H*g
8 楼
这个delta32是在ORF中间缺了32个核苷酸,导致密码子移位,翻译提前终止。
ccr5本身是个7螺旋-穿膜 G蛋白欧联受体 (GPCR),正常翻译长度是352 氨基酸,基本
全插在细胞膜里。delta32之后,翻译长度成了215氨基酸,其中只有前面184个氨基酸
跟正常序列一样。
通常这么严重的提前终止,都是导致完全失活的。当然也有特殊情况是弄出来一个新的
蛋白,但是这个比较罕见。尤其考虑到这个ccr5是单结构域蛋白,缺了这么大一块可能
既插不进膜里也溶不进水里,很可能刚翻译完就被细胞自己降解了(也正是因为这样,
它才到不了细胞表面,所以HIV看不到它)。wikipeida说delta32之后,这个ccr5就不
上细胞膜了,所以估计是直接被细胞降解了。至少,GPCR不上细胞膜的话应该一点功能
都没有。
加上考虑到delta32确实在正常人群里就有(不知道平均智商如何),所以贺某删了这
个蛋白,【可能】实际上最后造成的问题不会很大。但是这么做本身是极不必要也风险
极大的,必须谴责。
ccr5的DNA序列:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/U95626.1
delta32的序列:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KP687749.1
野生ccr5 ORF(黑括号里就是delta32丢的部分):
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【在 d****o 的大作中提到】
: 只是改掉一截不是全删掉
: 基本功能应该还是有吧
: 删了估计会死
ccr5本身是个7螺旋-穿膜 G蛋白欧联受体 (GPCR),正常翻译长度是352 氨基酸,基本
全插在细胞膜里。delta32之后,翻译长度成了215氨基酸,其中只有前面184个氨基酸
跟正常序列一样。
通常这么严重的提前终止,都是导致完全失活的。当然也有特殊情况是弄出来一个新的
蛋白,但是这个比较罕见。尤其考虑到这个ccr5是单结构域蛋白,缺了这么大一块可能
既插不进膜里也溶不进水里,很可能刚翻译完就被细胞自己降解了(也正是因为这样,
它才到不了细胞表面,所以HIV看不到它)。wikipeida说delta32之后,这个ccr5就不
上细胞膜了,所以估计是直接被细胞降解了。至少,GPCR不上细胞膜的话应该一点功能
都没有。
加上考虑到delta32确实在正常人群里就有(不知道平均智商如何),所以贺某删了这
个蛋白,【可能】实际上最后造成的问题不会很大。但是这么做本身是极不必要也风险
极大的,必须谴责。
ccr5的DNA序列:
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delta32 ORF(和野生相同的蛋白质部分是到FPY,‘【】’就是丢掉那块):
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【在 d****o 的大作中提到】
: 只是改掉一截不是全删掉
: 基本功能应该还是有吧
: 删了估计会死
H*g
9 楼
序列考到notepad++里看得清楚些
【在 H********g 的大作中提到】
: 这个delta32是在ORF中间缺了32个核苷酸,导致密码子移位,翻译提前终止。
: ccr5本身是个7螺旋-穿膜 G蛋白欧联受体 (GPCR),正常翻译长度是352 氨基酸,基本
: 全插在细胞膜里。delta32之后,翻译长度成了215氨基酸,其中只有前面184个氨基酸
: 跟正常序列一样。
: 通常这么严重的提前终止,都是导致完全失活的。当然也有特殊情况是弄出来一个新的
: 蛋白,但是这个比较罕见。尤其考虑到这个ccr5是单结构域蛋白,缺了这么大一块可能
: 既插不进膜里也溶不进水里,很可能刚翻译完就被细胞自己降解了(也正是因为这样,
: 它才到不了细胞表面,所以HIV看不到它)。wikipeida说delta32之后,这个ccr5就不
: 上细胞膜了,所以估计是直接被细胞降解了。至少,GPCR不上细胞膜的话应该一点功能
: 都没有。
【在 H********g 的大作中提到】
: 这个delta32是在ORF中间缺了32个核苷酸,导致密码子移位,翻译提前终止。
: ccr5本身是个7螺旋-穿膜 G蛋白欧联受体 (GPCR),正常翻译长度是352 氨基酸,基本
: 全插在细胞膜里。delta32之后,翻译长度成了215氨基酸,其中只有前面184个氨基酸
: 跟正常序列一样。
: 通常这么严重的提前终止,都是导致完全失活的。当然也有特殊情况是弄出来一个新的
: 蛋白,但是这个比较罕见。尤其考虑到这个ccr5是单结构域蛋白,缺了这么大一块可能
: 既插不进膜里也溶不进水里,很可能刚翻译完就被细胞自己降解了(也正是因为这样,
: 它才到不了细胞表面,所以HIV看不到它)。wikipeida说delta32之后,这个ccr5就不
: 上细胞膜了,所以估计是直接被细胞降解了。至少,GPCR不上细胞膜的话应该一点功能
: 都没有。
d*o
10 楼
Receptor for a number of inflammatory CC-chemokines including CCL3/MIP-1-
alpha, CCL4/MIP-1-beta and RANTES and subsequently transduces a signal by
increasing the intracellular calcium ion level. May play a role in the
control of granulocytic lineage proliferation or differentiation.
纯合的话对免疫力影响应该不小吧
【在 H********g 的大作中提到】
: 这个delta32是在ORF中间缺了32个核苷酸,导致密码子移位,翻译提前终止。
: ccr5本身是个7螺旋-穿膜 G蛋白欧联受体 (GPCR),正常翻译长度是352 氨基酸,基本
: 全插在细胞膜里。delta32之后,翻译长度成了215氨基酸,其中只有前面184个氨基酸
: 跟正常序列一样。
: 通常这么严重的提前终止,都是导致完全失活的。当然也有特殊情况是弄出来一个新的
: 蛋白,但是这个比较罕见。尤其考虑到这个ccr5是单结构域蛋白,缺了这么大一块可能
: 既插不进膜里也溶不进水里,很可能刚翻译完就被细胞自己降解了(也正是因为这样,
: 它才到不了细胞表面,所以HIV看不到它)。wikipeida说delta32之后,这个ccr5就不
: 上细胞膜了,所以估计是直接被细胞降解了。至少,GPCR不上细胞膜的话应该一点功能
: 都没有。
alpha, CCL4/MIP-1-beta and RANTES and subsequently transduces a signal by
increasing the intracellular calcium ion level. May play a role in the
control of granulocytic lineage proliferation or differentiation.
纯合的话对免疫力影响应该不小吧
【在 H********g 的大作中提到】
: 这个delta32是在ORF中间缺了32个核苷酸,导致密码子移位,翻译提前终止。
: ccr5本身是个7螺旋-穿膜 G蛋白欧联受体 (GPCR),正常翻译长度是352 氨基酸,基本
: 全插在细胞膜里。delta32之后,翻译长度成了215氨基酸,其中只有前面184个氨基酸
: 跟正常序列一样。
: 通常这么严重的提前终止,都是导致完全失活的。当然也有特殊情况是弄出来一个新的
: 蛋白,但是这个比较罕见。尤其考虑到这个ccr5是单结构域蛋白,缺了这么大一块可能
: 既插不进膜里也溶不进水里,很可能刚翻译完就被细胞自己降解了(也正是因为这样,
: 它才到不了细胞表面,所以HIV看不到它)。wikipeida说delta32之后,这个ccr5就不
: 上细胞膜了,所以估计是直接被细胞降解了。至少,GPCR不上细胞膜的话应该一点功能
: 都没有。
x*u
11 楼
delta32是最近数百年自然进化出来的缺失,肯定是有相应的好处的,有猜测说对鼠疫
天花免疫
【在 H********g 的大作中提到】
: 这个delta32是在ORF中间缺了32个核苷酸,导致密码子移位,翻译提前终止。
: ccr5本身是个7螺旋-穿膜 G蛋白欧联受体 (GPCR),正常翻译长度是352 氨基酸,基本
: 全插在细胞膜里。delta32之后,翻译长度成了215氨基酸,其中只有前面184个氨基酸
: 跟正常序列一样。
: 通常这么严重的提前终止,都是导致完全失活的。当然也有特殊情况是弄出来一个新的
: 蛋白,但是这个比较罕见。尤其考虑到这个ccr5是单结构域蛋白,缺了这么大一块可能
: 既插不进膜里也溶不进水里,很可能刚翻译完就被细胞自己降解了(也正是因为这样,
: 它才到不了细胞表面,所以HIV看不到它)。wikipeida说delta32之后,这个ccr5就不
: 上细胞膜了,所以估计是直接被细胞降解了。至少,GPCR不上细胞膜的话应该一点功能
: 都没有。
天花免疫
【在 H********g 的大作中提到】
: 这个delta32是在ORF中间缺了32个核苷酸,导致密码子移位,翻译提前终止。
: ccr5本身是个7螺旋-穿膜 G蛋白欧联受体 (GPCR),正常翻译长度是352 氨基酸,基本
: 全插在细胞膜里。delta32之后,翻译长度成了215氨基酸,其中只有前面184个氨基酸
: 跟正常序列一样。
: 通常这么严重的提前终止,都是导致完全失活的。当然也有特殊情况是弄出来一个新的
: 蛋白,但是这个比较罕见。尤其考虑到这个ccr5是单结构域蛋白,缺了这么大一块可能
: 既插不进膜里也溶不进水里,很可能刚翻译完就被细胞自己降解了(也正是因为这样,
: 它才到不了细胞表面,所以HIV看不到它)。wikipeida说delta32之后,这个ccr5就不
: 上细胞膜了,所以估计是直接被细胞降解了。至少,GPCR不上细胞膜的话应该一点功能
: 都没有。
x*u
12 楼
欧洲百分之十的人有缺失,要是有免疫力缺陷也早在统计学上显现了吧
【在 d****o 的大作中提到】
: Receptor for a number of inflammatory CC-chemokines including CCL3/MIP-1-
: alpha, CCL4/MIP-1-beta and RANTES and subsequently transduces a signal by
: increasing the intracellular calcium ion level. May play a role in the
: control of granulocytic lineage proliferation or differentiation.
: 纯合的话对免疫力影响应该不小吧
【在 d****o 的大作中提到】
: Receptor for a number of inflammatory CC-chemokines including CCL3/MIP-1-
: alpha, CCL4/MIP-1-beta and RANTES and subsequently transduces a signal by
: increasing the intracellular calcium ion level. May play a role in the
: control of granulocytic lineage proliferation or differentiation.
: 纯合的话对免疫力影响应该不小吧
H*g
16 楼
可能是其功能还没被明确认识到。人体里不知道具体功能的蛋白多了去了(当然不是说
是个蛋白肯定有功能。没功能的蛋白肯定是存在的,想演化就得养闲汉)。生物才搞了
多少年,还不能说现在认识不到的东西肯定不存在。
如果ccr5是跟免疫相关,也可能是它负责的免疫原或者免疫过程现在已经不大常遇到了
(比如很久以前有个啥病导致大家都得用一下ccr5,但是那个病杀完了99%的球人以后
就自己饿死了),但是不是说以后不会再出现。就像现在的防毒软件,几百兆的病毒库
,里面的病毒估计大部分都已经在世界上绝迹了,还不是得装着。
总之,为了抗hiv而删掉未知功能的基因是极其傻逼的行为。贺的问题不是造了一个有
病的孩子还是没病的孩子,他的问题是为了功利拿人类的整体利益冒险。
【在 d****o 的大作中提到】
: Receptor for a number of inflammatory CC-chemokines including CCL3/MIP-1-
: alpha, CCL4/MIP-1-beta and RANTES and subsequently transduces a signal by
: increasing the intracellular calcium ion level. May play a role in the
: control of granulocytic lineage proliferation or differentiation.
: 纯合的话对免疫力影响应该不小吧
是个蛋白肯定有功能。没功能的蛋白肯定是存在的,想演化就得养闲汉)。生物才搞了
多少年,还不能说现在认识不到的东西肯定不存在。
如果ccr5是跟免疫相关,也可能是它负责的免疫原或者免疫过程现在已经不大常遇到了
(比如很久以前有个啥病导致大家都得用一下ccr5,但是那个病杀完了99%的球人以后
就自己饿死了),但是不是说以后不会再出现。就像现在的防毒软件,几百兆的病毒库
,里面的病毒估计大部分都已经在世界上绝迹了,还不是得装着。
总之,为了抗hiv而删掉未知功能的基因是极其傻逼的行为。贺的问题不是造了一个有
病的孩子还是没病的孩子,他的问题是为了功利拿人类的整体利益冒险。
【在 d****o 的大作中提到】
: Receptor for a number of inflammatory CC-chemokines including CCL3/MIP-1-
: alpha, CCL4/MIP-1-beta and RANTES and subsequently transduces a signal by
: increasing the intracellular calcium ion level. May play a role in the
: control of granulocytic lineage proliferation or differentiation.
: 纯合的话对免疫力影响应该不小吧
d*o
17 楼
这个蛋白ligand和下游信号都是知道的,
功能肯定有,
只是可能冗余比较大,
没有明确的缺乏症
【在 H********g 的大作中提到】
: 可能是其功能还没被明确认识到。人体里不知道具体功能的蛋白多了去了(当然不是说
: 是个蛋白肯定有功能。没功能的蛋白肯定是存在的,想演化就得养闲汉)。生物才搞了
: 多少年,还不能说现在认识不到的东西肯定不存在。
: 如果ccr5是跟免疫相关,也可能是它负责的免疫原或者免疫过程现在已经不大常遇到了
: (比如很久以前有个啥病导致大家都得用一下ccr5,但是那个病杀完了99%的球人以后
: 就自己饿死了),但是不是说以后不会再出现。就像现在的防毒软件,几百兆的病毒库
: ,里面的病毒估计大部分都已经在世界上绝迹了,还不是得装着。
: 总之,为了抗hiv而删掉未知功能的基因是极其傻逼的行为。贺的问题不是造了一个有
: 病的孩子还是没病的孩子,他的问题是为了功利拿人类的整体利益冒险。
功能肯定有,
只是可能冗余比较大,
没有明确的缺乏症
【在 H********g 的大作中提到】
: 可能是其功能还没被明确认识到。人体里不知道具体功能的蛋白多了去了(当然不是说
: 是个蛋白肯定有功能。没功能的蛋白肯定是存在的,想演化就得养闲汉)。生物才搞了
: 多少年,还不能说现在认识不到的东西肯定不存在。
: 如果ccr5是跟免疫相关,也可能是它负责的免疫原或者免疫过程现在已经不大常遇到了
: (比如很久以前有个啥病导致大家都得用一下ccr5,但是那个病杀完了99%的球人以后
: 就自己饿死了),但是不是说以后不会再出现。就像现在的防毒软件,几百兆的病毒库
: ,里面的病毒估计大部分都已经在世界上绝迹了,还不是得装着。
: 总之,为了抗hiv而删掉未知功能的基因是极其傻逼的行为。贺的问题不是造了一个有
: 病的孩子还是没病的孩子,他的问题是为了功利拿人类的整体利益冒险。
H*g
18 楼
那我的乙醛脱氢酶缺失,是个什么进化优势啊?
很多轻微缺陷,不造成很大的选择压力,就可以保持在人群里,并不等于它就好。尤其
是人类的遗传不光是有自然因素,还有社会因素。假如古代某个贵族发生了突变,因为
他家族的社会经济地位远胜于身体好的农民,那他的垃圾基因还是会撒得到处都是。人
类社会就是这样,帝王将相那个种,不一定是好种,但是扩散很快。
【在 x****u 的大作中提到】
: 这个数量就说明突变在某种条件下有优势啊,否则不可能800年积累这么多啊
: wiki写是整个欧洲,这个数量可不小
: CCR5 Δ32 has an (heterozygote) allele frequency of 10% in Europe, and a
: homozygote frequency of 1%.
很多轻微缺陷,不造成很大的选择压力,就可以保持在人群里,并不等于它就好。尤其
是人类的遗传不光是有自然因素,还有社会因素。假如古代某个贵族发生了突变,因为
他家族的社会经济地位远胜于身体好的农民,那他的垃圾基因还是会撒得到处都是。人
类社会就是这样,帝王将相那个种,不一定是好种,但是扩散很快。
【在 x****u 的大作中提到】
: 这个数量就说明突变在某种条件下有优势啊,否则不可能800年积累这么多啊
: wiki写是整个欧洲,这个数量可不小
: CCR5 Δ32 has an (heterozygote) allele frequency of 10% in Europe, and a
: homozygote frequency of 1%.
x*u
20 楼
人类不感染大量寄生虫实际上已经严重影响免疫系统的正常运行了,类似于杀毒软件积
累的老病毒指纹多了,哪天把系统文件给杀了就是严重自身免疫系统
人类这个基因组是进化的很反人性的,不加外部干预,自然有百分之几十的生育死亡率
和新生儿死亡率
现在生孩子一看不好就剖腹产,顺产也侧切,是鼓励人类生育自然分娩不了的孩子,这
么再折腾几百年后搞不好离开医院妇女生育死亡率得过80%。
【在 H********g 的大作中提到】
: 可能是其功能还没被明确认识到。人体里不知道具体功能的蛋白多了去了(当然不是说
: 是个蛋白肯定有功能。没功能的蛋白肯定是存在的,想演化就得养闲汉)。生物才搞了
: 多少年,还不能说现在认识不到的东西肯定不存在。
: 如果ccr5是跟免疫相关,也可能是它负责的免疫原或者免疫过程现在已经不大常遇到了
: (比如很久以前有个啥病导致大家都得用一下ccr5,但是那个病杀完了99%的球人以后
: 就自己饿死了),但是不是说以后不会再出现。就像现在的防毒软件,几百兆的病毒库
: ,里面的病毒估计大部分都已经在世界上绝迹了,还不是得装着。
: 总之,为了抗hiv而删掉未知功能的基因是极其傻逼的行为。贺的问题不是造了一个有
: 病的孩子还是没病的孩子,他的问题是为了功利拿人类的整体利益冒险。
累的老病毒指纹多了,哪天把系统文件给杀了就是严重自身免疫系统
人类这个基因组是进化的很反人性的,不加外部干预,自然有百分之几十的生育死亡率
和新生儿死亡率
现在生孩子一看不好就剖腹产,顺产也侧切,是鼓励人类生育自然分娩不了的孩子,这
么再折腾几百年后搞不好离开医院妇女生育死亡率得过80%。
【在 H********g 的大作中提到】
: 可能是其功能还没被明确认识到。人体里不知道具体功能的蛋白多了去了(当然不是说
: 是个蛋白肯定有功能。没功能的蛋白肯定是存在的,想演化就得养闲汉)。生物才搞了
: 多少年,还不能说现在认识不到的东西肯定不存在。
: 如果ccr5是跟免疫相关,也可能是它负责的免疫原或者免疫过程现在已经不大常遇到了
: (比如很久以前有个啥病导致大家都得用一下ccr5,但是那个病杀完了99%的球人以后
: 就自己饿死了),但是不是说以后不会再出现。就像现在的防毒软件,几百兆的病毒库
: ,里面的病毒估计大部分都已经在世界上绝迹了,还不是得装着。
: 总之,为了抗hiv而删掉未知功能的基因是极其傻逼的行为。贺的问题不是造了一个有
: 病的孩子还是没病的孩子,他的问题是为了功利拿人类的整体利益冒险。
H*g
24 楼
军版有个帖子说贺发表的数据说明他做的两个儿童里,ccr5的序列跟delta32不一样。
这个只是说明他的技术比较糙而已。 如果delta32本身就是个失活突变,其实打成啥
样都行,照我看最好是把整个mRNA删了,因为翻译半个蛋白质对细胞还是稍微有一点点
不好的 。只要ccr5不会表达到细胞表面,抗那个hiv毒株的效果是一样的。国内的人太
极端了。
http://www.mitbbs.com/article_t/Military/52098809.html
这个只是说明他的技术比较糙而已。 如果delta32本身就是个失活突变,其实打成啥
样都行,照我看最好是把整个mRNA删了,因为翻译半个蛋白质对细胞还是稍微有一点点
不好的 。只要ccr5不会表达到细胞表面,抗那个hiv毒株的效果是一样的。国内的人太
极端了。
http://www.mitbbs.com/article_t/Military/52098809.html
H*g
25 楼
这些新突变可以当基因签名。以后看到这些序列,就知道是lulu nana的后代。
【在 H********g 的大作中提到】
: 军版有个帖子说贺发表的数据说明他做的两个儿童里,ccr5的序列跟delta32不一样。
: 这个只是说明他的技术比较糙而已。 如果delta32本身就是个失活突变,其实打成啥
: 样都行,照我看最好是把整个mRNA删了,因为翻译半个蛋白质对细胞还是稍微有一点点
: 不好的 。只要ccr5不会表达到细胞表面,抗那个hiv毒株的效果是一样的。国内的人太
: 极端了。
: http://www.mitbbs.com/article_t/Military/52098809.html
【在 H********g 的大作中提到】
: 军版有个帖子说贺发表的数据说明他做的两个儿童里,ccr5的序列跟delta32不一样。
: 这个只是说明他的技术比较糙而已。 如果delta32本身就是个失活突变,其实打成啥
: 样都行,照我看最好是把整个mRNA删了,因为翻译半个蛋白质对细胞还是稍微有一点点
: 不好的 。只要ccr5不会表达到细胞表面,抗那个hiv毒株的效果是一样的。国内的人太
: 极端了。
: http://www.mitbbs.com/article_t/Military/52098809.html
x*u
26 楼
贺第二天自己说深度测序未检测脱靶,疑似脱靶为误报
现在这事水开始深了,国内开始删帖
涉及到伦理人就会很疯狂,试管婴儿当年压力可想而知
【在 H********g 的大作中提到】
: 军版有个帖子说贺发表的数据说明他做的两个儿童里,ccr5的序列跟delta32不一样。
: 这个只是说明他的技术比较糙而已。 如果delta32本身就是个失活突变,其实打成啥
: 样都行,照我看最好是把整个mRNA删了,因为翻译半个蛋白质对细胞还是稍微有一点点
: 不好的 。只要ccr5不会表达到细胞表面,抗那个hiv毒株的效果是一样的。国内的人太
: 极端了。
: http://www.mitbbs.com/article_t/Military/52098809.html
现在这事水开始深了,国内开始删帖
涉及到伦理人就会很疯狂,试管婴儿当年压力可想而知
【在 H********g 的大作中提到】
: 军版有个帖子说贺发表的数据说明他做的两个儿童里,ccr5的序列跟delta32不一样。
: 这个只是说明他的技术比较糙而已。 如果delta32本身就是个失活突变,其实打成啥
: 样都行,照我看最好是把整个mRNA删了,因为翻译半个蛋白质对细胞还是稍微有一点点
: 不好的 。只要ccr5不会表达到细胞表面,抗那个hiv毒株的效果是一样的。国内的人太
: 极端了。
: http://www.mitbbs.com/article_t/Military/52098809.html
x*u
29 楼
前不久人工智能学界刚有个类似的争议,就是说科研是否必须要在理论完备的情况下推
进,两边都是大牛。
我的看法是从直觉上说,任何领域如果等到理论100%正确再推进,就等于放弃发展。或
者说无实践作为铺垫的理论发展难度是指数的,而有了实践就变成类多项式了。
BTW,我觉得删除一个训练效果不够好的卷积神经网络也类似于杀人了。这个几十兆字
节网络是可以产生类人情感的,你的喜怒哀乐表情它能基于直觉感知并反馈。
piapia
【在 H********g 的大作中提到】
: 脱不脱靶都不重要。重要的是把人做出来这个事情本身。
: 揪细节,希望他犯错,只是一厢情愿,舍本逐末,wishful thinking。过几天被piapia
: 打脸的时候,难道把诺奖奉上么?
进,两边都是大牛。
我的看法是从直觉上说,任何领域如果等到理论100%正确再推进,就等于放弃发展。或
者说无实践作为铺垫的理论发展难度是指数的,而有了实践就变成类多项式了。
BTW,我觉得删除一个训练效果不够好的卷积神经网络也类似于杀人了。这个几十兆字
节网络是可以产生类人情感的,你的喜怒哀乐表情它能基于直觉感知并反馈。
piapia
【在 H********g 的大作中提到】
: 脱不脱靶都不重要。重要的是把人做出来这个事情本身。
: 揪细节,希望他犯错,只是一厢情愿,舍本逐末,wishful thinking。过几天被piapia
: 打脸的时候,难道把诺奖奉上么?
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