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求助:请牛人指点 Chip-Seq !!!
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求助:请牛人指点 Chip-Seq !!!# Biology - 生物学
h*t
1
我上次入境I94有效期被设定为护照有效期,因为这个日期比H1b的I797过期早。现在
EAD/AP 下来了,我还需要把I94的有效期改了么?
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I*9
2
【 以下文字转载自 LosAngeles 讨论区 】
发信人: winCA (飞翔), 信区: LosAngeles
标 题: 贱价处理英语学习机
关键字: 英语 ESL ENGLISH 书籍 学习 GRE ? >(关键字请用,,隔开,最多5个)
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e*m
3
要求比较稳定,最好要轻薄一点,外观好看一些~
价格随意~
多谢~
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d*8
4
用果蝇做model, 我找到一个transcriptional repressor在stem cell中有non-
autonomous effect, 在人里面报道过这个转录因子能抑制很多cytokines表达。 现在
我想用Chipseq找它在干细胞中的targets。 在果蝇里还没有报道过这个因子的已知的
binding region,只知道它的consensus elements跟人的是保守的。人里面已知的
targets可能在果蝇里不保守。 如果这种情况想做Chipseq,要怎么找一个control
binding region。跟我们合作的一个实验室说没有control region也能做但是风险很大
。非常感谢!!!!
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c*s
5
there is a new i-94 on your i797 approval notice
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s*n
6
yoga 13
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s*s
7
从果蝇里面取干细胞然后chip? 听上去很牛

【在 d*****8 的大作中提到】
: 用果蝇做model, 我找到一个transcriptional repressor在stem cell中有non-
: autonomous effect, 在人里面报道过这个转录因子能抑制很多cytokines表达。 现在
: 我想用Chipseq找它在干细胞中的targets。 在果蝇里还没有报道过这个因子的已知的
: binding region,只知道它的consensus elements跟人的是保守的。人里面已知的
: targets可能在果蝇里不保守。 如果这种情况想做Chipseq,要怎么找一个control
: binding region。跟我们合作的一个实验室说没有control region也能做但是风险很大
: 。非常感谢!!!!

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h*t
8
我的入境在h1b renew之后,所以最新的I94是入境的那个。打算去机场都走一趟,看能
不能把I94的有效期改了。
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D*y
9
MBA

【在 e**********m 的大作中提到】
: 要求比较稳定,最好要轻薄一点,外观好看一些~
: 价格随意~
: 多谢~

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d*8
10
现在没control很难开始。 我们在干细胞里表达GFP, 然后可以用FACS sorting 出GFP
+ cell。 但是这个population 总会有点污染。而且做Chip 的material 估计不够,
所以我们打算用组织做。

【在 s******s 的大作中提到】
: 从果蝇里面取干细胞然后chip? 听上去很牛
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z*o
11
还是改过来吧

【在 h***t 的大作中提到】
: 我的入境在h1b renew之后,所以最新的I94是入境的那个。打算去机场都走一趟,看能
: 不能把I94的有效期改了。

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k*n
13
看你能搞到多少细胞了,多的话,做个test chip, barcode,加到别人的lane里seq,
结果好就大规模做
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d*o
14
CBP wont change it. CBP only defer things that are considered to be mistakes
made by the boarder officers. there is treaty between US and China that
makes CBP officer give you I94 only valid 6 months prior to your passport
expiration date. you are luckly that they gave you the I94 expiration same
as yr passport one.
however, there is a provision rule called "245(k)" that allows an individual
to overstay their status for up to 180 days and still be allowed to file
for adjustment. in another word, if you file yr 485 case within 180 days
after your I94 expires, you are fine.
BTW, USCIS thinks I94 on yr H1b797 override the one CBP gave you. this is
not agreed by CBP.
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m*t
15
Sony Vaio Pro挺好,就是贵点。
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h*u
16
有没有可能先敲除然后用microarray 或RNA-seq确定target gene. 没做过果蝇, 不知
道难度有多大.不过话说你已经知道表型了, 应该作了敲除吧. 拿到target gene 以后
可以在其附近找motif作为可能的control binding region.
sort的细胞如果能到几十K, 也是可以做ChIP的, 当然要看这个TF binding的强弱了.
可以试试这个kit
http://www.activemotif.com/catalog/868.html

【在 d*****8 的大作中提到】
: 用果蝇做model, 我找到一个transcriptional repressor在stem cell中有non-
: autonomous effect, 在人里面报道过这个转录因子能抑制很多cytokines表达。 现在
: 我想用Chipseq找它在干细胞中的targets。 在果蝇里还没有报道过这个因子的已知的
: binding region,只知道它的consensus elements跟人的是保守的。人里面已知的
: targets可能在果蝇里不保守。 如果这种情况想做Chipseq,要怎么找一个control
: binding region。跟我们合作的一个实验室说没有control region也能做但是风险很大
: 。非常感谢!!!!

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h*t
17
哈,不知道这么多规定。跑了2趟IAD机场,终于赶上cbp开门,把新旧护照,I94, I797交上去,边防官收走了
I94,给了个新的,写上旧号码,有效期更新到跟I797一致。
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e*m
18
多谢以上各位的回答~~~

【在 m****t 的大作中提到】
: Sony Vaio Pro挺好,就是贵点。
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d*8
19
谢谢你的建议, 我们有knockout的line,有想过在干细胞中做RNAi和overexpression
的然后sorting做RNAseq,但是老板说可能结果不是很特异,所以sample现在还放着没
做。主要是干细胞太少,做sorting还会损失一些。这个TF的binding应该很强,我们有
做BAC的GFP-tag看到核内有很强的信号。现在想可能还是要RNAseq入手先找可能的
target做control。

【在 h***u 的大作中提到】
: 有没有可能先敲除然后用microarray 或RNA-seq确定target gene. 没做过果蝇, 不知
: 道难度有多大.不过话说你已经知道表型了, 应该作了敲除吧. 拿到target gene 以后
: 可以在其附近找motif作为可能的control binding region.
: sort的细胞如果能到几十K, 也是可以做ChIP的, 当然要看这个TF binding的强弱了.
: 可以试试这个kit
: http://www.activemotif.com/catalog/868.html

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d*a
20
电池使用时间不对吧,大概是用了外接电池。
Laptopmag的测试,Sony pro 13只有MBA 13的一半。
当然,它六七个小时使用时间,对大多数人来说足够了。

【在 y*****0 的大作中提到】
: http://www.mitbbs.com/article_t0/PDA/32178907.html
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d*8
21
能拿到10k左右的细胞。这个应该不会花太多钱,估计值得一试。谢谢啦!!!

【在 k*****n 的大作中提到】
: 看你能搞到多少细胞了,多的话,做个test chip, barcode,加到别人的lane里seq,
: 结果好就大规模做

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w*u
22
sony pro 13 要是能到1000以内就好了
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d*8
23
用果蝇做model, 我找到一个transcriptional repressor在stem cell中有non-
autonomous effect, 在人里面报道过这个转录因子能抑制很多cytokines表达。 现在
我想用Chipseq找它在干细胞中的targets。 在果蝇里还没有报道过这个因子的已知的
binding region,只知道它的consensus elements跟人的是保守的。人里面已知的
targets可能在果蝇里不保守。 如果这种情况想做Chipseq,要怎么找一个control
binding region。跟我们合作的一个实验室说没有control region也能做但是风险很大
。非常感谢!!!!
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y*0
24
评测很多,不知道那个是准的。
我查了一下电池重量,得到这个,
With the optional sheet battery ($149) attached, the Pro 11 lasted an
astounding 14 hours and 32 minutes. Just keep in mind that this slice makes
the design of the system look awkward and brings the weight to 2.5 pounds.
电池大概0.6 pound。如果需要pro 13加附加电池,2.3 + 0.6 = 2.9 pound。

【在 d***a 的大作中提到】
: 电池使用时间不对吧,大概是用了外接电池。
: Laptopmag的测试,Sony pro 13只有MBA 13的一半。
: 当然,它六七个小时使用时间,对大多数人来说足够了。

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s*s
25
从果蝇里面取干细胞然后chip? 听上去很牛

【在 d*****8 的大作中提到】
: 用果蝇做model, 我找到一个transcriptional repressor在stem cell中有non-
: autonomous effect, 在人里面报道过这个转录因子能抑制很多cytokines表达。 现在
: 我想用Chipseq找它在干细胞中的targets。 在果蝇里还没有报道过这个因子的已知的
: binding region,只知道它的consensus elements跟人的是保守的。人里面已知的
: targets可能在果蝇里不保守。 如果这种情况想做Chipseq,要怎么找一个control
: binding region。跟我们合作的一个实验室说没有control region也能做但是风险很大
: 。非常感谢!!!!

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d*a
26
Sony Pro 13的10个小时,有可能是加了sheet电池后用了耗电量大的方法测的。
Laptop Magazine的测试,Pro 13是7小时20分钟,MBA 13是11小时20分钟。MBA 13的电
池要大一些,Pro 13的电池是37Wh,MBA 13的电池是54Wh。
话说PCMag的测试,MBA 13居然有15个半小时...

makes

【在 y*****0 的大作中提到】
: 评测很多,不知道那个是准的。
: 我查了一下电池重量,得到这个,
: With the optional sheet battery ($149) attached, the Pro 11 lasted an
: astounding 14 hours and 32 minutes. Just keep in mind that this slice makes
: the design of the system look awkward and brings the weight to 2.5 pounds.
: 电池大概0.6 pound。如果需要pro 13加附加电池,2.3 + 0.6 = 2.9 pound。

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d*8
27
现在没control很难开始。 我们在干细胞里表达GFP, 然后可以用FACS sorting 出GFP
+ cell。 但是这个population 总会有点污染。而且做Chip 的material 估计不够,
所以我们打算用组织做。

【在 s******s 的大作中提到】
: 从果蝇里面取干细胞然后chip? 听上去很牛
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T*n
28
pro 13 2.34磅,air 13大概3磅
pro 加sheet battery也比air轻

【在 d***a 的大作中提到】
: Sony Pro 13的10个小时,有可能是加了sheet电池后用了耗电量大的方法测的。
: Laptop Magazine的测试,Pro 13是7小时20分钟,MBA 13是11小时20分钟。MBA 13的电
: 池要大一些,Pro 13的电池是37Wh,MBA 13的电池是54Wh。
: 话说PCMag的测试,MBA 13居然有15个半小时...
:
: makes

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k*n
29
看你能搞到多少细胞了,多的话,做个test chip, barcode,加到别人的lane里seq,
结果好就大规模做
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y*0
30
不加电池放视频6.5小时,正常使用8小时吧。
http://www.cnet.com/laptops/sony-vaio-pro-13/4505-3121_7-357810
pro 13加电池应该和MBA差不多,肯定超过10小时,重量一样。
The carbon-fiber-constructed Pro 13 weighs only 2.34 pounds; it's 2.9 pounds
with its power supply, which is as much as the 13-inch MacBook Air weighs
on its own.
希望以后有更多的本。rmba两年之内不太可能,苹果赶快推haswell的rmbp,别等dell
,hp都反应过来了。

【在 d***a 的大作中提到】
: Sony Pro 13的10个小时,有可能是加了sheet电池后用了耗电量大的方法测的。
: Laptop Magazine的测试,Pro 13是7小时20分钟,MBA 13是11小时20分钟。MBA 13的电
: 池要大一些,Pro 13的电池是37Wh,MBA 13的电池是54Wh。
: 话说PCMag的测试,MBA 13居然有15个半小时...
:
: makes

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h*u
31
有没有可能先敲除然后用microarray 或RNA-seq确定target gene. 没做过果蝇, 不知
道难度有多大.不过话说你已经知道表型了, 应该作了敲除吧. 拿到target gene 以后
可以在其附近找motif作为可能的control binding region.
sort的细胞如果能到几十K, 也是可以做ChIP的, 当然要看这个TF binding的强弱了.
可以试试这个kit
http://www.activemotif.com/catalog/868.html

【在 d*****8 的大作中提到】
: 用果蝇做model, 我找到一个transcriptional repressor在stem cell中有non-
: autonomous effect, 在人里面报道过这个转录因子能抑制很多cytokines表达。 现在
: 我想用Chipseq找它在干细胞中的targets。 在果蝇里还没有报道过这个因子的已知的
: binding region,只知道它的consensus elements跟人的是保守的。人里面已知的
: targets可能在果蝇里不保守。 如果这种情况想做Chipseq,要怎么找一个control
: binding region。跟我们合作的一个实验室说没有control region也能做但是风险很大
: 。非常感谢!!!!

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t*t
32
看新的Z系列如何了,或者就没有Z系列了。

【在 m****t 的大作中提到】
: Sony Vaio Pro挺好,就是贵点。
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d*8
33
谢谢你的建议, 我们有knockout的line,有想过在干细胞中做RNAi和overexpression
的然后sorting做RNAseq,但是老板说可能结果不是很特异,所以sample现在还放着没
做。主要是干细胞太少,做sorting还会损失一些。这个TF的binding应该很强,我们有
做BAC的GFP-tag看到核内有很强的信号。现在想可能还是要RNAseq入手先找可能的
target做control。

【在 h***u 的大作中提到】
: 有没有可能先敲除然后用microarray 或RNA-seq确定target gene. 没做过果蝇, 不知
: 道难度有多大.不过话说你已经知道表型了, 应该作了敲除吧. 拿到target gene 以后
: 可以在其附近找motif作为可能的control binding region.
: sort的细胞如果能到几十K, 也是可以做ChIP的, 当然要看这个TF binding的强弱了.
: 可以试试这个kit
: http://www.activemotif.com/catalog/868.html

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d*a
34
从设计上说,我觉得Sony应该把Pro 13的内部电池加大,保证正常使用有10
个小时,重量可以加大到2.6-2.7磅(那样也很轻),这比用外接电池更合理。
Sony一直有做轻薄笔记本的传统,有时在轻薄上推过头了...可能是因为
日本国内市场的原因吧。用碳纤维是不错的。

pounds
dell

【在 y*****0 的大作中提到】
: 不加电池放视频6.5小时,正常使用8小时吧。
: http://www.cnet.com/laptops/sony-vaio-pro-13/4505-3121_7-357810
: pro 13加电池应该和MBA差不多,肯定超过10小时,重量一样。
: The carbon-fiber-constructed Pro 13 weighs only 2.34 pounds; it's 2.9 pounds
: with its power supply, which is as much as the 13-inch MacBook Air weighs
: on its own.
: 希望以后有更多的本。rmba两年之内不太可能,苹果赶快推haswell的rmbp,别等dell
: ,hp都反应过来了。

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d*8
35
能拿到10k左右的细胞。这个应该不会花太多钱,估计值得一试。谢谢啦!!!

【在 k*****n 的大作中提到】
: 看你能搞到多少细胞了,多的话,做个test chip, barcode,加到别人的lane里seq,
: 结果好就大规模做

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m*5
36
楼主问题解决了么?i'm also doing chip seq without control region so I would
really appreciate it a lot if you share with me your solution.

【在 d*****8 的大作中提到】
: 用果蝇做model, 我找到一个transcriptional repressor在stem cell中有non-
: autonomous effect, 在人里面报道过这个转录因子能抑制很多cytokines表达。 现在
: 我想用Chipseq找它在干细胞中的targets。 在果蝇里还没有报道过这个因子的已知的
: binding region,只知道它的consensus elements跟人的是保守的。人里面已知的
: targets可能在果蝇里不保守。 如果这种情况想做Chipseq,要怎么找一个control
: binding region。跟我们合作的一个实验室说没有control region也能做但是风险很大
: 。非常感谢!!!!

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