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请教TAP-Mass spect

请教TAP-Mass spect# Biology - 生物学

c*42012-04-16 07:04

1 楼

【以下文字转载自 RuralChina 讨论区】
发信人: cao4 (中英文不限), 信区: RuralChina
标题: 在这个世界活得最没人样的就是中国人了
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Apr 28 10:02:27 2012, 美东)
活得最二逼的也是中国人，
人家欧美强国，
活得那叫一个舒服，
非洲人
活得那叫一个自然。
中国人
傻逼
2逼
骚逼！

F*K2012-04-16 07:04

2 楼

用2步TAP然后打质谱找互作蛋白，除掉常见的contaminants，找到的大部分蛋白
peptide数都在1-2. 请问这个还有必要验证吗？一般经验peptide数要多大才可能是真
的互作蛋白？谢谢

t*y2012-04-16 07:04

3 楼

3个以上

M*72012-04-16 07:04

4 楼

这个好像是不一定的吧
首先需要你的peptide的p value要小，然后可以确定是这个序列就是真的，然后blast
回去蛋白，才可能是真的蛋白

【在 t******y 的大作中提到】

: 3个以上

K*S2012-04-16 07:04

5 楼

as long as the quality of MS2 is high, a peptide match is a peptide match.
But 1 peptide could be matched to different proteins.
if you have 2 or more high quality peptide match for that protein, it's
pretty confident. For those 1 peptide match proteins, you need blast search.

【在 F*K 的大作中提到】

: 用2步TAP然后打质谱找互作蛋白，除掉常见的contaminants，找到的大部分蛋白
: peptide数都在1-2. 请问这个还有必要验证吗？一般经验peptide数要多大才可能是真
: 的互作蛋白？谢谢