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再问两个关于ChIP的问题
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再问两个关于ChIP的问题# Biology - 生物学
T*s
1
问个问题, 现在公司A已经入职两个月多了,H1 transfer被RFE了,还没让律师
response。准备再找一个公司B,请问这时候可以再让公司B file一个transfer吗?还
是得等到公司A的transfer approve了再弄? 谢谢各位大神
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m*d
2
新手请教:
在做Polii-ChIP-qPCR,在qPCR这步怎么normalize,看protocol上建议留input,最后
qPCR这步normalize to input。可是reverse crosslink之后DNA yield这么少,留1%的
input能准么?我想请问,能不能不留input了,qPCR这步normalize to GAPDH行么,反
正treatment也不影响Polii binding.
还有另一个问题,reverse crosslink之后大家都怎样recover DNA,我过了个QIAGEN的
柱子,yield挺低的
谢谢~~
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c*8
3
等 transfer approval
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m*5
4
同问!!!
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T*s
5
十分感谢。我看到网上有说Bridge petition的,您知道这个操作吗?

【在 c******8 的大作中提到】
: 等 transfer approval
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g*f
6
1. 关于DNA extract 我以前用QIAGEN的柱子,方便到是方便,可是费钱不说,产量还
很低。后来我一直用 phenol: chloroform,挺好用,最后一步加glycogen 和乙醇后
-20 过夜或者 -80度 1小时,离心后可以看到大砣的沉淀。
2. 关于input,1%的 lysate 可以提取很多的DNA,足够后面PCR 用了。我觉得
normalize to GAPDH 从理论上讲就错了
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c*8
7
不知道 bridge petition,感觉还是有风险的。最好问问律师

:十分感谢。我看到网上有说Bridge petition的,您知道这个操作吗?
:【 在 china888 (陶瓷man) 的大作中提到: 】
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c*y
8
赞“大砣”



【在 g*******f 的大作中提到】
: 1. 关于DNA extract 我以前用QIAGEN的柱子,方便到是方便,可是费钱不说,产量还
: 很低。后来我一直用 phenol: chloroform,挺好用,最后一步加glycogen 和乙醇后
: -20 过夜或者 -80度 1小时,离心后可以看到大砣的沉淀。
: 2. 关于input,1%的 lysate 可以提取很多的DNA,足够后面PCR 用了。我觉得
: normalize to GAPDH 从理论上讲就错了

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k*n
9
必须要input,够chip了都不差那点input,两种方法纯化dna没有显著差异。只要你的
细胞量超过1,000,000,有合适的primer,qpcr一点问题都没有。至于那一大坨,多半
是糖原,去污剂和盐。
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k*n
10
chip后dna浓度本来就很低,如果是polii的话,如果你用10ug抗体pulldown100,000,
000个细胞,能搞下来100ng dna就nb得不行了。这个量nanodrop是测不准的,除非你用
pico green。还有,如果是etoh沉淀的话,nanodrop的值会偏高。
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