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请推荐几家提供 NextGen sequencing 的公司
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j*e
2 楼
年底想回国办理二代身份证的手续，不知道最近有没有人在北京留学服务中心办过，
有几个问题想请教一下经验 （网上和电话都查不到这些信息）：
1. 更换居民身份证申请表的住址一栏应该填什么？留学服务中心的集体户口地址吗？
（北京市海淀区学院路15号教育部留学服务中心）
2. 去东升派出所照相采集指纹的时候要带出户籍卡吗？我的户口存放合同已经过期，
是不是需要先去留学服务中心补交所有费用，续签合同以后才能借出户籍卡？还是可以
直接去派出所办？
3. 可不可以加急办理？不行的话委托人代领是去留学服务中心还是派出所？代领一定
需要我的护照原件吗？
多谢有知道情况的人分享经验！
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d*d
3 楼
将爱 观音山 幸存日 惊沙 跟踪孔令学 最爱 建党伟业 钢的琴 Hello 树先生 失恋33天
个人感觉拍的好看的国产片还多是立足于小人物平凡生活的故事片，真诚感人，容易引
起共鸣，而且多是悲剧收场，比如最爱，钢的琴，观音山。向好莱坞学习的时尚大片们
基本上是惨不忍睹了，不由让人怀疑这是拍片还是洗钱。
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w*o
4 楼
【 以下文字转载自 Stock 讨论区 】
发信人: walstudio (午夜未眠人), 信区: Stock
标 题: iPhone4s 特别版?
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Oct 6 22:45:08 2011, 美东)
用下面的logo, 有人提议，不知道能不能做成
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t*d
6 楼
打算用 NextGen Sequencing 测一些 mRNA 的样本。有经验的同志们请推荐个提供 RNA
-seq service 的公司吧。多谢！
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a*t
7 楼
刚被他家拒了credit card，悲剧，真难申请
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N*m
8 楼
嗯，比香港烂片好多了

33天

【在 d****d 的大作中提到】
: 将爱 观音山 幸存日 惊沙 跟踪孔令学 最爱 建党伟业 钢的琴 Hello 树先生 失恋33天
: 个人感觉拍的好看的国产片还多是立足于小人物平凡生活的故事片，真诚感人，容易引
: 起共鸣，而且多是悲剧收场，比如最爱，钢的琴，观音山。向好莱坞学习的时尚大片们
: 基本上是惨不忍睹了，不由让人怀疑这是拍片还是洗钱。
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u*a
9 楼
后盖可换，到时候第三方厂商会造的……

【在 w*******o 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Stock 讨论区 】
: 发信人: walstudio (午夜未眠人), 信区: Stock
: 标 题: iPhone4s 特别版?
: 发信站: BBS 未名空间站 (Thu Oct 6 22:45:08 2011, 美东)
: 用下面的logo, 有人提议，不知道能不能做成
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s*e
11 楼
www.genomics.cn
www.bgiamericas.com
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k*u
12 楼
我被他家拒了三次。。。

【在 a*****t 的大作中提到】
: 刚被他家拒了credit card，悲剧，真难申请
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K*s
13 楼
嗯，我还有好些没看呢。很喜欢那些小人物的故事

33天

【在 d****d 的大作中提到】
: 将爱 观音山 幸存日 惊沙 跟踪孔令学 最爱 建党伟业 钢的琴 Hello 树先生 失恋33天
: 个人感觉拍的好看的国产片还多是立足于小人物平凡生活的故事片，真诚感人，容易引
: 起共鸣，而且多是悲剧收场，比如最爱，钢的琴，观音山。向好莱坞学习的时尚大片们
: 基本上是惨不忍睹了，不由让人怀疑这是拍片还是洗钱。
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t*d
15 楼
谢谢！看来 BGI 打入美国市场了。

【在 s*********e 的大作中提到】
: www.genomics.cn
: www.bgiamericas.com
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m*t
17 楼
靠，看了不少啊。
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l*h
18 楼
买了1年都没用，本来嫌麻烦不想折腾。不过，看这个神坛介绍太详细，大概扫了一眼
，应该linux白也不很有太大问题。有点动心折腾了

【在 d********g 的大作中提到】
: 看吧，神坛里有神棍在解答：
: http://www.beimeicn.com/Forums/viewtopic/t=347411/lang=tchinese
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l*n
19 楼
BGI的价格有绝对优势，他们按数据量收费，好像20G的数据5-8万RMB
而且测序后的生物信息分析支持比美国的傻逼公司要好很多
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l*3
20 楼

他家是最好申请的，最好建议现有他家checking...然后到branch去办credit card,
500credit
line也行，涨的很快的，我一张卡从500涨到7000只用了1年时间

【在 k****u 的大作中提到】
: 我被他家拒了三次。。。
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c*g
21 楼
钢的琴动不动就唱歌，十分雷人。摄影也幼稚，跟舞台剧似的。
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d*g
22 楼
神棍写得太详细了，我正在装webmin，哈哈

【在 l***h 的大作中提到】
: 买了1年都没用，本来嫌麻烦不想折腾。不过，看这个神坛介绍太详细，大概扫了一眼
: ，应该linux白也不很有太大问题。有点动心折腾了
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l*n
23 楼
好像可以直接寄样品给大陆的BGI吧
测序结果直接登录服务器
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c*x
24 楼
不折腾了
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t*d
25 楼
cool. 这个计费方法不错。

【在 l******n 的大作中提到】
: BGI的价格有绝对优势，他们按数据量收费，好像20G的数据5-8万RMB
: 而且测序后的生物信息分析支持比美国的傻逼公司要好很多
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s*n
27 楼
外行问一下，20G是什么概念？像一般的细菌基因组大概在1-5 M，20G是指20,000M的序
列信息？

【在 l******n 的大作中提到】
: BGI的价格有绝对优势，他们按数据量收费，好像20G的数据5-8万RMB
: 而且测序后的生物信息分析支持比美国的傻逼公司要好很多
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j*x
29 楼
你得到了它
还有一个重要的概念叫coverage，无论对于定性的DNA还是定量的RNA-seq。
针对你这个例子，20G的数据理论上可以有4000x-20000x的coverage，这对于序列拼接
或者in-deep sequencing是至关重要的。

【在 s********n 的大作中提到】
: 外行问一下，20G是什么概念？像一般的细菌基因组大概在1-5 M，20G是指20,000M的序
: 列信息？
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s*i
30 楼
一个USB口可以接hub么？
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s*n
31 楼
那这个价格很便宜啊。还有个问题就是比如测一个基因组，多少倍的coverage比较合适？

【在 j****x 的大作中提到】
: 你得到了它
: 还有一个重要的概念叫coverage，无论对于定性的DNA还是定量的RNA-seq。
: 针对你这个例子，20G的数据理论上可以有4000x-20000x的coverage，这对于序列拼接
: 或者in-deep sequencing是至关重要的。
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n*8
32 楼
mark
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j*x
33 楼
看目的了，如果是细菌基因组resequencing，有参考序列，那么coverage有10x可能
就够了，如果是denovo seq，没有参考序列，那么考虑到拼接问题，一般30x以上，
当然还要看基因组复杂度有没有重复序列。如果你想in-deep找SNP，那么取决于你
需要的敏感度，要想找1%左右的SNP或者mutation，那么理论上也是至少100x，考虑
到防止测序错误造成的假阳性，一般1000x是比较理想的。

适？

【在 s********n 的大作中提到】
: 那这个价格很便宜啊。还有个问题就是比如测一个基因组，多少倍的coverage比较合适？
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s*k
34 楼
Is it a good idea to buy a Pogoplug for $50 at MicroCenter.
It should have a bigger memory and WIFI (?).
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s*n
35 楼
THX!

【在 j****x 的大作中提到】
: 看目的了，如果是细菌基因组resequencing，有参考序列，那么coverage有10x可能
: 就够了，如果是denovo seq，没有参考序列，那么考虑到拼接问题，一般30x以上，
: 当然还要看基因组复杂度有没有重复序列。如果你想in-deep找SNP，那么取决于你
: 需要的敏感度，要想找1%左右的SNP或者mutation，那么理论上也是至少100x，考虑
: 到防止测序错误造成的假阳性，一般1000x是比较理想的。
:
: 适？
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z*5
36 楼
这种plug computer都怎么接3.5硬盘呢？adapter？
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s*e
37 楼
补充一下，因为细菌的genome比较小，所以一般的NGS,一个round就可以很多次.
这样,bgi不推荐reseq, 更推荐直接de novo. 这样的费用和reseq差不多.

【在 j****x 的大作中提到】
: 看目的了，如果是细菌基因组resequencing，有参考序列，那么coverage有10x可能
: 就够了，如果是denovo seq，没有参考序列，那么考虑到拼接问题，一般30x以上，
: 当然还要看基因组复杂度有没有重复序列。如果你想in-deep找SNP，那么取决于你
: 需要的敏感度，要想找1%左右的SNP或者mutation，那么理论上也是至少100x，考虑
: 到防止测序错误造成的假阳性，一般1000x是比较理想的。
:
: 适？
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s*i
38 楼
$30+plus tax，进了一个，用用看，看看神不？
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j*x
39 楼
没直接和BGI打过交道，不过身边直接打过交道的朋友不少，反馈都不是太好。
便宜是便宜，但是质量。。。不过这也都是1-2年前的情况了。
你说得这个情况，究竟是denovo还是reseq，其实差别只在于上不上454（目前的情况），
真正意义上的denovo最终还是需要ABI3730来填gap的。
我不知道BGI推荐直接denove的出发点是什么，如果是我，可能还是会选择reseq的策略

【在 s*********e 的大作中提到】
: 补充一下，因为细菌的genome比较小，所以一般的NGS,一个round就可以很多次.
: 这样,bgi不推荐reseq, 更推荐直接de novo. 这样的费用和reseq差不多.
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w*e
40 楼
这个跟神座一号比，能破解么？多的那个sata能用来作什么？好像不如一号usb方便啊
。
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s*n
41 楼
de novo和re-sequence有何区别？只是coverage的区别吗？
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p*g
42 楼
神座2号的internet连接不给力啊。用pogoplug远程从神座上下载文件到笔记本硬盘最
多50k/s，看个普通压缩的rmvb也不流畅。只能在自家局域网里用用！
有高人说说该怎么用这个神座么？要破解的话，装哪个linux好些，新手没玩过linux。
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p*n
43 楼
20G 5到8万太贵了，现在的cost是10k per genome (human),数据量是30x coverage,
就是100G。
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i*e
44 楼
包子～
http://jeff.doozan.com/debian/

【在 p******g 的大作中提到】
: 神座2号的internet连接不给力啊。用pogoplug远程从神座上下载文件到笔记本硬盘最
: 多50k/s，看个普通压缩的rmvb也不流畅。只能在自家局域网里用用！
: 有高人说说该怎么用这个神座么？要破解的话，装哪个linux好些，新手没玩过linux。
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p*n
45 楼
对了，另外还有就是你是做什么的？人的mRNASeq 2个lane就可以了，但是如果是细菌
，1个lane都多余，需要muliplexing,1一个lane能上16个sample, 但是感觉这个做的都
不太好.
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u*r
46 楼
破解以后pogoplug原有的共享，自动预览之类的功能就没了吧？还有，是不是得上动态
域名解析，否则找不到dock吧？
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g*g
48 楼
re
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s*e
49 楼
质量问题,仁者见仁智者见智吧. 我的观点是世界上没有任何一个公司的顾客满意率为
100%.
1,2年前的话,多半是国内的老师,因为那时候bgi还没有大规模打入国际市场. 国内的老
师,还是很难伺候的.最近的一个事情就是一个老师死活不给项目完成以后的尾款.这个
项目最终发表到nature genetics, 老师不爽的原因是项目没有发表到nature, 说bgi以
前忽悠了他. 这种事情,难道华大能保证发nature?
其他的事情,华大有错的也有,比如让测植物根的,测成茎了,这事情是发生过的.关键看
怎么解决了.
华大最近在美国的口碑还不错.9月和merck签了5年的service contract,然后和lily,
pfizer都签了几个mil的合同. 项目的进展都很不错. 美国其它的竞争者,现在大一点的
complete genomics,口碑就不太好.我为华大工作,就不多说了.
www.bgiamericas.com, 华大美洲分部建立就是为了解决美洲客户所遇到的问题.大家可
以按上面的联系方式找我们,或者直接pm我,如果遇到任何问题. 我们尽全力让大家满意
, 总不能坠了中国企业的名头.

），

【在 j****x 的大作中提到】
: 没直接和BGI打过交道，不过身边直接打过交道的朋友不少，反馈都不是太好。
: 便宜是便宜，但是质量。。。不过这也都是1-2年前的情况了。
: 你说得这个情况，究竟是denovo还是reseq，其实差别只在于上不上454（目前的情况），
: 真正意义上的denovo最终还是需要ABI3730来填gap的。
: 我不知道BGI推荐直接denove的出发点是什么，如果是我，可能还是会选择reseq的策略
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s*e
50 楼
华大就是这个差不多这个价钱. 比这个便宜都有可能,取决于多少sample.

【在 p******n 的大作中提到】
: 20G 5到8万太贵了，现在的cost是10k per genome (human),数据量是30x coverage,
: 就是100G。
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s*n
51 楼
10k RMB/100 G?
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s*n
52 楼
10k RMB/100 G?
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j*x
53 楼
hehe，既然你在华大工作，那么我还能说什么呢
没有公司满意率100%，这个我同意，好比taobao上也没有100%好评的商户。
不过我这里关于BGI的差评实在是不少，我觉得这里玩偷换概念的没什么意义。
我说了，这是1-2前的情况。于是你把责任推到因为国内的老师难伺候。说实话，
这不是一个负责任的公司应有的态度。当然，你是代表你的个人观点。事实上这些
人我都很熟悉，有些还是我的客户，他们的要求都很合理，问题很明确，当时BGI
的测序质量确实很差，无论是传统测序还是NGS，这个“口碑”不是一两个人确立
起来的，几乎是共识了。
BGI这两年也许在质控上作的好的多了，你比我有发言权，而且既然要开发国际市场
自然不能想对付国内客户的那种办法来应付，或者你说得，国际客户比国内的老师
“好伺候”。anyway，我评价的只是1-2年前的BGI，今后如果有机会合作，我还是
很愿意看到他们的变化。

【在 s*********e 的大作中提到】
: 质量问题,仁者见仁智者见智吧. 我的观点是世界上没有任何一个公司的顾客满意率为
: 100%.
: 1,2年前的话,多半是国内的老师,因为那时候bgi还没有大规模打入国际市场. 国内的老
: 师,还是很难伺候的.最近的一个事情就是一个老师死活不给项目完成以后的尾款.这个
: 项目最终发表到nature genetics, 老师不爽的原因是项目没有发表到nature, 说bgi以
: 前忽悠了他. 这种事情,难道华大能保证发nature?
: 其他的事情,华大有错的也有,比如让测植物根的,测成茎了,这事情是发生过的.关键看
: 怎么解决了.
: 华大最近在美国的口碑还不错.9月和merck签了5年的service contract,然后和lily,
: pfizer都签了几个mil的合同. 项目的进展都很不错. 美国其它的竞争者,现在大一点的
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s*e
54 楼
同学，我无意和你争执。 我主动说我在华大工作，就是避免因为我说的话有偏见，从
而误导了这里的同学和老师。如果我不提，光说bgi多好多好，至少还有个混淆视听的
作用吧。
至于“不是负责任的公司应有的态度“，我不过是辩解了一下bgi的差评问题，谈不上
你说的那么严重吧。至少，我上来说明我自己不是客观公正的。 我觉得我上来说明自
己的立场，才是负责任的做法。
对于bgi的差评，我这么看待这个问题，很多是双方面的，双方都有责任。我也举例说
明，有些时候确实是客户的责任。 没有客户会主动告诉你，“哎，这事儿，其实是我
自己错了“。 很多情况是双方都有问题，而只有对方的问题才会被提出来。比如说，
国内的回款率不超过50%。 换言之，有50% 左右的老师是赖账的。华大也怕了，现在
都是不全款，不释放数据。 有些老师就会说华大服务不好，但是他们就不会提及自己
没负完钱的问题。当然，很多老师不负全款是因为怕拿到的数据不好，钱负完了，就怕
没有办法在和华大协商解决了。这是国内社会上的一个通病，大家相互缺乏信任，没有
信用体制。 缺乏互信，导致双方的争执和不合。
华大现在整体的名声呢，在我这个员工眼里，我觉得还是越来越好的。08年国内的销售
额1亿，09年3亿，10年6亿。 说明越来越多的客户相信华大的服务。
在美国开展的业务，确实比较重视。所以在这里的同学老师，不用太担心质量问题。如
同华大基本不担心美国的回款问题一样。当然，华大也不可能保证100%的满意率.实际
上没有任何一个公司可以保证。版上前两天还有抱怨sigma的公司。我phd的时候买
invitroge的primer是坏的，导致我3礼拜的时间光作一个pcr，还做不出来。华大目前
一个人盯一个项目，尽最大可能保证中间环节不出问题，保证客户的利益。
实际上，华大在美国的业务是有保险的，如果万一项目有闪失，华大和保险公司会赔偿
损失的。
华大作为生物技术公司，进入海外市场，总会有各种各样的问题。希望诸位多鞭策，多
提意见。华大一定是珍稀自己名声的公司，会尽力解决问题。
1，2年前的项目，不知道还能不能追索。如果你能提供你朋友，客户的联系方式和项目
简介，email我站内邮箱。 我可以尝试帮助解决。

【在 j****x 的大作中提到】
: hehe，既然你在华大工作，那么我还能说什么呢
: 没有公司满意率100%，这个我同意，好比taobao上也没有100%好评的商户。
: 不过我这里关于BGI的差评实在是不少，我觉得这里玩偷换概念的没什么意义。
: 我说了，这是1-2前的情况。于是你把责任推到因为国内的老师难伺候。说实话，
: 这不是一个负责任的公司应有的态度。当然，你是代表你的个人观点。事实上这些
: 人我都很熟悉，有些还是我的客户，他们的要求都很合理，问题很明确，当时BGI
: 的测序质量确实很差，无论是传统测序还是NGS，这个“口碑”不是一两个人确立
: 起来的，几乎是共识了。
: BGI这两年也许在质控上作的好的多了，你比我有发言权，而且既然要开发国际市场
: 自然不能想对付国内客户的那种办法来应付，或者你说得，国际客户比国内的老师
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j*x
55 楼
恩，我还是认同你这里所说的，但是很明显在上一个帖子中你一开始就把别人对BGI的
差评而且不是个别事例偷换概念成为没有公司是100%好评的，这在我看来是典型的诡辩
，之后又看到“国内的老师很难伺候”这样的表述，实在有点忍不住才会和你计较一下
，可能有点意气了，希望你谅解。
关于你所说责任是双方面的，我不否认你们遇到过很多麻烦。问题是，我这里的反馈，
直接是测序质量上的问题，以及相应的售后服务的问题，而且不止一次。部分数据我经
手过，所以我很清楚问题可能出在哪里。这里没有任何你所说的回款问题。而恰恰是这
些“优质客户”，往往没有得到应有的保障，这些朋友只好转向其他公司并得到了比较
满意的结果，所以在这里我也不方便提供他们的信息。我可以征求一下他们的意见，然
后和你沟通。
华大现在以公司的模式运营，而且如你所说业绩一直在稳步增长，我相信是有目共睹的
。当然，公司的声誉，想要树立起来需要花很多的时间，毁起来确实很容易的事情，相
信你们不会做国内国外客户区别对待的事情。

【在 s*********e 的大作中提到】
: 同学，我无意和你争执。 我主动说我在华大工作，就是避免因为我说的话有偏见，从
: 而误导了这里的同学和老师。如果我不提，光说bgi多好多好，至少还有个混淆视听的
: 作用吧。
: 至于“不是负责任的公司应有的态度“，我不过是辩解了一下bgi的差评问题，谈不上
: 你说的那么严重吧。至少，我上来说明我自己不是客观公正的。 我觉得我上来说明自
: 己的立场，才是负责任的做法。
: 对于bgi的差评，我这么看待这个问题，很多是双方面的，双方都有责任。我也举例说
: 明，有些时候确实是客户的责任。 没有客户会主动告诉你，“哎，这事儿，其实是我
: 自己错了“。 很多情况是双方都有问题，而只有对方的问题才会被提出来。比如说，
: 国内的回款率不超过50%。 换言之，有50% 左右的老师是赖账的。华大也怕了，现在
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t*d
56 楼
请问人的 RNA-seq 大概需要多少 coverage？能不能同时检测 RNA expression level
，alternative splicing 和 SNPs in expressed RNAs? 大概费用？
样品是送回国做吗？
谢谢！
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A*n
57 楼
这个10K至少是以刀为单位吧？

【在 p******n 的大作中提到】
: 20G 5到8万太贵了，现在的cost是10k per genome (human),数据量是30x coverage,
: 就是100G。
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