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Help!: intensity 很不同的microarray可以比较expression么？

Help!: intensity 很不同的microarray可以比较expression么？# Biology - 生物学

T*y2010-09-29 07:09

1 楼

原来读书的时候是ee里面，做的是eda circuits simulation方向，现在在一家eda公司
software engineer的title。如果现在去flag之类的偏cs的公司，h1b能办得下来吗？
会不会方向不符合？谢谢！

j*x2010-09-29 07:09

2 楼

ＲＴ．

y*i2010-09-29 07:09

3 楼

Primary cell的microarray general intensity 比起 cell line 明显低，虽然之前检
测过RNA (量，蛋白，降解)。microarray 的 Quality Criteria 都过了。
两个问题：
1。这种情况下可以用normalization然后对比两者的表达么
2。什么因素可能造成这种情况？实验中得buffer用的是一样得。

p*s2010-09-29 07:09

4 楼

我刚删了主贴了因为不太好管理有些人不会用dropbox 一不小心就把共享文件全删了
我又得重新恢复
晚上我整理下软件打包上传得了

c*t2010-09-29 07:09

5 楼

try removeBatchEffect in limma,where you can throw in a design matrix
but that is far away from being the ideal solution
that is why randomized experimental design is very important

G*e2010-09-29 07:09

6 楼

辛苦了

【在 p******s 的大作中提到】

: 我刚删了主贴了因为不太好管理有些人不会用dropbox 一不小心就把共享文件全删了
: 我又得重新恢复
: 晚上我整理下软件打包上传得了

y*i2010-09-29 07:09

7 楼

Thanks. 一共就那么几个条件，不可能randomize啊。

【在 c*********t 的大作中提到】

: try removeBatchEffect in limma,where you can throw in a design matrix
: but that is far away from being the ideal solution
: that is why randomized experimental design is very important

j*x2010-09-29 07:09

8 楼

还是dropbox好用．我可以帮忙管理．Local backup一下，谁删将谁踢出去．

【在 p******s 的大作中提到】

: 我刚删了主贴了因为不太好管理有些人不会用dropbox 一不小心就把共享文件全删了
: 我又得重新恢复
: 晚上我整理下软件打包上传得了

g*y2010-09-29 07:09

9 楼

这个是很有用，不过内容太多，我的dropbox account容量不够，老是要我升级，最后
只好退出share了。定期打包share会好用一些，不过管理会比较辛苦。还要感谢
pandarus的助人为乐。

【在 p******s 的大作中提到】

: 我刚删了主贴了因为不太好管理有些人不会用dropbox 一不小心就把共享文件全删了
: 我又得重新恢复
: 晚上我整理下软件打包上传得了

G*e2010-09-29 07:09

10 楼

可不可以用Live的skydrive共享？记得只有creator才有权限删除，visitor没有
容量记得比Dropbox打

【在 g*****y 的大作中提到】

: 这个是很有用，不过内容太多，我的dropbox account容量不够，老是要我升级，最后
: 只好退出share了。定期打包share会好用一些，不过管理会比较辛苦。还要感谢
: pandarus的助人为乐。

j*x2010-09-29 07:09

11 楼

好主意．上skydrive吧．

【在 G****e 的大作中提到】

: 可不可以用Live的skydrive共享？记得只有creator才有权限删除，visitor没有
: 容量记得比Dropbox打

b*s2010-09-29 07:09

12 楼

Yes, pls use it. my dropbox also maxed out.
keep asking upgrade, not sure why should a shared folder take up
private space in DB. Guess this is how DB try to make money..

【在 j*x 的大作中提到】

: 好主意．上skydrive吧．