有哪些蛋白在细胞内会被cleavage? 有哪些生物信息网站能给出cleavage site？# Biology - 生物学
H*s
1 楼
在第三国读博士持J-1签证去美国实习三个月，签证有两年回国服务条件，请问什么时
候申请waive？在美国实习期间还是以后毕业了申请？
谢谢。
候申请waive？在美国实习期间还是以后毕业了申请？
谢谢。
m*5
2 楼
在做一个蛋白，用N端tag或者anti N - peptide的抗体能看到两条等量的带，一条高一
些，一条低一些，用anti C terminal的抗体就只能看到高的那条带。 因此怀疑低的带
是cleavage产物，类似pro caspase 变成caspase的过程，请教有哪些常用生物信息软
件能找到cleavage识别位点？
些，一条低一些，用anti C terminal的抗体就只能看到高的那条带。 因此怀疑低的带
是cleavage产物，类似pro caspase 变成caspase的过程，请教有哪些常用生物信息软
件能找到cleavage识别位点？
H*s
3 楼
有人知道吗？
谢谢
【在 H**s 的大作中提到】
: 在第三国读博士持J-1签证去美国实习三个月，签证有两年回国服务条件，请问什么时
: 候申请waive？在美国实习期间还是以后毕业了申请？
: 谢谢。
谢谢
【在 H**s 的大作中提到】
: 在第三国读博士持J-1签证去美国实习三个月，签证有两年回国服务条件，请问什么时
: 候申请waive？在美国实习期间还是以后毕业了申请？
: 谢谢。
s*s
4 楼
生物信息学表示压力很大。
H*s
5 楼
顶
【在 H**s 的大作中提到】
: 在第三国读博士持J-1签证去美国实习三个月，签证有两年回国服务条件，请问什么时
: 候申请waive？在美国实习期间还是以后毕业了申请？
: 谢谢。
【在 H**s 的大作中提到】
: 在第三国读博士持J-1签证去美国实习三个月，签证有两年回国服务条件，请问什么时
: 候申请waive？在美国实习期间还是以后毕业了申请？
: 谢谢。
m*5
6 楼
谢谢回复！ 不受调控，但还是想搞清楚这个问题，因为那个条带留在那边导致之后的
co-ip , pull down等实验都很dirty
co-ip , pull down等实验都很dirty
D*a
7 楼
我最近也遇到了一个问题。在一个膜蛋白N端加了个tag，测序以及用抗C端抗体检测都
没问题，但抗tag的抗体检测不到。
【在 m******5 的大作中提到】
: 在做一个蛋白，用N端tag或者anti N - peptide的抗体能看到两条等量的带，一条高一
: 些，一条低一些，用anti C terminal的抗体就只能看到高的那条带。 因此怀疑低的带
: 是cleavage产物，类似pro caspase 变成caspase的过程，请教有哪些常用生物信息软
: 件能找到cleavage识别位点？
没问题，但抗tag的抗体检测不到。
【在 m******5 的大作中提到】
: 在做一个蛋白，用N端tag或者anti N - peptide的抗体能看到两条等量的带，一条高一
: 些，一条低一些，用anti C terminal的抗体就只能看到高的那条带。 因此怀疑低的带
: 是cleavage产物，类似pro caspase 变成caspase的过程，请教有哪些常用生物信息软
: 件能找到cleavage识别位点？
s*y
8 楼
有大量的蛋白在合成之后是会被切的。如果是信号肽，有一些算法可以预测。
如果是calpain 切的话也勉强可以预测，
如果是被ER, golgi, lysosome那些乱七八糟的蛋白酶切的话就更难预测了（主要是数
据库没有建立起来）
【在 m******5 的大作中提到】
: 在做一个蛋白，用N端tag或者anti N - peptide的抗体能看到两条等量的带，一条高一
: 些，一条低一些，用anti C terminal的抗体就只能看到高的那条带。 因此怀疑低的带
: 是cleavage产物，类似pro caspase 变成caspase的过程，请教有哪些常用生物信息软
: 件能找到cleavage识别位点？
如果是calpain 切的话也勉强可以预测，
如果是被ER, golgi, lysosome那些乱七八糟的蛋白酶切的话就更难预测了（主要是数
据库没有建立起来）
【在 m******5 的大作中提到】
: 在做一个蛋白，用N端tag或者anti N - peptide的抗体能看到两条等量的带，一条高一
: 些，一条低一些，用anti C terminal的抗体就只能看到高的那条带。 因此怀疑低的带
: 是cleavage产物，类似pro caspase 变成caspase的过程，请教有哪些常用生物信息软
: 件能找到cleavage识别位点？
m*5
9 楼
是个transcription factor
【在 s******y 的大作中提到】
: 有大量的蛋白在合成之后是会被切的。如果是信号肽，有一些算法可以预测。
: 如果是calpain 切的话也勉强可以预测，
: 如果是被ER, golgi, lysosome那些乱七八糟的蛋白酶切的话就更难预测了（主要是数
: 据库没有建立起来）
【在 s******y 的大作中提到】
: 有大量的蛋白在合成之后是会被切的。如果是信号肽，有一些算法可以预测。
: 如果是calpain 切的话也勉强可以预测，
: 如果是被ER, golgi, lysosome那些乱七八糟的蛋白酶切的话就更难预测了（主要是数
: 据库没有建立起来）
p*p
10 楼
It seems the "cleavage" happens closer to the C-terminus.
I think alternative splicing of the mRNA is a more likely explanation of
your results. Run an RT-PCR to test it.
【在 m******5 的大作中提到】
: 在做一个蛋白，用N端tag或者anti N - peptide的抗体能看到两条等量的带，一条高一
: 些，一条低一些，用anti C terminal的抗体就只能看到高的那条带。 因此怀疑低的带
: 是cleavage产物，类似pro caspase 变成caspase的过程，请教有哪些常用生物信息软
: 件能找到cleavage识别位点？
I think alternative splicing of the mRNA is a more likely explanation of
your results. Run an RT-PCR to test it.
【在 m******5 的大作中提到】
: 在做一个蛋白，用N端tag或者anti N - peptide的抗体能看到两条等量的带，一条高一
: 些，一条低一些，用anti C terminal的抗体就只能看到高的那条带。 因此怀疑低的带
: 是cleavage产物，类似pro caspase 变成caspase的过程，请教有哪些常用生物信息软
: 件能找到cleavage识别位点？
b*r
11 楼
There is a systematic prediction website. Google it
f*e
12 楼
if it is a purified protein, try N-terminal sequecing if possible
【在 m******5 的大作中提到】
: 在做一个蛋白，用N端tag或者anti N - peptide的抗体能看到两条等量的带，一条高一
: 些，一条低一些，用anti C terminal的抗体就只能看到高的那条带。 因此怀疑低的带
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: 件能找到cleavage识别位点？
【在 m******5 的大作中提到】
: 在做一个蛋白，用N端tag或者anti N - peptide的抗体能看到两条等量的带，一条高一
: 些，一条低一些，用anti C terminal的抗体就只能看到高的那条带。 因此怀疑低的带
: 是cleavage产物，类似pro caspase 变成caspase的过程，请教有哪些常用生物信息软
: 件能找到cleavage识别位点？
m*2
13 楼
http://www.expasy.ch/
you'll find all the tools you need.
【在 m******5 的大作中提到】
: 在做一个蛋白，用N端tag或者anti N - peptide的抗体能看到两条等量的带，一条高一
: 些，一条低一些，用anti C terminal的抗体就只能看到高的那条带。 因此怀疑低的带
: 是cleavage产物，类似pro caspase 变成caspase的过程，请教有哪些常用生物信息软
: 件能找到cleavage识别位点？
you'll find all the tools you need.
【在 m******5 的大作中提到】
: 在做一个蛋白，用N端tag或者anti N - peptide的抗体能看到两条等量的带，一条高一
: 些，一条低一些，用anti C terminal的抗体就只能看到高的那条带。 因此怀疑低的带
: 是cleavage产物，类似pro caspase 变成caspase的过程，请教有哪些常用生物信息软
: 件能找到cleavage识别位点？
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