s*y
2 楼
应该是和其他基因的进化速度比较吧。
【在 M*P 的大作中提到】
: 有人说跟sex reproduction 相关的基因进化快，这种是用什么方法测量的？
【在 M*P 的大作中提到】
: 有人说跟sex reproduction 相关的基因进化快，这种是用什么方法测量的？
m*c
3 楼
If you are hardcore, see the classic paper by Donnelly and Tavare: The ages
of alleles and a coalescent.
If you are just curious, see wiki entry of human accelerated regions (HARs).
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8
【在 M*P 的大作中提到】
: 有人说跟sex reproduction 相关的基因进化快，这种是用什么方法测量的？
of alleles and a coalescent.
If you are just curious, see wiki entry of human accelerated regions (HARs).
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8
【在 M*P 的大作中提到】
: 有人说跟sex reproduction 相关的基因进化快，这种是用什么方法测量的？
t*z
4 楼
我来尝试解释下吧。
如果要计算基因进化速率的具体数值，那么第一需要进化树，第二需要估计进化分支的
年代（利用化石证据或者其他基因的已知的突变率），然后根据进化树上树枝的长度（
积累的突变个数），就可以算出你感兴趣的基因的进化速率（单位时间内突变数量）了。
年代的估计是个很不靠谱的事情，基本是十个组能做出十个结果。所以在多数情况下，
你无法精确算出进化速度，而是只能比较相对的进化速度。后者可以分成两种：
一、感兴趣的基因在这个物种中是否比在别的物种中进化快？做该基因家族的进化树然
后比较树枝长度就可以。
二、感兴趣的基因跟同一个基因组中的别的基因相比是否进化快？这个问题意义不是很
大，因为不同基因的进化速率本来就是一个分布。如果真想知道，可以单纯比较从一个
共同祖先开始（哪怕年代未知）的各个基因积累的突变个数。
常用软件包中PAML就有比较全面的关于进化速率的功能。
【在 M*P 的大作中提到】
: 有人说跟sex reproduction 相关的基因进化快，这种是用什么方法测量的？
如果要计算基因进化速率的具体数值，那么第一需要进化树，第二需要估计进化分支的
年代（利用化石证据或者其他基因的已知的突变率），然后根据进化树上树枝的长度（
积累的突变个数），就可以算出你感兴趣的基因的进化速率（单位时间内突变数量）了。
年代的估计是个很不靠谱的事情，基本是十个组能做出十个结果。所以在多数情况下，
你无法精确算出进化速度，而是只能比较相对的进化速度。后者可以分成两种：
一、感兴趣的基因在这个物种中是否比在别的物种中进化快？做该基因家族的进化树然
后比较树枝长度就可以。
二、感兴趣的基因跟同一个基因组中的别的基因相比是否进化快？这个问题意义不是很
大，因为不同基因的进化速率本来就是一个分布。如果真想知道，可以单纯比较从一个
共同祖先开始（哪怕年代未知）的各个基因积累的突变个数。
常用软件包中PAML就有比较全面的关于进化速率的功能。
【在 M*P 的大作中提到】
: 有人说跟sex reproduction 相关的基因进化快，这种是用什么方法测量的？
M*P
5 楼
多谢
了。
【在 t*****z 的大作中提到】
: 我来尝试解释下吧。
: 如果要计算基因进化速率的具体数值，那么第一需要进化树，第二需要估计进化分支的
: 年代（利用化石证据或者其他基因的已知的突变率），然后根据进化树上树枝的长度（
: 积累的突变个数），就可以算出你感兴趣的基因的进化速率（单位时间内突变数量）了。
: 年代的估计是个很不靠谱的事情，基本是十个组能做出十个结果。所以在多数情况下，
: 你无法精确算出进化速度，而是只能比较相对的进化速度。后者可以分成两种：
: 一、感兴趣的基因在这个物种中是否比在别的物种中进化快？做该基因家族的进化树然
: 后比较树枝长度就可以。
: 二、感兴趣的基因跟同一个基因组中的别的基因相比是否进化快？这个问题意义不是很
: 大，因为不同基因的进化速率本来就是一个分布。如果真想知道，可以单纯比较从一个
了。
【在 t*****z 的大作中提到】
: 我来尝试解释下吧。
: 如果要计算基因进化速率的具体数值，那么第一需要进化树，第二需要估计进化分支的
: 年代（利用化石证据或者其他基因的已知的突变率），然后根据进化树上树枝的长度（
: 积累的突变个数），就可以算出你感兴趣的基因的进化速率（单位时间内突变数量）了。
: 年代的估计是个很不靠谱的事情，基本是十个组能做出十个结果。所以在多数情况下，
: 你无法精确算出进化速度，而是只能比较相对的进化速度。后者可以分成两种：
: 一、感兴趣的基因在这个物种中是否比在别的物种中进化快？做该基因家族的进化树然
: 后比较树枝长度就可以。
: 二、感兴趣的基因跟同一个基因组中的别的基因相比是否进化快？这个问题意义不是很
: 大，因为不同基因的进化速率本来就是一个分布。如果真想知道，可以单纯比较从一个
相关阅读
生物vs数学，为什么没有人提生物物理呢？用于ihf的p4小鼠大脑需要先pfa perfusion么，还是直接挖出来扔UNC ranks 9 in Federal research funds转基因的安全性和必要性交完论文，OPT下来之前，能在实验室干活吗？其实这个clinical trial为啥美国人不在自己身上做的问题生物版真萎缩，偷偷删除要铲除把中国人当小白鼠的汉奸的帖子也聊聊生物学里面唯一一个完美的数学/物理模型：Hodgkin–Huxley modelRe: 一群各个专业的人 神叨叨在bio版讨论 (转载)似乎越来越多中国人把family name放前面了请问一句话英语怎么说editor决定要不要直接据一个投稿，是不是只看 abstract?有没有博士后课题做了一半quit的？有一部分搞生物的传统生物和数学运用公猴子比母的活的长本科生求问前辈在美国读epidemiology 的phd／master怎么样？paper help (biochem.soc.trans)生物专业毕业来美Tufts 大学的背景