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计算化学菜鸟求指点

计算化学菜鸟求指点# Chemistry - 化学

y*12015-07-31 07:07

1 楼

今天早上8点的评审会，下午2点回家后查，Priority Score 20；这是RESUBMISSION;第
一次的Priority Score 29。希望这次的分数能够拿到钱。学校的秘书说没有问题。

m*e2015-07-31 07:07

2 楼

【以下文字转载自 SanFrancisco 讨论区】
发信人: maywhite (梅逐雨中黄), 信区: SanFrancisco
标题: 【求助】有在Chevron上班的同胞嘛？
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Sep 28 17:56:09 2012, 美东)
在Chevron的网站上找到一个很合适的职位，正在申请，但是我现阶段处在
比较特殊的状态，想看看有没有同胞可以帮忙推荐，增加机会。先在这里谢
过！

E*h2015-07-31 07:07

3 楼

【以下文字转载自 Postdoc 讨论区】
发信人: ElFish (ELF), 信区: Postdoc
标题: US Army Institute of Surgical Research
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Oct 1 00:23:32 2010, 美东)
打听个地方
US Army Institute of Surgical Research
在德州
请问这个所怎么样？

b*n2015-07-31 07:07

4 楼

菜鸟中的菜鸟，现有一optimized geometry，要算vibrational zero point energy。
用GAMESS算的。结果算了一个月了还没停下来。以前相似的分子都是一两天成功的。
Question: 1）这类计算有什么要注意的吗？
2）如果现在把计算停下来的话，怎样restart?
谢先哈！

b*d2015-07-31 07:07

5 楼

恭喜了。应该问题不大。那个institute,如果是公开payline的，你可以查查他们的
payline.

m*e2015-07-31 07:07

6 楼

这个职位是在加州，感谢有德州的朋友愿意帮忙的。感叹一下，不认识人根本
都没有面试机会，本来我的背景很适合，还是直接被拒（自动回复的邮件），
说是有更合适的人选。

【在 m******e 的大作中提到】

: 【以下文字转载自 SanFrancisco 讨论区】
: 发信人: maywhite (梅逐雨中黄), 信区: SanFrancisco
: 标题: 【求助】有在Chevron上班的同胞嘛？
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Sep 28 17:56:09 2012, 美东)
: 在Chevron的网站上找到一个很合适的职位，正在申请，但是我现阶段处在
: 比较特殊的状态，想看看有没有同胞可以帮忙推荐，增加机会。先在这里谢
: 过！

g*x2015-07-31 07:07

7 楼

1) 你根本没说你要算啥东西，如果只是零点能+震动，那真没啥好注意的。
2) 你至少告诉大家为啥没停啊，不收敛？基组太大算太慢？分子太大？如果别的分子
两天算完，就算你MAXIT设很大一个月也应该挂了。
3) 这么简单的问题自己看手册去。把dat里的orbital copy到input里，然后guess=
moread

h*w2015-07-31 07:07

8 楼

I got 20 too 8%. NCI has a cutoff line at 7%. They said they needed several
months to make a decision for the 8%-15%. Why??? what a stupid policy?

a*n2015-07-31 07:07

9 楼

是不是办绿卡的广告

【在 m******e 的大作中提到】

: 这个职位是在加州，感谢有德州的朋友愿意帮忙的。感叹一下，不认识人根本
: 都没有面试机会，本来我的背景很适合，还是直接被拒（自动回复的邮件），
: 说是有更合适的人选。

a*o2015-07-31 07:07

10 楼

二楼说得对。好歹说说你用的理论基组分子大小。一般来说，如果结构优化完成了的话
，振动频率就是对hessian矩阵求本征值。

：菜鸟中的菜鸟，现有一optimized geometry，要算vibrational zero point energy。
：用GAMESS算的。结果算了一个月了还没停下来。以前相似的分子都是一两天成功的。

b*d2015-07-31 07:07

11 楼

因为fisical year 2012，9月30号结束。他们还有去年10月投的proposal要考虑
funding.他们只有等到这批的分出来后，才能最终知道多少钱剩下了，怎么分。

several

【在 h*w 的大作中提到】

: I got 20 too 8%. NCI has a cutoff line at 7%. They said they needed several
: months to make a decision for the 8%-15%. Why??? what a stupid policy?

m*e2015-07-31 07:07

12 楼

应该也不是，这个职位都写明不给办身份绿卡什么的。

【在 a*****n 的大作中提到】

: 是不是办绿卡的广告

A*02015-07-31 07:07

13 楼

还有算Hessian的时候，用的是数值解还是解析解。用数值解的话，对大一点的分子基
本上就是无解。

energy。

【在 a****o 的大作中提到】

: 二楼说得对。好歹说说你用的理论基组分子大小。一般来说，如果结构优化完成了的话
: ，振动频率就是对hessian矩阵求本征值。
:
: ：菜鸟中的菜鸟，现有一optimized geometry，要算vibrational zero point energy。
: ：用GAMESS算的。结果算了一个月了还没停下来。以前相似的分子都是一两天成功的。

f*72015-07-31 07:07

14 楼

New investigator cutoff is 10% at NCI in FY2012.

several

【在 h*w 的大作中提到】

: I got 20 too 8%. NCI has a cutoff line at 7%. They said they needed several
: months to make a decision for the 8%-15%. Why??? what a stupid policy?

b*n2015-07-31 07:07

15 楼

不好意思没说清楚。用的是MP2/6-311G.分子大概MW=350,普通organic 分子。
最后error了，说是not enough memory.

h*w2015-07-31 07:07

16 楼

问题是我们是去年4月的proposal。等到了12月才知道今年的cutoff line。NCI正式自
己找麻烦，非要卡在7%。然后剩下的他们在考虑。正常应该到10% 吧？倒霉啊 PD说
他还要给每个之间的写report

【在 b*****d 的大作中提到】

: 因为fisical year 2012，9月30号结束。他们还有去年10月投的proposal要考虑
: funding.他们只有等到这批的分出来后，才能最终知道多少钱剩下了，怎么分。
:
: several