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高通量测序建库时怎样避免adapter自连
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高通量测序建库时怎样避免adapter自连# Biology - 生物学
e*o
1 楼
上次问的那个问题，http://www.mitbbs.com/article_t0/Biology/31880339.html
如果有办法在高通量测序建库时避免adapter自连。
也就能解决很大问题。一般建库是DNA片段肖平加A，adapter带T就不会有自连了。但是
我的DNA产物是两个NN的末端，所以只能通过adapter不磷酸化来避免自连。但带来的问
题是DNA有nick不好扩增。
不知各位大侠有什么好的办法没有。谢谢！
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N*n
2 楼
你的adaptor 5‘端可以采用2’-OH。也就是2‘和3’-OH，相对于通常的3‘和5’-OH
。好像是这样的。你可以问Operon或Sigma的tech support。

【在 e***o 的大作中提到】
: 上次问的那个问题，http://www.mitbbs.com/article_t0/Biology/31880339.html
: 如果有办法在高通量测序建库时避免adapter自连。
: 也就能解决很大问题。一般建库是DNA片段肖平加A，adapter带T就不会有自连了。但是
: 我的DNA产物是两个NN的末端，所以只能通过adapter不磷酸化来避免自连。但带来的问
: 题是DNA有nick不好扩增。
: 不知各位大侠有什么好的办法没有。谢谢！
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c*b
3 楼
好像很难完全避免，但是可以用一个resin移除大部分。
http://www.fishersci.com/ecomm/servlet/itemdetail?itemdetail=

【在 e***o 的大作中提到】
: 上次问的那个问题，http://www.mitbbs.com/article_t0/Biology/31880339.html
: 如果有办法在高通量测序建库时避免adapter自连。
: 也就能解决很大问题。一般建库是DNA片段肖平加A，adapter带T就不会有自连了。但是
: 我的DNA产物是两个NN的末端，所以只能通过adapter不磷酸化来避免自连。但带来的问
: 题是DNA有nick不好扩增。
: 不知各位大侠有什么好的办法没有。谢谢！
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e*o
4 楼
感谢各位的帮助，那个2’-OH看起来好像很贵的样子哦
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