b*l
2 楼
不好揣,不好拿,太耗电。理想状态是小手机大屏幕低功耗。可能技术上障碍太多。
y*u
3 楼
用TRIZOL同时提临床得来的病人组织的RNA和DNA.之前一直觉得RNA很稳定没问题,在好
不容易凑足了DNA后送出测序,结果回馈说RNA降解了,而DNA浓度和我们测出的浓度相
差100倍。惊呆了。
1. DNA浓度我是用NANODROP测了好几次,不明白为啥测序公司测出来的数值会和我测出
来的差100倍???
2.RNA我后来把剩下的跑了胶,发现的确降解。现在又得到新的组织再提,还是发现有
降解情况。我以前都是做现杀的老鼠组织提RNA,手法我也一直没问题。这个新的临床标
本据说是病人手术切下之后一直低温保存,有实验需要就用干冰运来。第一次是保存在
TRIZOL里运来,第二次是直接运组织,我用液态氮碾碎了。但是都提出了降解的RNA.
我现在打算用细胞用同样的手法提RNA作为对比,看是否我的实验有问题?还是标本已
经降解的了。请问细胞提出的RNA对于组织RNA是否有参考性?
如果标本有问题,我现在提出的已经降解的RNA是否也能进行测序呢?效果如何?
不容易凑足了DNA后送出测序,结果回馈说RNA降解了,而DNA浓度和我们测出的浓度相
差100倍。惊呆了。
1. DNA浓度我是用NANODROP测了好几次,不明白为啥测序公司测出来的数值会和我测出
来的差100倍???
2.RNA我后来把剩下的跑了胶,发现的确降解。现在又得到新的组织再提,还是发现有
降解情况。我以前都是做现杀的老鼠组织提RNA,手法我也一直没问题。这个新的临床标
本据说是病人手术切下之后一直低温保存,有实验需要就用干冰运来。第一次是保存在
TRIZOL里运来,第二次是直接运组织,我用液态氮碾碎了。但是都提出了降解的RNA.
我现在打算用细胞用同样的手法提RNA作为对比,看是否我的实验有问题?还是标本已
经降解的了。请问细胞提出的RNA对于组织RNA是否有参考性?
如果标本有问题,我现在提出的已经降解的RNA是否也能进行测序呢?效果如何?
n*t
4 楼
Amazon drive is only $60 for unlimited space?
geez, this is good.
geez, this is good.
z*q
6 楼
我有些做小鼠组织的经验。如果组织取出来切成小块立刻放液氮速冻的话可以放很久都
没事,但如果放TRIZOL里冻着会相对容易降解因为RNA被释放出来了。还有RNAlater我
也用过很好用但组织还是要切小块否则溶液很难渗进去。
没事,但如果放TRIZOL里冻着会相对容易降解因为RNA被释放出来了。还有RNAlater我
也用过很好用但组织还是要切小块否则溶液很难渗进去。
n*t
7 楼
I will go with Onedrive
s*1
8 楼
理想是屏幕能够折叠变小,摊开时候可以选择大小,而且平面衔接处无痕~~~
x*d
9 楼
1.测序公司一般用Bioanalyzer测DNA的质量和浓度;所以会和Nanodrop有差别。
2.snap frozen的组织提RNA推荐RNA-Later ICE。
2.snap frozen的组织提RNA推荐RNA-Later ICE。
x*r
10 楼
Top two are good.
l*e
12 楼
这是个有意思的问题.
RNA反转录以后, 建library以前, 是必须超声打碎到150-300bp的小片段
所以,理论上说,部分降解的RNA是完全不影响测序的.
但是实际中应该有些细节要考虑,比如不能用oligo dt反转录或者polyA enrichment.
因为这样做出来的library会丢失所有没有polyA的片断.
市面上有用random primer建库的kit (比如Nugen). 因为是病人样本, 只要不是完全降
解, 值得尝试.
【在 y*****u 的大作中提到】
: 用TRIZOL同时提临床得来的病人组织的RNA和DNA.之前一直觉得RNA很稳定没问题,在好
: 不容易凑足了DNA后送出测序,结果回馈说RNA降解了,而DNA浓度和我们测出的浓度相
: 差100倍。惊呆了。
: 1. DNA浓度我是用NANODROP测了好几次,不明白为啥测序公司测出来的数值会和我测出
: 来的差100倍???
: 2.RNA我后来把剩下的跑了胶,发现的确降解。现在又得到新的组织再提,还是发现有
: 降解情况。我以前都是做现杀的老鼠组织提RNA,手法我也一直没问题。这个新的临床标
: 本据说是病人手术切下之后一直低温保存,有实验需要就用干冰运来。第一次是保存在
: TRIZOL里运来,第二次是直接运组织,我用液态氮碾碎了。但是都提出了降解的RNA.
: 我现在打算用细胞用同样的手法提RNA作为对比,看是否我的实验有问题?还是标本已
RNA反转录以后, 建library以前, 是必须超声打碎到150-300bp的小片段
所以,理论上说,部分降解的RNA是完全不影响测序的.
但是实际中应该有些细节要考虑,比如不能用oligo dt反转录或者polyA enrichment.
因为这样做出来的library会丢失所有没有polyA的片断.
市面上有用random primer建库的kit (比如Nugen). 因为是病人样本, 只要不是完全降
解, 值得尝试.
【在 y*****u 的大作中提到】
: 用TRIZOL同时提临床得来的病人组织的RNA和DNA.之前一直觉得RNA很稳定没问题,在好
: 不容易凑足了DNA后送出测序,结果回馈说RNA降解了,而DNA浓度和我们测出的浓度相
: 差100倍。惊呆了。
: 1. DNA浓度我是用NANODROP测了好几次,不明白为啥测序公司测出来的数值会和我测出
: 来的差100倍???
: 2.RNA我后来把剩下的跑了胶,发现的确降解。现在又得到新的组织再提,还是发现有
: 降解情况。我以前都是做现杀的老鼠组织提RNA,手法我也一直没问题。这个新的临床标
: 本据说是病人手术切下之后一直低温保存,有实验需要就用干冰运来。第一次是保存在
: TRIZOL里运来,第二次是直接运组织,我用液态氮碾碎了。但是都提出了降解的RNA.
: 我现在打算用细胞用同样的手法提RNA作为对比,看是否我的实验有问题?还是标本已
s*3
13 楼
风水轮流转
o*a
14 楼
Comparative analysis of RNA sequencing methods for degraded or low-input
samples
http://www.nature.com/nmeth/journal/v10/n7/full/nmeth.2483.html
samples
http://www.nature.com/nmeth/journal/v10/n7/full/nmeth.2483.html
t*y
15 楼
y*3
16 楼
1,差100倍不太正常哦,如果不是测序公司稀释了,建议送到第三方去检查下。
2,如果降解的不太厉害,用去rRNA的方法还是可以建出很不错的library的。
2,如果降解的不太厉害,用去rRNA的方法还是可以建出很不错的library的。
s*y
17 楼
现在旗舰机都太大了,好东西都不往小机型上放
我就想要N9那样的机器
我就想要N9那样的机器
f*a
18 楼
我以前有一次本来自己用bioanalyzer测得perfect的sample,送测序公司就降解了,也有
可能是运输或者测序公司操作不当.
可能是运输或者测序公司操作不当.
G*g
21 楼
这个很小了, 可以给孩子带着。
目前还有更小的android手机,大概2cm见方, 象一个钮扣那样大小,不过都是概念机
, 大概几年后才能成型吧。
【在 t*******y 的大作中提到】
: http://www.amazon.com/Motorola-Flipout-Unlocked-Quad-Band-Bluet
: 这个小,符合楼主需要
目前还有更小的android手机,大概2cm见方, 象一个钮扣那样大小,不过都是概念机
, 大概几年后才能成型吧。
【在 t*******y 的大作中提到】
: http://www.amazon.com/Motorola-Flipout-Unlocked-Quad-Band-Bluet
: 这个小,符合楼主需要
a*a
22 楼
不同组织rna的稳定性不同,胰腺就非常难抽。
【在 y*****u 的大作中提到】
: 用TRIZOL同时提临床得来的病人组织的RNA和DNA.之前一直觉得RNA很稳定没问题,在好
: 不容易凑足了DNA后送出测序,结果回馈说RNA降解了,而DNA浓度和我们测出的浓度相
: 差100倍。惊呆了。
: 1. DNA浓度我是用NANODROP测了好几次,不明白为啥测序公司测出来的数值会和我测出
: 来的差100倍???
: 2.RNA我后来把剩下的跑了胶,发现的确降解。现在又得到新的组织再提,还是发现有
: 降解情况。我以前都是做现杀的老鼠组织提RNA,手法我也一直没问题。这个新的临床标
: 本据说是病人手术切下之后一直低温保存,有实验需要就用干冰运来。第一次是保存在
: TRIZOL里运来,第二次是直接运组织,我用液态氮碾碎了。但是都提出了降解的RNA.
: 我现在打算用细胞用同样的手法提RNA作为对比,看是否我的实验有问题?还是标本已
【在 y*****u 的大作中提到】
: 用TRIZOL同时提临床得来的病人组织的RNA和DNA.之前一直觉得RNA很稳定没问题,在好
: 不容易凑足了DNA后送出测序,结果回馈说RNA降解了,而DNA浓度和我们测出的浓度相
: 差100倍。惊呆了。
: 1. DNA浓度我是用NANODROP测了好几次,不明白为啥测序公司测出来的数值会和我测出
: 来的差100倍???
: 2.RNA我后来把剩下的跑了胶,发现的确降解。现在又得到新的组织再提,还是发现有
: 降解情况。我以前都是做现杀的老鼠组织提RNA,手法我也一直没问题。这个新的临床标
: 本据说是病人手术切下之后一直低温保存,有实验需要就用干冰运来。第一次是保存在
: TRIZOL里运来,第二次是直接运组织,我用液态氮碾碎了。但是都提出了降解的RNA.
: 我现在打算用细胞用同样的手法提RNA作为对比,看是否我的实验有问题?还是标本已
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