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Engineer蛋白结构/功能有前途吗？
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n*w
2 楼
【 以下文字转载自 WBCenter 讨论区 】
发信人: newanew (扭啊扭), 信区: WBCenter
标 题: 中文电视TVCHINESE版十月水枪排名包子代发申请
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Nov 3 13:58:06 2012, 美东)
注：1）版面活动：手续费无；2）个人申请：手续费10%:
1）版面活动：手续费无
代发版面/ID:
中文电视（TVCHINESE）
代发事由(主题标题或链接):
http://mitbbs.com/article1/TVChinese/31340915_3_0.html
楼主是否计入统计:
否
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sill
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pppttt
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sequel
redpoppy
rodney
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Ash
frada
aaddoo
sector33
iamright
伪币金额:320伪币，从版上出。
备注：感谢TVCHINESE中文电视版的水枪们！
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a*y
3 楼
比如改进酶效率
研究蛋白结构进化法则
为蛋白药物设计做研究
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a*3
4 楼
流一下口水。

【在 n*****w 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 WBCenter 讨论区 】
: 发信人: newanew (扭啊扭), 信区: WBCenter
: 标 题: 中文电视TVCHINESE版十月水枪排名包子代发申请
: 发信站: BBS 未名空间站 (Sat Nov 3 13:58:06 2012, 美东)
: 注：1）版面活动：手续费无；2）个人申请：手续费10%:
: 1）版面活动：手续费无
: 代发版面/ID:
: 中文电视（TVCHINESE）
: 代发事由(主题标题或链接):
: http://mitbbs.com/article1/TVChinese/31340915_3_0.html
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w*2
5 楼
a dead field

【在 a***y 的大作中提到】
: 比如改进酶效率
: 研究蛋白结构进化法则
: 为蛋白药物设计做研究
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a*y
6 楼
why is it dead?

【在 w*******2 的大作中提到】
: a dead field
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s*m
7 楼
前一阵该领域里一些重要paper retracted

【在 a***y 的大作中提到】
: why is it dead?
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a*y
8 楼
Where can I find out what happened?
我事实上是在考虑对这方面的可行性的基础性＋实用性研究的课题。

【在 s***m 的大作中提到】
: 前一阵该领域里一些重要paper retracted
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k*u
9 楼
看你打算跟谁做了。还是自己起家？

【在 a***y 的大作中提到】
: 比如改进酶效率
: 研究蛋白结构进化法则
: 为蛋白药物设计做研究
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a*y
10 楼
跟什么样的人做好？
不是自己起家。。

【在 k********u 的大作中提到】
: 看你打算跟谁做了。还是自己起家？
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S*I
11 楼
google Hellinga；这方面研究的实用性目前基本上都还停留在纸面上。

【在 a***y 的大作中提到】
: Where can I find out what happened?
: 我事实上是在考虑对这方面的可行性的基础性＋实用性研究的课题。
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d*e
12 楼
自己设计蛋白简直就是扯淡，现在预测 secondary structure还不怎么样呢

【在 S**I 的大作中提到】
: google Hellinga；这方面研究的实用性目前基本上都还停留在纸面上。
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a*y
13 楼
我觉得现在的研究潜能主要是在改进已有蛋白功能上
首先理解蛋白质功能变化于结构的更本质关系，这个可以在修改的过程中研究出来
成果可以指导如何修改蛋白，用什么方法高效筛选等
从头设计的话，是还很遥远。

【在 S**I 的大作中提到】
: google Hellinga；这方面研究的实用性目前基本上都还停留在纸面上。
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k*u
14 楼
A pubmed search would answer most of your questions.=)
I know a guy from UPenn, HHMI investigator, used to be working
in related field. I don't know whether or not he is focusing on that now.
I am not in this field, don't follow it.
Generally speaking, you want to find a Big Cow, has tons of extra money
to burn, probably from a structure lab, and is nice if you are lucky...

【在 a***y 的大作中提到】
: 跟什么样的人做好？
: 不是自己起家。。
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k*u
15 楼
Easy to say than to do...
You can try.

【在 a***y 的大作中提到】
: 我觉得现在的研究潜能主要是在改进已有蛋白功能上
: 首先理解蛋白质功能变化于结构的更本质关系，这个可以在修改的过程中研究出来
: 成果可以指导如何修改蛋白，用什么方法高效筛选等
: 从头设计的话，是还很遥远。
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s*n
16 楼
Rational design成功率很低，directed evolution如果有好的筛选系统的话成功率会
高一些。
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p*r
17 楼
you can try to go to janelia farm and work for looren looger.
They have money to burn. :)

【在 a***y 的大作中提到】
: 比如改进酶效率
: 研究蛋白结构进化法则
: 为蛋白药物设计做研究
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a*y
18 楼
directed evolution你觉得这个方向如何?
我感觉directed evolution做得多了，rational design才更有rationale可以依据吧？

【在 s********n 的大作中提到】
: Rational design成功率很低，directed evolution如果有好的筛选系统的话成功率会
: 高一些。
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s*n
19 楼
rational design比较炫，directed evolution比较实用。
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s*m
20 楼
看看david baker的实验室
他rp比较好

【在 a***y 的大作中提到】
: Where can I find out what happened?
: 我事实上是在考虑对这方面的可行性的基础性＋实用性研究的课题。
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s*m
21 楼
去年有两片文章分别发在nature和science
david baker实验室的

～～～～～～～～～～～～
～～～～～～～～
怎么不怎样呢？

【在 d********e 的大作中提到】
: 自己设计蛋白简直就是扯淡，现在预测 secondary structure还不怎么样呢
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l*1
22 楼
对酶工程来说没啥好的hts技术嘛。
display ×
荧光 ×
抗生素 ×
设计高质量的library才是王道

【在 s********n 的大作中提到】
: Rational design成功率很低，directed evolution如果有好的筛选系统的话成功率会
: 高一些。
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l*1
23 楼
这年头，觉着之友david baker算是这行的大牛。Baker+Tawfik才是未来的方向。
早两年stephen mayo搞计算还是很nb的，这两年不知道为什么没啥动静了。
顺便求内幕。

【在 a***y 的大作中提到】
: 比如改进酶效率
: 研究蛋白结构进化法则
: 为蛋白药物设计做研究
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s*n
24 楼
不能一概而论吧，很多工业用的酶都没有很好的筛选系统。当然高质量的library是前
提，但还是要有高通量甚至超高通量的筛选。

【在 l*********1 的大作中提到】
: 对酶工程来说没啥好的hts技术嘛。
: display ×
: 荧光 ×
: 抗生素 ×
: 设计高质量的library才是王道
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a*y
25 楼
I know him well. But to be honest, his science is far from good.

【在 p*******r 的大作中提到】
: you can try to go to janelia farm and work for looren looger.
: They have money to burn. :)
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v*m
26 楼
利用各种表达库来筛结合伴侣比设计快得多。
看看单抗筛选，能得到结合常数在pmol级别的单抗。

【在 a***y 的大作中提到】
: 我觉得现在的研究潜能主要是在改进已有蛋白功能上
: 首先理解蛋白质功能变化于结构的更本质关系，这个可以在修改的过程中研究出来
: 成果可以指导如何修改蛋白，用什么方法高效筛选等
: 从头设计的话，是还很遥远。
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b*d
27 楼
在rational degign方面很多研究将实验和计算结合起来，是一个不错的探索。
david Baker组里利用Rosetta等软件设计、改造酶，再通过实验验证，在sicence
nature发表了重要研究成果。 但这方面非常烧钱啊，问题在于成功率。
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