100kDa，而且在体外能折叠成具有生物活性的蛋白，那绝对是个重大突破。
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k*o
44 楼
再怎么不济，总比CNS上某些无法重复结果的文章好得多吧
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a*g
45 楼
不要太酸了
大家都不傻
人venter也是聪明人
当年在metagenomics里也算搞出了点名堂 Sargasso Sea那篇paper也算是metagenomics
的经典
这哥们确实够牛的了
有钱有人有想法能做事
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