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Transcription factor, Promoter分析软件

Transcription factor, Promoter分析软件# Biology - 生物学

S*n2013-02-06 08:02

1 楼

李刚（1922—2001年）1922年生，陕西三原人。中国人民武装警察部队原司令员。
1938年进入延安抗大学习。次年加入中国共产党。
曾任八路军一一五师团政治处干事，新四军第三师营教导员，东北军区营长、团参谋长
，第四野战军副团长。
1950年参加抗美援朝，任中国人民志愿军团长、师参谋长、副师长。回国后，任师长。
1959年毕业于苏联伏罗希洛夫总参军事学院。后历任总参谋部军训部处长，北京卫戍区
参谋长、副司令员，中国人民武装警察部队司令员、顾问。
2001年9月20日，因病医治无效，在北京逝世，享年79岁

p*m2013-02-06 08:02

2 楼

每次要启动好几次才能进系统有时还要repair。还好免费退了。以后是不敢再碰了
还好不是联想哪里买的听说他们那里的以后要收restocking了

b*u2013-02-06 08:02

3 楼

End of May with price tag of $299.99 and $35 plan. , decide to go that route
due to overall cost. Better than TM for me due to signal coverage.
Btw, any one wants LG Optimus with $25 plan? How much is the market value
now?
★ 发自iPhone App: ChineseWeb - 中文网站浏览器

l*e2013-02-06 08:02

4 楼

打算做ChIP，然后PCR目标基因的promoter区域。哪里有比较可靠的软件（不花钱网络
的就行）大致分析一下TF的结合部位？完全没做过，老板一句话就让做，他自己也不懂
。还有ChIP谁有优化过的protocol，重要环节在哪步？先谢了。

p*m2013-02-06 08:02

5 楼

google太牛了才发了一分钟就狗出来了

c*32013-02-06 08:02

6 楼

很多软件，bioconductor里面有不少package处理chipseq，ChIPseeqer
或者你用encode里面得方法也行，我最近在处理chipseq数据
你先做试验吧，有数据了你问我，我告诉你具体怎么用，用哪个

y*x2013-02-06 08:02

7 楼

听起来好像是系统问题啊。每次买回来电脑都自己重装系统的飘过。。。

【在 p*******m 的大作中提到】

: 每次要启动好几次才能进系统有时还要repair。还好免费退了。以后是不敢再碰了
: 还好不是联想哪里买的听说他们那里的以后要收restocking了

l*e2013-02-06 08:02

8 楼

多谢啊。
我是想做ChIP-PCR，想先预测一下TF的结合位置，然后上下游选几个不同的区域PCR一
下，能P出来就胜利了。但是不知道从哪里选择PCR位点，上下5000bp这范围也太大了啊。

【在 c***3 的大作中提到】

: 很多软件，bioconductor里面有不少package处理chipseq，ChIPseeqer
: 或者你用encode里面得方法也行，我最近在处理chipseq数据
: 你先做试验吧，有数据了你问我，我告诉你具体怎么用，用哪个

b*t2013-02-06 08:02

9 楼

是的，Lenovo refurbish极端不靠谱

【在 p*******m 的大作中提到】

: 每次要启动好几次才能进系统有时还要repair。还好免费退了。以后是不敢再碰了
: 还好不是联想哪里买的听说他们那里的以后要收restocking了

k*n2013-02-06 08:02

10 楼

查查别人的pol ii 或者tbp chip－seq data

p*m2013-02-06 08:02

11 楼

问题是重装了还是一样的：）每次买回来电脑先换个硬盘的飘过

【在 y***x 的大作中提到】

: 听起来好像是系统问题啊。每次买回来电脑都自己重装系统的飘过。。。

l*12013-02-06 08:02

12 楼

RE LZ
plus
HTTP: //pages.cs.wisc.edu/~kliang/DBChIP/DBChIP.pdf
HTTP: //www.sunduzkeles.org/software
HTTP: //www.biostat.wisc.edu/People/faculty/keles.htm

啊。

【在 l*******e 的大作中提到】

: 多谢啊。
: 我是想做ChIP-PCR，想先预测一下TF的结合位置，然后上下游选几个不同的区域PCR一
: 下，能P出来就胜利了。但是不知道从哪里选择PCR位点，上下5000bp这范围也太大了啊。