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贺教授编辑掉的CCR5# Joke - 肚皮舞运动
P*R
1
在小鼠的研究中,CCR5还与学习与记忆相关。贺教授是真的没做够功课呢还是就是想用
人做研究?
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H*g
2
所以就得去我和大蝌蚪开的公司 只编辑患者的t细胞 不编辑脑细胞

【在 P********R 的大作中提到】
: 在小鼠的研究中,CCR5还与学习与记忆相关。贺教授是真的没做够功课呢还是就是想用
: 人做研究?

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P*R
3
增加一个CCR5的copy?

【在 H********g 的大作中提到】
: 所以就得去我和大蝌蚪开的公司 只编辑患者的t细胞 不编辑脑细胞
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H*g
4
亲,这个也可以的!但是价格要贵一点!

【在 P********R 的大作中提到】
: 增加一个CCR5的copy?
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x*u
5
北欧百分之10的人天生么没有,也是一切正常
相关不等于因果

【在 P********R 的大作中提到】
: 在小鼠的研究中,CCR5还与学习与记忆相关。贺教授是真的没做够功课呢还是就是想用
: 人做研究?

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d*o
6
只是改掉一截不是全删掉
基本功能应该还是有吧
删了估计会死

【在 x****u 的大作中提到】
: 北欧百分之10的人天生么没有,也是一切正常
: 相关不等于因果

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p*h
7
未必吧,不是说dna里大部分是legacy废码吗?
目前对基因的功能原理还在原始社会阶段

【在 d****o 的大作中提到】
: 只是改掉一截不是全删掉
: 基本功能应该还是有吧
: 删了估计会死

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H*g
8
这个delta32是在ORF中间缺了32个核苷酸,导致密码子移位,翻译提前终止。
ccr5本身是个7螺旋-穿膜 G蛋白欧联受体 (GPCR),正常翻译长度是352 氨基酸,基本
全插在细胞膜里。delta32之后,翻译长度成了215氨基酸,其中只有前面184个氨基酸
跟正常序列一样。
通常这么严重的提前终止,都是导致完全失活的。当然也有特殊情况是弄出来一个新的
蛋白,但是这个比较罕见。尤其考虑到这个ccr5是单结构域蛋白,缺了这么大一块可能
既插不进膜里也溶不进水里,很可能刚翻译完就被细胞自己降解了(也正是因为这样,
它才到不了细胞表面,所以HIV看不到它)。wikipeida说delta32之后,这个ccr5就不
上细胞膜了,所以估计是直接被细胞降解了。至少,GPCR不上细胞膜的话应该一点功能
都没有。
加上考虑到delta32确实在正常人群里就有(不知道平均智商如何),所以贺某删了这
个蛋白,【可能】实际上最后造成的问题不会很大。但是这么做本身是极不必要也风险
极大的,必须谴责。
ccr5的DNA序列:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/U95626.1
delta32的序列:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KP687749.1
野生ccr5 ORF(黑括号里就是delta32丢的部分):
atggattatcaagtgtcaagtccaatctatgacatcaattattatacatcggagccctgc
M D Y Q V S S P I Y D I N Y Y T S E P C
caaaaaatcaatgtgaagcaaatcgcagcccgcctcctgcctccgctctactcactggtg
Q K I N V K Q I A A R L L P P L Y S L V
ttcatctttggttttgtgggcaacatgctggtcatcctcatcctgataaactgcaaaagg
F I F G F V G N M L V I L I L I N C K R
ctgaagagcatgactgacatctacctgctcaacctggccatctctgacctgtttttcctt
L K S M T D I Y L L N L A I S D L F F L
cttactgtccccttctgggctcactatgctgccgcccagtgggactttggaaatacaatg
L T V P F W A H Y A A A Q W D F G N T M
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C Q L L T G L Y F I G F F S G I F F I I
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L L T I D R Y L A V V H A V F A L K A R
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T V T F G V V T S V I T W V V A V F A S
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L P G I I F T R S Q K E G L H Y T C S S
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H F P Y S Q Y Q F W K N F Q T L K I V I
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L G L V L P L L V M V I C Y S G I L K T
ctgcttcggtgtcgaaatgagaagaagaggcacagggctgtgaggcttatcttcaccatc
L L R C R N E K K R H R A V R L I F T I
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M I V Y F L F W A P Y N I V L L L N T F
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Q E F F G L N N C S S S N R L D Q A M Q
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V T E T L G M T H C C I N P I I Y A F V
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G E K F R N Y L L V F F Q K H I A K R F
tgcaaatgctgttctattttccagcaagaggctcccgagcgagcaagctcagtttacacc
C K C C S I F Q Q E A P E R A S S V Y T
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R S T G E Q E I S V G L *
delta32 ORF(和野生相同的蛋白质部分是到FPY,‘【】’就是丢掉那块):
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M D Y Q V S S P I Y D I N Y Y T S E P C
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Q K I N V K Q I A A R L L P P L Y S L V
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F I F G F V G N M L V I L I L I N C K R
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L K S M T D I Y L L N L A I S D L F F L
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L T V P F W A H Y A A A Q W D F G N T M
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C Q L L T G L Y F I G F F S G I F F I I
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T V T F G V V T S V I T W V V A V F A S
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L P G I I F T R S Q K E G L H Y T C S S
cattttccataca【】ttaaagatagtcatcttggggctggtcctgccgctgcttgtcatggt
H F P Y I K D S H L G A G P A A A C H G
catctgctactcgggaatcctaaaaactctgcttcggtgtcgaaatgagaagaagaggca
H L L L G N P K N S A S V S K *

【在 d****o 的大作中提到】
: 只是改掉一截不是全删掉
: 基本功能应该还是有吧
: 删了估计会死

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H*g
9
序列考到notepad++里看得清楚些

【在 H********g 的大作中提到】
: 这个delta32是在ORF中间缺了32个核苷酸,导致密码子移位,翻译提前终止。
: ccr5本身是个7螺旋-穿膜 G蛋白欧联受体 (GPCR),正常翻译长度是352 氨基酸,基本
: 全插在细胞膜里。delta32之后,翻译长度成了215氨基酸,其中只有前面184个氨基酸
: 跟正常序列一样。
: 通常这么严重的提前终止,都是导致完全失活的。当然也有特殊情况是弄出来一个新的
: 蛋白,但是这个比较罕见。尤其考虑到这个ccr5是单结构域蛋白,缺了这么大一块可能
: 既插不进膜里也溶不进水里,很可能刚翻译完就被细胞自己降解了(也正是因为这样,
: 它才到不了细胞表面,所以HIV看不到它)。wikipeida说delta32之后,这个ccr5就不
: 上细胞膜了,所以估计是直接被细胞降解了。至少,GPCR不上细胞膜的话应该一点功能
: 都没有。

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d*o
10
Receptor for a number of inflammatory CC-chemokines including CCL3/MIP-1-
alpha, CCL4/MIP-1-beta and RANTES and subsequently transduces a signal by
increasing the intracellular calcium ion level. May play a role in the
control of granulocytic lineage proliferation or differentiation.
纯合的话对免疫力影响应该不小吧

【在 H********g 的大作中提到】
: 这个delta32是在ORF中间缺了32个核苷酸,导致密码子移位,翻译提前终止。
: ccr5本身是个7螺旋-穿膜 G蛋白欧联受体 (GPCR),正常翻译长度是352 氨基酸,基本
: 全插在细胞膜里。delta32之后,翻译长度成了215氨基酸,其中只有前面184个氨基酸
: 跟正常序列一样。
: 通常这么严重的提前终止,都是导致完全失活的。当然也有特殊情况是弄出来一个新的
: 蛋白,但是这个比较罕见。尤其考虑到这个ccr5是单结构域蛋白,缺了这么大一块可能
: 既插不进膜里也溶不进水里,很可能刚翻译完就被细胞自己降解了(也正是因为这样,
: 它才到不了细胞表面,所以HIV看不到它)。wikipeida说delta32之后,这个ccr5就不
: 上细胞膜了,所以估计是直接被细胞降解了。至少,GPCR不上细胞膜的话应该一点功能
: 都没有。

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x*u
11
delta32是最近数百年自然进化出来的缺失,肯定是有相应的好处的,有猜测说对鼠疫
天花免疫

【在 H********g 的大作中提到】
: 这个delta32是在ORF中间缺了32个核苷酸,导致密码子移位,翻译提前终止。
: ccr5本身是个7螺旋-穿膜 G蛋白欧联受体 (GPCR),正常翻译长度是352 氨基酸,基本
: 全插在细胞膜里。delta32之后,翻译长度成了215氨基酸,其中只有前面184个氨基酸
: 跟正常序列一样。
: 通常这么严重的提前终止,都是导致完全失活的。当然也有特殊情况是弄出来一个新的
: 蛋白,但是这个比较罕见。尤其考虑到这个ccr5是单结构域蛋白,缺了这么大一块可能
: 既插不进膜里也溶不进水里,很可能刚翻译完就被细胞自己降解了(也正是因为这样,
: 它才到不了细胞表面,所以HIV看不到它)。wikipeida说delta32之后,这个ccr5就不
: 上细胞膜了,所以估计是直接被细胞降解了。至少,GPCR不上细胞膜的话应该一点功能
: 都没有。

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x*u
12
欧洲百分之十的人有缺失,要是有免疫力缺陷也早在统计学上显现了吧

【在 d****o 的大作中提到】
: Receptor for a number of inflammatory CC-chemokines including CCL3/MIP-1-
: alpha, CCL4/MIP-1-beta and RANTES and subsequently transduces a signal by
: increasing the intracellular calcium ion level. May play a role in the
: control of granulocytic lineage proliferation or differentiation.
: 纯合的话对免疫力影响应该不小吧

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d*o
13
不是欧洲,是北欧
10%是杂合,纯合只有1%
说错了,
北欧最高,
但欧洲好像整体10%携带
纯合还是只有1%

【在 x****u 的大作中提到】
: 欧洲百分之十的人有缺失,要是有免疫力缺陷也早在统计学上显现了吧
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x*u
14
这个数量就说明突变在某种条件下有优势啊,否则不可能800年积累这么多啊
wiki写是整个欧洲,这个数量可不小
CCR5 Δ32 has an (heterozygote) allele frequency of 10% in Europe, and a
homozygote frequency of 1%.

【在 d****o 的大作中提到】
: 不是欧洲,是北欧
: 10%是杂合,纯合只有1%
: 说错了,
: 北欧最高,
: 但欧洲好像整体10%携带
: 纯合还是只有1%

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d*o
15
地中海贫血还防疟疾呢
不妨碍它在正常人身上是缺陷
给疟疾高发区屁民全部转上地中海贫血基因,
舆论肯定爆炸

【在 x****u 的大作中提到】
: 这个数量就说明突变在某种条件下有优势啊,否则不可能800年积累这么多啊
: wiki写是整个欧洲,这个数量可不小
: CCR5 Δ32 has an (heterozygote) allele frequency of 10% in Europe, and a
: homozygote frequency of 1%.

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H*g
16
可能是其功能还没被明确认识到。人体里不知道具体功能的蛋白多了去了(当然不是说
是个蛋白肯定有功能。没功能的蛋白肯定是存在的,想演化就得养闲汉)。生物才搞了
多少年,还不能说现在认识不到的东西肯定不存在。
如果ccr5是跟免疫相关,也可能是它负责的免疫原或者免疫过程现在已经不大常遇到了
(比如很久以前有个啥病导致大家都得用一下ccr5,但是那个病杀完了99%的球人以后
就自己饿死了),但是不是说以后不会再出现。就像现在的防毒软件,几百兆的病毒库
,里面的病毒估计大部分都已经在世界上绝迹了,还不是得装着。
总之,为了抗hiv而删掉未知功能的基因是极其傻逼的行为。贺的问题不是造了一个有
病的孩子还是没病的孩子,他的问题是为了功利拿人类的整体利益冒险。

【在 d****o 的大作中提到】
: Receptor for a number of inflammatory CC-chemokines including CCL3/MIP-1-
: alpha, CCL4/MIP-1-beta and RANTES and subsequently transduces a signal by
: increasing the intracellular calcium ion level. May play a role in the
: control of granulocytic lineage proliferation or differentiation.
: 纯合的话对免疫力影响应该不小吧

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d*o
17
这个蛋白ligand和下游信号都是知道的,
功能肯定有,
只是可能冗余比较大,
没有明确的缺乏症

【在 H********g 的大作中提到】
: 可能是其功能还没被明确认识到。人体里不知道具体功能的蛋白多了去了(当然不是说
: 是个蛋白肯定有功能。没功能的蛋白肯定是存在的,想演化就得养闲汉)。生物才搞了
: 多少年,还不能说现在认识不到的东西肯定不存在。
: 如果ccr5是跟免疫相关,也可能是它负责的免疫原或者免疫过程现在已经不大常遇到了
: (比如很久以前有个啥病导致大家都得用一下ccr5,但是那个病杀完了99%的球人以后
: 就自己饿死了),但是不是说以后不会再出现。就像现在的防毒软件,几百兆的病毒库
: ,里面的病毒估计大部分都已经在世界上绝迹了,还不是得装着。
: 总之,为了抗hiv而删掉未知功能的基因是极其傻逼的行为。贺的问题不是造了一个有
: 病的孩子还是没病的孩子,他的问题是为了功利拿人类的整体利益冒险。

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H*g
18
那我的乙醛脱氢酶缺失,是个什么进化优势啊?
很多轻微缺陷,不造成很大的选择压力,就可以保持在人群里,并不等于它就好。尤其
是人类的遗传不光是有自然因素,还有社会因素。假如古代某个贵族发生了突变,因为
他家族的社会经济地位远胜于身体好的农民,那他的垃圾基因还是会撒得到处都是。人
类社会就是这样,帝王将相那个种,不一定是好种,但是扩散很快。

【在 x****u 的大作中提到】
: 这个数量就说明突变在某种条件下有优势啊,否则不可能800年积累这么多啊
: wiki写是整个欧洲,这个数量可不小
: CCR5 Δ32 has an (heterozygote) allele frequency of 10% in Europe, and a
: homozygote frequency of 1%.

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x*u
19
地中海贫血是轻型的人多,重型的人少,分很多子类型,如果疟疾流行像天花那么猛估
计就有彻底无症状地中海贫血了

【在 d****o 的大作中提到】
: 地中海贫血还防疟疾呢
: 不妨碍它在正常人身上是缺陷
: 给疟疾高发区屁民全部转上地中海贫血基因,
: 舆论肯定爆炸

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x*u
20
人类不感染大量寄生虫实际上已经严重影响免疫系统的正常运行了,类似于杀毒软件积
累的老病毒指纹多了,哪天把系统文件给杀了就是严重自身免疫系统
人类这个基因组是进化的很反人性的,不加外部干预,自然有百分之几十的生育死亡率
和新生儿死亡率
现在生孩子一看不好就剖腹产,顺产也侧切,是鼓励人类生育自然分娩不了的孩子,这
么再折腾几百年后搞不好离开医院妇女生育死亡率得过80%。

【在 H********g 的大作中提到】
: 可能是其功能还没被明确认识到。人体里不知道具体功能的蛋白多了去了(当然不是说
: 是个蛋白肯定有功能。没功能的蛋白肯定是存在的,想演化就得养闲汉)。生物才搞了
: 多少年,还不能说现在认识不到的东西肯定不存在。
: 如果ccr5是跟免疫相关,也可能是它负责的免疫原或者免疫过程现在已经不大常遇到了
: (比如很久以前有个啥病导致大家都得用一下ccr5,但是那个病杀完了99%的球人以后
: 就自己饿死了),但是不是说以后不会再出现。就像现在的防毒软件,几百兆的病毒库
: ,里面的病毒估计大部分都已经在世界上绝迹了,还不是得装着。
: 总之,为了抗hiv而删掉未知功能的基因是极其傻逼的行为。贺的问题不是造了一个有
: 病的孩子还是没病的孩子,他的问题是为了功利拿人类的整体利益冒险。

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x*u
21
你喝酒少就不容易得很多酒精相关的癌症啊
酒精本来就是酵母菌进化出来的毒素,乙醇一出霉菌死光光,人类祖先为了食腐烂水果
才拼死进化出了这个东西

【在 H********g 的大作中提到】
: 那我的乙醛脱氢酶缺失,是个什么进化优势啊?
: 很多轻微缺陷,不造成很大的选择压力,就可以保持在人群里,并不等于它就好。尤其
: 是人类的遗传不光是有自然因素,还有社会因素。假如古代某个贵族发生了突变,因为
: 他家族的社会经济地位远胜于身体好的农民,那他的垃圾基因还是会撒得到处都是。人
: 类社会就是这样,帝王将相那个种,不一定是好种,但是扩散很快。

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d*o
22
那不还是缺陷?
CCR5缺失也完全可能在有某些生理缺陷的前提下没有消失

【在 x****u 的大作中提到】
: 地中海贫血是轻型的人多,重型的人少,分很多子类型,如果疟疾流行像天花那么猛估
: 计就有彻底无症状地中海贫血了

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x*u
23
完全无症状的缺陷就不是缺陷啊,比如有这个CCR5可以对抗某史前原核生物,但现在只
剩下了痕迹。进化也不一定是基因表达愈来愈越丰富,总体更有效才是最终目标

【在 d****o 的大作中提到】
: 那不还是缺陷?
: CCR5缺失也完全可能在有某些生理缺陷的前提下没有消失

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H*g
24
军版有个帖子说贺发表的数据说明他做的两个儿童里,ccr5的序列跟delta32不一样。
这个只是说明他的技术比较糙而已。 如果delta32本身就是个失活突变,其实打成啥
样都行,照我看最好是把整个mRNA删了,因为翻译半个蛋白质对细胞还是稍微有一点点
不好的 。只要ccr5不会表达到细胞表面,抗那个hiv毒株的效果是一样的。国内的人太
极端了。
http://www.mitbbs.com/article_t/Military/52098809.html
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H*g
25
这些新突变可以当基因签名。以后看到这些序列,就知道是lulu nana的后代。

【在 H********g 的大作中提到】
: 军版有个帖子说贺发表的数据说明他做的两个儿童里,ccr5的序列跟delta32不一样。
: 这个只是说明他的技术比较糙而已。 如果delta32本身就是个失活突变,其实打成啥
: 样都行,照我看最好是把整个mRNA删了,因为翻译半个蛋白质对细胞还是稍微有一点点
: 不好的 。只要ccr5不会表达到细胞表面,抗那个hiv毒株的效果是一样的。国内的人太
: 极端了。
: http://www.mitbbs.com/article_t/Military/52098809.html

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x*u
26
贺第二天自己说深度测序未检测脱靶,疑似脱靶为误报
现在这事水开始深了,国内开始删帖
涉及到伦理人就会很疯狂,试管婴儿当年压力可想而知

【在 H********g 的大作中提到】
: 军版有个帖子说贺发表的数据说明他做的两个儿童里,ccr5的序列跟delta32不一样。
: 这个只是说明他的技术比较糙而已。 如果delta32本身就是个失活突变,其实打成啥
: 样都行,照我看最好是把整个mRNA删了,因为翻译半个蛋白质对细胞还是稍微有一点点
: 不好的 。只要ccr5不会表达到细胞表面,抗那个hiv毒株的效果是一样的。国内的人太
: 极端了。
: http://www.mitbbs.com/article_t/Military/52098809.html

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x*u
27
贺做了多次基因检测,出生后的他自己说未发现脱靶
对于全基因组测序,我们做了100倍脐带血和30倍其他测序,在基因组范围内没有观察
到脱靶,也没有观察到使用全基因组测序的缺失。

【在 H********g 的大作中提到】
: 这些新突变可以当基因签名。以后看到这些序列,就知道是lulu nana的后代。
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H*g
28
脱不脱靶都不重要。重要的是把人做出来这个事情本身。
揪细节,希望他犯错,只是一厢情愿,舍本逐末,wishful thinking。过几天被piapia
打脸的时候,难道把诺奖奉上么?

【在 x****u 的大作中提到】
: 贺做了多次基因检测,出生后的他自己说未发现脱靶
: 对于全基因组测序,我们做了100倍脐带血和30倍其他测序,在基因组范围内没有观察
: 到脱靶,也没有观察到使用全基因组测序的缺失。

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x*u
29
前不久人工智能学界刚有个类似的争议,就是说科研是否必须要在理论完备的情况下推
进,两边都是大牛。
我的看法是从直觉上说,任何领域如果等到理论100%正确再推进,就等于放弃发展。或
者说无实践作为铺垫的理论发展难度是指数的,而有了实践就变成类多项式了。
BTW,我觉得删除一个训练效果不够好的卷积神经网络也类似于杀人了。这个几十兆字
节网络是可以产生类人情感的,你的喜怒哀乐表情它能基于直觉感知并反馈。

piapia

【在 H********g 的大作中提到】
: 脱不脱靶都不重要。重要的是把人做出来这个事情本身。
: 揪细节,希望他犯错,只是一厢情愿,舍本逐末,wishful thinking。过几天被piapia
: 打脸的时候,难道把诺奖奉上么?

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d*o
30
没有发现不等于没有
可能在某些特定条件下发生,
比如坏血病
也可能是现在没确认症状

【在 x****u 的大作中提到】
: 完全无症状的缺陷就不是缺陷啊,比如有这个CCR5可以对抗某史前原核生物,但现在只
: 剩下了痕迹。进化也不一定是基因表达愈来愈越丰富,总体更有效才是最终目标

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d*o
31
在当前来说确实是这样
但很可能未来伦理观下这根本不是个事儿
那贺教授就赚大了
威廉哈维割死人的时候也是为当时伦理观不容的
不妨碍成了生理学之父

piapia

【在 H********g 的大作中提到】
: 脱不脱靶都不重要。重要的是把人做出来这个事情本身。
: 揪细节,希望他犯错,只是一厢情愿,舍本逐末,wishful thinking。过几天被piapia
: 打脸的时候,难道把诺奖奉上么?

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x*u
32
你身上也有各种突变啊,不同的是这个突变是有明确遗传优势的,积累的欧洲10%人口数

【在 d****o 的大作中提到】
: 没有发现不等于没有
: 可能在某些特定条件下发生,
: 比如坏血病
: 也可能是现在没确认症状

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x*u
33
哥白尼提出的日心说是不符合当时大部分观测数据的,基本也是一种宗教执着

【在 d****o 的大作中提到】
: 在当前来说确实是这样
: 但很可能未来伦理观下这根本不是个事儿
: 那贺教授就赚大了
: 威廉哈维割死人的时候也是为当时伦理观不容的
: 不妨碍成了生理学之父
:
: piapia

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d*o
34
哥白尼这个属于言论自由范畴
跟医学伦理关系不大

【在 x****u 的大作中提到】
: 哥白尼提出的日心说是不符合当时大部分观测数据的,基本也是一种宗教执着
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d*o
35
什么遗传优势?
优势劣势都是针对环境的
某些环境的特殊优势很可能是普通环境下的劣势

口数

【在 x****u 的大作中提到】
: 你身上也有各种突变啊,不同的是这个突变是有明确遗传优势的,积累的欧洲10%人口数
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x*u
36
不得天花或者艾滋算是优势还是劣势呢?现在人类不需要原始那么强力的免疫力了,吃
个果子狸都能搞成瘟疫也算退化的证据吧

【在 d****o 的大作中提到】
: 什么遗传优势?
: 优势劣势都是针对环境的
: 某些环境的特殊优势很可能是普通环境下的劣势
:
: 口数

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d*o
37
不得艾滋的优势,
在艾滋风险小到一定程度以后完全可以是劣势
吃个果子狸就死了,
说明在吃果子狸的地区是劣势

【在 x****u 的大作中提到】
: 不得天花或者艾滋算是优势还是劣势呢?现在人类不需要原始那么强力的免疫力了,吃
: 个果子狸都能搞成瘟疫也算退化的证据吧

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x*u
38
SARS的最初几个超级病人搞的身边尸横遍野,自己反而没事

【在 d****o 的大作中提到】
: 不得艾滋的优势,
: 在艾滋风险小到一定程度以后完全可以是劣势
: 吃个果子狸就死了,
: 说明在吃果子狸的地区是劣势

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d*o
39
SARS死于cytokine storm
并不是因为免疫力强
而是死于免疫系统失控
你弄掉一部分平时看起来没啥用的,
完全可能是关键时刻才用上的一个辅助刹车的部件

【在 x****u 的大作中提到】
: SARS的最初几个超级病人搞的身边尸横遍野,自己反而没事
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