请教如何用z-score计算foldchange？# Biology - 生物学
v*v
1 楼
锛00k, seems not that good?
need to make decision on monday, advice please
need to make decision on monday, advice please
Z*5
2 楼
因为要比较不同测序平台、不同课题组来源的数据，需要对各个样品进行z-score转换
，才能进行比较。
目前计算p value，q value都没问题；但是还需要计算基因的foldchange来进一步过滤
掉差异不显著的基因。但是原数据肯定是不能进行直接的计算，那么z-score标准化后
，如何计算foldchange呢？
，才能进行比较。
目前计算p value，q value都没问题；但是还需要计算基因的foldchange来进一步过滤
掉差异不显著的基因。但是原数据肯定是不能进行直接的计算，那么z-score标准化后
，如何计算foldchange呢？
t*k
3 楼
你在哪个州?
s*s
4 楼
z-score都标准化了，哪来的fold change
【 在 Zifeng85 (Zifeng9527) 的大作中提到: 】
【 在 Zifeng85 (Zifeng9527) 的大作中提到: 】
b*2
5 楼
有点高，可以去我的俱乐部查询当天的利率。
【在 v***v 的大作中提到】
: 锛00k, seems not that good?
: need to make decision on monday, advice please
【在 v***v 的大作中提到】
: 锛00k, seems not that good?
: need to make decision on monday, advice please
G*n
6 楼
你说的z-score是指对每一个sample，所有gene放一起进行z transform，相当于z-
score normalization。 如果是这样的话，你可以用这个每一个gene 的z值，作为表达
量，或者说是相对表达量。然后across sample做DE。
但是这个方法，不好，建议用别的cross-platform normalization
score normalization。 如果是这样的话，你可以用这个每一个gene 的z值，作为表达
量，或者说是相对表达量。然后across sample做DE。
但是这个方法，不好，建议用别的cross-platform normalization
k*o
7 楼
如果你的 case 很好，在加州，绝对高了，以 Friday 为例。
不妨访问我俱乐部的利率以供参考。
【在 v***v 的大作中提到】
: 锛00k, seems not that good?
: need to make decision on monday, advice please
不妨访问我俱乐部的利率以供参考。
【在 v***v 的大作中提到】
: 锛00k, seems not that good?
: need to make decision on monday, advice please
v*v
8 楼
多谢楼上几位。。。。
相关阅读
paper helpscience 投稿一问请教博后的选择请教：大分子能否进入Matrigel嫁了个农村生物博士，悲催啊（转载）Renal cell carcinoma 和血液什么关系？真诚球offer比较,PhD in Bio@UCLA vs Chem@Brown求推荐FACS数白细胞subpopulation的label没人觉得eLife这个名字很媚俗吗？有常做原代细胞培养的兄弟姐妹进来做下surveypaper help, baozi thanks!50bp左右的片段用TBE-UREA mini-gel能分辨1-2bp的差异么？美国生物博士转校哪位同学纯化过Rat IgG2b的蛋白， 有没有效率高的resin推荐-送包子！Large Capacity CO2 incubatork99 问题请教真正药物的革命，全是北欧和瑞士领导的生物简直是刀口上讨生活的行当关于用powerpoint作Figure的问题发个我家lg发文章的坎坷史，感叹academic路的艰辛！