b*8
2 楼
如题,最近研究一个基因,发现敲掉他之后细胞增殖变慢,p53-p21激活,做flow 看
cell cycle发现有G1/S arrest,虽然统计学p小于0.05,但是看起来很marginal,特别
是转了control siRNA的细胞G1 比例都特别高,达到60%以上,请问这是怎么回事?有
什么好的trick吗?
tips:肝癌细胞株HepG2,转染control/smartpool siNRA targeting a gene 48小时候
收细胞,固定于70%的乙醇。
cell cycle发现有G1/S arrest,虽然统计学p小于0.05,但是看起来很marginal,特别
是转了control siRNA的细胞G1 比例都特别高,达到60%以上,请问这是怎么回事?有
什么好的trick吗?
tips:肝癌细胞株HepG2,转染control/smartpool siNRA targeting a gene 48小时候
收细胞,固定于70%的乙醇。
a*8
4 楼
这样的数据,统计再有意义,也没有生物意义。purely negative data to me
z*i
8 楼
HepG2很难转染,你效率有多少?分析细胞周期的时候你用的是total population还是
只看那些被transfected的细胞周期?
只看那些被transfected的细胞周期?
q*g
10 楼
如果你感兴趣的话,还是sort cells,然后看筛选过的细胞周期。目前你的结果几乎没
有什么变化,尽管统计上小于0.05.另外,我更倾向于用shRNA.
有什么变化,尽管统计上小于0.05.另外,我更倾向于用shRNA.
b*8
12 楼
恩
多谢楼上各位,怀疑转染效率不够,但是之前也用过lentiviral shRNA+puromycin
selection的,结果跟这次用siRNA差不多,当时就发现G1的比例很高,怀疑是
puromycin对细胞周期有干扰,所以转用siRNA的,不明白为什么control的时候G1的比
例都那么高
多谢楼上各位,怀疑转染效率不够,但是之前也用过lentiviral shRNA+puromycin
selection的,结果跟这次用siRNA差不多,当时就发现G1的比例很高,怀疑是
puromycin对细胞周期有干扰,所以转用siRNA的,不明白为什么control的时候G1的比
例都那么高
A*y
14 楼
G1 always looks like that for cancer cell culture in a flask. If you show a
different one, I will simply told you that your control is junk.
【在 b**********8 的大作中提到】
: 恩
: 多谢楼上各位,怀疑转染效率不够,但是之前也用过lentiviral shRNA+puromycin
: selection的,结果跟这次用siRNA差不多,当时就发现G1的比例很高,怀疑是
: puromycin对细胞周期有干扰,所以转用siRNA的,不明白为什么control的时候G1的比
: 例都那么高
different one, I will simply told you that your control is junk.
【在 b**********8 的大作中提到】
: 恩
: 多谢楼上各位,怀疑转染效率不够,但是之前也用过lentiviral shRNA+puromycin
: selection的,结果跟这次用siRNA差不多,当时就发现G1的比例很高,怀疑是
: puromycin对细胞周期有干扰,所以转用siRNA的,不明白为什么control的时候G1的比
: 例都那么高
m*m
16 楼
Your siRNA might not work well, and some cancer cells (lines) always have
hight G1 if cultured in vitro
Change the cell line or siRNA
【在 b**********8 的大作中提到】
: 如题,最近研究一个基因,发现敲掉他之后细胞增殖变慢,p53-p21激活,做flow 看
: cell cycle发现有G1/S arrest,虽然统计学p小于0.05,但是看起来很marginal,特别
: 是转了control siRNA的细胞G1 比例都特别高,达到60%以上,请问这是怎么回事?有
: 什么好的trick吗?
: tips:肝癌细胞株HepG2,转染control/smartpool siNRA targeting a gene 48小时候
: 收细胞,固定于70%的乙醇。
hight G1 if cultured in vitro
Change the cell line or siRNA
【在 b**********8 的大作中提到】
: 如题,最近研究一个基因,发现敲掉他之后细胞增殖变慢,p53-p21激活,做flow 看
: cell cycle发现有G1/S arrest,虽然统计学p小于0.05,但是看起来很marginal,特别
: 是转了control siRNA的细胞G1 比例都特别高,达到60%以上,请问这是怎么回事?有
: 什么好的trick吗?
: tips:肝癌细胞株HepG2,转染control/smartpool siNRA targeting a gene 48小时候
: 收细胞,固定于70%的乙醇。
d*n
17 楼
不是罚回去很多,是全都罚回去,估计还得赔自己公司点儿损失。
f*x
19 楼
每天都是历史新低
p*b
23 楼
今天比上周五还低吗?15年。今天比上周五还低吗?15年。
b*8
24 楼
没想到这么多朋友回复,谢谢大家的意见和建议
看来主要原因可能是转染效率太低,我准备重复一次这个实验,连续两天转染两次
siRNA,第三天收细胞分析试试看
多谢大家
看来主要原因可能是转染效率太低,我准备重复一次这个实验,连续两天转染两次
siRNA,第三天收细胞分析试试看
多谢大家
c*r
26 楼
这data,不就是没有差别么?
转染率多少?超过50%就别做了,没意义
【在 b**********8 的大作中提到】
: 如题,最近研究一个基因,发现敲掉他之后细胞增殖变慢,p53-p21激活,做flow 看
: cell cycle发现有G1/S arrest,虽然统计学p小于0.05,但是看起来很marginal,特别
: 是转了control siRNA的细胞G1 比例都特别高,达到60%以上,请问这是怎么回事?有
: 什么好的trick吗?
: tips:肝癌细胞株HepG2,转染control/smartpool siNRA targeting a gene 48小时候
: 收细胞,固定于70%的乙醇。
转染率多少?超过50%就别做了,没意义
【在 b**********8 的大作中提到】
: 如题,最近研究一个基因,发现敲掉他之后细胞增殖变慢,p53-p21激活,做flow 看
: cell cycle发现有G1/S arrest,虽然统计学p小于0.05,但是看起来很marginal,特别
: 是转了control siRNA的细胞G1 比例都特别高,达到60%以上,请问这是怎么回事?有
: 什么好的trick吗?
: tips:肝癌细胞株HepG2,转染control/smartpool siNRA targeting a gene 48小时候
: 收细胞,固定于70%的乙醇。
p*b
27 楼
谢谢Bed,10年的和上周五比呢?多少
r*s
28 楼
搭车请教:怎么测siRNA转染效率?唯有sort?
谢谢
谢谢
a*a
32 楼
no si的细胞G1 phase是多少?
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