XCMS-online 一个metabolomics数据分析的好软件！ - 未名空间MITBBS历史存档

国际科技财经博客移民网络热点娱乐民生时事公众号

Redian新闻

>未名空间

>Computation - 科学计算

XCMS-online 一个metabolomics数据分析的好软件！

XCMS-online 一个metabolomics数据分析的好软件！# Computation - 科学计算

t*z2011-06-13 07:06

1 楼

（十三）像福尔摩斯一样
好不容易来一次成都，一个望江楼公园自然不能满足我们的游兴，而当年成都市上
所售地图全然不把陶铸同志的指示当回事，把各名胜古迹全都隐去。我们只好像福尔摩
斯那样在地图上寻找蛛丝马迹。果然我们在地图上发现一处地方叫“南郊公园”，按方
位应当是武侯祠了，还有一处公汽车站的站名叫“草堂”，想必就是杜甫草堂。
首先我们乘车找到了南郊公园，果不其然，那里正是我们要找的“武侯祠”。成
都武侯祠又名“汉昭烈庙”，是中国惟一的君臣合祀祠庙。由刘备、诸葛亮君臣合祀祠
宇及惠陵组成。始建于公元223年，为刘备陵寝。武侯祠建于唐，初与祭祀刘备的昭烈
庙相邻。明朝初年重建时将武侯祠并入了“汉昭烈庙”，形成现存武侯祠君臣合庙。
1961年公布为全国重点文物保护单位，是国内纪念蜀汉丞相诸葛亮的主要胜迹。
武侯祠与昭烈庙、刘备墓（惠陵）相毗连。整个武侯祠坐北朝南，主体建筑大门，
二门，昭烈庙，过厅，武侯祠五重建筑，排列在从南到北的一条中轴线上。以刘备殿最
高，建筑最为雄伟壮丽。武侯祠后还有三义庙、结义楼等建筑。
大门匾额为“汉昭烈庙”。大门内至二门之间浓荫丛中

j*j2011-06-13 07:06

2 楼

不知道说什么，只是觉得这个版可以稍微真实的吐露自己的心情。这两年一直过的很不
顺，分手，放弃读phd，被老板整了一年多，没有奖学金，onsite屡次失败，最后将就
一个工作，但是又碰到今年adv要抽签。可能原来我还有没有这么悲观，可是经历了这
么多不可能的事情之后，我现在真的很担心自己。在美国一个人，孤零零的，觉得自
己很孤独，连朋友开玩笑的时候都会说别人运气差的话都是那我做参照物。
学校的心理医生结合我的情况，说我是chronical depression，让我吃药，我总觉得自
己可以坚持下来，而且药的副作用让我觉得害怕。
我没有什么极端的想法，可是，我觉得自己已经够坚强的在支撑着，我不知道为什么自
己这么不顺，难道是命吗?

s*e2011-06-13 07:06

3 楼

书籍或培训教材或使用文档，电子版的或印刷的都可以。本人愿意出钱购买。

G*72011-06-13 07:06

4 楼

有推荐的么？多谢！

s*a2011-06-13 07:06

5 楼

1.4GHz CPU (SU3500)
2GB RAM
用的Vista，觉得不够快，界面太繁琐

j*12011-06-13 07:06

6 楼

本人在这个组，刚刚group发布了beta版本。有兴趣的可以试着用用。说是用于
metabolomics，其实对LC-MS的数据普遍可用，需要upload 两组data进行对比分析。
Announcement:如下
The Scripps Center for Metabolomics is pleased to announce XCMS Online, a
new user-friendly approach to process metabolomics data.
XCMS Online provides the same high-quality metabolomic analysis that you are
used to but in a user-friendly, web-based format. XCMS Online allows users
to easily upload LC/MS metabolomic data that can then be processed with a
few simple mouse clicks. Predefined parameter settings for different
instruments (e.g., QTOF, Orbitrap, etc...) will be available as will be
options for customization. Results can be viewed online in an interactive,
customizable table showing statistics, chromatograms, and putative METLIN
identities. All results and images will be available for download as .zip
files.
You can click on the following link (or paste it into a browser address bar)
to access XCMS Online:
http://xcmsonline.scripps.edu">http://xcmsonline.scripps.edu
You will need to register with XCMS Online to use the system and the
software is currently in beta version but works quite well.
Please direct any questions regarding this e-mail to xcmsonline [at] scripps
.edu.

c*r2011-06-13 07:06

7 楼

怕药物的副作用的话，就从其他方面努力改变自己。一是坚持看心理医生，这个不好可以
换一个，二是多进行社交活动，再普通的社交活动都有助于改善你心情，三是坚持体育
锻炼。当然，一旦情况严重，该吃药还是得吃药。你现在只是在生命的低谷中，走出来
以后，就会重见蓝天的，不要放弃。

【在 j***j 的大作中提到】

: 不知道说什么，只是觉得这个版可以稍微真实的吐露自己的心情。这两年一直过的很不
: 顺，分手，放弃读phd，被老板整了一年多，没有奖学金，onsite屡次失败，最后将就
: 一个工作，但是又碰到今年adv要抽签。可能原来我还有没有这么悲观，可是经历了这
: 么多不可能的事情之后，我现在真的很担心自己。在美国一个人，孤零零的，觉得自
: 己很孤独，连朋友开玩笑的时候都会说别人运气差的话都是那我做参照物。
: 学校的心理医生结合我的情况，说我是chronical depression，让我吃药，我总觉得自
: 己可以坚持下来，而且药的副作用让我觉得害怕。
: 我没有什么极端的想法，可是，我觉得自己已经够坚强的在支撑着，我不知道为什么自
: 己这么不顺，难道是命吗?

s*o2011-06-13 07:06

8 楼

你想学习什么，目的是什么

【在 G********7 的大作中提到】

: 有推荐的么？多谢！

c*h2011-06-13 07:06

9 楼

xp

【在 s******a 的大作中提到】

: 1.4GHz CPU (SU3500)
: 2GB RAM
: 用的Vista，觉得不够快，界面太繁琐

G*72011-06-13 07:06

10 楼

会一点sql query, 想学sql server administration. 部门education funding
有剩余

【在 s**********o 的大作中提到】

: 你想学习什么，目的是什么

s*a2011-06-13 07:06

11 楼

刚从xp过来，最讨厌vista的还不是慢，担心它是是硬盘杀手--硬盘有事没事老闪，闪
得我心里发虚

【在 c*******h 的大作中提到】

: xp

a*d2011-06-13 07:06

12 楼

我觉得Beijing几个月前推荐的中文视频教程不错：
http://www.mitbbs.com/article_t/Database/31161447.html

【在 G********7 的大作中提到】

: 会一点sql query, 想学sql server administration. 部门education funding
: 有剩余

H*I2011-06-13 07:06

13 楼

小姐，硬盘一闪一闪的，那是硬盘在indexing，是为了跑的更快。等一个星期它
indexing完，就不会闪了

【在 s******a 的大作中提到】

: 刚从xp过来，最讨厌vista的还不是慢，担心它是是硬盘杀手--硬盘有事没事老闪，闪
: 得我心里发虚

B*g2011-06-13 07:06

14 楼

我也下了几个，还没有发现不能下的，嘿嘿

【在 a**d 的大作中提到】

: 我觉得Beijing几个月前推荐的中文视频教程不错：
: http://www.mitbbs.com/article_t/Database/31161447.html

s*a2011-06-13 07:06

15 楼

咋越看vista越不如xp呢？
字体发虚，边缘模糊，甚至有的情况下拖着有杂色；就像使用无版权字体的linux一样。
indexing要一个星期？我能不能不要这破功能啊？

t*t2011-06-13 07:06

16 楼

Win7用起来明显比Vista快。

【在 s******a 的大作中提到】

: 1.4GHz CPU (SU3500)
: 2GB RAM
: 用的Vista，觉得不够快，界面太繁琐

H*I2011-06-13 07:06

17 楼

样。
公主，首先你要使你的显卡resolution matchs LCD的native resolution。然后fine
tune你的clear type font。这样字体看起来就会无比舒服。vista需要一到两个星期学
习你用计算机的习惯并且fine tune indexing。如果不喜欢这个破功能你可以去
registry把它关了。

【在 s******a 的大作中提到】

: 咋越看vista越不如xp呢？
: 字体发虚，边缘模糊，甚至有的情况下拖着有杂色；就像使用无版权字体的linux一样。
: indexing要一个星期？我能不能不要这破功能啊？

y*n2011-06-13 07:06

18 楼

1.4估计很勉强，我用2.4G， 1G马马虎虎。

l*e2011-06-13 07:06

19 楼

可以，我1.4的cpu，1.5g的ram，跑win7好好的！
当然，目前有些软件兼容性还差点

t*t2011-06-13 07:06

20 楼

我还没遇到兼容性的问题

【在 l*****e 的大作中提到】

: 可以，我1.4的cpu，1.5g的ram，跑win7好好的！
: 当然，目前有些软件兼容性还差点