Re: 有谁觉得做bioinformatics 的数据分析 python比R好的？ (转载)# Programming - 葵花宝典
b*g
1 楼
毕业以后可能要做两份half-time postdoc，两个不同学校
OPT或H1B，H1B可能性大一点
有两份工作情况下怎么签证呢？ 是用一份工作的资料去申请，还是用两份的？
OPT或H1B，H1B可能性大一点
有两份工作情况下怎么签证呢？ 是用一份工作的资料去申请，还是用两份的？
c*i
2 楼
明星保养肯定是强过一般人的, 但也不至于40岁素颜脸上除了奔波留下的一颗小痘
和大眼睛人都有的一点点不夸张的鱼尾纹再也找不到任何瑕疵了! 人间极品简直了!!
看花样姐姐更了解她了, 情商高颜值高就算了, 主要智商更高, 话多却没什么可让
人诟病的, 在一个到处是非不断的网络世界都可以安然无恙就知道她的外在加内在真是
近乎完美了, 封她弯弯第一当之有余了, 内地也找不出几个可以各方面同时和她pk的吧!
难怪男女通吃! 这般完美的人就算是同性也恨不起来!
和大眼睛人都有的一点点不夸张的鱼尾纹再也找不到任何瑕疵了! 人间极品简直了!!
看花样姐姐更了解她了, 情商高颜值高就算了, 主要智商更高, 话多却没什么可让
人诟病的, 在一个到处是非不断的网络世界都可以安然无恙就知道她的外在加内在真是
近乎完美了, 封她弯弯第一当之有余了, 内地也找不出几个可以各方面同时和她pk的吧!
难怪男女通吃! 这般完美的人就算是同性也恨不起来!
x*n
3 楼
在外面上internet, 有没有办法网络唤醒router里的server?
假设操作系统都是win7, server有线/无线网卡都available, bios里wake on LAN
enabled.
假设操作系统都是win7, server有线/无线网卡都available, bios里wake on LAN
enabled.
b*r
4 楼
看到有人在讨论Kindle 3G的流量费，很奇怪
不是说Kindle 3G是免费的吗？
今天下午刚在amazon上订了kindle 3G版，为了能够应急查个邮件，或者订阅个blog什
么的。
不是说Kindle 3G是免费的吗？
今天下午刚在amazon上订了kindle 3G版，为了能够应急查个邮件，或者订阅个blog什
么的。
l*k
5 楼
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: xydotcom (xydotcom), 信区: Biology
标 题: Re: 有谁觉得做bioinformatics 的数据分析 python比R好的？
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Jun 26 16:00:30 2014, 美东)
你可以用java c++ 代替python做任何东西。但是在统计分析时，没有什么可以代替R，
发信人: xydotcom (xydotcom), 信区: Biology
标 题: Re: 有谁觉得做bioinformatics 的数据分析 python比R好的？
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Jun 26 16:00:30 2014, 美东)
你可以用java c++ 代替python做任何东西。但是在统计分析时，没有什么可以代替R，
S*I
6 楼
你需要两个H-1B，用其中一个签就行
【在 b******g 的大作中提到】
: 毕业以后可能要做两份half-time postdoc，两个不同学校
: OPT或H1B，H1B可能性大一点
: 有两份工作情况下怎么签证呢？ 是用一份工作的资料去申请，还是用两份的？
【在 b******g 的大作中提到】
: 毕业以后可能要做两份half-time postdoc，两个不同学校
: OPT或H1B，H1B可能性大一点
: 有两份工作情况下怎么签证呢？ 是用一份工作的资料去申请，还是用两份的？
t*g
7 楼
我也想知道。
【在 x*****n 的大作中提到】
: 在外面上internet, 有没有办法网络唤醒router里的server?
: 假设操作系统都是win7, server有线/无线网卡都available, bios里wake on LAN
: enabled.
【在 x*****n 的大作中提到】
: 在外面上internet, 有没有办法网络唤醒router里的server?
: 假设操作系统都是win7, server有线/无线网卡都available, bios里wake on LAN
: enabled.
j*n
8 楼
3G上网免费， 但是用3G传送amazon帮你转的文件要收费的。
N*K
9 楼
R有些别人写好的公式算法而已
【在 l********k 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
: 发信人: xydotcom (xydotcom), 信区: Biology
: 标 题: Re: 有谁觉得做bioinformatics 的数据分析 python比R好的？
: 发信站: BBS 未名空间站 (Thu Jun 26 16:00:30 2014, 美东)
: 你可以用java c++ 代替python做任何东西。但是在统计分析时，没有什么可以代替R，
【在 l********k 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
: 发信人: xydotcom (xydotcom), 信区: Biology
: 标 题: Re: 有谁觉得做bioinformatics 的数据分析 python比R好的？
: 发信站: BBS 未名空间站 (Thu Jun 26 16:00:30 2014, 美东)
: 你可以用java c++ 代替python做任何东西。但是在统计分析时，没有什么可以代替R，
b*g
10 楼
谢谢答复
【在 S**I 的大作中提到】
: 你需要两个H-1B，用其中一个签就行
【在 S**I 的大作中提到】
: 你需要两个H-1B，用其中一个签就行
t*g
11 楼
是不是wake on message的port forwarding到要唤醒的server 内网ip上去？
【在 x*****n 的大作中提到】
: 在外面上internet, 有没有办法网络唤醒router里的server?
: 假设操作系统都是win7, server有线/无线网卡都available, bios里wake on LAN
: enabled.
【在 x*****n 的大作中提到】
: 在外面上internet, 有没有办法网络唤醒router里的server?
: 假设操作系统都是win7, server有线/无线网卡都available, bios里wake on LAN
: enabled.
l*t
12 楼
做bioinformatics如果不是Python，R双修的话，就过时了。
【在 l********k 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
: 发信人: xydotcom (xydotcom), 信区: Biology
: 标 题: Re: 有谁觉得做bioinformatics 的数据分析 python比R好的？
: 发信站: BBS 未名空间站 (Thu Jun 26 16:00:30 2014, 美东)
: 你可以用java c++ 代替python做任何东西。但是在统计分析时，没有什么可以代替R，
【在 l********k 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
: 发信人: xydotcom (xydotcom), 信区: Biology
: 标 题: Re: 有谁觉得做bioinformatics 的数据分析 python比R好的？
: 发信站: BBS 未名空间站 (Thu Jun 26 16:00:30 2014, 美东)
: 你可以用java c++ 代替python做任何东西。但是在统计分析时，没有什么可以代替R，
x*n
13 楼
我也是这个思路,magic packet到router,router port forwarding,还没试.
如果windows 7有什么现成solution那就更好.
【在 t****g 的大作中提到】
: 是不是wake on message的port forwarding到要唤醒的server 内网ip上去？
如果windows 7有什么现成solution那就更好.
【在 t****g 的大作中提到】
: 是不是wake on message的port forwarding到要唤醒的server 内网ip上去？
n*7
14 楼
而已。。。
不服你也写个
【在 N******K 的大作中提到】
: R有些别人写好的公式算法而已
不服你也写个
【在 N******K 的大作中提到】
: R有些别人写好的公式算法而已
T*n
15 楼
我用的router tomato里面有wake on lan功能，可以直接登录后唤醒
如果是普通router，打开port forwarding，然后用wake online软件指明你的ip和port
，发margic packet就可以了
【在 x*****n 的大作中提到】
: 在外面上internet, 有没有办法网络唤醒router里的server?
: 假设操作系统都是win7, server有线/无线网卡都available, bios里wake on LAN
: enabled.
如果是普通router，打开port forwarding，然后用wake online软件指明你的ip和port
，发margic packet就可以了
【在 x*****n 的大作中提到】
: 在外面上internet, 有没有办法网络唤醒router里的server?
: 假设操作系统都是win7, server有线/无线网卡都available, bios里wake on LAN
: enabled.
n*7
16 楼
前段时间认真研究了一下 scipy代替R，及时悬崖勒马了
【在 l*****t 的大作中提到】
: 做bioinformatics如果不是Python，R双修的话，就过时了。
【在 l*****t 的大作中提到】
: 做bioinformatics如果不是Python，R双修的话，就过时了。
a*s
17 楼
It has been discussed extensivly at many places before. Basically it is not
secure practice and most routers today does not allow this feature. So
either you expose all your machines on your private network or forget it.
Believe me, even if you don't care about security, it is not easy to find a
compatible router.
secure practice and most routers today does not allow this feature. So
either you expose all your machines on your private network or forget it.
Believe me, even if you don't care about security, it is not easy to find a
compatible router.
T*u
18 楼
同意，没必要啊，以scipy之短，博R之长。
【在 n******7 的大作中提到】
: 前段时间认真研究了一下 scipy代替R，及时悬崖勒马了
【在 n******7 的大作中提到】
: 前段时间认真研究了一下 scipy代替R，及时悬崖勒马了
T*n
19 楼
你说的是port forwarding不secure？
not
a
【在 a*****s 的大作中提到】
: It has been discussed extensivly at many places before. Basically it is not
: secure practice and most routers today does not allow this feature. So
: either you expose all your machines on your private network or forget it.
: Believe me, even if you don't care about security, it is not easy to find a
: compatible router.
not
a
【在 a*****s 的大作中提到】
: It has been discussed extensivly at many places before. Basically it is not
: secure practice and most routers today does not allow this feature. So
: either you expose all your machines on your private network or forget it.
: Believe me, even if you don't care about security, it is not easy to find a
: compatible router.
W*o
20 楼
学术界用R多些
【在 n******7 的大作中提到】
: 前段时间认真研究了一下 scipy代替R，及时悬崖勒马了
【在 n******7 的大作中提到】
: 前段时间认真研究了一下 scipy代替R，及时悬崖勒马了
a*s
21 楼
No, port forwarding is safe in general. However, port forwarding to a
broadcasting address is very dangerous. But there are people who don't care.
【在 T****n 的大作中提到】
: 你说的是port forwarding不secure？
:
: not
: a
broadcasting address is very dangerous. But there are people who don't care.
【在 T****n 的大作中提到】
: 你说的是port forwarding不secure？
:
: not
: a
N*K
22 楼
我天天在写新算法
【在 n******7 的大作中提到】
: 而已。。。
: 不服你也写个
【在 n******7 的大作中提到】
: 而已。。。
: 不服你也写个
l*u
23 楼
直接进router里唤醒，如果你的router装得是ddwrt的话；
很简单，一个click就唤醒；
【在 x*****n 的大作中提到】
: 在外面上internet, 有没有办法网络唤醒router里的server?
: 假设操作系统都是win7, server有线/无线网卡都available, bios里wake on LAN
: enabled.
很简单，一个click就唤醒；
【在 x*****n 的大作中提到】
: 在外面上internet, 有没有办法网络唤醒router里的server?
: 假设操作系统都是win7, server有线/无线网卡都available, bios里wake on LAN
: enabled.
n*7
24 楼
so what??
所以你可以写个R出来？
所以你自己啥都要自己写？
所以不会写算法的才用R？
自我中心的太厉害了
【在 N******K 的大作中提到】
: 我天天在写新算法
所以你可以写个R出来？
所以你自己啥都要自己写？
所以不会写算法的才用R？
自我中心的太厉害了
【在 N******K 的大作中提到】
: 我天天在写新算法
x*n
25 楼
你是说ddwrt菜单里就有？哪里？我去找找
【在 l****u 的大作中提到】
: 直接进router里唤醒，如果你的router装得是ddwrt的话；
: 很简单，一个click就唤醒；
【在 l****u 的大作中提到】
: 直接进router里唤醒，如果你的router装得是ddwrt的话；
: 很简单，一个click就唤醒；
n*7
26 楼
我一般用python做data processing,R做analysis
我想试试用python搞定全套东西
numpy+scipy+matplotlib+pandas
似乎很好很强大
另外一点是我对ggplot2有点不爽
文档太简陋了，稍微特别点的图就要google stackoverflow上看别人答案
而且还老在变，比如theme什么的
隔壁组的一人一直用matplotlib画图，感觉也还不错
不过他也觉得scipy不如R，准备跳过来了了
【在 T*****u 的大作中提到】
: 同意，没必要啊，以scipy之短，博R之长。
我想试试用python搞定全套东西
numpy+scipy+matplotlib+pandas
似乎很好很强大
另外一点是我对ggplot2有点不爽
文档太简陋了，稍微特别点的图就要google stackoverflow上看别人答案
而且还老在变，比如theme什么的
隔壁组的一人一直用matplotlib画图，感觉也还不错
不过他也觉得scipy不如R，准备跳过来了了
【在 T*****u 的大作中提到】
: 同意，没必要啊，以scipy之短，博R之长。
V*r
27 楼
哪些不如？具体说说？
【在 n******7 的大作中提到】
: 我一般用python做data processing,R做analysis
: 我想试试用python搞定全套东西
: numpy+scipy+matplotlib+pandas
: 似乎很好很强大
: 另外一点是我对ggplot2有点不爽
: 文档太简陋了，稍微特别点的图就要google stackoverflow上看别人答案
: 而且还老在变，比如theme什么的
: 隔壁组的一人一直用matplotlib画图，感觉也还不错
: 不过他也觉得scipy不如R，准备跳过来了了
【在 n******7 的大作中提到】
: 我一般用python做data processing,R做analysis
: 我想试试用python搞定全套东西
: numpy+scipy+matplotlib+pandas
: 似乎很好很强大
: 另外一点是我对ggplot2有点不爽
: 文档太简陋了，稍微特别点的图就要google stackoverflow上看别人答案
: 而且还老在变，比如theme什么的
: 隔壁组的一人一直用matplotlib画图，感觉也还不错
: 不过他也觉得scipy不如R，准备跳过来了了
n*7
28 楼
都是一些琐碎的问题
http://www.mitbbs.com/article/Programming/31349753_3.html
反正我是没信心了，还是用最主流的工具省心
另外对于做bioinfo来说，bioconductor太有用了
【在 V*********r 的大作中提到】
: 哪些不如？具体说说？
http://www.mitbbs.com/article/Programming/31349753_3.html
反正我是没信心了，还是用最主流的工具省心
另外对于做bioinfo来说，bioconductor太有用了
【在 V*********r 的大作中提到】
: 哪些不如？具体说说？
d*r
29 楼
忍不住问一下，你们统计的画图，要是在不同软件间来回传数据，
也是用的 csv 这种通用格式吧？有没有人转成JSON扔到 JavaScript 里画？
比如用 D3.js 这种，不比 Python/R 爽多了？还可以动态调改
http://d3js.org/
【在 n******7 的大作中提到】
: 我一般用python做data processing,R做analysis
: 我想试试用python搞定全套东西
: numpy+scipy+matplotlib+pandas
: 似乎很好很强大
: 另外一点是我对ggplot2有点不爽
: 文档太简陋了，稍微特别点的图就要google stackoverflow上看别人答案
: 而且还老在变，比如theme什么的
: 隔壁组的一人一直用matplotlib画图，感觉也还不错
: 不过他也觉得scipy不如R，准备跳过来了了
也是用的 csv 这种通用格式吧？有没有人转成JSON扔到 JavaScript 里画？
比如用 D3.js 这种，不比 Python/R 爽多了？还可以动态调改
http://d3js.org/
【在 n******7 的大作中提到】
: 我一般用python做data processing,R做analysis
: 我想试试用python搞定全套东西
: numpy+scipy+matplotlib+pandas
: 似乎很好很强大
: 另外一点是我对ggplot2有点不爽
: 文档太简陋了，稍微特别点的图就要google stackoverflow上看别人答案
: 而且还老在变，比如theme什么的
: 隔壁组的一人一直用matplotlib画图，感觉也还不错
: 不过他也觉得scipy不如R，准备跳过来了了
T*u
30 楼
我用python做data management，用R做data analysis，感觉比较舒服；这个应该跟你
的思路是一样的。以前是什么东西都自己做做，现在觉着还是站在别人的肩膀上舒服一
些。
【在 n******7 的大作中提到】
: 我一般用python做data processing,R做analysis
: 我想试试用python搞定全套东西
: numpy+scipy+matplotlib+pandas
: 似乎很好很强大
: 另外一点是我对ggplot2有点不爽
: 文档太简陋了，稍微特别点的图就要google stackoverflow上看别人答案
: 而且还老在变，比如theme什么的
: 隔壁组的一人一直用matplotlib画图，感觉也还不错
: 不过他也觉得scipy不如R，准备跳过来了了
的思路是一样的。以前是什么东西都自己做做，现在觉着还是站在别人的肩膀上舒服一
些。
【在 n******7 的大作中提到】
: 我一般用python做data processing,R做analysis
: 我想试试用python搞定全套东西
: numpy+scipy+matplotlib+pandas
: 似乎很好很强大
: 另外一点是我对ggplot2有点不爽
: 文档太简陋了，稍微特别点的图就要google stackoverflow上看别人答案
: 而且还老在变，比如theme什么的
: 隔壁组的一人一直用matplotlib画图，感觉也还不错
: 不过他也觉得scipy不如R，准备跳过来了了
W*o
31 楼
我用java处理数据，然后用python或者R 做分析，画图
最近在琢磨用D3，不过发现这个library支持的model太少了
【在 T*****u 的大作中提到】
: 我用python做data management，用R做data analysis，感觉比较舒服；这个应该跟你
: 的思路是一样的。以前是什么东西都自己做做，现在觉着还是站在别人的肩膀上舒服一
: 些。
最近在琢磨用D3，不过发现这个library支持的model太少了
【在 T*****u 的大作中提到】
: 我用python做data management，用R做data analysis，感觉比较舒服；这个应该跟你
: 的思路是一样的。以前是什么东西都自己做做，现在觉着还是站在别人的肩膀上舒服一
: 些。
t*e
32 楼
画图上node.js, 大杀器啊
w*g
33 楼
有点杀鸡用牛刀的感觉。我们以前发paper都用gnuplot画的图。
【在 t********e 的大作中提到】
: 画图上node.js, 大杀器啊
【在 t********e 的大作中提到】
: 画图上node.js, 大杀器啊
t*e
34 楼
现在的不少paper, 图已经不够了， 很多要源代码，还有demo
node.js正合适
【在 w***g 的大作中提到】
: 有点杀鸡用牛刀的感觉。我们以前发paper都用gnuplot画的图。
node.js正合适
【在 w***g 的大作中提到】
: 有点杀鸡用牛刀的感觉。我们以前发paper都用gnuplot画的图。
W*o
35 楼
能否介绍几个用node.js作图的example？ 需要用啥library 吗？
【在 t********e 的大作中提到】
: 现在的不少paper, 图已经不够了， 很多要源代码，还有demo
: node.js正合适
【在 t********e 的大作中提到】
: 现在的不少paper, 图已经不够了， 很多要源代码，还有demo
: node.js正合适
t*e
36 楼
d3.js
【在 W***o 的大作中提到】
: 能否介绍几个用node.js作图的example？ 需要用啥library 吗？
【在 W***o 的大作中提到】
: 能否介绍几个用node.js作图的example？ 需要用啥library 吗？
n*7
37 楼
D3我琢磨过，还怂恿我同事用过
但是感觉这个不是专门为统计设计的，高级点的统计作图估计搞不定
不过好处是可以做dynamic,interactive的图表，我一直觉得这种效果用来忽悠外人很
好，以后推广我们的东西的时候我是准备用用这个
【在 d*******r 的大作中提到】
: 忍不住问一下，你们统计的画图，要是在不同软件间来回传数据，
: 也是用的 csv 这种通用格式吧？有没有人转成JSON扔到 JavaScript 里画？
: 比如用 D3.js 这种，不比 Python/R 爽多了？还可以动态调改
: http://d3js.org/
但是感觉这个不是专门为统计设计的，高级点的统计作图估计搞不定
不过好处是可以做dynamic,interactive的图表，我一直觉得这种效果用来忽悠外人很
好，以后推广我们的东西的时候我是准备用用这个
【在 d*******r 的大作中提到】
: 忍不住问一下，你们统计的画图，要是在不同软件间来回传数据，
: 也是用的 csv 这种通用格式吧？有没有人转成JSON扔到 JavaScript 里画？
: 比如用 D3.js 这种，不比 Python/R 爽多了？还可以动态调改
: http://d3js.org/
n*7
38 楼
统计里面水很深，对大部分人来说，能自己倒腾的一般涉及的统计背景很少
如果自己能搞定，用的比较多，还希望有些自由度的功能，还是自己写好
开源的东西文档烂，有bug，有时候干半天发现被坑了
【在 T*****u 的大作中提到】
: 我用python做data management，用R做data analysis，感觉比较舒服；这个应该跟你
: 的思路是一样的。以前是什么东西都自己做做，现在觉着还是站在别人的肩膀上舒服一
: 些。
如果自己能搞定，用的比较多，还希望有些自由度的功能，还是自己写好
开源的东西文档烂，有bug，有时候干半天发现被坑了
【在 T*****u 的大作中提到】
: 我用python做data management，用R做data analysis，感觉比较舒服；这个应该跟你
: 的思路是一样的。以前是什么东西都自己做做，现在觉着还是站在别人的肩膀上舒服一
: 些。
n*7
39 楼
这个是用来画图的？我一直以为是做server段服务的
【在 t********e 的大作中提到】
: 画图上node.js, 大杀器啊
【在 t********e 的大作中提到】
: 画图上node.js, 大杀器啊
n*3
40 楼
same question: node.js 画图?
link please . thanks.
【在 n******7 的大作中提到】
: 这个是用来画图的？我一直以为是做server段服务的
link please . thanks.
【在 n******7 的大作中提到】
: 这个是用来画图的？我一直以为是做server段服务的
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