Arctoris开发自动化实验室平台,为AI药物发现提供高质量制药数据支撑
随着AI药物研发的方法逐渐向干湿实验结合转变,许多AI公司已开始通过自建或合作的方式开发湿实验平台,以加速药物发现。
Arctoris 是一家以机器人技术、数据科学和机器学习为基础的生物制药平台公司,成立于英国牛津。Arctoris通过自主开发自动化技术平台Ulysses,推动了研发过程中效率、准确性及可重复性的大幅提升,并实现了从小分子设计到IND的完整数据链和元数据捕获,显著提高了数据质量和深度,用于药物研发。
这个端到端自动化平台能够在数百种实验类型和分析中生成大型且精确的数据集。由此产生的数据资产被捕获并通过自动分析管道传递,并直接输入 Arcctoris 的机器学习功能,从而创建能够更快识别优质分子的强大预测模型。Arcctoris 将经验丰富的生物技术和制药资深人士的专业知识与专有技术相结合,可提高成功率并加快临床项目的进展。
目前,Arctoris正在推动Ulysses平台与美国、欧洲和亚太地区的优秀生物技术和制药团队合作,以指导和快速推进其在肿瘤学和神经学领域的药物发现计划。
帮助科研人员跳出重复性实验,
投身于更有创造性的工作
Arctoris由Martin-Immanuel Bittner和Tom Fleming在2016年创立。公司CEO、联合创始人Martin在牛津大学攻读癌症药物发现博士学位。
打造自动化平台的想法,其实源自于Martin第一次进入实验室的经历。当看到传统的实验过程仍然由科研人员花费无数时间手动进行,Martin感受到一种资源的浪费。在他看来,科学家们的时间是非常宝贵的,更应该做的是利用其科研实力推动实际项目进展,而非将宝贵的时间浪费在重复性的实验过程之中。
那么如果有一个机器人实验室平台,不仅能24小时远程运行实验,还可以实现更高的精度和可重复性,从而将时间用于更有创造性的工作,也将会大大提高实验的效率,推动科研工作的创造性进程。
这也成为Arctoris的创立初衷。2016年,Arctoris正式成立,并开发了全世界第一个全自动药物发现平台,通过端到端自动化,该公司的技术平台可快速提供可靠、可重现且完全可审计的数据集,从而在药物发现过程的早期做出更好的决策。
推动实验标准化和高质量数据管理,支持AI药物发现
近年来,随着AI技术的不断发展,越来越多的公司和研究人员试图利用人工智能完成药物发现的不同任务,包括靶点验证、药物合成、新药设计等。而AI药物发现目前最重要的瓶颈是缺乏对高质量、结构良好的数据集的访问。
在Martin看来,自动化实验相比手工实验会有几个方面的提升。首先是在标准化方面,手工操作在操作误差、一致性和可重复性方面较差,而微小的实验操作可能就会导致实验结果不同。自动化能实现高水平的精确度和一致性。
其次是数据采集和数据质量,人工数据采集往往缺乏完整度和精确度,而自动化系统能在实验过程中捕捉到更多维度的元数据,并能实现完整的数据链条,可用于实验回溯。
最后是高质量的数据管理和数据访问。实验室数据往往是分开的,在可访问性和安全存储方面也存在一定风险。由于完整的记录、轻松地分享非常关键,Arctoris将确保所有数据都被采集,并通过一个安全的在线门户进行访问,每个客户和合作伙伴组织都可以安全地访问、查看、下载和分享他们一致结构化和注释的数据。
总的来说,自动化平台可以推动元数据的捕获以及完整可回溯的数据链条存储和访问。数据质量、数据结构和数据生成速度对于机器学习应用非常关键。自动化实验室每次检测可以捕获比行业标准多100倍以上的数据。这种深入而丰富的数据和元数据的结合,正是机器人驱动的药物发现的强大之处,使Arctoris能够生成用于训练机器学习模型的大型、结构化、注释良好的数据集。
基于此,Arctori开发了独特技术平台Ulysses,使该公司能够以更快的速度、更准确和更可重复的方式进行研发,从靶点到hit和候选药物,并显著提高数据质量和深度,为AI药物发现提供有力支撑。
与10余家AI制药机构合作,
同步推动7个内部管线
Martin表示,药物发现生态系统正在迅速发展,成功的关键是在正确的时间访问正确的数据,将正确的项目推向临床。Arctoris通过生成数据为三大洲的生物技术和制药公司的决策提供支持,在实现全球真正的数据驱动型药物发现方面发挥着重要作用。
据了解,截至目前Arctoris已与全球十余家AI药物发现公司和机构建立了合作。2020年9月,Arctoris与韩国Syntekabio公司合作开展药物发现工作,Syntekabio使用Arctoris的技术平台进行生化和细胞实验,包括靶点的测定和可行性评估。
2020年7月,Arctoris与英矽智能宣布建立技术合作伙伴关系,结合双方在人工智能引导药物发现方面的独特优势,一方面用于靶点识别和生成化学,另一方面结合机器人技术快速生成高质量的细胞、分子和生化数据。
此后的2022年3月,Arctoris和AI药物发现公司Cyclica宣布双方同意扩大合作关系,推进以阿尔茨海默病为重点的新型神经退行性药物发现项目。
Martin博士表示,我们的联合药物发现计划侧重于双重特异性抑制剂,Cyclica是这一领域的领导者之一,利用其基于结构和人工智能的分子设计进行多药理学研究。同时,Arctoris在复杂的酶学和先进的神经变性细胞模型方面建立了特殊的专业知识,此次合作结合双方优势,希望为这一适应症领域的患者开发更好的治疗方案。
与此同时,Arctoris也在积极开发内部管线,七个肿瘤和神经退行性疾病适应症的项目已在持续推进当中。
Arctoris首席运营官Tom Fleming表示,药物发现正在经历快速的数字蜕变,Ulysses平台在这一转变中起着核心的催化作用。期待在未来五年,我们能看到平台的更大变化和加速增长,用尽量小的成本,为更多治疗领域带来更好的治疗方案,我们很荣幸能够在建设这一未来中发挥作用。
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