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20年、60亿人民币、7000种蛋白质,SomaLogic蛋白质组数据库的构建之途

20年、60亿人民币、7000种蛋白质,SomaLogic蛋白质组数据库的构建之途

财经


1995年,Marc Wikins和他的同事在《Electrophoresis》杂志上发表了第一篇提及蛋白质组的期刊文章,他们写道:“‘蛋白质组’是指基因组的总蛋白质补充”。


5年后,科罗拉多大学的Larry Gold教授追逐尚未火热的蛋白质组学赛道,创立了SomaLogic。


作为最早扎进蛋白质组学领域的创新企业之一,SomaLogic如今已走过23个年头,是一家专注于蛋白质生物标志物发现和临床诊断的公司。目前SomaLogic开发的蛋白质组技术平台SOMAmer Assay可测量约7000种蛋白质,是人体内大约20000种蛋白质的一半。在技术平台和临床蛋白质组数据库的支持下,SomaLogic的目标是彻底改变精准医学,解决未满足的医疗需求。


在见证行业兴起的二十余年里,SomaLogic已融资17轮,并于2021年,在蛋白质组学风头正盛时成功IPO,总融资额超9.56亿美元(约60亿人民币),如今市值为4.23亿美元。


创业老将驱动SomaLogic 20年征程


SomaLogic之所以能够稳健发展二十余年,离不开其行业实战经验丰富的团队。


创始人Larry Gold是创业老手。自1970年以来,Larry Gold一直在科罗拉多大学博尔德分校任职,曾担任过分子、细胞和发育生物学系系主任。在创立SomaLogic之前,他曾创建过两家生物技术公司NeXagen和Synergen。在蛋白质组学领域扎根多年,Larry Gold获得过许多荣誉,包括CU杰出讲师奖、美国国立卫生研究院优异奖、职业发展奖和凯龙生物技术奖。


Adam Taich于2021年底加入SomaLogic,最初担任首席商务官,后被任命为SomaLogic的临时首席执行官。他在生命科学和医疗保健市场拥有20多年的经验。在此之前,他曾在Thermo Fisher Scientific担任分子生物学业务副总裁兼总经理,在此职位上,他在超过10亿美元的复杂全球业务中发挥了重要作用。


作为SomaLogic的首席医疗官,Stephen A. Williams医学博士则负责临床研发、医疗事务以及监管和质量工作。在加入SomaLogic之前,他与他人共同创立了制药咨询公司Decisionability, LLC。此前,他曾在辉瑞公司担任副总裁兼临床技术全球主管。


Jason Cleveland博士是SomaLogic的首席技术官。他曾是Asylum Research公司的联合创始人和董事长,该公司后来被出售给牛津仪器公司。他还曾是Digital Instruments公司的一员。目前,Jason Cleveland博士在SomaLogic的工作重点是推动SomaScan平台的技术改进。


得益于核心团队对蛋白质组学市场需求和潜在机会的洞察,SomaLogic在蛋白质组学领域率先研发了蛋白质组学的开创性检测平台,使SomaLogic在蛋白质组学研究领域持续取得突破性进展。


除此之外,该团队在面对市场环境的各种变化和不确定性时,也展现了出色的应变能力,灵活调整策略,来提高公司的适应性和抗风险能力。


尽管SomaLogic 2023年第一季度的财务业绩并不理想,公司的营收同比下降11%,毛利率为39.6%,与2022年同期的49.3%相比有所下降。但SomaLogic团队积极采取措施来应对市场不确定性和挑战。除去授权收入后,公司收入实际上同比增长了2%。


而在面对疫情导致的需求波动和供应链中断等问题时,团队积极调整了运营和管理策略,开展了费用削减计划以确保财务稳健。目前,SomaLogic拥有5.006亿美元的现金、现金等价物和短期投资,为公司后续的战略选择和持续发展提供了资金保障。


7000个分析物,市场上最大的商业蛋白质组测定平台


蛋白质组(Proteome)是指一个细胞、组织或生物体在特定时间点上所表达的所有蛋白质的集合。与基因组类似,蛋白质组代表了一个生物体所有蛋白质的全面信息,包括它们的种类、数量、结构、功能以及相互之间的相互作用。


蛋白质组的研究在生物学和医学领域扮演着关键的角色。在生物学方面,分析蛋白质组,能够揭示蛋白质在细胞功能、信号传导、代谢途径等重要生物过程中的功能和调控机制。在医学领域,蛋白质组研究能够挖掘潜在生物标志物,用于疾病的早期诊断和监测病情进展,为个性化医学提供基础,同时也为药物研发提供了重要的靶点和策略。


■ 解决质谱难题,检测多达7000种蛋白质


蛋白质循环在血液和其他液体中,因此它们易于采样。然而,分析蛋白质组却具有挑战性。许多蛋白质组学实验室的主要工具是质谱(MS),它能够识别和量化给定样品的分子含量。这种方法需要将分子分解成更小的碎片,然后根据它们独特的质量和电荷来分析和解释这些碎片。质谱是一项成熟且完善的技术,但其覆盖范围也受到限制——很难同时分析稀有和丰富的蛋白质。


加州大学旧金山分校的心脏病专家Peter Ganz指出,MS速度缓慢,并且缺乏有效生物标志物发现的动态范围。如果进行非目标实验,MS可以测量出高丰度的蛋白质,但无法测量低浓度的蛋白质。


SomaLogic的蛋白质组学SomaScan Assay平台通过组装SOMAmer试剂来解决这个问题。这些经过化学修饰、基于DNA的SOMAmer试剂经过选择和改造,可与特定的蛋白质靶标结合并保持紧密耦合。SOMAmer试剂在SomaScan Assay平台中应用于临床样品,可用于同时检测多达7000种不同的蛋白质,涵盖从飞摩尔浓度到微摩尔浓度的十个数量级的动态范围。


■ 仅需55µL小样本检验,用可视化呈现结果


SomaScan Assay是第一个可以从55μL样品中测量7000种蛋白质的平台,样本类型包含血浆、血清、脑脊液和多种其他复杂样本类型(人类和非人类)。该平台还提供了极好的再现性,其中值变异系数(CV)约为5%,可以增强发现新的蛋白质生物标志物、查看因果关系和识别新药物靶点的能力。


SomaScan 检测不依赖于可变的多克隆抗体,

因此 SomaScan 数据的变异系数低于行业标准


同时由于采用分层稀释法,在用于分别测量非常高丰度和非常低丰度的蛋白质时,SomaScan Aassy可以从55μl 血浆或血清中测量10个对数的总范围。SomaScan Aassy的分层方法能够在没有样品预处理的情况下一致地检测罕见的蛋白质。该产品还具备高吞吐量,每天可以分析超过1000个临床样本。


分级稀释方法用于测量非常高丰度和非常低丰度的蛋白质


用户能够将SomaScan Aassy与SomaLogic旗下的DataDelve统计平台结合,进行探索性的统计分析,并创建可视化以及可定制的图表,包括制定散点图、箱线图、CDF图,执行相关性、t检验和U检验等各种统计检验。


凭借检测、测试双服务,

与诺华、安进达成合作


目前,面对不同的市场需求,SomaLogic提供两类服务。一是基于SomaScan Assay平台,为客户提供在医药研发和学术研发领域的检测服务;二是通过单次抽血为客户提供多项临床评估的SomaSignal测试服务。


SomaScan Assay平台在医药研发领域可应用于目标识别、目标验证、作用机制、药代动力学、丰富临床试验和临床试验分层等方面。它也适用于学术研发,如疾病生物学建模、疾病亚表型、生理学调查、通路调控调查等。


SomaSignal测试则应用于临床试验监测方面,可以通过简单的血液测试实现频繁采样,而不需要专门的医生或病理学家参与。该测试能够提供一系列临床意义重大的指标,包括21项定量临床指标,涉及心血管疾病、NASH(非酒精性脂肪性肝病)、糖尿病等,并且能够报告患者当前的健康状况并了解患者的风险水平。


这些测试也可供研究使用,涵盖了体内脂肪百分比、静息能量消耗、葡萄糖耐量,以及4年内心脏病发作、中风或心力衰竭的风险等多个方面。


自2015年以来,SomaLogic已经建立了300多个行业合作伙伴和客户关系,其中包括生物制药公司、学术实验室、CRO和卫生系统。SomaLogic的合作伙伴目前涵盖了诺华、安进等知名制药公司,其蛋白质组学检测已经在FDA和美国国立卫生研究院的实验室中得到了应用。


2023年5月10日,SomaLogic将其羽翼伸向中国市场,与上海仁科生物科技有限公司(以下简称仁科生物)达成了战略合作协议。仁科生物将成为SomaLogic在中国的首家授权合作伙伴,为中国用户提供SomaScan Aassy分析服务,并向客户提供相应的SomaScan Aassy数据。











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