简单谈谈我对PACB的看法# Stock
E*r
1 楼
今早有人问我对于PACB的看法,不好意思,今天蛮多事情,还来不及马上回复。 说实
在对于下一代测序本人不是专家,不过也随便讲几句。其实Mutate大牛是搞测序的,具
体可以问他。 我曾经到过Ion Torrent看过他们一个Demo,不过感觉比Illumina的方法
差一些。PACB的话,我以前有一个同事在那边工作,后来离开了,问他原因,他说
Bored。 至于长片段有没有用,我的观点是肯定好一些,但不是绝对的。下一代测序是
把短片段通过软件接起来,目前大概Ion Torrent的小片段就100多个碱基,然后串成整
个Genome Sequence。长片段连接的准确率高,短的就差一些,不过还要看软件怎么写。
值得一提的是,测序在临床上的使用还只是开始,能够解决的问题不多,主要是遗传性
疾病,最大的用途是找SNP,现在的Pharmacogenomics很热,也所谓的个体化医疗方案
。现今了解到不少疾病或者药物反应和某些SNP有很大的关系,因此筛选SNP成为分子诊
断非常重要的一个环节。不过测序有点用牛刀,有些东西,一个RT-PCR就可以解决,
Luminex也有专门筛选SNP的检测法,我帮他们做过Validation Assay,很好用。 如果
真的Target一个SNP,传统的测序法足够了,也就5美元测一次,几个小时可以做完。
个人对于下一代测序在临床上的使用报谨慎的态度,我们医院最新规定减少使用分子诊
断的方法,因为那只是做一些预测,想必听到过疾病基因的检测,这些都是胡扯蛋的事
情。临床讲究的是Diagnosis而不是Prediction。
PACB这种公司苟且偷生可以,要想有大发展的话大概也是白日做梦了!
在对于下一代测序本人不是专家,不过也随便讲几句。其实Mutate大牛是搞测序的,具
体可以问他。 我曾经到过Ion Torrent看过他们一个Demo,不过感觉比Illumina的方法
差一些。PACB的话,我以前有一个同事在那边工作,后来离开了,问他原因,他说
Bored。 至于长片段有没有用,我的观点是肯定好一些,但不是绝对的。下一代测序是
把短片段通过软件接起来,目前大概Ion Torrent的小片段就100多个碱基,然后串成整
个Genome Sequence。长片段连接的准确率高,短的就差一些,不过还要看软件怎么写。
值得一提的是,测序在临床上的使用还只是开始,能够解决的问题不多,主要是遗传性
疾病,最大的用途是找SNP,现在的Pharmacogenomics很热,也所谓的个体化医疗方案
。现今了解到不少疾病或者药物反应和某些SNP有很大的关系,因此筛选SNP成为分子诊
断非常重要的一个环节。不过测序有点用牛刀,有些东西,一个RT-PCR就可以解决,
Luminex也有专门筛选SNP的检测法,我帮他们做过Validation Assay,很好用。 如果
真的Target一个SNP,传统的测序法足够了,也就5美元测一次,几个小时可以做完。
个人对于下一代测序在临床上的使用报谨慎的态度,我们医院最新规定减少使用分子诊
断的方法,因为那只是做一些预测,想必听到过疾病基因的检测,这些都是胡扯蛋的事
情。临床讲究的是Diagnosis而不是Prediction。
PACB这种公司苟且偷生可以,要想有大发展的话大概也是白日做梦了!