为什么这个序列不是一个基因？ - 未名空间MITBBS历史存档

为什么这个序列不是一个基因？# Biology - 生物学

s*82010-03-21 07:03

1 楼

FED WIRE IN xxx ORIGINATOR:xxxxx CHASE BANK ABA:xxxx BENEFICIARY:xxxx
RFB:xxxx OF 11/01/20 OBI:JANUARY 2011 PAYROLL USD 5000 GROSSAMT USD 2831
WITHHELD FOR TAXES
为什么这个税扣了工资的60%+ 还有这个税是公司帮我扣的？还是什么？
谢谢了！！！

A*t2010-03-21 07:03

2 楼

USPS上完全没有寄出的信息

q*d2010-03-21 07:03

3 楼

它是以ATG开始，并且以TAA结束，且序列长度是3的整数位，为什么不能翻译为一个蛋
白呢？
atgcagttacttcgctgtttttcaatattttctgttattgcttcagttttagcacaggaactgacaactatatgcg
agcaaatcccctcaccaactttagaatcgacgccgtactctttgtcaacgactactattttggccaacgggaaggc
aatgcaaggagtttttgaatattacaaatcagtaacgtttgtcagtaattgcggttctcacccctcaacaactagc
aaaggcagccccataaacacacagtatgtttttgccggtggtttatccgctgtgcagcctaatgttagtttaggcg
aagtactggatgtttctgctaacagaaccgctgctgacggaacagttgaatggcttatcccaacagtaactgcagc
tccaggccagacggtcactatgcccgtagtagtcaagagttcaagtcttgcagttgctggtgcgcagtt

g*n2010-03-21 07:03

4 楼

401K，ESPP，dependent flex account 等等有否包括在里面？这些会预扣。但钱都是你的。

M*92010-03-21 07:03

5 楼

什么好东东？

P*d2010-03-21 07:03

6 楼

Translation in what sense? in silico, in vivo, during cloing/expression?
NCBI blastx finds great hits.

A*t2010-03-21 07:03

7 楼

就一张乱买的邮票。

【在 M**9 的大作中提到】

: 什么好东东？

p*p2010-03-21 07:03

8 楼

1。上游有promoter吗？
2。ATG附近有Kozak序列吗？
3。这段序列中间有intron吗？
4。这段序列中间有转录终止信号吗？
5。这段序列中间有polyA剪接信号吗？
6。中间有in－frame的stop codon吗？

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agcaaatcccctcaccaactttagaatcgacgccgtactctttgtcaacgactactattttggccaacgggaaggc
aatgcaaggagtttttgaatattacaaatcagtaacgtttgtcagtaattgcggttctcacccctcaacaactagc
aaaggcagccccataaacacacagtatgtttttgccggtggtttatccgctgtgcagcctaatgttagtttaggcg
aagtactggatgtttctgctaacagaaccgctgctgacggaacagttgaatggcttatcccaacagtaactgc

【在 q*****d 的大作中提到】

: 它是以ATG开始，并且以TAA结束，且序列长度是3的整数位，为什么不能翻译为一个蛋
: 白呢？
: atgcagttacttcgctgtttttcaatattttctgttattgcttcagttttagcacaggaactgacaactatatgcg
: agcaaatcccctcaccaactttagaatcgacgccgtactctttgtcaacgactactattttggccaacgggaaggc
: aatgcaaggagtttttgaatattacaaatcagtaacgtttgtcagtaattgcggttctcacccctcaacaactagc
: aaaggcagccccataaacacacagtatgtttttgccggtggtttatccgctgtgcagcctaatgttagtttaggcg
: aagtactggatgtttctgctaacagaaccgctgctgacggaacagttgaatggcttatcccaacagtaactgcagc
: tccaggccagacggtcactatgcccgtagtagtcaagagttcaagtcttgcagttgctggtgcgcagtt

q*d2010-03-21 07:03

9 楼

谢谢已经找到问题的所在，这段序列没有intron，就是一个CDS

p*p2010-03-21 07:03

10 楼

中间有一个stop codon。或许是一个26kDa左右的蛋白如果表达。

【在 q*****d 的大作中提到】

: 谢谢已经找到问题的所在，这段序列没有intron，就是一个CDS

s*r2010-03-21 07:03

11 楼

非要有intron吗

【在 q*****d 的大作中提到】

: 谢谢已经找到问题的所在，这段序列没有intron，就是一个CDS

i*f2010-03-21 07:03

12 楼

intron应该不是必须的吧,
又不少基因就是只有一个exon的,至少在RICE和ATH里面是这样

【在 s*r 的大作中提到】

: 非要有intron吗

p*p2010-03-21 07:03

13 楼

误会了。
我是针对OP把那段序列当作一个ORF而提的问题。如果中间有intron，那么能够被3整除
一点意义都没有。

【在 s*r 的大作中提到】

: 非要有intron吗

q*d2010-03-21 07:03

14 楼

没有intron啊，我要构建一个cellulosome的骨架，这上面有一个AGA2基因的信号肽，
三个cohesion分别来自三个微生物，第二和第三个cohesion之间有一个CBD(cellulose
binding domain)，现在问题出在第二个cohesion序列上，如果用这人序列就不能翻译
为一个蛋白，但是把第二个改变一下大小，就可以翻译成一个蛋白了。到底是什么原因
，我现在也没有搞清楚，我反正是把序列改动一下，就OK了！难道这个Vector NTI能够
自动识别intron吗？这是最新的序列，大家如果有空可以比对一下，只有几个碱基不
同而已，太令人匪夷所思了。
atgcagttacttcgctgtttttcaatattttctgttattgcttcagttttagcacaggaactgacaactatatgcg
agcaaatcccctcaccaactttagaatcgacgccgtactctttgtcaacgactactattttggccaacgggaaggc
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i*f2010-03-21 07:03

15 楼

会不会是因为在原核和真核里面, t-RNA三联体密码的偏好性不同

cellulose
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agcaaatcccctcaccaactttagaatcgacgccgtactctttgtcaacgactactattttggccaacgggaaggc
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【在 q*****d 的大作中提到】

: 没有intron啊，我要构建一个cellulosome的骨架，这上面有一个AGA2基因的信号肽，
: 三个cohesion分别来自三个微生物，第二和第三个cohesion之间有一个CBD(cellulose
: binding domain)，现在问题出在第二个cohesion序列上，如果用这人序列就不能翻译
: 为一个蛋白，但是把第二个改变一下大小，就可以翻译成一个蛋白了。到底是什么原因
: ，我现在也没有搞清楚，我反正是把序列改动一下，就OK了！难道这个Vector NTI能够
: 自动识别intron吗？这是最新的序列，大家如果有空可以比对一下，只有几个碱基不
: 同而已，太令人匪夷所思了。
: atgcagttacttcgctgtttttcaatattttctgttattgcttcagttttagcacaggaactgacaactatatgcg
: agcaaatcccctcaccaactttagaatcgacgccgtactctttgtcaacgactactattttggccaacgggaaggc
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p*p2010-03-21 07:03

16 楼

如果是微生物，可能发生的情况就复杂些了。比如，不同的promoter，ribosomal
entry site, readthough，frame shift等等。建议你看看转录翻译调控。

cellulose
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【在 q*****d 的大作中提到】

: 没有intron啊，我要构建一个cellulosome的骨架，这上面有一个AGA2基因的信号肽，
: 三个cohesion分别来自三个微生物，第二和第三个cohesion之间有一个CBD(cellulose
: binding domain)，现在问题出在第二个cohesion序列上，如果用这人序列就不能翻译
: 为一个蛋白，但是把第二个改变一下大小，就可以翻译成一个蛋白了。到底是什么原因
: ，我现在也没有搞清楚，我反正是把序列改动一下，就OK了！难道这个Vector NTI能够
: 自动识别intron吗？这是最新的序列，大家如果有空可以比对一下，只有几个碱基不
: 同而已，太令人匪夷所思了。
: atgcagttacttcgctgtttttcaatattttctgttattgcttcagttttagcacaggaactgacaactatatgcg
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q*d2010-03-21 07:03

17 楼

我这个还没有装promoter呢，应该跟promoter没有关系的吧，这个序列是人工合成的。
来源于4种微生物！

p*p2010-03-21 07:03

18 楼

你这玩笑开的。人工合成的序列应该找设计的人去问吧。几个ORF中间有可能放入IRES
等ribosomal entry sites。

【在 q*****d 的大作中提到】

: 我这个还没有装promoter呢，应该跟promoter没有关系的吧，这个序列是人工合成的。
: 来源于4种微生物！

D*g2010-03-21 07:03

19 楼

中间有Stop coden

cellulose
atgcagttacttcgctgtttttcaatattttctgttattgcttcagttttagcacaggaactgacaactatatgcg
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【在 q*****d 的大作中提到】

: 没有intron啊，我要构建一个cellulosome的骨架，这上面有一个AGA2基因的信号肽，
: 三个cohesion分别来自三个微生物，第二和第三个cohesion之间有一个CBD(cellulose
: binding domain)，现在问题出在第二个cohesion序列上，如果用这人序列就不能翻译
: 为一个蛋白，但是把第二个改变一下大小，就可以翻译成一个蛋白了。到底是什么原因
: ，我现在也没有搞清楚，我反正是把序列改动一下，就OK了！难道这个Vector NTI能够
: 自动识别intron吗？这是最新的序列，大家如果有空可以比对一下，只有几个碱基不
: 同而已，太令人匪夷所思了。
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