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求助板上mouse/rat genetics的大牛, 用哪个promoter来作brain specific knockout？

求助板上mouse/rat genetics的大牛, 用哪个promoter来作brain specific knockout？# Biology - 生物学

h*o2014-04-11 07:04

1 楼

老板打算合作去做一个brain specific的knockout，还要inducible，对方说做Cre－
loxp, 然后用tamoxifen 去induce，要求我们提供一个brain specific的gene 去放
Cre -ER
我查了几个常用的brain specific的promoter
BDNF，但是似乎不是brain specific，因为retina， prostate，kidney 也表达
CaMKII BAC, 这个貌似用的人不多，但是好像有文献说适合brain specific的knockout
不是做这个的，对于KO的知识仅限于Cre LoxP了.
有没有好心人给点建议，该用那个 gene来放Cre-ER?谢谢！

D*a2014-04-11 07:04

2 楼

这老鼠不一堆了吗，为啥要自己做？
CaMKII 很多了

N*n2014-04-11 07:04

3 楼

rat

【在 D*a 的大作中提到】

: 这老鼠不一堆了吗，为啥要自己做？
: CaMKII 很多了

D*a2014-04-11 07:04

4 楼

哪里写rat了
长木行走不正在做吗

【在 N******n 的大作中提到】

:
: rat

l*e2014-04-11 07:04

5 楼

自己挑一个吧
http://enhancer.lbl.gov/

knockout

【在 h*******o 的大作中提到】

: 老板打算合作去做一个brain specific的knockout，还要inducible，对方说做Cre－
: loxp, 然后用tamoxifen 去induce，要求我们提供一个brain specific的gene 去放
: Cre -ER
: 我查了几个常用的brain specific的promoter
: BDNF，但是似乎不是brain specific，因为retina， prostate，kidney 也表达
: CaMKII BAC, 这个貌似用的人不多，但是好像有文献说适合brain specific的knockout
: 不是做这个的，对于KO的知识仅限于Cre LoxP了.
: 有没有好心人给点建议，该用那个 gene来放Cre-ER?谢谢！

r*g2014-04-11 07:04

6 楼

不是一般都是 brain的某一类细胞吗？一般不会 brain cre吧

r*g2014-04-11 07:04

7 楼

不是一般都是 brain的某一类细胞吗？一般不会 brain cre吧

h*o2014-04-11 07:04

8 楼

恩，我也是有这个疑问，
貌似大部分都是neuronal specific而不是brain specific的

【在 r******g 的大作中提到】

: 不是一般都是 brain的某一类细胞吗？一般不会 brain cre吧

h*o2014-04-11 07:04

9 楼

恩，要rat的
对方实验室很牛，看报道是第一个这样的rat model。

【在 D*a 的大作中提到】

: 这老鼠不一堆了吗，为啥要自己做？
: CaMKII 很多了

h*o2014-04-11 07:04

10 楼

顺便问一下
用tamoxifen 诱导，对于本身就做estrogen receptor的是不是不太合适啊
我开会的时候提出来了，说能不能用doxycyclin做，对方说tamoxifen就打一次，应该
没有影响

D*a2014-04-11 07:04

11 楼

其实绝大部分cre都不是完全特异性的，总会在其他某些地方有点表达。比如brain的，
如果要神经marker，周围神经系统很可能少不了。
如果没有这方面的数据，那就只能看运气。如果有这方面的数据，那就要看你的课题，
会不会冲突。比如你研究brain 跟糖尿病那么leak到胰腺去了肯定不行，但是如果
leak到肺什么的，那也无所谓。然后还有就是运气，如果你做knockin（就是把一条
allele替换成cre），那么大概是没啥意外，如果你是弄bac后面接cre做随机插入，那
么它自己从哪里leak，你还真控制不了，只能多做几个line挑一挑。