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一个条件性细胞剔除模式小鼠
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一个条件性细胞剔除模式小鼠# Biology - 生物学
C*4
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一个条件性细胞剔除模式小鼠的诞生 (2013-02-22 18:10:22)转载▼
标签: talen 创业 大鼠基因敲除 基因敲除 杂谈 分类: 个人随笔
对于基因敲除(gene knockout)小鼠大家并不陌生,比如我们想要研究一个基因
在体内的功能,我们就可以把这个基因从小鼠体内敲除掉。而有的时候我们除了关心一
个基因的功能外,还想知道表达这个基因的细胞在体内是干嘛的。比如,我们想知道B
细胞是干什么的,胰岛细胞是干什么的?我们可以从小鼠体内把这些细胞清除掉(也叫
细胞剔除,cell depletion),一看不能产生新抗体了,或是胰岛素没了,血糖升高器
官衰竭了,我们就可以恍然大悟说:“你看,胰岛细胞是产生胰岛素的,B细胞是产生
抗体的”。然后就可以发文章到CNS(Cell, Nature, Science)了。当然这些都被别人
发现过了,是我们没有赶上好时代呀。
那怎样才能在体内把一群细胞清除掉呢?方法可能很多,但也真不多。这里我讲一
个非常简单的方法,就是白喉毒素介导的细胞剔除。白喉毒素(Diphtheria toxin, 简
称DT)大家可能知道,很多小孩子得过白喉blabla。DT这东西通过跟细胞表面一种叫白
喉毒素受体(DT receptor,简称DTR)的蛋白结合,然后这个毒素就被带进了细胞内,
再然后就通过据说是抑制蛋白合成还是什么机制把细胞废掉。但这种DTR只在灵长类(
比如人呀,猴呀)有,小鼠等啮齿类动物没有。也就是说你给小鼠注射一大堆DT进去,
小鼠也依然安然无恙。所以就有聪明人想,可以让小鼠某些细胞表达DTR,然后给小鼠
注射一针DT就可以把这种有DTR的细胞干掉,也就是我题目讲的细胞清除。如果在给DTR
加一个标签(EGFP),这样还可以看看到底哪个细胞绿了(EGFP),再给小鼠肚子上来
一针DT,piapia,绿细胞不见了。多神奇呀。这种方法最早是被用来剔除树突状细胞(
dendritic cells, 简称DC)(2002年)。Jung等将DTR-EGFP这个融合蛋白放在DC细胞
特异分子CD11c启动子控制之下,做了一个转基因小鼠。注射一针DT之后,DC真的不见
了。然后发在了一个叫Immunity的杂志上。这样后来人就用它来研究DC细胞在体内do
what啦。后来这个DTR-EGFP融合蛋白基因又被用来剔除巨噬细胞(CD11b)(Duffield
JS),Lgr5肿瘤干细胞(如果真有的话)(Tian H, et al)和调节性T细胞(FoxP3)(
Rudensky A. et al.)。关于这个剔除调节性T细胞。想当年我也做了这个FoxP3-DTR-
EGFP,做出来比Rudensky实验室还早呢,但是愣是被他们先发了,从此也奠定了我彻底
离开学术界的不归路。
为了使这个DTR用途更广,有人把它放在了Rosa26启动子下(Buch T, et al.),
叫Rosa-iDTR小鼠。其实是在Rosa26启动子跟DTR之间放了一个loxP-STOP-loxP(Rosa26
-loxP-STOP-loxP-DTR)。正常情况下,这个小鼠里哪个细胞都不会表达DTR,因为在
Rosa26启动子和DTR之间有一个大大的”STOP”,Rosa26启动子够不到DTR。可是当这个
小鼠跟Cre小鼠结婚生子之后,小鼠仔们哪个细胞有Cre,哪个细胞就会有DTR,因为Cre
这把剪刀把“STOP”移走了,这样Rosa26启动子就够到了DTR(Rosa26-loxP-DTR)。这
个时候再给小鼠DT,DT杀哪个细胞就完全看Cre在哪个细胞了。
我自己是学免疫的。尽管有人可能不同意,我自个儿还是觉得免疫学的核心问题是
一种将“免疫记忆”的东西。比如天花,人接种之后一辈子也不再得了。而有些疫苗接
种之后几个月就不保护了;更有甚这有些家伙根本引不起免疫记忆,当然也不可能用它
来做疫苗了。尽管免疫学研究已经有上百年的历史了,但直到现在我们对于免疫记忆的
起始、维持和消亡的分子机制也很不了解。当然也有人说自己特别了解的,就像很多神
父说了解圣经里的每一句话。但当你问他蛇在引诱夏娃吃那个水果之前是怎么走路的时
候,他可能真不知道。 如果了解了免疫记忆的机制,就可以更好地设计疫苗,增强人
民体质,进而保家卫国。我在读博士的时候就对这个大课题特别感兴趣,然后做博士后
开始研究模式动物,觉得可以对免疫记忆做些研究了,当然最后我不成功。当时还没有
rosa-iDTR(这个小鼠没有EGFP)的时候我就想,如果我做一个Rosa-iDTR-EGFP小鼠,
然后做无数的Cre小鼠,这样我就可以把细胞一群一群的杀死,就可以知道哪些细胞对
免疫记忆有帮助。举个例子吧,假如说表达IL-6的细胞跟免疫记忆有关系,那我可以做
一个IL6-Cre小鼠,然后跟Rosa-iDTR-EGFP小鼠交配。得到的小鼠先用病毒感染一次,
这个时候只要是曾经表达过IL-6的细胞都是绿色的,并且都带有了DTR。这样我可以把
EGFP阳性的细胞分离出来,转到另一只小鼠里,看是不是可以把免疫记忆带过去。或是
在第二次病毒感染之前,先给小鼠来一针DT,这样只要是曾经表达过IL-6的细胞就都被
干掉了,然后再看是不是把免疫记忆也顺带给干掉了。如果结果真是这样,至少可以说
明表达IL-6的细胞跟免疫记忆有关,咱再往下研究就是了。哇塞,那个时候我发财了,
至少发一篇超过15分的文章有可能吧。当然恰好是IL-6的可能性不是很大。但我可以把
所有的细胞因子全做成cre小鼠呀,是不是成功的可能性就大起来了呢?很可惜我的博
士后生涯结束了,做一个小公司,也可以把这个做出来呀。
公司一旦能够开始做基因敲除小鼠了,我就想终于可以开始把这个模型做出来了。
下面就是设计思考怎么做了。通过我自己的经验和发表的文章,这个DTR-EGFP融合蛋白
信号特别弱。如果比较一下CD11c-EYFP跟CD11c-DTR-EGFP; 或是FoxP3-EGFP和FoxP3-
DTR-EGFP,信号强度简直是一个天上一个地下。说明这个DTR和EGFP互相处不好。所以
我就想对这个做一个改造,把DTR-EGFP融合蛋白做成DTR-2A-EGFP,这样这俩哥们一起
被表达出来,但表达完就分开了,互不干扰。这个时候就可以把DTR-2A-EGFP放在
rosa26位置了。且慢,还不行。因为Rosa26启动子太弱了,即使是用EYFP单基因,阳性
跟阴性也只有不到一个log的区别。把DTR-2A-EGFP放那里,谁知道是不是能够看到EGFP
信号呀。所以我们想可以放一个强启动子,于是我们选择了pCAG启动子,这家伙不但动
力强劲,而且是放哪儿都混不吝。也就是文言文里说的ubiquitous。这样就开始做一个
叫做pCAG-loxP-STOP-loxP-DTR-2A-EGFP的工具鼠。 我得意呀,觉得可以找一批人做免
疫记忆了。但我们的投资人给了我当头棒喝,说不能把公司做成研究所。做公司了还老
想着科研,简直就是婚姻里找小三儿,必须坚决悔改,主要是改。也就是做公司必须以
盈利为目的。我绝望了一阵,然后想,既然不让我自己做,我也可以给别人呀。他们发
文章,然后说老鼠是我们这里来的,说不定谁还把我名字挂在他们文章里,也挺美的呀。
去年9月这个小鼠出来了,先把种群扩起来,从一个到几十个。然后就想得到的小
鼠跟我预期的是不是一回事儿?于是我们把它跟一个免疫细胞特异基因(CD19)的cre
小鼠交配,年前得到了一只CD19Cre/Rosa-iDTRGFP小鼠。因为只有珍贵的一只,所以先
采血看看是不是有GFP信号。答案是有,还不错(Fig 1a)。至少是目前为止看到的DTR
-EGFP中信号最好的。下面就是要看DT是不是可以把这群EGFP细胞给杀死。只有一只小
鼠,也没有对照,咱也不能直接一针进去,还没有个重复。所以我们就把这个小鼠的脾
脏个取出来,然后把它的所有细胞洗吧洗吧再转到另外几只小鼠之中,这个时候再注射
DT。24小时候,采点血看看见分晓了。没有注射DT的小鼠,EGFP阳性细胞还在;注射DT
的小鼠呢,EGFP阳性细胞不见了(Fig 1b)。说明这个小鼠是成功的。
那这个工具鼠怎么用呢?海了去了。我列几个我自己感兴趣的。
比如我想研究I型糖尿病,我就可以把这个小鼠跟胰岛细胞特异的Cre小鼠交配,然
后所有胰岛细胞都是绿的。然后注射DT就可以让beta细胞仙去,这个小鼠都没有胰岛素
了,就得了糖尿病,当然这个是非常干净的I型糖尿病模型。刚出的973项目有个课题是
研究I型糖尿病引起的继发性器官衰竭机制和干预的,这是一个多好的模型呀。比用STZ
诱导干净多了。 当然我们是公司,没有资格申请这种高水平的国家大课题。现在细胞
治疗很火。如果想做胰岛细胞移植治疗,研究者最担心的就是受体鼠本身beta细胞去不
干净,还会再生。你把自己用ES/iPS好不容易分化出来的beta细胞打进去,检测胰岛素
,不知道是自己打进去的beta细胞产生的呢,还是受体小鼠自身当初没有杀干净的beta
细胞产生的。多影响情绪呀。如果用我们这个小鼠,你把自己的细胞漂红,小鼠的细胞
是绿的,直接就可以用眼看。最不济还可以不断注射DT,让小鼠自己没有产生新胰岛细
胞的机会。如果把这个小鼠跟NSG小鼠交配,说不定就可以直接研究从人iPS来的beta细
胞的功能应用了,这是不是可以更快地上临床呢?
还有人想研究肝脏再生机制的。可以把这个小鼠跟albumin-cre小鼠交配,让所有
肝细胞都变绿带DTR。再通过不同剂量的DT来杀死肝细胞,研究肝损伤多好呀。如果是
NSG背景,不用做手术就可以做人鼠嵌合肝移植了。对药物研究多有贡献呀。
这个用途很广,想杀谁杀谁,完全看你不喜欢哪个细胞。管你是神经、癌症、心脏
、肺脏的。当然还有我最欣赏的免疫细胞。如果有人想做免疫记忆的话,这个工具鼠就
是真正找到了归宿。

现在种群不是很大,只有几十只,先给老客户,然后给不是客户的客户。我相信今
后会有成百上千的文章是用这个小鼠做出来的。
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C*4
2
作者同意转的。
原文 http://blog.sina.com.cn/s/blog_a82125c301016p0u.html
我想也许有人需要这种老鼠吧,供参考。
公司老总沈月雷说对国内客户只要签MTA,不收费用。对欧美日等西方科研客户,目前
是8800美元执照费用。因为小鼠在国家啮齿类资源中心,他们会收点饲养,检测和运输
费用。现在小鼠只有六、七十只,而排队等的有上百家实验室,所以会先给现在的客户
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b*n
3
ROSA-DTA付个百来块钱就可以了,只是没有GFP报告而已。
顺车问一下:如何保证毒素只特异性地杀死自身细胞,而不会在凋亡的时候泄露影响周
围的细胞?

B

【在 C********4 的大作中提到】
: 一个条件性细胞剔除模式小鼠的诞生 (2013-02-22 18:10:22)转载▼
: 标签: talen 创业 大鼠基因敲除 基因敲除 杂谈 分类: 个人随笔
: 对于基因敲除(gene knockout)小鼠大家并不陌生,比如我们想要研究一个基因
: 在体内的功能,我们就可以把这个基因从小鼠体内敲除掉。而有的时候我们除了关心一
: 个基因的功能外,还想知道表达这个基因的细胞在体内是干嘛的。比如,我们想知道B
: 细胞是干什么的,胰岛细胞是干什么的?我们可以从小鼠体内把这些细胞清除掉(也叫
: 细胞剔除,cell depletion),一看不能产生新抗体了,或是胰岛素没了,血糖升高器
: 官衰竭了,我们就可以恍然大悟说:“你看,胰岛细胞是产生胰岛素的,B细胞是产生
: 抗体的”。然后就可以发文章到CNS(Cell, Nature, Science)了。当然这些都被别人
: 发现过了,是我们没有赶上好时代呀。

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C*4
4
1)DT注射到体内的量很少,一个细胞分不到多少DT; 2) DT有两个亚基A和B,B负责跟
受体结合进细胞,并在endosome/lysosome里降解,A进cytosol里搞破坏。即使A流出来
,没有B也进不了别的细胞。3)现在打靶载体上都带DTA做阴性筛选,从来没有见到DTA
从被杀死细胞流出来影响别的细胞。
再有就是这个方法已经应用了超过10年,没有遇到过问题。做这个改进主要是两个目的
: 1)提高细胞剔除效率: A)用强启动子,使DTR表达水平提高;2)加EGFP使细胞可以
被追踪又可以随时被清除,比如我们想观察某群细胞被杀死之后的再生情况。

【在 b*****n 的大作中提到】
: ROSA-DTA付个百来块钱就可以了,只是没有GFP报告而已。
: 顺车问一下:如何保证毒素只特异性地杀死自身细胞,而不会在凋亡的时候泄露影响周
: 围的细胞?
:
: B

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s*r
5
Rosa启动子有什么问题,难道会弱到很多细胞都能survive?

DTA

【在 C********4 的大作中提到】
: 1)DT注射到体内的量很少,一个细胞分不到多少DT; 2) DT有两个亚基A和B,B负责跟
: 受体结合进细胞,并在endosome/lysosome里降解,A进cytosol里搞破坏。即使A流出来
: ,没有B也进不了别的细胞。3)现在打靶载体上都带DTA做阴性筛选,从来没有见到DTA
: 从被杀死细胞流出来影响别的细胞。
: 再有就是这个方法已经应用了超过10年,没有遇到过问题。做这个改进主要是两个目的
: : 1)提高细胞剔除效率: A)用强启动子,使DTR表达水平提高;2)加EGFP使细胞可以
: 被追踪又可以随时被清除,比如我们想观察某群细胞被杀死之后的再生情况。

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C*2
6
http://jaxmice.jax.org/strain/006331.html
STOCK Gt(ROSA)26Sortm1(DTA)
这个老鼠也是以Cre调节性表达dta,不是DTR。这个系统不用feed DT, 似乎更简洁?
能说说你贴的这个方法与已有的系统(比如jax的这个小鼠)的优点吗?

DTA

【在 C********4 的大作中提到】
: 1)DT注射到体内的量很少,一个细胞分不到多少DT; 2) DT有两个亚基A和B,B负责跟
: 受体结合进细胞,并在endosome/lysosome里降解,A进cytosol里搞破坏。即使A流出来
: ,没有B也进不了别的细胞。3)现在打靶载体上都带DTA做阴性筛选,从来没有见到DTA
: 从被杀死细胞流出来影响别的细胞。
: 再有就是这个方法已经应用了超过10年,没有遇到过问题。做这个改进主要是两个目的
: : 1)提高细胞剔除效率: A)用强启动子,使DTR表达水平提高;2)加EGFP使细胞可以
: 被追踪又可以随时被清除,比如我们想观察某群细胞被杀死之后的再生情况。

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C*2
7
说到小鼠的模型,最近的一篇文章在ROSA26位点做了很好的一个构建方案,也可以说
是比较复杂,感兴趣的可以读一读:http://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(13)00023-5, The ROSA26-iPSC Mouse: A Conditional, Inducible, and Exchangeable Resource for Studying Cellular (De)Differentiation。
虽然技术上是集大成,但是重编程的效率没有原来的方法高,也许是在某些特定的
条件下能够比较巧妙地回答一些科学问题,或者模型。

B

【在 C********4 的大作中提到】
: 一个条件性细胞剔除模式小鼠的诞生 (2013-02-22 18:10:22)转载▼
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: 对于基因敲除(gene knockout)小鼠大家并不陌生,比如我们想要研究一个基因
: 在体内的功能,我们就可以把这个基因从小鼠体内敲除掉。而有的时候我们除了关心一
: 个基因的功能外,还想知道表达这个基因的细胞在体内是干嘛的。比如,我们想知道B
: 细胞是干什么的,胰岛细胞是干什么的?我们可以从小鼠体内把这些细胞清除掉(也叫
: 细胞剔除,cell depletion),一看不能产生新抗体了,或是胰岛素没了,血糖升高器
: 官衰竭了,我们就可以恍然大悟说:“你看,胰岛细胞是产生胰岛素的,B细胞是产生
: 抗体的”。然后就可以发文章到CNS(Cell, Nature, Science)了。当然这些都被别人
: 发现过了,是我们没有赶上好时代呀。

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b*e
8
这个估计楼上有几位根本就没看懂或根本没仔细看。常做动物实验的肯定就能明白区别
。说rosa-GFP-dta鼠,这个小鼠一出生全身是绿的。用Cre后去掉GFP, Dta表达,细胞
直接死掉。楼主这个小鼠是有Cre的细胞才表达GFP, 但细胞不会死。只有给DT这些细胞
才死。至于rosa启动子,LZ说了设计的时候是为了跟踪DTR阳性细胞。什么时间说rosa
能够survive了?我们实验室有很多cre鼠,我觉得这是非常有用的一个,至少在某些方
面比楼上提到的几个有优势。

B

【在 C********4 的大作中提到】
: 一个条件性细胞剔除模式小鼠的诞生 (2013-02-22 18:10:22)转载▼
: 标签: talen 创业 大鼠基因敲除 基因敲除 杂谈 分类: 个人随笔
: 对于基因敲除(gene knockout)小鼠大家并不陌生,比如我们想要研究一个基因
: 在体内的功能,我们就可以把这个基因从小鼠体内敲除掉。而有的时候我们除了关心一
: 个基因的功能外,还想知道表达这个基因的细胞在体内是干嘛的。比如,我们想知道B
: 细胞是干什么的,胰岛细胞是干什么的?我们可以从小鼠体内把这些细胞清除掉(也叫
: 细胞剔除,cell depletion),一看不能产生新抗体了,或是胰岛素没了,血糖升高器
: 官衰竭了,我们就可以恍然大悟说:“你看,胰岛细胞是产生胰岛素的,B细胞是产生
: 抗体的”。然后就可以发文章到CNS(Cell, Nature, Science)了。当然这些都被别人
: 发现过了,是我们没有赶上好时代呀。

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C*2
9
帖子中说的方案是一种情况; 还有其它更为简便的方法来实现.

rosa

【在 b********e 的大作中提到】
: 这个估计楼上有几位根本就没看懂或根本没仔细看。常做动物实验的肯定就能明白区别
: 。说rosa-GFP-dta鼠,这个小鼠一出生全身是绿的。用Cre后去掉GFP, Dta表达,细胞
: 直接死掉。楼主这个小鼠是有Cre的细胞才表达GFP, 但细胞不会死。只有给DT这些细胞
: 才死。至于rosa启动子,LZ说了设计的时候是为了跟踪DTR阳性细胞。什么时间说rosa
: 能够survive了?我们实验室有很多cre鼠,我觉得这是非常有用的一个,至少在某些方
: 面比楼上提到的几个有优势。
:
: B

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b*e
10
肯定还会有更好的方案。有实验室专门硏究新方法新技术。但人家做的新小鼠要起来并
不容易。如果手上有些cre鼠,拿楼主的工具鼠马上就能回答一些问题,何乐而不为?
但我觉得LZ这鼠运到美国可能没那么容易。
楼主写得很科普,我倒觉得他做事很严谨的,逻辑很不错。文中提到的设计中的考虑对
这版上很多新人还是很有帮助的。唯一就是有广告嫌疑可能会很快被删除。

【在 C***2 的大作中提到】
: 帖子中说的方案是一种情况; 还有其它更为简便的方法来实现.
:
: rosa

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J*3
11
这个文章有矛盾哈!
文章第5段有如下内容:“且慢,还不行。因为Rosa26启动子太弱了,即使是用EYFP单
基因,阳性跟阴性也只有不到一个log的区别。把DTR-2A-EGFP放那里,谁知道是不是能
够看到EGFP信号呀。所以我们想可以放一个强启动子,于是我们选择了pCAG启动子,这
家伙不但动力强劲,而且是放哪儿都混不吝。也就是文言文里说的ubiquitous。这样就
开始做一个叫做pCAG-loxP-STOP-loxP-DTR-2A-EGFP的工具鼠。”
说的Rosa26启动子太弱了,所以做了pCAG-loxP-STOP-loxP-DTR-2A-EGFP的工具鼠!
可是第6段如下:
“于是我们把它跟一个免疫细胞特异基因(CD19)的cre小鼠交配,年前得到了一只
CD19Cre/Rosa-iDTRGFP小鼠。”
这一句显示并没有用到动力强劲pCAG-loxP-STOP-loxP-DTR-2A-EGFP的工具鼠,明明是
用的启动子太弱的Rosa26-loxP-STOP-loxP-DTR-2A-EGFP工具鼠,呵呵。
自相矛盾啊!
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s*y
12
还是很有意思的。比方说可以搞一个chimera 老鼠,然后在某个时间注射一针这个毒素
把某些特定的细胞杀死,看看会出现什么效果,等等,还是很有意思的。

B

【在 C********4 的大作中提到】
: 一个条件性细胞剔除模式小鼠的诞生 (2013-02-22 18:10:22)转载▼
: 标签: talen 创业 大鼠基因敲除 基因敲除 杂谈 分类: 个人随笔
: 对于基因敲除(gene knockout)小鼠大家并不陌生,比如我们想要研究一个基因
: 在体内的功能,我们就可以把这个基因从小鼠体内敲除掉。而有的时候我们除了关心一
: 个基因的功能外,还想知道表达这个基因的细胞在体内是干嘛的。比如,我们想知道B
: 细胞是干什么的,胰岛细胞是干什么的?我们可以从小鼠体内把这些细胞清除掉(也叫
: 细胞剔除,cell depletion),一看不能产生新抗体了,或是胰岛素没了,血糖升高器
: 官衰竭了,我们就可以恍然大悟说:“你看,胰岛细胞是产生胰岛素的,B细胞是产生
: 抗体的”。然后就可以发文章到CNS(Cell, Nature, Science)了。当然这些都被别人
: 发现过了,是我们没有赶上好时代呀。

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b*e
13
楼上看得仔细。楼主可以把设计方案画出来吗?

【在 J********3 的大作中提到】
: 这个文章有矛盾哈!
: 文章第5段有如下内容:“且慢,还不行。因为Rosa26启动子太弱了,即使是用EYFP单
: 基因,阳性跟阴性也只有不到一个log的区别。把DTR-2A-EGFP放那里,谁知道是不是能
: 够看到EGFP信号呀。所以我们想可以放一个强启动子,于是我们选择了pCAG启动子,这
: 家伙不但动力强劲,而且是放哪儿都混不吝。也就是文言文里说的ubiquitous。这样就
: 开始做一个叫做pCAG-loxP-STOP-loxP-DTR-2A-EGFP的工具鼠。”
: 说的Rosa26启动子太弱了,所以做了pCAG-loxP-STOP-loxP-DTR-2A-EGFP的工具鼠!
: 可是第6段如下:
: “于是我们把它跟一个免疫细胞特异基因(CD19)的cre小鼠交配,年前得到了一只
: CD19Cre/Rosa-iDTRGFP小鼠。”

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